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利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术及环介导等温扩增技术在结核性脑膜炎的诊断价值 被引量:13
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作者 冉燕 赵建军 +1 位作者 张建勇 宗兆婧 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第24期3416-3419,共4页
目的评价脑脊液利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(GeneXpert MTB/RIF)及脑脊液环介导等温扩增技术(LAMP)在结核性脑膜炎中的诊断价值。方法收集临床诊断为结核性脑膜炎住院患者110例,随机收集60例为结核性脑膜炎A组,50例为结核... 目的评价脑脊液利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(GeneXpert MTB/RIF)及脑脊液环介导等温扩增技术(LAMP)在结核性脑膜炎中的诊断价值。方法收集临床诊断为结核性脑膜炎住院患者110例,随机收集60例为结核性脑膜炎A组,50例为结核性脑膜炎B组,另收集其他中枢神经系统感染患者脑脊液20例为对照组(CG组)。其中结核性脑膜炎A组患者入院后抽取脑脊液送脑脊液常规、生化、结核菌涂片、结核菌培养、GeneXpert MTB/RIF,结核性脑膜炎B组患者送脑脊液作常规、生化、结核菌涂片、结核菌培养和LAMP,CG组患者送脑脊液作常规、生化、结核菌涂片、结核菌培养、GeneXpert MTB/RIF和LAMP。结果结核性脑膜炎A组脑脊液GeneXpert MTB/RIF阳性32例,其中利福平耐药基因检测阳性3例,结核性脑膜炎A组脑脊液结核菌涂片、培养、GeneXpert MTB/RIF阳性率分别为8.3%(5/60)、16.7%(10/60)和53.0%(32/60)。结核性脑膜炎B组50例脑脊液结核菌涂片、结核菌培养、LAMP,阳性率分别为8.0%(4/50),18.0%(9/50)和58.0%(29/50),CG组脑脊液GeneXpert MTB/RIF和脑脊液LAMP均为阴性。结论脑脊液GeneXpert MTB/RIF及脑脊液LAMP均为早期诊断结核性脑膜炎的较好方法。 展开更多
关键词 结核 脑膜炎 脑脊液 利福平 耐药 利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术 环介导等温技术
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结合Transformer与Kolmogorov Arnold网络的分子扩增时序预测研究 被引量:5
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作者 刘灿锋 孙浩 东辉 《图学学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1256-1265,共10页
随着医辽诊断和治疗干预技术的不断进步,医学时间序列数据呈现指数级增长。人工智能(AI),尤其是深度学习在挖掘医学时间序列数据潜在信息方面展现出巨大潜力。为此,首次提出将Transformer与Kolmogorov arnold网络(KAN)相结合的方法,用... 随着医辽诊断和治疗干预技术的不断进步,医学时间序列数据呈现指数级增长。人工智能(AI),尤其是深度学习在挖掘医学时间序列数据潜在信息方面展现出巨大潜力。为此,首次提出将Transformer与Kolmogorov arnold网络(KAN)相结合的方法,用于核酸扩增实验数据的预测分析。通过实验数据分析,证实模型在准确预测扩增趋势和终点值方面的有效性,终点值误差仅为1.87,R-square系数为0.98,且模型能准确识别不同样本类型的实验数据。进一步地,通过消融实验和超参数调优,深入探究模型各组成部分及其参数对预测性能的影响。最后,在911条临床数据上对10种深度学习模型进行泛化能力测试的结果表明,Transformer-KAN模型在预测准确性和泛化能力上均优于其他模型,不仅为改进大流行病常规诊断技术提供了新视角,还为进一步研究KAN模型及相应基础理论提供了实验佐证。 展开更多
关键词 深度学习 时间序列预测 核酸扩增检测技术 Kolmogorov-Arnold网络 TRANSFORMER
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结核分枝杆菌核酸检测试剂生产质量控制与临床研究概述
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作者 陈保文 沈小兵 +3 位作者 都伟欣 杨蕾 苏城 王国治 《中国防痨杂志》 CAS 2012年第2期115-116,共2页
Mtb核酸扩增检测技术泛指以扩增DNA或RNA为手段,从而检测特定Mtb核酸序列或筛查特定Mtb基因的检测技术,常用检测技术有:PCR、连接酶链反应(1igasechainreaction,LCR)、转录依赖的扩增反应(transcriptionmediatedamplification,... Mtb核酸扩增检测技术泛指以扩增DNA或RNA为手段,从而检测特定Mtb核酸序列或筛查特定Mtb基因的检测技术,常用检测技术有:PCR、连接酶链反应(1igasechainreaction,LCR)、转录依赖的扩增反应(transcriptionmediatedamplification,TMA)等。笔者主要针对Mtb核酸扩增法检测试剂的主要原材料、生产工艺及反应体系、产品质量控制及临床研究的技术要求进行概述,为Mtb核酸扩增法检测试剂的研制提供参考。 展开更多
关键词 核酸扩增检测技术 产品质量控制 检测试剂 临床研究 结核分枝杆菌 连接酶链反应 核酸 MTB
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应用XpertMTB/RIF技术快速诊断膝关节结核 被引量:10
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作者 唐恺 董伟杰 +4 位作者 兰汀隆 范俊 李元 严广璇 秦世炳 《中国防痨杂志》 CAS 2016年第4期300-304,共5页
