轮状病毒VP4、VP7基因的克隆与核苷酸序列分析 被引量：9

1

作者 王鹏雁 陈创夫 +3 位作者 余兴龙 徐兴然 涂长春 张高轩 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期99-103,共5页

用反转录聚合酶链式反应 (RT_PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增 816bp、916bp的VP4、VP7片段中抗原表位区。通过T4DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒pGEM_T上 ,转化至受体菌DH5α中。提取质粒经PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒... 用反转录聚合酶链式反应 (RT_PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增 816bp、916bp的VP4、VP7片段中抗原表位区。通过T4DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒pGEM_T上 ,转化至受体菌DH5α中。提取质粒经PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒pT_V4、PT_V7中含有轮状病毒的VP4、VP7基因片段。经核苷酸序列分析 ,表明克隆了轮状病毒主要保护性抗原VP4。 展开更多

关键词 核苷酸序列分析 轮状病毒 基因克隆 VP4 VP7

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福建省肠道病毒71型分离株(2010FJLY008)全基因组核苷酸序列分析 被引量：6

2

作者 陈炜 周朝晖 +7 位作者 沈晓娜 张拥军 谢剑锋 吴冰珊 王金章 翁育伟 郑奎城 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期14-18,共5页

目的了解肠道病毒71型在福建省的遗传背景,追踪EV71流行过程中可能发生的变异。方法对2010年福建1例手足口病患儿标本中分离到的1株肠道病毒71型分离株(2010FJLY008)进行全基因组核苷酸序列测定,并对基因组序列进行同源性比较及遗传进... 目的了解肠道病毒71型在福建省的遗传背景,追踪EV71流行过程中可能发生的变异。方法对2010年福建1例手足口病患儿标本中分离到的1株肠道病毒71型分离株(2010FJLY008)进行全基因组核苷酸序列测定,并对基因组序列进行同源性比较及遗传进化分析。结果 2010FJLY008株全长7 403bp,核苷酸及编码氨基酸序列同源性比较,均与08年阜阳流行株Fuyang17.08-2同源性最高,整个基因组核苷酸同源性为98.2%,氨基酸同源性为99.5%;全长基因组核苷酸序列遗传进化分析及VP1区基因遗传进化分析,与Fuyang17.08-2株进化关系较为接近,同属于C4a基因亚型。结论 2010年福建省EV71型病毒流行株(2010FJLY008)在病毒基因组结构、基因组核苷酸同源性比较、编码氨基酸同源性比较、全长基因组核苷酸序列遗传进化分析及VP1区基因遗传进化分析等方面,均与2008年阜阳流行株(Fuyang17.08-2)关系密切,未产生明显的抗原漂移及变异。 展开更多

关键词 肠道病毒71型 全基因组 核苷酸序列分析

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鼻咽癌恶性转化基因Tx核苷酸序列分析 被引量：4

3

作者 任维 黎明 +3 位作者 夏林庆 翁新宪 廖伟 曹亚 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期541-547,共7页

从人类鼻咽癌细胞系CNE2基因组DNA文库中克隆一个恶性转化基因Tx转染小鼠JB6 + 细胞 ,使细胞恶性转化 ,宿主细胞具有停泊非依赖生长的特性 .已经报道的Tx中一个 3 0kb片段(Tx3 0 )的序列分析结果表明 ,Tx包含人类免疫球蛋白κ轻链完整的... 从人类鼻咽癌细胞系CNE2基因组DNA文库中克隆一个恶性转化基因Tx转染小鼠JB6 + 细胞 ,使细胞恶性转化 ,宿主细胞具有停泊非依赖生长的特性 .已经报道的Tx中一个 3 0kb片段(Tx3 0 )的序列分析结果表明 ,Tx包含人类免疫球蛋白κ轻链完整的J区 .进一步对Tx全长进行亚克隆和测序 ,并采用生物信息学方法进行分析表明 ,Tx包含人类Igκ完整的J区、C区基因片段、还有 5个重组信号序列 ,1个核基质结合序列和 1个N segment的插入 .Tx与正常人IgκJ、C区比较只是在某些位点存在碱基的缺失、插入或置换 ,二者同源性高达 98% ,其电子定位于 2p11 2 ,这与人Igκ的染色体定位是一致的 .可以认为 。 展开更多

