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不同生境沙氏鹿茸草根际土壤细菌群落结构和多样性分析 被引量:1
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作者 李峰卿 刘素贞 +3 位作者 罗桂生 邹玉玲 黄维 曾满生 《林业科学》 北大核心 2025年第1期47-56,共10页
【目的】分析江西省内野生和人工栽培沙氏鹿茸草根际土壤细菌群落结构和多样性及其与土壤理化性质的关系,为构建沙氏鹿茸草健康的根际微环境,进一步探究沙氏鹿茸草仿野生栽培模式提供理论依据。【方法】应用高通量测序技术,比较油茶、... 【目的】分析江西省内野生和人工栽培沙氏鹿茸草根际土壤细菌群落结构和多样性及其与土壤理化性质的关系,为构建沙氏鹿茸草健康的根际微环境,进一步探究沙氏鹿茸草仿野生栽培模式提供理论依据。【方法】应用高通量测序技术,比较油茶、栀子、马尾松林下野生以及人工栽培2种生境下沙氏鹿茸草根际土壤细菌群落结构和多样性,结合根际土壤理化性质进行相关性分析。【结果】2种生境下,沙氏鹿茸草根际土壤理化性质差异显著,人工仿野生栽培的根际微生物Alpha多样性最高,但在各林分类型间差异未达显著水平;各生境下优势菌门均为变形菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、放线菌门,共有优势属包括卡氏伯克霍尔德菌属、慢生根瘤菌属、Candidatus_Solibacter、Occallatibacter、苔藓杆菌属和uncultured bacterium等有益菌;野生生境和人工栽培土壤细菌群落结构存在明显差异,人工栽培生境下变形菌门丰度最高;野生生境特有优势菌属(嗜酸栖热菌属、FCPS473、丛毛单胞菌属、酸杆菌属、未培养酸杆菌属、uncultured_forest_soil_bacterium等)的丰度在人工栽培生境下显著降低,而人工栽培生境特有优势细菌属(鞘脂单胞菌属、粒状胞菌属、嗜盐囊菌属、 Mucilaginibacter)的丰度较野生生境增加明显。冗余分析表明,根际细菌群落与土壤全氮、速效钾、碱解氮、有机质含量密切相关。【结论】在野生和人工栽培生境间,沙氏鹿茸草根际土壤理化性质、细菌群落结构具有显著差异,但野生生境沙氏鹿茸草根际细菌群落之间的相似性较高。土壤全氮、速效钾、碱解氮和有机质含量是影响细菌群落结构的主要环境因子。 展开更多
关键词 沙氏鹿茸草 土壤细菌 群落结构 生境
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卷丹百合健康与患根腐病根际土壤细菌群落结构差异
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作者 马杰 刘芳 +6 位作者 贺璐 傅淋 巩养仓 李偲 曾潜 肖才升 李庠 《西南农业学报》 北大核心 2025年第3期572-580,共9页
【目的】探索卷丹百合根腐病发生的微生态机制及优化根际土壤微生物群落结构,为进一步探明根腐病的微生态发病机理及生防菌的筛选提供理论依据。【方法】采用高通量测序技术,对连作种植卷丹百合健康与患根腐病根际土壤细菌16S V3V4基因... 【目的】探索卷丹百合根腐病发生的微生态机制及优化根际土壤微生物群落结构,为进一步探明根腐病的微生态发病机理及生防菌的筛选提供理论依据。【方法】采用高通量测序技术,对连作种植卷丹百合健康与患根腐病根际土壤细菌16S V3V4基因进行扩增并测序,分析健康与患病百合根际细菌群落结构。【结果】患根腐病百合与健康植株根际细菌群落物种之间差异显著,患病植株根际细菌类群多于健康植株,患病植株根际土壤细菌进化多样性显著高于健康植株,覆盖度则相反;变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)等为卷丹百合根际土壤优势菌群,患病百合根际土壤中变形菌门、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、放线菌纲(Actinobacteria)、伯克氏菌科(Burkholderiaceae)等的相对丰富度显著高于健康百合,绿弯菌门-AD3、Pedosphaeraceae等的相对丰度显著低于健康百合;功能预测分析表明,患病百合根际土壤细菌群落编码膜转运、脂质代谢、运输和分解代谢、异种生物降解和代谢等功能基因相对丰富度均显著高于健康百合和空白土壤。【结论】卷丹百合患根腐病和健康植株根际土壤细菌群落结构在一定程度上具有同源性,但两者之间部分菌群根际土壤中的多样性和丰度有显著差异,卷丹百合根腐病的发生可能与根际土壤中变形菌、放线菌、伯克氏菌等细菌的增殖密切相关。本研究为进一步探明百合根腐病发病机制及生防菌的筛选及应用提供理论依据。 展开更多
关键词 卷丹百合 腐病 土壤 细菌 群落
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炭基肥对辣椒生长及根际土壤细菌群落结构的影响
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作者 王薇薇 沈峰 +6 位作者 梅燚 吴永成 郑佳秋 张丽娜 冯汝超 祖艳侠 刘哲 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第4期692-701,共10页
