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题名五个绵羊群体KAP11-1基因核苷酸序列变异分析
被引量：6
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作者
朱建勋
王继卿
胡江
刘秀
李少斌
闫伟
罗玉柱
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机构
甘肃农业大学动物科学技术学院
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出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2016年第5期101-107,共7页
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基金
甘肃省创新研究群体计划项目(1210RJIA005)
国际科技合作与交流项目(2011DFG33310)
+1 种基金
甘肃省高校基本科研业务费项目
甘肃农业大学自列课题
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文摘
为了分析绵羊KAP11-1基因的核苷酸序列变异,采用PCR-SSCP方法和DNA测序技术检测了欧拉羊、甘肃高山细毛羊、滩羊、湖羊和青海细毛羊5个群体(749只个体)KAP11-1基因的单核苷酸多态性,同时分析了等位基因频率、遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量等群体遗传特征。结果表明,5个绵羊群体的KAP11-1基因中共检测到c.93C/T、c.240G/A、c.285C/G/A和c.331A/G 4个单核苷酸多态位点,且c.331A/G为非同义突变。等位基因A在5个群体中出现的频率最高(87.70%),为优势等位基因,其次为等位基因B(基因频率为11.03%),等位基因C和D的频率最低(分别为0.53%和0.74%)。群体遗传学分析结果表明,滩羊KAP11-1基因的遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量均高于其余4个群体。KAP11-1基因作为羊毛经济性状的主要候选基因之一,其核苷酸序列的变异导致KAP11-1中相应氨基酸的改变,最终可能会影响羊毛纤维的结构和羊毛主要经济性状。
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关键词
绵羊
KAP11-1基因
核苷酸序列变异
PCR-SSCP
单核苷酸多态性
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Keywords
Sheep
KAP11-1 gene
Nucleotide sequence variations
PCR-SSCP
Single nucleotide polymorphism
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分类号
Q78
[生物学—分子生物学]
S826
[农业科学—畜牧学]
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题名河西绒山羊DQB1基因核苷酸序列变异和跨种进化
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作者
王继卿
王玺年
罗玉柱
胡江
刘秀
李少斌
闫伟
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机构
甘肃农业大学甘肃省草食动物生物技术重点实验室/研究测试中心/动物科学技术学院
甘肃省畜牧工程职业技术学院
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出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期23-28,共6页
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基金
甘肃省省青年科技基金(1107RJYA060)
2013年甘肃省农业科技创新项目(GNCX-2013-35)
2012年甘肃省高等学校基本科研业务费项目
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文摘
DQB1基因在抗原呈递和免疫系统中发挥重要的作用。为了研究河西绒山羊DQB1基因的核苷酸序列变异和跨种进化,采用PCR-SSCP和测序技术,检测899只河西绒山羊DQB1基因的多态性,并用来自山羊、绵羊和黄牛DQB1基因的33条核苷酸序列构建NJ树。结果表明,河西绒山羊DQB1基因存在6个等位基因和34个核苷酸变异位点,变异位点数目占分析位点数目的15.53%。经与GenBank中山羊DQB1基因的核苷酸序列比对后发现,5个等位基因为首次发现。系统进化研究表明,山羊DQB1基因的所有核苷酸序列均聚在第1支中,部分核苷酸序列与绵羊、牛的序列相似性高于山羊之间的序列相似性。因此,河西绒山羊DQB1基因多态性丰富,在山羊、绵羊和牛中存在跨种多态性。
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关键词
DQB1基因
核苷酸序列变异
跨种多态性
河西绒山羊
PCR—SSCP
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Keywords
DQB1 gene
Nucleotide sequence variation
Trans-species polymorphism
Hexi cashmeregoat
PCR-SSCP
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分类号
S827
[农业科学—畜牧学]
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