关键词 鼻咽癌 恶性转化基因 核苷酸序列分析 Igκ基因

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马传染性贫血病病毒驴白细胞弱毒疫苗株前病毒全基因组核苷酸序列分析 被引量：2

4

作者 杨志彪 王柳 +2 位作者 童光志 孔宪刚 仇华吉 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期161-166,共6页

马传染性贫血病病毒 (EIAV)是马传染性贫血病 (简称马传贫 ,EIA)的病原。我国的EIAV弱毒疫苗是迄今为止世界上唯一投入应用的慢病毒疫苗 ,成功地控制了我国EIA的流行。本研究从EIAV弱毒疫苗株 (DLA)感染的驴白细胞中提取前病毒DNA ,以... 马传染性贫血病病毒 (EIAV)是马传染性贫血病 (简称马传贫 ,EIA)的病原。我国的EIAV弱毒疫苗是迄今为止世界上唯一投入应用的慢病毒疫苗 ,成功地控制了我国EIA的流行。本研究从EIAV弱毒疫苗株 (DLA)感染的驴白细胞中提取前病毒DNA ,以提取的前病毒DNA为模板 ,利用PCR技术分 3个片段扩增EIAV前病毒 ,这 3个片段覆盖全部前病毒DNA。将这 3个片段分别克隆到载体质粒pBluescrtiptsK中 ,得到 3个重组质粒P2 .8,P2 .4,P4.1,经酶切鉴定后 ,测序。对测序结果分析、拼接 ,得到EIAV驴白细胞弱毒疫苗株前病毒基因组全序列。EIAVDLA株前病毒基因组全长 82 6 6bp。基因组两端是长为334bp的LTR ,其中U3为 2 14bp ,R为 81bp ,U5为 39bp。前病毒基因组有 3个较大的开放阅读框架 (ORF) ,分别编码gag、pol和env基因。gag基因位于 732～ 1931位碱基之间 ,全长 12 0 0bp ;pol基因位于 172 7～ 5 12 8位碱基之间 ,全长 34 0 2bp ;env基因位于5 32 4～ 7912之间 ,长为 2 5 89bp。此外前病毒还有 3个小的ORF ,S1位于 5 132～ 5 2 84位碱基之间 ,长为 15 3bp ;S2位于 5 2 98～ 5 5 0 1位碱基之间 ,长为 2 0 4bp ;S3位于 72 5 8～ 76 5 9位碱基之间 ,长为 40 2bp。本研究结果为进一步确定EIAV的基因功能、揭示马传贫疫苗毒的致弱? 展开更多

关键词 马传染性贫血病毒 驴白细胞弱母疫苗株 前病毒 核苷酸序列分析 基因组

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猪水泡病病毒结构蛋白VP1基因的核苷酸序列分析 被引量：1

5

作者 龚振华 田相军 +2 位作者 刘俊辉 王玉东 蒋正军 《中国动物检疫》 CAS 北大核心 2005年第2期23-26,共4页

提取SVDV毒株的RNA ,用两对引物经反转录PCR扩增了包括VP1基因在内的约872bp的DNA片段 ,采用双脱氧DNA末端终止法测得VP1基因的核苷酸序列。分析表明 ,病毒VP1基因的核苷酸序列与已报道的VP1基因的同源性在89 %和98 %之间 ,对应的氨基酸... 提取SVDV毒株的RNA ,用两对引物经反转录PCR扩增了包括VP1基因在内的约872bp的DNA片段 ,采用双脱氧DNA末端终止法测得VP1基因的核苷酸序列。分析表明 ,病毒VP1基因的核苷酸序列与已报道的VP1基因的同源性在89 %和98 %之间 ,对应的氨基酸在89%和98 %之间。 展开更多