为明确炭基肥对辣椒生长发育、养分吸收、土壤理化性质及微生物群落结构的影响,本研究采用盆栽试验,设置不施肥对照(CK)和施用等量氮素的N、P_(2)O_(5)、K_(2)O含量分别为15%、15%、15%的复合肥(HF),N、P_(2)O_(5)、K_(2)O含量分别为15%... 为明确炭基肥对辣椒生长发育、养分吸收、土壤理化性质及微生物群落结构的影响,本研究采用盆栽试验,设置不施肥对照(CK)和施用等量氮素的N、P_(2)O_(5)、K_(2)O含量分别为15%、15%、15%的复合肥(HF),N、P_(2)O_(5)、K_(2)O含量分别为15%、15%、15%的炭基肥1(TF1),N、P_(2)O_(5)、K_(2)O含量分别为15%、10%、10%的炭基肥2(TF2),N、P_(2)O_(5)、K_(2)O含量分别为10%、10%、10%的炭基肥3(TF3)等处理,分析生物炭与化肥按不同配比制备的炭基肥替代化肥对辣椒生长和根际土壤质量的影响。结果表明,与HF处理相比,TF1~TF3处理辣椒茎粗、单株根系干重、单株干果重和果实干物质分配比例均有所增加。TF1~TF3处理土壤全氮含量显著高于HF处理和CK。与HF处理相比,TF1~TF3处理果实对氮、磷、钾等营养元素的吸收量及分配比例均呈增加趋势。TF1~TF3处理下辣椒根际土壤细菌的Richness指数、Chao1指数、Ace指数、Shannon指数总体显著高于HF处理。不同施肥处理土壤细菌群落的优势菌门为酸杆菌门、变形菌门及芽单胞菌门,累计相对丰度为74.69%~82.46%。TF1、TF3和HF处理酸杆菌门细菌的相对丰度显著低于CK;TF1~TF3和HF处理的黏菌门细菌的相对丰度显著低于CK;HF处理Methylomirabilota门细菌的相对丰度高于CK和TF1~TF3处理。TF1~TF3处理芽单胞菌门细菌的相对丰度显著高于HF处理和CK。综上,炭基肥的应用不仅可以增强辣椒植株对养分的吸收能力,提高果实中养分的分配比例,还可以优化土壤理化特性,提高土壤微生物多样性,进而提高辣椒果实产量。 展开更多
关键词 炭基肥 养分吸收与分配 土壤理化性质 土壤细菌群落结构
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高寒黑土区不同轮作模式对马铃薯根际土壤细菌群落结构与功能的影响 被引量:1
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作者 王籽懿 韩伟 +2 位作者 金鸿飚 黄修梅 李明 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第2期286-295,共10页
为明确不同轮作模式对马铃薯根际土壤细菌群落的影响,本研究以马铃薯-小麦-甜菜-马铃薯(A处理)、马铃薯-水飞蓟-小麦-马铃薯(B处理)、小麦-甜菜-小麦-马铃薯(C处理),油菜-小麦-甜菜-马铃薯(D处理),小麦-油菜-大麦-马铃薯(E处理)和油菜-... 为明确不同轮作模式对马铃薯根际土壤细菌群落的影响,本研究以马铃薯-小麦-甜菜-马铃薯(A处理)、马铃薯-水飞蓟-小麦-马铃薯(B处理)、小麦-甜菜-小麦-马铃薯(C处理),油菜-小麦-甜菜-马铃薯(D处理),小麦-油菜-大麦-马铃薯(E处理)和油菜-小麦-马铃薯-马铃薯(CK,对照)6种种植模式为研究对象,采用细菌16S区的高通量测序技术,对比分析当地6种种植模式对马铃薯根际土壤细菌群落结构和功能的影响。结果表明,6种轮作模式的土壤样本共获得36420个扩增子序列变异(ASV),划分为45门、119纲、298目、451科、790属和357种。不同轮作模式马铃薯根际土壤主要优势菌群同为变形菌门、酸杆菌门、拟杆菌门、芽单胞菌门、放线菌门、浮霉菌门、疣微菌门、绿弯菌门、黏球菌门、髌骨菌门,但主要优势菌群的相对丰度在不同轮作模式中存在差异。与CK相比,轮作明显提高了细菌中酸杆菌门和芽单胞菌门细菌的相对丰度,而放线菌门细菌相对丰度明显降低,溶杆菌属细菌以及与碳、氮相关的功能菌相对丰度升高。组间群落差异分析(LEfSe)结果表明,在细菌群落中共鉴定出38个差异物种。通过基因功能预测发现,一级功能中新陈代谢的相对丰度最大(62.04%~62.46%),相对丰度大于1.0%的二级功能代谢通路有19类,其中碳水化合物代谢的相对丰度最高(12.93%~13.29%)。综上所述,轮作改变了土壤细菌群落结构,提高了土壤细菌中的优势功能菌,其中以小麦-甜菜-小麦-马铃薯轮作模式效果最好,更适宜高寒黑土区马铃薯产业的可持续发展。 展开更多
关键词 高寒黑土区 轮作模式 马铃薯 土壤 细菌群落结构 细菌群落功能
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胡椒枯萎病植株与健康植株根际土壤细菌群落结构差异性分析 被引量:1
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作者 和国优 张义杰 +6 位作者 白来远 鲁耀 卢木朴 王婧冉 王振充 瞿晓丽 孔垂思 《中国热带农业》 2025年第1期33-43,共11页
胡椒是我国重要的热带经济作物,而枯萎病是其主要病害之一。为了深入探究云南省绿春县枯萎病频发的原因,分析根际土壤细菌群落结构及其与土壤环境因子的关联,并揭示健康与发病状态下的胡椒根际土壤细菌群落及环境因子的差异,采集健康和... 胡椒是我国重要的热带经济作物,而枯萎病是其主要病害之一。为了深入探究云南省绿春县枯萎病频发的原因,分析根际土壤细菌群落结构及其与土壤环境因子的关联,并揭示健康与发病状态下的胡椒根际土壤细菌群落及环境因子的差异,采集健康和患枯萎病的胡椒植株根际土壤样本,通过16s扩增子测序技术和生物信息学方法,分析健康与患病样品间细菌群落多样性和组成变化,以及土壤环境因子与细菌群落的关联性。结果表明,患病植株根际土壤细菌群落的丰富度和多样性高于健康植株:在门水平上,患病植株根际土壤中放线菌门的相对丰度显著高于健康植株,但绿弯菌门和酸杆菌门的相对丰度与之相反;在属水平上,健康根际土壤中的嗜酸栖热菌属、HSB_OF53-F07、酸杆菌属、JG30a-KF-32、FCPS473相对丰度显著高于患病植株,患病的土微菌属、卢得曼氏菌属、鞘氨醇单胞属的相对丰度显著高于健康植株。LEfSe算法分析结果显示,健康与患病胡椒根际土壤所富集细菌差别较大;RDA分析表明,铵态氮、有机碳和脲酶活性是影响健康与患病胡椒根际细菌群落组成的关键因子。根际土壤细菌群落结构和环境因子与胡椒健康状态紧密相关,推测绿弯菌门和酸杆菌门等有益细菌门相对丰度显著减少和土壤酶活性的降低是导致枯萎病发生的关键因素,可为制定科学有效的防控策略提供理论基础。 展开更多
关键词 枯萎病 胡椒 细菌 土壤理化性质 多样性
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基于高通量测序分析微生物菌肥对烤烟根际土壤细菌群落结构和多样性的影响
