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西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析(英文)
1
作者
冯燕丽
马欣荣
+2 位作者
夏庆杰
谈心
张义正
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期76-83,共8页
西藏胡黄连是著名的濒危西藏药材,其粗壮的根茎部是重要的合成和储存药用萜类物质器官,萜类含量显著高于叶部。为克隆西藏胡黄连根状茎和叶的差异表达基因,利用抑制消减杂交技术,构建了根状茎特定的抑制消减文库。从该SSH文库中随机挑...
西藏胡黄连是著名的濒危西藏药材,其粗壮的根茎部是重要的合成和储存药用萜类物质器官,萜类含量显著高于叶部。为克隆西藏胡黄连根状茎和叶的差异表达基因,利用抑制消减杂交技术,构建了根状茎特定的抑制消减文库。从该SSH文库中随机挑取片段不一的阳性克隆测序,采用B lastx进行同源比对,获得了27个表达序列标签(EST),并获登录号。序列统计分析结果表明,其中有11个EST在GenBank中无同源性序列,推测可能是新基因片断。蛋白质功能分类结果表明,这些蛋白质与翻译、能量代谢、转运与结合、细胞膜合成、氨基酸生物合成及中间代谢6大类蛋白功能有关。为深入研究与萜类生物合成直接或间接相关基因,选择了长595 bp的差异表达EST序列EX172715进行了同源比对和蛋白系统进化分析。结果表明,EX172715具有细胞色素P450单加氧酶的特征结构,与拟南芥的细胞色素P450单加氧酶蛋白的同源性高于水稻和小麦。提供了一组与西藏胡黄连次生代谢相关的新基因库。
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关键词
西藏胡黄连
根状茎特异表达基因
抑制消减杂交
表达
序列标签
同源性分析
细胞色素P450单加氧酶
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题名
西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析(英文)
1
作者
冯燕丽
马欣荣
夏庆杰
谈心
张义正
机构
四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室
中国科学院成都生物研究所
四川大学华西医学院
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期76-83,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(30572337)
文摘
西藏胡黄连是著名的濒危西藏药材,其粗壮的根茎部是重要的合成和储存药用萜类物质器官,萜类含量显著高于叶部。为克隆西藏胡黄连根状茎和叶的差异表达基因,利用抑制消减杂交技术,构建了根状茎特定的抑制消减文库。从该SSH文库中随机挑取片段不一的阳性克隆测序,采用B lastx进行同源比对,获得了27个表达序列标签(EST),并获登录号。序列统计分析结果表明,其中有11个EST在GenBank中无同源性序列,推测可能是新基因片断。蛋白质功能分类结果表明,这些蛋白质与翻译、能量代谢、转运与结合、细胞膜合成、氨基酸生物合成及中间代谢6大类蛋白功能有关。为深入研究与萜类生物合成直接或间接相关基因,选择了长595 bp的差异表达EST序列EX172715进行了同源比对和蛋白系统进化分析。结果表明,EX172715具有细胞色素P450单加氧酶的特征结构,与拟南芥的细胞色素P450单加氧酶蛋白的同源性高于水稻和小麦。提供了一组与西藏胡黄连次生代谢相关的新基因库。
关键词
西藏胡黄连
根状茎特异表达基因
抑制消减杂交
表达
序列标签
同源性分析
细胞色素P450单加氧酶
Keywords
Picrorhiza scrophtdariiflora
rhizome-specific genes
suppression subtractive hybridization
ESTs
phylogenetic analysis
eytochrome P450 monooxygenase
分类号
R96 [医药卫生—药理学]
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1
西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析(英文)
冯燕丽
马欣荣
夏庆杰
谈心
张义正
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2009
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