关键词 猪水泡病病毒 结构蛋白 VP1基因 核苷酸序列分析 猪 水泡病

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轮状病毒VP7基因的克隆及核苷酸序列分析 被引量：1

6

作者 王鹏雁 陈创夫 +3 位作者 余兴龙 徐兴然 涂长春 张高轩 《石河子大学学报（自然科学版）》 CAS 2002年第2期87-90,共4页

用反转录聚合酶链式反应 (RT PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增了 916bp的VP7片段中抗原表位区。通过T4DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒pGEM T上 ,转化至受体菌DH5α中。提取质粒经PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒pT V7中含... 用反转录聚合酶链式反应 (RT PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增了 916bp的VP7片段中抗原表位区。通过T4DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒pGEM T上 ,转化至受体菌DH5α中。提取质粒经PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒pT V7中含有轮状病毒的VP7基因片段。经核苷酸序列分析 。 展开更多

关键词 核苷酸序列分析 轮状病毒 保护性抗原 VP7基因 基因克隆 PCR扩增 重组质粒 腹泻

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轮状病毒VP4基因的克隆与核苷酸序列分析 被引量：7

7

作者 王鹏雁 陈创夫 +3 位作者 余兴龙 徐兴然 涂长春 张高轩 《动物科学与动物医学》 2002年第5期25-28,共4页

用反转录聚合酶链式反应 (RT- PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增了 816 bp的 VP4片段中抗原表位区。通过 T4 DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒 p GEM- T上 ,转化至受体菌 DH5 α中。提取质粒经 PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质... 用反转录聚合酶链式反应 (RT- PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增了 816 bp的 VP4片段中抗原表位区。通过 T4 DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒 p GEM- T上 ,转化至受体菌 DH5 α中。提取质粒经 PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒 p T- V4中含有轮状病毒的 VP4基因片段。经核苷酸序列分析 ,表明克隆了轮状病毒主要保护性抗原 展开更多

关键词 核苷酸序列分析 轮状病毒 保护性抗原 VP4基因 基因克隆 RT-PCR 非细菌性腹泻 基因工程疫苗

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多浪羊IFN-γ基因克隆及核苷酸序列分析 被引量：1

8

作者 左文斌 潘辉 李莲瑞 《塔里木大学学报》 2011年第2期19-23,共5页

为了分析新疆多浪羊的IFN-γ基因,根据GenBank中NM_001009803的mRNA序列设计引物,以新疆多浪羊淋巴细胞的总RNA为模板,用RT-PCR扩增多浪羊IFN-γ基因序列。测序结果表明I,FN-γ基因序列包含了一个582 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Bla... 为了分析新疆多浪羊的IFN-γ基因,根据GenBank中NM_001009803的mRNA序列设计引物,以新疆多浪羊淋巴细胞的总RNA为模板,用RT-PCR扩增多浪羊IFN-γ基因序列。测序结果表明I,FN-γ基因序列包含了一个582 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,多浪羊的IFN-γ基因与普通绵羊的同源性高达99.82%,为多浪羊IFN-γ的功能研究及多浪羊免疫应答基因的筛选奠定基础。 展开更多

关键词 多浪羊 IFN-Γ 基因克隆 核苷酸序列分析

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新疆卡拉库尔羊Fas基因的克隆及核苷酸序列分析 被引量：1

9

作者 潘辉 贺艳艳 李莲瑞 《塔里木大学学报》 2011年第2期14-18,共5页

为了分析新疆卡拉库尔羊的Fas基因,根据普通绵羊的碱基序列和相关文献设计引物,用RT-PCR扩增并测定了卡拉库尔羊Fas基因的cDNA序列。结果表明,Fas基因cDNA序列包含了一个750 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,卡拉库... 为了分析新疆卡拉库尔羊的Fas基因,根据普通绵羊的碱基序列和相关文献设计引物,用RT-PCR扩增并测定了卡拉库尔羊Fas基因的cDNA序列。结果表明,Fas基因cDNA序列包含了一个750 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,卡拉库尔羊的Fas基因与普通绵羊的同源性高达99.69%。这为将来制备卡拉库尔羊Fas基因探针及卡拉库尔羊分子免疫学的发展提供了理论依据。 展开更多