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作者 李茜 杨惠娟 +5 位作者 赫英宇 李帅兵 王景 汪海燕 王惠 苗圃 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第16期236-246,共11页
为探究微生物菌肥对烤烟根际土壤微生物群落的影响,通过对比不同肥料处理下的土壤微生物特征,为优化烤烟栽培土壤管理策略提供科学依据。本研究于河南省洛阳市宜阳县开展大田试验,以明确微生物菌肥在改善烤烟土壤微生物生态方面的作用... 为探究微生物菌肥对烤烟根际土壤微生物群落的影响,通过对比不同肥料处理下的土壤微生物特征,为优化烤烟栽培土壤管理策略提供科学依据。本研究于河南省洛阳市宜阳县开展大田试验,以明确微生物菌肥在改善烤烟土壤微生物生态方面的作用。试验设置固态和液态微生物菌肥处理,并以化肥(黄腐酸钾)作为对照。通过高通量测序技术,系统分析不同肥料处理下烤烟根际土壤的细菌相对丰度、群落结构及数量变化。结果表明,施用微生物菌肥的烤烟根际土壤细菌相对丰度、群落结构与对照组间存在差异。具体表现为,土壤中放线菌门、变形菌门、黄色单胞菌目、硝化螺旋菌目、红螺菌属、硝化螺旋属等有益功能菌群的相对丰度与数量提高,而Blastocatellales目等特定菌群的丰度则有所降低。液态菌肥在提升土壤微生物群落多样性、优化群落结构方面表现出更为明显的效果。综上所述,施用微生物菌肥能够有效改善烤烟根际土壤的微生物群落结构,不仅促进了有益功能菌群的增殖,还激活了土壤中的功能性微生物群落,促进土壤中有益功能菌群增加,从而提升了土壤的整体健康水平,且液态菌肥对土壤微生物群落结构的改善效果更好。 展开更多
关键词 烤烟 土壤 微生物菌肥 微生物群落 高通量测序
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玉米倒茬与秸秆覆盖对连作马铃薯根际土壤细菌群落结构的影响
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作者 李金钰 谢奎忠 +2 位作者 胡新元 董博 陈松虎 《干旱地区农业研究》 北大核心 2025年第2期138-147,159,共11页
为了研究玉米倒茬和秸秆覆盖对长期连作马铃薯土壤的影响,试验在连续种植马铃薯8 a的土地上进行了4种不同的处理:对照组(CK),未进行任何处理;采用玉米秸秆覆盖(T_(1));先进行玉米倒茬,然后覆盖玉米秸秆(T_(2));仅进行玉米倒茬处理(T_(3)... 为了研究玉米倒茬和秸秆覆盖对长期连作马铃薯土壤的影响,试验在连续种植马铃薯8 a的土地上进行了4种不同的处理:对照组(CK),未进行任何处理;采用玉米秸秆覆盖(T_(1));先进行玉米倒茬,然后覆盖玉米秸秆(T_(2));仅进行玉米倒茬处理(T_(3))。通过高通量测序研究玉米倒茬与秸秆覆盖对马铃薯现蕾期根际土壤细菌群落结构和多样性的影响。结果表明:采用秸秆覆盖后马铃薯根际土壤细菌的丰富度均增长,T_(1)、T_(2)分别增长了3.72%和5.18%,但单独采用玉米倒茬降低了4.91%,并且玉米倒茬和秸秆覆盖会明显提高马铃薯根际土壤细菌的多样性,T_(1)、T_(2)、T_(3)较CK分别提高7.03%、8.03%、3.43%,处理间差异不显著。将不同处理马铃薯土壤样品细菌群落结构相似度进行聚类分析,按细菌相似度可将处理分为两大类,第一类包含CK和T_(1)处理组,第二类包含T_(2)和T_(3)处理组。玉米倒茬与秸秆覆盖下马铃薯根际土壤细菌的优势种群以放线菌门(Actinobacteriota)、变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、酸杆菌门(Acidobacteriota)、拟杆菌门(Bacteroidota)、芽单胞菌门(Gemmatimonadota)、黏球菌门(Myxococcota)为主。其中T_(1)处理的放线菌门(Actinobacteriota)较CK增长10.89%,T_(2)和T_(3)处理较CK分别降低4.83%和8.78%。与CK相比,3组处理变形菌门(Proteobacteria)相对丰度均增长,T_(2)增幅最高(33.44%)。各处理厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度较CK均降低,T_(2)较CK降低最多,为77.41%。T_(1)处理的绿弯菌门(Chloroflexi)相对丰度较CK增长29.09%,T_(2)和T_(3)处理较CK分别显著增长41.03%和34.45%(P<0.05)。各处理酸杆菌门(Acidobacteriota)相对丰度较CK均有所增长,T_(1)、T_(2)、T_(3)分别增长58.86%、27.69%、35.27%。环境因子关联度分析结果表明,土壤全磷含量、土壤脱氢酶活性是影响根际土壤细菌群落的主要环境因子。玉米倒茬和秸秆覆盖改善了土壤微环境,显著降低了有害菌属如芽孢杆菌属(Bacillus)的数量,尤其是T_(2)处理其数量显著降低了70.28%,有效缓解了马铃薯病害的传播与发生。 展开更多
关键词 马铃薯 连作障碍 玉米倒茬 秸秆覆盖 土壤细菌群落
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野生种和栽培种浙贝母根际土壤细菌群落结构分析及伴生菌群挖掘
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作者 蔡龙 孙健 +3 位作者 王盼 沈阳辉 江建铭 王志安 《浙江农业科学》 2025年第9期2137-2146,共10页
