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猪水泡病病毒结构蛋白VP1基因的核苷酸序列分析 被引量:1
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作者 龚振华 田相军 +2 位作者 刘俊辉 王玉东 蒋正军 《中国动物检疫》 CAS 北大核心 2005年第2期23-26,共4页
提取SVDV毒株的RNA ,用两对引物经反转录PCR扩增了包括VP1基因在内的约872bp的DNA片段 ,采用双脱氧DNA末端终止法测得VP1基因的核苷酸序列。分析表明 ,病毒VP1基因的核苷酸序列与已报道的VP1基因的同源性在89 %和98 %之间 ,对应的氨基酸... 提取SVDV毒株的RNA ,用两对引物经反转录PCR扩增了包括VP1基因在内的约872bp的DNA片段 ,采用双脱氧DNA末端终止法测得VP1基因的核苷酸序列。分析表明 ,病毒VP1基因的核苷酸序列与已报道的VP1基因的同源性在89 %和98 %之间 ,对应的氨基酸在89%和98 %之间。 展开更多
关键词 猪水泡病病毒 结构蛋白 VP1基因 核苷酸序列分析 水泡病
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轮状病毒VP4基因的克隆与核苷酸序列分析 被引量:7
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作者 王鹏雁 陈创夫 +3 位作者 余兴龙 徐兴然 涂长春 张高轩 《动物科学与动物医学》 2002年第5期25-28,共4页
用反转录聚合酶链式反应 (RT- PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增了 816 bp的 VP4片段中抗原表位区。通过 T4 DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒 p GEM- T上 ,转化至受体菌 DH5 α中。提取质粒经 PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质... 用反转录聚合酶链式反应 (RT- PCR)技术 ,从轮状病毒感染的细胞中扩增了 816 bp的 VP4片段中抗原表位区。通过 T4 DNA连接酶将其直接连接于克隆载体质粒 p GEM- T上 ,转化至受体菌 DH5 α中。提取质粒经 PCR扩增、酶切鉴定 ,证明重组质粒 p T- V4中含有轮状病毒的 VP4基因片段。经核苷酸序列分析 ,表明克隆了轮状病毒主要保护性抗原 展开更多
关键词 核苷酸序列分析 轮状病毒 保护性抗原 VP4基因 基因克隆 RT-PCR 非细菌性腹泻 基因工程疫苗
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多浪羊IL-1β基因的克隆及序列分析 被引量:5
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作者 曾国航 曹玉华 +4 位作者 王娟娟 潘伊微 贾山玲 徐宏伟 李莲瑞 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1347-1352,共6页
【目的】进行多浪羊IL-1β基因的克隆及序列分析,为多浪羊IL-1β的功能研究及多浪羊免疫应答基因的筛选奠定基础。【方法】根据GenBank中NM_001009465.2的mRNA序列设计引物,以新疆多浪羊淋巴细胞的总RNA为模板,用RT-PCR扩增多浪羊IL-1... 【目的】进行多浪羊IL-1β基因的克隆及序列分析,为多浪羊IL-1β的功能研究及多浪羊免疫应答基因的筛选奠定基础。【方法】根据GenBank中NM_001009465.2的mRNA序列设计引物,以新疆多浪羊淋巴细胞的总RNA为模板,用RT-PCR扩增多浪羊IL-1β基因序列。【结果】IL-1β基因序列包含了一个862 bp的开放阅读框,成熟蛋白编码的氨基酸序列长度为286个氨基酸。通过IL-1-β核苷酸多序列比对发现,第70、163、180、269位上四个相对保守的碱基处出现了四个突变;通过IL-1-β氨基酸多序列比对,第24、36位上两个氨基酸发生突变。通过GenBank中的Blastn序列比较分析,多浪羊的IL-1β基因与普通绵羊的同源性高达99%。【结论】在进化树体系中,多浪羊与反刍动物集成一束,它们与其它哺乳动物源于共同的祖先,但分别处于进化树上不同的分支。 展开更多
关键词 多浪羊 IL-1Β 基因克隆 核苷酸序列分析
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甘肃地区新生儿遗传代谢病疾病谱与基因变异分析
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作者 刘芙蓉 王兴 +4 位作者 李燕婷 张钏 郭媛媛 惠玲 郝胜菊 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2024年第5期378-383,共6页