关键词 卡拉库尔羊 FAS基因 核苷酸序列分析

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2株O型口蹄疫病毒结构蛋白基因VP1的核苷酸序列分析 被引量：1

10

作者 宋敏 王淼 +2 位作者 王天仕 张丽 李黎 《上海畜牧兽医通讯》 2007年第1期32-33,共2页

关键词 O型口蹄疫病毒 核苷酸序列分析 结构蛋白基因 VP1 动物传染病 小核糖核酸 交叉免疫 血清型

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小鹅瘟病毒GPV-YG株主要开放性阅读框架核苷酸序列分析

11

作者 葛艳 尤永进 +2 位作者 徐泉兴 陈谊 饶忠 《上海农业学报》 CSCD 2005年第2期11-15,共5页

通过PCR技术分段扩增小鹅瘟病毒(Gooseparvovirus,GPV)扬州分离株GPV YG的2个主要开放性阅读框架(openreadingframe,ORF)基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,其结果在GenBank登录。将上述序列与登录的国外参考株GPV-B株作比较,GPV-YG主... 通过PCR技术分段扩增小鹅瘟病毒(Gooseparvovirus,GPV)扬州分离株GPV YG的2个主要开放性阅读框架(openreadingframe,ORF)基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,其结果在GenBank登录。将上述序列与登录的国外参考株GPV-B株作比较,GPV-YG主要ORF核苷酸序列与GPV-B的同源性为94%,显示二者亲缘关系密切。在此基础上,分别确定了GPV-YG编码结构蛋白和非结构蛋白的基因组序列,并推导出GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的相应的氨基酸序列,GPV-YG与GPV B结构蛋白的氨基酸序列同源性为96.4%,非结构蛋白同源性为97.9%,由此进一步分析了GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的氨基酸序列与功能特征。同时,将GPV-YG主要ORF与番鸭细小病毒(MuscovyDuckParvovirus,MDPV)FM作比较,核苷酸序列同源性为80%,非结构蛋白推导氨基酸序列同源性为89.6%,结构蛋白为84.6%。 展开更多

关键词 小鹅瘟病毒 开放性阅读框架 核苷酸序列分析 GPV-YG株 小鹅瘟

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新疆卡拉库尔羊TNF-α基因的克隆及核苷酸序列分析

12

作者 贺艳艳 潘辉 +2 位作者 刘书东 左文斌 李莲瑞 《塔里木大学学报》 2011年第3期54-58,共5页

根据普通绵羊的碱基序列和相关文献设计引物,用RT-PCR扩增并测定了卡拉库尔羊肿瘤坏死因子-α基因的cDNA序列。结果表明,TNF-αcDNA序列包含了一个705 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,卡拉库尔羊的TNF-α基因与普通... 根据普通绵羊的碱基序列和相关文献设计引物,用RT-PCR扩增并测定了卡拉库尔羊肿瘤坏死因子-α基因的cDNA序列。结果表明,TNF-αcDNA序列包含了一个705 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,卡拉库尔羊的TNF-α基因与普通绵羊的同源性高达99.86%。这为将来制备卡拉库尔羊TNF-α基因探针及卡拉库尔羊分子免疫学的发展提供了理论依据。 展开更多

关键词 卡拉库尔羊 肿瘤坏死因子-Α 核苷酸序列分析

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一株新型散发型戊型肝炎病毒部分核苷酸序列测定与分析

13

作者 刘子玲 迟宝荣 +4 位作者 姚程 杨波 张静 韩西瑶 王秀丽 《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期647-650,共4页