为探究浙贝母驯化栽培过程中菌群的变化情况,筛选优势伴生菌群。采集来自不同生长环境的浙贝母根际土壤样本,使用16S rDNA测序技术对其根际土壤细菌群落进行统计分析和功能预测,筛选浙贝母优势伴生菌群。结果表明,野生种和栽培种浙贝母... 为探究浙贝母驯化栽培过程中菌群的变化情况,筛选优势伴生菌群。采集来自不同生长环境的浙贝母根际土壤样本,使用16S rDNA测序技术对其根际土壤细菌群落进行统计分析和功能预测,筛选浙贝母优势伴生菌群。结果表明,野生种和栽培种浙贝母根际土壤细菌由51门131纲296目506科1105属1929种组成,α多样性分析Shannon和Chao1指数均表现为野生种浙贝母根际土壤菌落多样性高于栽培种。在门分类水平上,野生种浙贝母根际土壤的厚壁菌门(Firmicutes)、酸杆菌门(Acidobacteriota)、粘菌门(Myxococcota)菌群的丰度高于栽培种,为栽培种均值的3.0倍以上;绿弯菌门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidota)等菌群丰度则下降,为栽培种均值的30%以下。在属分类水平上,野生种浙贝母根际土壤的剑菌属(Ensifer)等11个属的丰度高于栽培种。野生种和栽培种浙贝母根际土壤共有伴生菌属主要为假单胞菌属(Pseudomonas)、α-变形菌属(Alphaproteobacteria)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)、伯克霍尔德菌属(Burkholderia)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)。本研究为开发浙贝母微生物菌剂、优化浙贝母栽培模式、缓解栽培种浙贝母病害等奠定了基础。 展开更多
关键词 浙贝母 土壤细菌 16S rDNA
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不同地区柑橘根际土壤细菌群落结构及功能预测分析
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作者 袁昭弟 蒋俊杰 +7 位作者 胡礼川 段婷婷 杨俊 朱惠敏 张海鸿 张小夏 朱利君 付强 《耕作与栽培》 2025年第2期8-18,36,共12页
为探究不同地区柑橘园土壤细菌群落的结构、功能与养分可用性,对绵阳市3个采样点9个样品进行土壤理化分析,结合高通量测序技术比较河边镇(A组)、黄土镇(B组)和花荄镇(C组)柑橘根际土壤细菌群落多样性、结构及功能的差异,并挖掘不同地区... 为探究不同地区柑橘园土壤细菌群落的结构、功能与养分可用性,对绵阳市3个采样点9个样品进行土壤理化分析,结合高通量测序技术比较河边镇(A组)、黄土镇(B组)和花荄镇(C组)柑橘根际土壤细菌群落多样性、结构及功能的差异,并挖掘不同地区的优势细菌,分析环境因素对细菌结构和功能的影响。结果表明,柑橘根际土壤细菌群落丰富度A组显著高于B组和C组,而A组细菌群落多样性最高,其次为B组,C组最低。主成分分析表明,不同地区柑橘根际土壤细菌群落结构具有明显差异;冗余分析表明,土壤有机碳和pH值是影响柑橘根际土壤细菌群落结构和功能的重要因子。在门水平上,A、B、C组对应的优势菌门分别为酸杆菌门(Acidobacteriota)、变形菌门(Proteobacteria)以及拟杆菌门(Bacteroidota)。属水平上,未鉴定细菌属Vicinamibacterales、Gemmatimonadaceae是A组的优势细菌属,朱氏杆菌属(Chujaibacter)和芽孢八叠球菌属(Sporosarcina)是B组的优势细菌属,而C组优势细菌属为鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)和未鉴定细菌属Chitinophagaceae。根据PICRUST功能预测分析,土壤细菌的功能途径主要集中在新陈代谢、遗传信息处理和环境信息处理等方面。 展开更多
关键词 柑橘 土壤 高通量测序 细菌群落结构 功能预测 土壤理化
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不同种植年限川党参根际土壤细菌群落结构研究
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作者 罗敏 朱晓富 +5 位作者 徐广 罗舜 卢胜鄂 郭瑀 杨丹 邓才富 《中国土壤与肥料》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期32-39,共8页
为了探究生长年限对川党参根际土壤细菌群落结构特征及其多样性的影响,阐明细菌群落变化规律,采用Illumina MiSeq高通量测序技术对1年生、2年生、3年生和4年生的川党参根际土壤细菌16S rRNA序列进行测序分析。结果表明:(1)生长年限显著... 为了探究生长年限对川党参根际土壤细菌群落结构特征及其多样性的影响,阐明细菌群落变化规律,采用Illumina MiSeq高通量测序技术对1年生、2年生、3年生和4年生的川党参根际土壤细菌16S rRNA序列进行测序分析。结果表明:(1)生长年限显著影响川党参根际土壤细菌群落多样性,其OTU数、Alpha多样性指数均随生长年限增加呈先升高后降低的趋势;(2)生长年限改变了细菌群落组成,但在门水平上优势菌门(相对丰度>5%)相对稳定,均为变形菌门(Proteobacteria)、未分类细菌门(unclassified_Bacteria)、酸杆菌门(Aci-dobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和绿弯菌门(Chloroflexi),其相对丰度总和占85.71%~91.39%;在属水平上优势菌群相差较大,仅有全噬菌属(Holophaga)和念珠菌属(Candidatus Udaeo-bacter)是4个年限所共有的优势菌属,革兰氏阴性菌cTPY-13(Gram-negative bacterium cTPY-13)则为2年生独有优势菌属,其余则分别为不同年限有相应共有优势菌属;(3)PCoA分析与UPGMA聚类分析显示,各生长年限间细菌群落差异明显,随生长年限增加,不同组间细菌群落结构差异先增大后逐渐减小,细菌群落在2~3年生时演变较为剧烈;(4)土壤速效养分是影响根际土壤细菌群落的主要环境因子,其程度大小为水解氮(HN)>有效磷(AP)>速效钾(AK),优势菌门中酸杆菌门与AP、AK呈显著负相关(P<0.05),拟杆菌门与AP、AK呈显著正相关(P<0.05),而绿弯菌门与HN呈显著负相关(P<0.05)。综上所述,川党参生长年限延长会影响根际土壤细菌群落结构和多样性,从而改变其根际微生态系统。 展开更多
