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侵蚀黑土玉米和大豆根部伴生细菌群落结构分析
1
作者
喻江
范国权
+4 位作者
IKENAGA Makoto
SAKAI Masao
王光华
刘晓冰
于镇华
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期232-240,共9页
为分析东北侵蚀黑土中大豆和玉米根部伴生细菌群落结构多样性,促进土壤侵蚀过程中其根部伴生细菌群落结构响应规律的研究,本研究结合LNA-PCR技术和高通量测序方法,模拟东北黑土侵蚀土壤,分析玉米播种期和抽穗期、大豆开花期根部细菌群...
为分析东北侵蚀黑土中大豆和玉米根部伴生细菌群落结构多样性,促进土壤侵蚀过程中其根部伴生细菌群落结构响应规律的研究,本研究结合LNA-PCR技术和高通量测序方法,模拟东北黑土侵蚀土壤,分析玉米播种期和抽穗期、大豆开花期根部细菌群落结构多样性和差异。结果表明:土壤表层剥离后大豆根部细菌群落多样性降低,而玉米根部细菌群落多样性变化不显著。变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)为大豆和玉米根部伴生细菌共有的优势菌门。属水平上,Acinetobacter、Rhodanobacter、Steroidobacter和Dyella主要在玉米根部获得,而Bacillus、Arenimonas、Variovorax、Propionibacterium、gnorankp和CandidatedivisionTM7主要在大豆根部发现。本研究首次发现Candidate division TM7也是植物伴生细菌的成员,其序列主要划分为α、β和γ 3个簇,有97.5%的序列属于α簇。研究证实了植物根部伴生细菌群落结构不仅具有宿主特异性,且易受土壤侵蚀影响。
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关键词
LNA-PCR
高通量测序
土壤侵蚀
根部伴生细菌
群落结构
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题名
侵蚀黑土玉米和大豆根部伴生细菌群落结构分析
1
作者
喻江
范国权
IKENAGA Makoto
SAKAI Masao
王光华
刘晓冰
于镇华
机构
中国科学院东北地理与农业生态研究所/黑土区农业生态重点实验室
哈尔滨商业大学
黑龙江省农业科学院马铃薯研究所
日本鹿儿岛大学农学院
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期232-240,共9页
基金
黑龙江省自然科学基金(D2018008)
中国科学院青年创新促进会项目(2019233)
哈尔滨商业大学博士科研启动项目(2019DS103)。
文摘
为分析东北侵蚀黑土中大豆和玉米根部伴生细菌群落结构多样性,促进土壤侵蚀过程中其根部伴生细菌群落结构响应规律的研究,本研究结合LNA-PCR技术和高通量测序方法,模拟东北黑土侵蚀土壤,分析玉米播种期和抽穗期、大豆开花期根部细菌群落结构多样性和差异。结果表明:土壤表层剥离后大豆根部细菌群落多样性降低,而玉米根部细菌群落多样性变化不显著。变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)为大豆和玉米根部伴生细菌共有的优势菌门。属水平上,Acinetobacter、Rhodanobacter、Steroidobacter和Dyella主要在玉米根部获得,而Bacillus、Arenimonas、Variovorax、Propionibacterium、gnorankp和CandidatedivisionTM7主要在大豆根部发现。本研究首次发现Candidate division TM7也是植物伴生细菌的成员,其序列主要划分为α、β和γ 3个簇,有97.5%的序列属于α簇。研究证实了植物根部伴生细菌群落结构不仅具有宿主特异性,且易受土壤侵蚀影响。
关键词
LNA-PCR
高通量测序
土壤侵蚀
根部伴生细菌
群落结构
Keywords
LNA-PCR
High-throughput sequencing
Soil erosion
Root-associated bacteria
Communities structure
分类号
S513 [农业科学—作物学]
S565.1 [农业科学—作物学]
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作者
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1
侵蚀黑土玉米和大豆根部伴生细菌群落结构分析
喻江
范国权
IKENAGA Makoto
SAKAI Masao
王光华
刘晓冰
于镇华
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021
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