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核酸条形码技术:扩展蛋白质-蛋白质相互作用检测通量的新方法
1
作者
李林鑫
秦晓红
米立志
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期281-294,共14页
蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)几乎参与了机体内所有重要的生物学过程,在细胞的基本生命过程中扮演了至关重要的角色,开发高通量的PPI检测新方法具有重要的生物学意义。目前,下一代测序技术(next-generation ...
蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)几乎参与了机体内所有重要的生物学过程,在细胞的基本生命过程中扮演了至关重要的角色,开发高通量的PPI检测新方法具有重要的生物学意义。目前,下一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)发展快速,能在几天内测定超过10亿个模板的DNA序列。由于并行DNA测序技术所特有的敏感性、特异性、高通量和多路复用优势,其已被用作广谱分子计数器,应用于基因组测序和转录物组测序等领域。核酸条形码技术通过将寡核苷酸标签与目标蛋白质连接起来,从而标记编码蛋白质。之后,利用高通量的测序方法检测相互作用的蛋白质,实现了PPI的高通量检测。这一技术推动了PPI检测方法的飞速发展,提升了单次实验检测的通量,为构建PPI网络提供了强有力的技术支持。本文详细阐述了核酸条形码在PPI检测方法中的设计、生成和读取;通过分析核酸条形码技术在PPI研究中的应用范例,探讨了各自的优势和不足,并评估了数据的可靠性,讨论了基于核酸条形码技术的PPI检测方法未来的发展趋势。
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关键词
蛋白质-蛋白质相互作用
核酸条形码检测技术
下一代测序
技术
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职称材料
题名
核酸条形码技术:扩展蛋白质-蛋白质相互作用检测通量的新方法
1
作者
李林鑫
秦晓红
米立志
机构
天津大学生命科学学院结构与分子生物学系
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期281-294,共14页
文摘
蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)几乎参与了机体内所有重要的生物学过程,在细胞的基本生命过程中扮演了至关重要的角色,开发高通量的PPI检测新方法具有重要的生物学意义。目前,下一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)发展快速,能在几天内测定超过10亿个模板的DNA序列。由于并行DNA测序技术所特有的敏感性、特异性、高通量和多路复用优势,其已被用作广谱分子计数器,应用于基因组测序和转录物组测序等领域。核酸条形码技术通过将寡核苷酸标签与目标蛋白质连接起来,从而标记编码蛋白质。之后,利用高通量的测序方法检测相互作用的蛋白质,实现了PPI的高通量检测。这一技术推动了PPI检测方法的飞速发展,提升了单次实验检测的通量,为构建PPI网络提供了强有力的技术支持。本文详细阐述了核酸条形码在PPI检测方法中的设计、生成和读取;通过分析核酸条形码技术在PPI研究中的应用范例,探讨了各自的优势和不足,并评估了数据的可靠性,讨论了基于核酸条形码技术的PPI检测方法未来的发展趋势。
关键词
蛋白质-蛋白质相互作用
核酸条形码检测技术
下一代测序
技术
Keywords
protein-protein interaction(PPI)
nucleic acid barcode technology
next-generation sequencing
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
核酸条形码技术:扩展蛋白质-蛋白质相互作用检测通量的新方法
李林鑫
秦晓红
米立志
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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