关键词 川党参 土壤 细菌群落 高通量测序
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大豆和玉米茬口对冬小麦根际土壤细菌群落结构和功能的影响 被引量:2
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作者 郭辉 连延浩 +3 位作者 赵志博 任永哲 王志强 林同保 《河南农业科学》 北大核心 2024年第7期79-89,共11页
为探明黄淮海地区玉米茬口和大豆茬口微生物遗留效应的差异,于2023年在长达4 a(2019—2023年)的长期定位试验田中采集冬小麦拔节期的根际土壤样品,采用16S高通量测序技术并结合Tax4Fun2功能预测分析,研究玉米茬口(M)和大豆茬口(S)下冬... 为探明黄淮海地区玉米茬口和大豆茬口微生物遗留效应的差异,于2023年在长达4 a(2019—2023年)的长期定位试验田中采集冬小麦拔节期的根际土壤样品,采用16S高通量测序技术并结合Tax4Fun2功能预测分析,研究玉米茬口(M)和大豆茬口(S)下冬小麦拔节期根际土壤细菌群落结构及功能对不施氮(N0)和常规施氮(N240,纯氮240 kg/hm2)共4个处理(MN0、SN0、MN240、SN240)的响应。结果表明,门水平下,变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteriota)为冬小麦拔节期根际优势菌门,优势菌门相对丰度为66.66%~69.56%。N0施氮量S茬口的拟杆菌门相对丰度比M茬口显著增加了19.10%(P<0.05);N240施氮量S茬口的变形菌门相对丰度比M茬口显著增加了11.90%(P<0.05)。目水平下,Vicinamibacterales与伯克氏菌目(Burkholderiales)为优势菌目,优势菌目相对丰度为18.42%~19.68%。N0施氮量S茬口的Vicinamibacterales相对丰度比M茬口显著减少了13.69%(P<0.05),伯克氏菌目相对丰度显著增加了11.31%(P<0.05)。通过Tax4Fun2功能预测,与KEGG数据库对比发现,N0施氮量下新陈代谢分类中的7个二级功能途径相对丰度存在显著差异(P<0.05);进一步通过相关性分析发现,Vicinamibacterales和伯克氏菌目与氨基酸代谢途径存在极显著相关关系(P<0.01)。冬小麦土壤细菌有26个功能基因参与土壤氮循环途径,其中反硝化功能基因相对丰度最高。N0施氮量M茬口的norB、norC、nirS型反硝化功能基因相对丰度显著高于S茬口(P<0.05)。综上,不同施氮量下茬口均造成冬小麦拔节期根际土壤细菌群落结构发生变化,不同茬口通过改变根际土壤细菌群落结构进一步影响细菌群落氮代谢功能。 展开更多
关键词 冬小麦 大豆茬口 玉米茬口 土壤 细菌群落结构 功能预测 氮循环
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不同生物反应堆对设施黄瓜根际土壤细菌群落结构多样性的影响 被引量:1
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作者 王嘉 王艳霞 +2 位作者 潘璐 宋阳 李晓静 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期170-178,共9页
研究不同生物反应堆处理对设施黄瓜根际土壤细菌群落结构及多样性的影响,旨在为黄瓜根际土壤改良和设施土壤可持续利用提供理论依据和现实基础。以16S rRNA基因V3-V4区为基础,设置原始温室土壤(CK),未经处理的黄瓜根际土壤100(CK1),200 ... 研究不同生物反应堆处理对设施黄瓜根际土壤细菌群落结构及多样性的影响,旨在为黄瓜根际土壤改良和设施土壤可持续利用提供理论依据和现实基础。以16S rRNA基因V3-V4区为基础,设置原始温室土壤(CK),未经处理的黄瓜根际土壤100(CK1),200 d(CK2),玉米秸秆生物反应堆处理100(S1),200 d(S2)的根际土壤,羊粪生物反应堆处理100(M1),200 d(M2)的根际土壤7个处理,使用Illumina Miseq高通量测序技术对不同生物反应堆处理下的设施黄瓜进行根际土壤细菌群落多样性、结构、理化性质分析。结果表明,土壤样品经测序后共得到6344个OTUs,主要隶属于39门315目980属;M2处理可提高黄瓜根际土壤细菌丰富度,并显著增加细菌群落多样性。在门水平上,玉米秸秆生物反应堆处理和羊粪生物反应堆处理土壤细菌门水平优势种群结构相似,其中放线菌门和变形菌门是优势菌门;在属水平上,norank_f_JG30-KF-CM、节杆菌属、norank_f_norank_o_Gaiellales、norank_f_67-14、芽球菌属、Gaiella、火山岩海球菌属(Marmoricola)在不同处理之间有显著差异;从细菌群落丰度组成情况来看,M2处理和S2处理在一定程度上提高了黄瓜根际部分有益细菌类群相对丰度;RDA分析表明,土壤细菌群落受土壤环境因子的影响显著,铵态氮含量(P=0.015)、全钾含量(P=0.002)、速效钾含量(P=0.005)对细菌群落影响显著。因此,M2处理可提高设施黄瓜根际土壤细菌丰富度、增加细菌群落多样性、改变细菌群落结构,有利于设施黄瓜根际土壤的改良。 展开更多
关键词 设施黄瓜 土壤 生物反应堆 细菌群落 高通量测序
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生物炭对不同黑胫病抗性烤烟品种根际土壤细菌群落结构的影响 被引量:1
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作者 李澳 任志超 +5 位作者 李想 李彦周 王景 穆耀辉 刘国顺 殷全玉 《山东农业科学》 北大核心 2024年第10期102-112,126,共12页