目的 :了解长春地区戊型肝炎病毒 ( HEV)株的变异程度。方法 :用逆转录 -套式 -聚合酶链反应方法从患者血清中获取病毒 ,用双脱氧终止法进行核苷酸序列分析。结果 :China Changchun-2 2 0 MC与日本株、猪的 HEV分离株 ( AF0 82 843)、... 目的 :了解长春地区戊型肝炎病毒 ( HEV)株的变异程度。方法 :用逆转录 -套式 -聚合酶链反应方法从患者血清中获取病毒 ,用双脱氧终止法进行核苷酸序列分析。结果 :China Changchun-2 2 0 MC与日本株、猪的 HEV分离株 ( AF0 82 843)、美国株 - 1 ( AF0 60 669)、墨西哥株 ( M745 0 6)、第四基因型 ( AJ2 72 1 0 8)、缅甸株 ( M732 1 8)、中国株 ( M941 77、D1 1 0 93、D1 1 0 92 )、尼泊尔株 ( AF0 5 1 830 )、巴基斯坦株 ( M80 5 81、AF1 85 82 2 )核苷酸同源性为 72 %～ 88% ,氨基酸同源性为 93%～ 97%。结论 :China Changchun- 2 2 0 MC株与其它 HEV株相比有较高的基因异质性 ,可能是一新型的 展开更多

关键词 戊型肝炎病毒 碱基序列 逆转录聚合酶链反应 双脱氧终止法 核苷酸序列分析

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新疆绵羊种布鲁氏菌OMP25基因的分子克隆及核苷酸序列的测定 被引量：3

14

作者 柳建新 陈创夫 田晶华 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2005年第11期6-8,共3页

根据GeneBank库上国际标准菌株绵羊种布鲁氏菌(63/290)的OMP25的基因序列设计引物,用聚合酶链式反应(PCR)技术从新疆绵羊种布鲁氏菌(80/019)基因组DNA中扩增出OMP25基因片段,T4DNA连接酶将其连接于PBS-T克隆载体质粒上,将重组质粒转化... 根据GeneBank库上国际标准菌株绵羊种布鲁氏菌(63/290)的OMP25的基因序列设计引物,用聚合酶链式反应(PCR)技术从新疆绵羊种布鲁氏菌(80/019)基因组DNA中扩增出OMP25基因片段,T4DNA连接酶将其连接于PBS-T克隆载体质粒上,将重组质粒转化到受体菌DH10B中,蓝白斑筛选阳性菌落,结果成功克隆OMP25基因片段,进行核苷酸序列测定,测序结果分析表明:新疆绵羊菌株与国际标准菌株有明显差异。 展开更多

关键词 新疆绵羊种布鲁氏菌 OMP25 克隆 核苷酸序列分析

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新疆维吾尔族妇女宫颈癌组织中乳头瘤病毒16型E6基因的克隆和序列分析 被引量：24

15

作者 马正海 钱东 +5 位作者 马纪 林仁勇 闻明 钟哲 张富春 张秋云 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第3期400-404,共5页

为了分析新疆南部地区维吾尔族妇女宫颈癌组织中HPV16型E6基因结构特点 ,从中国新疆南部地区维吾尔族妇女宫颈癌活检组织标本中提取DNA ,以宫颈癌活检组织标本DNA为模板进行PCR扩增 ,获得HPV16E6基因 ,将其克隆到pUCm T载体上 ,并对其... 为了分析新疆南部地区维吾尔族妇女宫颈癌组织中HPV16型E6基因结构特点 ,从中国新疆南部地区维吾尔族妇女宫颈癌活检组织标本中提取DNA ,以宫颈癌活检组织标本DNA为模板进行PCR扩增 ,获得HPV16E6基因 ,将其克隆到pUCm T载体上 ,并对其进行基因全序列分析 .PCR检测结果显示宫颈癌组织中HPV16E6阳性率为 82 35 % (14/17) ;测序结果显示 ,新疆株HPV16E6基因全长 45 6bp ,大小与德国标准株一致 .E6基因的第 2 47位碱基发生T→G突变 ,并由此引起所编码的氨基酸亦发生改变 .上述结果表明 ,中国新疆南部地区维吾尔族妇女宫颈癌患者组织中HPV16E6的基因结构与德国标准株HPV16E6基因之间存在差异 . 展开更多

关键词 人乳头瘤病毒16型 宫颈癌 E6基因 核苷酸序列分析新疆 维族妇女

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HCV 3b亚型全长序列测定及基线耐药相关置换的分析 被引量：1

16

作者 黄杰庭 许茹 +5 位作者 廖峭 王敏 单振刚 尤庆柱 戎霞 付涌水 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2020年第1期94-97,共4页

