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应用于小鼠早期胚胎细胞的ChIP-seq体系中基因组水解酶的筛选
1
作者
高晗
钟蓓
《现代畜牧科技》
2020年第1期8-11,共4页
在过去的十几年中,染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)成为了分析表观基因组和鉴定DNA相关蛋白重要结合位点的主要技术。然而,ChIP-seq技术目前仍存在一些技术难点。其中一个重要限制是ChIP-seq需要大量的起始材料,需要至少数百万个细...
在过去的十几年中,染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)成为了分析表观基因组和鉴定DNA相关蛋白重要结合位点的主要技术。然而,ChIP-seq技术目前仍存在一些技术难点。其中一个重要限制是ChIP-seq需要大量的起始材料,需要至少数百万个细胞才能启动,然而实验中有两个关键步骤往往会造成所使用的样本丢失,即染色质制备和免疫沉淀。本实验通过从染色体制备入手,通过选择两种不同核酸水解酶DNase和MNase,设计不同实验组验证最佳酶切浓度,以优化ChIP-seq体系。结果证明0.1U/μL的MNase为本实验中ChIP-seq最佳酶切浓度。结果为ChIP-seq体系的优化提供了参考,对ChIP-seq技术在小鼠早期胚胎细胞中的应用以及发展有一定的积极意义。
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关键词
小鼠早期胚胎
CHIP-SEQ
核酸水解酶
酶切效率
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职称材料
题名
应用于小鼠早期胚胎细胞的ChIP-seq体系中基因组水解酶的筛选
1
作者
高晗
钟蓓
机构
东北农业大学生命科学学院
出处
《现代畜牧科技》
2020年第1期8-11,共4页
文摘
在过去的十几年中,染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)成为了分析表观基因组和鉴定DNA相关蛋白重要结合位点的主要技术。然而,ChIP-seq技术目前仍存在一些技术难点。其中一个重要限制是ChIP-seq需要大量的起始材料,需要至少数百万个细胞才能启动,然而实验中有两个关键步骤往往会造成所使用的样本丢失,即染色质制备和免疫沉淀。本实验通过从染色体制备入手,通过选择两种不同核酸水解酶DNase和MNase,设计不同实验组验证最佳酶切浓度,以优化ChIP-seq体系。结果证明0.1U/μL的MNase为本实验中ChIP-seq最佳酶切浓度。结果为ChIP-seq体系的优化提供了参考,对ChIP-seq技术在小鼠早期胚胎细胞中的应用以及发展有一定的积极意义。
关键词
小鼠早期胚胎
CHIP-SEQ
核酸水解酶
酶切效率
Keywords
Early embryo of mouse
ChIP-seq
Nucleic acid hydrolase
Enzyme digestion efficiency
分类号
S865.1 [农业科学—野生动物驯养]
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题名
作者
出处
发文年
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1
应用于小鼠早期胚胎细胞的ChIP-seq体系中基因组水解酶的筛选
高晗
钟蓓
《现代畜牧科技》
2020
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