本试验旨在探究不同品种烟草根际土壤中添加生物炭对细菌群落结构的潜在影响,以期为完善和优化烤烟微环境调节措施以及黑胫病综合防治策略提供理论支撑。通过盆栽试验,选用3种对黑胫病抗性不同的烤烟品种净叶黄(高感),NC82(高抗),K326(... 本试验旨在探究不同品种烟草根际土壤中添加生物炭对细菌群落结构的潜在影响,以期为完善和优化烤烟微环境调节措施以及黑胫病综合防治策略提供理论支撑。通过盆栽试验,选用3种对黑胫病抗性不同的烤烟品种净叶黄(高感),NC82(高抗),K326(中抗),以未种植过烟草的土壤为空白对照,分别设置施生物炭与未施生物炭处理,利用高通量测序技术研究生物炭对烤烟根际土壤细菌群落结构以及黑胫病发病状况的影响。结果表明:(1)未施用生物炭时,不同品种烟草的发病率表现为净叶黄显著高于另外两个品种;施用生物炭后,各品种的黑胫病发病率显著降低,净叶黄的防治效果为56.52%,NC82及K326的分别为27.00%和31.00%。(2)土壤细菌群落Alpha多样性分析结果显示,生物炭与烤烟品种之间存在显著的交互作用。未施用生物炭时,NC82和净叶黄的根际土壤细菌多样性显著高于K326;施加生物炭后,K326的土壤细菌多样性明显提升,而NC82和净叶黄呈现出不同程度的下降。(3)LEfSe结果显示,不同品种间根际土壤优势菌群呈现显著差异,生物炭的施用使品种间的差异更加明显。(4)细菌群落结构与组成分析结果表明,未施用生物炭情况下,不同品种烤烟之间土壤细菌群落结构存在显著差异;除未植烟土壤外,施加生物炭前后不同烤烟品种间土壤细菌群落结构均无显著变化。综合来看,施加生物炭可以有效遏制烤烟黑胫病的滋生蔓延,不同品种烤烟土壤细菌结构对生物炭施入的反应有所差异,在运用生物炭改善土壤质量以及烟草微观生态环境的过程中,必须充分考虑到品种因素的影响。 展开更多
关键词 生物炭 黑胫病 烤烟 土壤 细菌群落结构
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不同样地白木香结香前后根际土壤细菌群落结构差异与土壤理化性质相关性研究 被引量:1
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作者 李思 徐诗涛 +2 位作者 王德立 张梦真 李慧婷 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第7期1489-1497,共9页
为阐明白木香结香前后根际细菌群落差异,并探讨与土壤理化性质的相关性。本研究采用高通量测序技术和生物信息学相关手段,对海南省3个种植地(海口市文山村、临高东光农场、乐东抱伦农场)白木香结香前后根际土壤细菌群落组成和多特征进... 为阐明白木香结香前后根际细菌群落差异,并探讨与土壤理化性质的相关性。本研究采用高通量测序技术和生物信息学相关手段,对海南省3个种植地(海口市文山村、临高东光农场、乐东抱伦农场)白木香结香前后根际土壤细菌群落组成和多特征进行分析,并结合冗余分析对根际土壤理化性质与细菌群落进行相关性分析。结果表明:3个样地间共获得7944402条序列,隶属于51个门,151个纲,380个目,637个科,1296个属,2649个种;样地内结香前后细菌群落和多样性差异性不大,样地间存在显著差异。3个样地根际土壤细菌丰富度和多样性上均呈现为:LDJX>LDWJ>LGWJ>LGJX>WSWJ>WSJX。在群落结构上,乐东样地与文山和临高样地群落结构存在显著差异。在门水平上,乐东样地的优势细菌门为浮霉菌门(Planctomycetota)、绿弯菌门(Chloroflexi)、疣微菌门(Verrucomicrobiota);文山和临高样地的菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidota)、变形菌门(Proteobacteria)。在属水平上,文山和临高的优势属为拟杆菌属(Bacteroides)、uncultured_bacterium_f Muribaculaceae、粪杆菌属(Faecalibacterium);乐东优势属为未确定属(g_uncultured_f__Gemmataceae)、Candidatus_Udaeobacter和拟杆菌属(Bacteroides)。对RDA分析发现,不同样地间白木香根际土壤细菌群落受土壤理化因子的影响具有一定差异。全磷与细菌种群差异和多样性呈显著负相关,pH与细菌种群差异和多样性呈显著正相关。该研究结果对白木香根际微生物互作关系研究具有参考价值,对海南沉香产业发展具有指导意义。 展开更多
关键词 白木香 土壤 细菌多样性 理化性质 相关性
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环境因子对西藏野生手掌参根际土壤细菌群落结构的影响 被引量:4
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作者 尹秀 张二豪 +4 位作者 李谊 普姆 刘亚可 禄亚洲 兰小中 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期835-843,共9页
[目的]探究环境因子对西藏野生手掌参根际土壤细菌群落结构的影响。[方法]选取废弃木材厂(FM)、林芝观景台(LZ)、林海观景台(LH)和雷达站(LD)4个采样点采集土壤样品,采用高通量测序技术分析不同海拔手掌参根际土壤细菌群落多样性和群落... [目的]探究环境因子对西藏野生手掌参根际土壤细菌群落结构的影响。[方法]选取废弃木材厂(FM)、林芝观景台(LZ)、林海观景台(LH)和雷达站(LD)4个采样点采集土壤样品,采用高通量测序技术分析不同海拔手掌参根际土壤细菌群落多样性和群落结构特征及不同环境因子对其多样性和结构的影响。[结果]所有样品共检测32门、90纲、224目、378科和693属细菌,变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)为优势门,慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)和金黄杆菌属(Chryseobacterium)为优势属。随着海拔的升高,手掌参根际土壤细菌群落多样性和丰富度增加,且不同采样点土壤细菌群落多样性的组间差异大于组内差异。[结论]海拔、总钾(TK)、pH和电导率(EC)显著影响根际土壤细菌群落在门水平的组成,总钾(TK)、总磷(TP)和海拔3种环境因子对土壤细菌群落组成在属水平上的影响更明显。 展开更多