目的探讨二代测序法(NGS)在HCV 3b全长序列及基线耐药相关置换(RAS)检测中的应用。方法从1例2016年7月在广州血液中心献血的献血者(HCV RNA阳性)血浆中提取核酸,经序列非依赖性扩增后,构建测序文库并采用illumina Hiseq进行深度测序,然... 目的探讨二代测序法(NGS)在HCV 3b全长序列及基线耐药相关置换(RAS)检测中的应用。方法从1例2016年7月在广州血液中心献血的献血者(HCV RNA阳性)血浆中提取核酸,经序列非依赖性扩增后,构建测序文库并采用illumina Hiseq进行深度测序,然后通过生物信息学方法分析HCV全长序列、病毒基因分型以及针对直接抗病毒药物(DAA)的基线RAS。结果NGS获得8.4 Gb原始测序数据,序列数(reads)超过56 M。经生物信息学分析获得HCV全长序列,平均测序深度为488007,基因分型结果为3b亚型。病毒氨基酸序列里含有12个RAS,分别是NS3区域的Y56H、Q80K、Q80R、A156G,NS5A区域的M28G、Q/A30G、Q/A30K、L31F、L31M、Y93H,以及NS5B区域的S282T和V321A,其中位于NS5A区域的Q/A30K和L31M属于高丰度RAS(99.16%和98.37%),其余10个RAS丰度较低(<0.5%)。结论NGS用于HCV 3b亚型的全长序列检测和基因分型,最终鉴定出基线RAS,对于HCV 3b的流行病学研究和DAA治疗方案的制订有重要意义。 展开更多

关键词 肝炎病毒属 高通量核苷酸序列分析 基因型

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多浪羊IL-1β基因的克隆及序列分析 被引量：5

17

作者 曾国航 曹玉华 +4 位作者 王娟娟 潘伊微 贾山玲 徐宏伟 李莲瑞 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1347-1352,共6页

【目的】进行多浪羊IL-1β基因的克隆及序列分析,为多浪羊IL-1β的功能研究及多浪羊免疫应答基因的筛选奠定基础。【方法】根据GenBank中NM_001009465.2的mRNA序列设计引物,以新疆多浪羊淋巴细胞的总RNA为模板,用RT-PCR扩增多浪羊IL-1... 【目的】进行多浪羊IL-1β基因的克隆及序列分析,为多浪羊IL-1β的功能研究及多浪羊免疫应答基因的筛选奠定基础。【方法】根据GenBank中NM_001009465.2的mRNA序列设计引物,以新疆多浪羊淋巴细胞的总RNA为模板,用RT-PCR扩增多浪羊IL-1β基因序列。【结果】IL-1β基因序列包含了一个862 bp的开放阅读框,成熟蛋白编码的氨基酸序列长度为286个氨基酸。通过IL-1-β核苷酸多序列比对发现,第70、163、180、269位上四个相对保守的碱基处出现了四个突变;通过IL-1-β氨基酸多序列比对,第24、36位上两个氨基酸发生突变。通过GenBank中的Blastn序列比较分析,多浪羊的IL-1β基因与普通绵羊的同源性高达99%。【结论】在进化树体系中,多浪羊与反刍动物集成一束,它们与其它哺乳动物源于共同的祖先,但分别处于进化树上不同的分支。 展开更多

关键词 多浪羊 IL-1Β 基因克隆 核苷酸序列分析

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菜豆DnaJ-like基因组DNA片段的克隆及其表达分析 被引量：5

18

作者 张玉秀 张延红 +2 位作者 杨水云 柴团耀 赵文明 《西安交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第2期199-203,共5页

