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棘孢小单孢菌DSM 43816双组分系统的生物信息学分析
1
作者
龙雨欣
彭萱
+3 位作者
张小梅
倪海燕
邹龙
龙中儿
《江西师范大学学报(自然科学版)》
北大核心
2024年第5期499-508,共10页
棘孢小单孢菌(Micromonospara echinospora)是一种能产生多种生物活性化合物的菌株,在药物发现和开发领域中具有重要的应用价值.双组分系统(two-component systems,TCSs)是存在于细菌内的一种信号传导系统,一般由组氨酸激酶(histidine k...
棘孢小单孢菌(Micromonospara echinospora)是一种能产生多种生物活性化合物的菌株,在药物发现和开发领域中具有重要的应用价值.双组分系统(two-component systems,TCSs)是存在于细菌内的一种信号传导系统,一般由组氨酸激酶(histidine kinase,HK)和应答调控蛋白(response regulator,RR)2部分组成,细菌可通过该系统感受外界环境变化,调控自身的生理过程以维持生存,是细菌适应选择压力的一种机制.该文以棘孢小单孢菌DSM 43816为研究对象,采用生物信息学方法系统分析了该菌株基因组内TCSs表达基因的分布、结构及功能.分析结果表明:棘孢小单孢菌DSM 43816基因组共编码35个组氨酸激酶和47个应答调控蛋白,其中包括21对配对的TCSs、2个杂合蛋白、14个孤儿HK蛋白、26个孤儿RR蛋白.这些配对的TCSs可能参与调控金属离子转运、硝酸盐和磷酸盐的代谢、生长运动、群体感应、应激反应、细菌毒力、细胞膜细胞壁的合成及抗生素的合成等多重生物学功能.研究结果可为揭示棘孢小单孢菌DSM 43816对环境的适应性机制、开发其生物活性化合物提供参考.
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关键词
棘孢小单孢菌dsm
43816
双组分系统
组氨酸激酶
应答调控蛋白
生物信息学分析
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职称材料
题名
棘孢小单孢菌DSM 43816双组分系统的生物信息学分析
1
作者
龙雨欣
彭萱
张小梅
倪海燕
邹龙
龙中儿
机构
江西师范大学生命科学学院
出处
《江西师范大学学报(自然科学版)》
北大核心
2024年第5期499-508,共10页
基金
国家自然科学基金(31960015)
江西省自然科学基金(20192BAB204001)资助项目.
文摘
棘孢小单孢菌(Micromonospara echinospora)是一种能产生多种生物活性化合物的菌株,在药物发现和开发领域中具有重要的应用价值.双组分系统(two-component systems,TCSs)是存在于细菌内的一种信号传导系统,一般由组氨酸激酶(histidine kinase,HK)和应答调控蛋白(response regulator,RR)2部分组成,细菌可通过该系统感受外界环境变化,调控自身的生理过程以维持生存,是细菌适应选择压力的一种机制.该文以棘孢小单孢菌DSM 43816为研究对象,采用生物信息学方法系统分析了该菌株基因组内TCSs表达基因的分布、结构及功能.分析结果表明:棘孢小单孢菌DSM 43816基因组共编码35个组氨酸激酶和47个应答调控蛋白,其中包括21对配对的TCSs、2个杂合蛋白、14个孤儿HK蛋白、26个孤儿RR蛋白.这些配对的TCSs可能参与调控金属离子转运、硝酸盐和磷酸盐的代谢、生长运动、群体感应、应激反应、细菌毒力、细胞膜细胞壁的合成及抗生素的合成等多重生物学功能.研究结果可为揭示棘孢小单孢菌DSM 43816对环境的适应性机制、开发其生物活性化合物提供参考.
关键词
棘孢小单孢菌dsm
43816
双组分系统
组氨酸激酶
应答调控蛋白
生物信息学分析
Keywords
Micromonospora echinospora
dsm
43816
two-component system(TCS)
histidine kinase(HK)
response regulatory protein(RR)
bioinformatics analysis
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
棘孢小单孢菌DSM 43816双组分系统的生物信息学分析
龙雨欣
彭萱
张小梅
倪海燕
邹龙
龙中儿
《江西师范大学学报(自然科学版)》
北大核心
2024
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