关键词 手掌参 环境因子 土壤细菌 群落多样性 群落结构
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宁夏荒漠草原典型灌丛根际土壤细菌群落结构与功能 被引量:7
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作者 姚佳妮 代金霞 +2 位作者 刘爽 张钧杰 胡明珠 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第20期9285-9299,共15页
土壤微生物群落组成和功能特性对维持生态系统功能至关重要,明确荒漠土壤微生物群落结构、群落功能及其环境响应特征对维持生态系统稳定性及多样性保护具有重要意义。对宁夏白芨滩荒漠草原内柠条(Caragana spp.)、沙冬青(Ammopiptanthus... 土壤微生物群落组成和功能特性对维持生态系统功能至关重要,明确荒漠土壤微生物群落结构、群落功能及其环境响应特征对维持生态系统稳定性及多样性保护具有重要意义。对宁夏白芨滩荒漠草原内柠条(Caragana spp.)、沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)、毛刺(Caragana tibetica)和猫头刺(Oxytropis aciphylla)4种典型豆科灌丛不同发育期根际土壤样品进行了16S rRNA和宏基因组高通量测序,研究了荒漠草原生境下豆科灌丛根际土壤细菌群落结构与功能和根际碳、氮循环特征,并分析了影响微生物群落的关键环境因子。结果表明:4种灌丛果实期根际土壤细菌群落的丰富度和多样性较高,而不同灌丛之间无显著差异。放线菌门、变形菌门和酸杆菌门等优势类群相对丰度在灌丛间有差异但差异不显著。其中放线菌门(32.98%—44.53%)是根际最优势门类,其次为变形菌门、酸杆菌门和绿弯菌门;共有322个核心细菌属,多样性较为丰富。节杆菌属、红色杆菌属和微枝杆菌属为可定义的优势属。根际土壤微生物功能途径因灌丛种类和发育期的不同而有差异。蛋白质直系同源簇数据库(COG)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能注释表明,4种灌丛根际土壤中仍存在大量未知的功能类群有待挖掘,参与能量生成和转化、碳水化合物转运代谢和信号转导等功能群落在4种土壤间具有显著差异。在KEGG level 1水平下与代谢相关的功能类群丰度最高,平均占比73.05%。碳、氮循环特征分析表明,碳固定中还原性柠檬酸循环途径相关基因丰度较高,氮循环中有机氮代谢途径相关基因丰度较高。柠条根际土壤微生物参与碳、氮固定的基因丰度较其它3种土壤高。冗余分析(RDA)表明,放线菌门、厚壁菌门与土壤全氮(TN)、铵态氮(NH+4-N)、总磷(TP)和有效磷(AP),变形菌门与pH显著正相关,酸杆菌门与AP、速效钾(AK)和pH显著负相关;碳固定途径与土壤氮、磷元素均显著正相关;NH+4-N、亚销态氮(NO-2-N)和TP与固氮途径,硝态氮(NO-3-N)与有机氮代谢和反硝化途径显著正相关。研究结果为了解荒漠草原生境中植物根际土壤微生物多样性及其基因资源、土壤微生物群落的环境响应特征及其适应机制奠定基础。 展开更多
关键词 豆科灌丛 16S rRNA测序 宏基因组测序 土壤细菌多样性 碳循环基因 氮循环基因
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甘薯基部腐烂病对植株根际土壤细菌群落结构的影响 被引量:1
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作者 陈海生 唐超文 +2 位作者 刘守平 陈伟强 侯金祥 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1194-1202,共9页
【目的】探明甘薯茎基部腐烂病发生机制,为构建该病害的绿色防控体系提供依据。【方法】以处于南北薯区交接带、南北甘薯病害发生区的浙江省台州市黄岩区西部山区为研究对象,采用Illumina高通量测序技术,对比研究甘薯茎基部腐烂病发病... 【目的】探明甘薯茎基部腐烂病发生机制,为构建该病害的绿色防控体系提供依据。【方法】以处于南北薯区交接带、南北甘薯病害发生区的浙江省台州市黄岩区西部山区为研究对象,采用Illumina高通量测序技术,对比研究甘薯茎基部腐烂病发病甘薯植株与健康甘薯植株的根际土壤细菌群落结构和多样性,及其根际土壤酶包括土壤脲酶、蔗糖酶和碱性磷酸酶活性。【结果】甘薯茎基部腐烂病显著降低了植株根际土壤脲酶、蔗糖酶和碱性磷酸酶活性,提高了根际土壤细菌多样性指数。在门分类水平上,该病害显著降低了其植株根际土壤放线菌门、疣微菌门和拟杆菌门相对丰度,显著提高了绿湾菌门和Candidate-division-wps-2菌群的相对丰度。在属分类水平上,该病害显著提高了植株根际土壤细菌GP_(1)、未分类的厚壁菌属和芽单胞菌属的相对丰度,显著降低了未分类的链霉菌属、链嗜酸菌属、伯克霍尔德菌属等菌群的相对丰度。【结论】甘薯茎基部腐烂病降低了其植株根际脲酶、蔗糖酶和碱性磷酸酶活性,改变了甘薯根际土壤细菌群落的结构和多样性。 展开更多
关键词 甘薯茎基部腐烂病 高通量测序 根际土壤细菌群落结构 土壤酶活性
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盐地碱蓬根际土壤细菌群落结构及其功能 被引量:47
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作者 孙建平 刘雅辉 +3 位作者 左永梅 韩民利 张虹伟 吕晶晶 《中国生态农业学报(中英文)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1618-1629,共12页