以PvSR6cDNA编码一种菜豆DnaJ like蛋白 ,并利用PCR的方法克隆出基因组部分序列 .核苷酸序列分析表明PvSR6基因在这段编码区内无内含子 ;Southernblot分析表明菜豆基因组中存在多个PvSR6基因拷贝 ;Northernblot分析结果表明PvSR6是组成... 以PvSR6cDNA编码一种菜豆DnaJ like蛋白 ,并利用PCR的方法克隆出基因组部分序列 .核苷酸序列分析表明PvSR6基因在这段编码区内无内含子 ;Southernblot分析表明菜豆基因组中存在多个PvSR6基因拷贝 ;Northernblot分析结果表明PvSR6是组成型表达蛋白 ,重金属Hg、Cd和As ,过量的Cu和Zn及受伤、高温、病毒侵染和水杨酸等均能强烈地诱导其基因在叶片中的表达 ,表明DnaJ 展开更多

关键词 基因克隆 菜豆 DnaJ-like蛋白 基因表达 PvSR6基因 植物抗逆性 核苷酸序列分析

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阿部鲻(鱼叚)(鱼虎)P-gp蛋白编码区基因克隆与分析 被引量：4

19

作者 程章 聂湘平 +1 位作者 王芳 李凯彬 《安全与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期4-8,共5页

利用RT-PCR(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)分离阿部鲻(Mugilogobius abei)P-gp(P-glycoproteins)CDS(Sequence coding for amino acids in protein)基因,并进行序列测定与分析。结果表明,cDNA全长2 073 bp,其中阅读... 利用RT-PCR(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)分离阿部鲻(Mugilogobius abei)P-gp(P-glycoproteins)CDS(Sequence coding for amino acids in protein)基因,并进行序列测定与分析。结果表明,cDNA全长2 073 bp,其中阅读框1 958 bp,编码652个氨基酸,估算的蛋白质相对分子质量为71.87 kD;5′非翻译区115 bp。序列同源性分析表明,不同进化地位动物的P-gp编码序列存在高度同源性,显示P-gp基因在系统进化上高度保守。生物信息学分析表明,阿部鲻P-gp基因不含有编码蛋白信号肽的序列,预测结果显示,有4个跨膜区,编码蛋白含ATP结合盒(the ATP-binding cassette)内膜转运typ-1型结合域。 展开更多

关键词 水生生物学 阿部鲻鰕鯱 P-GP CDS 基因克隆 核苷酸序列分析

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基于Ion Torrent PGM^(TM)测序系统的人mtDNA全测序分析 被引量：4

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作者 曹禹 邹凯南 +2 位作者 黄江平 马克 平原 《法医学杂志》 CAS CSCD 2017年第4期368-373,共6页

目的应用Ion Torrent PGM^(TM)测序系统对人线粒体DNA(mitochondria DNA,mtDNA)全序列进行分析检测,研究不同组织间mt DNA序列差异情况。方法通过法医尸体检验采集6名无关个体的组织样本,包括胸腔血液、头发、肋软骨、指甲、骨骼肌和口... 目的应用Ion Torrent PGM^(TM)测序系统对人线粒体DNA(mitochondria DNA,mtDNA)全序列进行分析检测,研究不同组织间mt DNA序列差异情况。方法通过法医尸体检验采集6名无关个体的组织样本,包括胸腔血液、头发、肋软骨、指甲、骨骼肌和口腔上皮。使用4对引物对线粒体全序列进行扩增,应用Ion Shear^(TM)Plus Reagents试剂盒和Ion Plus Fragment Library试剂盒等构建文库,并在Ion Torrent PGM^(TM)测序系统上进行线粒体基因组全序列测序,并针对异质性位点和在HVⅠ区域突变位点,进行Sanger测序验证。结果所有样本的全基因组mtDNA都扩增成功,6名无关个体分属于6种不同的单倍型,同一个体不同组织之间mtDNA存在异质性差异。异质性位点和HVⅠ区域突变位点采用Sanger测序结果均得到验证。通过Kappa统计方法进行一致性检验后发现,相同个体不同组织的mtDNA序列检验结果仍具有较好的一致性。结论本研究所采用的人线粒体基因组全序列的测序检验方法,可以检测出同一个体不同组织间mtDNA的异质性差异,该差异具有较高的一致性,该结果对mtDNA在法庭科学中的应用具有指导作用。 展开更多

关键词 法医遗传学 DNA 线粒体 遗传异质性 IonTorrentPGMTM测序系统 高通量核苷酸序列分析

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