目的评价利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(XpertMTB/RIF,简称“Xpert”)在膝关节结核诊断中的临床应用价值。方法连续收集2014年1月至2015年10月在首都医科大学附属北京胸科医院骨科接受手术治疗的49例膝关节病变患者的关... 目的评价利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(XpertMTB/RIF,简称“Xpert”)在膝关节结核诊断中的临床应用价值。方法连续收集2014年1月至2015年10月在首都医科大学附属北京胸科医院骨科接受手术治疗的49例膝关节病变患者的关节积液标本,每份标本同时分别行涂片抗酸杆菌检查、罗氏培养基培养、Xpert检测。以临床诊断为参考标准,评价Xpert检测关节积液标本中结核分枝杆菌的敏感度和特异度。结果以临床诊断为参考标准,涂片、罗氏培养基培养、Xpert检测的敏感度分别为17.2%(5/29)、31.0%(9/29)、69.0%(20/29),差异有统计学意义(X2=8.34,P%0.05);特异度分别为85.0%(17/20)、100.0%(20/20)、90.O%(18/20)。结论Xpert检测关节积液标本中结核分枝杆菌的敏感度高,并且可同时检测其耐药性,可用于快速诊断膝关节结核。 展开更多
关键词 结核 骨关节 荧光定量核酸扩增检测技术 聚合酶链反应 诊断 耐药性
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GeneXpertMTB/RIF技术的应用进展及其在骨关节结核诊断中的价值 被引量:16
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作者 李祯马 马远征 秦世炳 《中国防痨杂志》 CAS 2016年第4期322-326,共5页
结核分枝杆菌/N福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测体系(GeneXpertMTB/RIF)是一套整合核酸准备、扩增、实时检测的完全自动化检测临床标本诊断结核分枝杆菌和利福平耐药的技术,已被美国认可为结核快速分子学诊断技术,世界卫生组织... 结核分枝杆菌/N福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测体系(GeneXpertMTB/RIF)是一套整合核酸准备、扩增、实时检测的完全自动化检测临床标本诊断结核分枝杆菌和利福平耐药的技术,已被美国认可为结核快速分子学诊断技术,世界卫生组织也推荐GeneXpertMTB/RIF在中低收入国家可替代涂片镜检去检测肺结核。GeneXpertMTB/RIF用于检测来自各个肺外结核部位(比如淋巴结)的组织样本都有更好的表现;相比于结核分枝杆菌的培养检测,GeneXpertMTB/RIF在结核病快速诊断中的高敏感度也使其成为一种更好的选择。然而,对于GeneXpertMTB/RIF用于可疑性骨关节结核诊断时,检测脓液标本的推荐数据却相当少。为探讨新的结核病诊断技术在骨关节结核诊断中的可行性,作者将介绍GeneXpertMTB/RIF的检测原理、及其在病原体诊断方面的临床应用和存在问题,以及发展前景。 展开更多
关键词 结核 骨关节 荧光定量核酸扩增检测技术 诊断
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SAT法检测人巨细胞病毒pp67 mRNA在人类免疫缺陷病毒合并人巨细胞病毒感染患者临床诊疗中的价值探讨 被引量:1
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作者 孟欢 王爽 +6 位作者 何超男 韩莹 潘美晨 殷商启 郑梅 金方方 王雅杰 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2021年第5期739-746,共8页
目的探讨实时荧光核酸恒温扩增检测技术(simultaneous amplification and testing,SAT)检测人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)基质表层蛋白pp67(phosphoprotein67,pp67)mRNA在人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,H... 目的探讨实时荧光核酸恒温扩增检测技术(simultaneous amplification and testing,SAT)检测人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)基质表层蛋白pp67(phosphoprotein67,pp67)mRNA在人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)合并HCMV感染患者临床诊疗中的价值。方法利用SAT技术构建检测HCMV pp67 mRNA的方法,评估SAT法检测HCMV pp67 mRNA重复性、特异性以及检测下限;收集HIV阳性HCMV活动性感染患者69例、HIV阳性HCMV非活动性/潜伏感染154例、HIV阴性HCMV非活动性/潜伏感染79例患者的血清、肺泡灌洗液、脑脊液等样本进行HCMV pp67 mRNA检测,评估特异度、灵敏度、正确率、阴性预测值、阳性预测值以及约登指数,评估HCMV pp67 mRNA在辨别HCMV活动性感染中的临床价值。结果SAT法检测HCMV pp67 mRNA的精密度(变异系数<10%)可满足临床检测要求,与其他病原体无交叉反应,特异性良好,试剂检测下限为400 copies/mL;特异度87.55%,灵敏度60.87%,正确率81.46%,阴性预测值0.88,阳性预测值0.59以及约登指数0.48;SAT法检测HCMV pp67 mRNA结果阳性率与临床诊断结果差异无统计学意义(P=0.894)。结论SAT法检测HCMV pp67 mRNA可用于HCMV活动性感染的辅助诊断。 展开更多
关键词 人免疫缺陷病毒 巨细胞病毒活动性感染 实时荧光核酸恒温检测技术 人巨细胞病毒pp67 mRNA
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