盐地碱蓬作为生物改良盐碱地的理想材料,其根际土壤微生物对土壤改良发挥着重要作用。为了深入探索环渤海滨海盐碱地碱蓬根际土壤细菌群落结构组成及其功能,采用Illumina Misep高通量测序平台对环渤海地区滨海盐碱地盐地碱蓬根际土壤和... 盐地碱蓬作为生物改良盐碱地的理想材料,其根际土壤微生物对土壤改良发挥着重要作用。为了深入探索环渤海滨海盐碱地碱蓬根际土壤细菌群落结构组成及其功能,采用Illumina Misep高通量测序平台对环渤海地区滨海盐碱地盐地碱蓬根际土壤和裸地土壤进行测序。从16个样本中获得有效序列734792条,4285个OTUs,归属于41门、100纲、282目、400科、892属、1577种。盐地碱蓬根际土壤细菌群落由变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、绿弯曲门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、蓝藻细菌门(Cyanobacteria)、髌骨细菌门(Patescibacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)组成。Alpha多样性计算结果表明,盐地碱蓬根际土壤细菌群落结构多样性高并与裸地土壤间差异显著;LEfSe(LDAEffectSize)分析发现,盐地碱蓬与裸地差异指示种明显不同。PCoA与相关性Heatmap表明,盐地碱蓬、速效氮、速效钾、速效磷、电导率是影响土壤细菌目类水平群落组成的主要因子。PICRUSt(Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States)分析表明微生物群落在新陈代谢等40个功能方面盐地碱蓬根际土壤比裸地土壤高。本研究表明盐地碱蓬覆盖能够降低土壤盐分,增加土壤养分,对土壤细菌群落多样性及其功能有积极作用。 展开更多
关键词 高通量测序 滨海盐碱地 盐地碱蓬 土壤 细菌群落结构 细菌群落功能
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施氮和间作花生对木薯根际土壤细菌群落结构的影响 被引量:9
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作者 林洪鑫 袁展汽 +3 位作者 肖运萍 汪瑞清 吕丰娟 张志华 《中国土壤与肥料》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期56-65,共10页
在等量施肥条件下,木薯间作一季花生,是否具有间作优势,间作模式中木薯根际土壤细菌群落结构如何变化,相关研究报道较少。以木薯品种"华南205"、花生品种"粤油200"为试验材料,设计施氮、不施氮2个处理和等量施肥条... 在等量施肥条件下,木薯间作一季花生,是否具有间作优势,间作模式中木薯根际土壤细菌群落结构如何变化,相关研究报道较少。以木薯品种"华南205"、花生品种"粤油200"为试验材料,设计施氮、不施氮2个处理和等量施肥条件下的3种种植模式(木薯单作、花生单作、木薯间作花生),采用高通量测序技术,研究施氮和间作花生对木薯根际土壤细菌群落结构的影响。结果表明,在等量施肥条件下,木薯-花生间作的土地当量比大于1,表现出间作优势。施氮和间作花生对木薯根际土壤细菌的多样性无显著影响。4个优势细菌门类依次为绿弯菌门、变形菌门、放线菌门和酸杆菌门。不同处理间的菌门Saccharibacteria的差异极显著,施氮显著降低了疣微菌门的相对丰度。木薯根际土壤细菌的属数量共464个。相对丰度排名前30的菌属中,不同处理间菌属Acidobacteriaceae__Subgroup_1_和Sphingomonas的差异达显著或极显著水平,施氮显著降低了菌属Subgroup_7的相对丰度,显著提高了菌属Acidothermus的相对丰度。主成分分析表明,施氮对细菌群落组成的影响大于种植模式;冗余分析得出,有机质、pH值显著影响细菌属水平群落组成。 展开更多
关键词 木薯 间作花生 施氮 土壤 细菌 群落结构
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施氮和木薯间作对成熟期花生根际土壤细菌群落结构的影响 被引量:9
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作者 林洪鑫 袁展汽 +3 位作者 肖运萍 汪瑞清 吕丰娟 张志华 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期723-733,共11页
为明确相同施肥量条件下木薯-花生间作与花生单作的成熟期根际土壤细菌群落特征差异,以木薯品种华南205和花生品种粤油200为试验材料,设计2个施氮水平(施氮、不施氮)和3种种植模式(木薯单作、花生单作、木薯间作3行花生),采用高通量测... 为明确相同施肥量条件下木薯-花生间作与花生单作的成熟期根际土壤细菌群落特征差异,以木薯品种华南205和花生品种粤油200为试验材料,设计2个施氮水平(施氮、不施氮)和3种种植模式(木薯单作、花生单作、木薯间作3行花生),采用高通量测序技术,研究了施氮和木薯间作对成熟期花生根际土壤细菌群落结构的影响。结果表明,在相同施肥量条件下,木薯间作花生模式的土地当量比大于1,表现出间作优势,土地利用率提高49%~60%。成熟期花生根际土壤细菌4个优势类群依次为Chloroflexi、Proteobacteria、Actinobacteria和Acidobacteria,合计比例84.42%~84.59%。花生根际土壤细菌的属数量共477个。施氮和木薯间作对花生根际土壤细菌的α多样性无显著影响。木薯间作显著降低了Proteobacteria的相对丰度,降幅18.12%。在相对丰度排名前30的菌属中,不同处理组合间TK10和Roseiflexus的差异达显著水平;施氮显著降低了菌属Candidatus_Solibacter、Acidimicrobiales和Amycolatopsis的相对丰度,降幅分别为41.18%、33.11%和71.98%。冗余分析表明,有效磷、pH显著影响细菌花生根际土壤属水平群落组成。本研究结果为明确间作体系中花生根际微生态环境提供理论依据。 展开更多
关键词 木薯-花生间作 施氮 土壤 细菌 群落结构
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