目的:回顾性分析甘肃地区新生儿遗传代谢病的疾病谱、发病率和基因变异谱,探究本地区新生儿遗传代谢病的遗传特征。方法:选择2021年1月—2023年12月在甘肃省妇幼保健院进行遗传代谢病串联质谱筛查的213786例新生儿干血斑样本,可疑阳性... 目的:回顾性分析甘肃地区新生儿遗传代谢病的疾病谱、发病率和基因变异谱,探究本地区新生儿遗传代谢病的遗传特征。方法:选择2021年1月—2023年12月在甘肃省妇幼保健院进行遗传代谢病串联质谱筛查的213786例新生儿干血斑样本,可疑阳性患儿进行尿气相质谱和(或)高通量基因测序诊断,对确诊患儿的疾病谱、发病率和基因变异谱进行分析。结果:在189例复筛阳性患儿中确诊145例,包含15种遗传代谢病,甘肃地区遗传代谢病总体发病率为1/1474,其中高苯丙氨酸血症99例,占68.28%,是甘肃地区遗传代谢病中发病率最高的疾病;发现20种变异基因相关的268个变异位点,如一些热点变异:PAH基因c.728G>A、c.611A>G和MMACHC基因c.609G>A、c.567dupT,以及未报道的新变异:MMACHC基因c.298G>T、MUT基因c.2000A>G、MMAA基因c.734-7A>G。结论:质谱学筛查联合基因检测技术可有效探究遗传代谢病的遗传特征,为该类疾病后续的临床诊断及遗传咨询提供数据支撑。 展开更多
关键词 串联质谱法 气相色谱-质谱法 高通量核苷酸序列分析 遗传性疾病 先天性
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菜豆DnaJ-like基因组DNA片段的克隆及其表达分析 被引量:5
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作者 张玉秀 张延红 +2 位作者 杨水云 柴团耀 赵文明 《西安交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第2期199-203,共5页
以PvSR6cDNA编码一种菜豆DnaJ like蛋白 ,并利用PCR的方法克隆出基因组部分序列 .核苷酸序列分析表明PvSR6基因在这段编码区内无内含子 ;Southernblot分析表明菜豆基因组中存在多个PvSR6基因拷贝 ;Northernblot分析结果表明PvSR6是组成... 以PvSR6cDNA编码一种菜豆DnaJ like蛋白 ,并利用PCR的方法克隆出基因组部分序列 .核苷酸序列分析表明PvSR6基因在这段编码区内无内含子 ;Southernblot分析表明菜豆基因组中存在多个PvSR6基因拷贝 ;Northernblot分析结果表明PvSR6是组成型表达蛋白 ,重金属Hg、Cd和As ,过量的Cu和Zn及受伤、高温、病毒侵染和水杨酸等均能强烈地诱导其基因在叶片中的表达 ,表明DnaJ 展开更多
关键词 基因克隆 菜豆 DnaJ-like蛋白 基因表达 PvSR6基因 植物抗逆性 核苷酸序列分析
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高通量测序技术检测自然流产绒毛染色体异常的准确性分析 被引量:3
6
作者 郭丽娜 赵敏英 刘盼 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2020年第1期26-29,共4页
目的:探讨高通量测序技术检测自然流产绒毛染色体异常的准确性。方法:选择2018年3月-2019年3月在本院行自然流产术的39例患者,提取39份绒毛标本,采用高通量测序技术对绒毛组织的基因组DNA进行分析,并与细胞培养染色体核型分析结果进行... 目的:探讨高通量测序技术检测自然流产绒毛染色体异常的准确性。方法:选择2018年3月-2019年3月在本院行自然流产术的39例患者,提取39份绒毛标本,采用高通量测序技术对绒毛组织的基因组DNA进行分析,并与细胞培养染色体核型分析结果进行比较。结果:细胞培养染色体核型分析发现:染色体异常21例(53.85%),染色体未见明显异常14例(35.90%),检测失败4例(10.26%)。在21例染色体异常样本中,非整倍体11例(52.38%),单体共5例(23.81%),四体3例(14.29%),染色体结构异常2例(9.52%)。高通量测序检测发现:染色体异常25例(64.10%),染色体未见明显异常14例(35.90%)。其中细胞培养染色体核型分析未见明显异常的14例标本中,发现1例三体嵌合体、2例拷贝数变化(CNVs);4例检测失败标本中,发现1例CNVs。2种检测方法检出率差异无统计学意义(χ~2=2.250,P=0.134)。结论:高通量测序检测技术是一项有助于明确自然流产遗传学因素的高效遗传学检测手段,可以作为细胞培养染色体核型分析检查的有力补充。 展开更多
关键词 流产 自然 高通量核苷酸序列分析 基因组学 绒毛膜绒毛取样 染色体畸变 染色体结构变异
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石家庄地区新生儿G6PD缺乏症筛查结果及基因突变分析 被引量:5
7
作者 封露露 李丽欣 +2 位作者 马翠霞 封纪珍 李扬 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2021年第4期282-285,共4页
目的:明确葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症在石家庄地区新生儿中的患病率,进一步分析致病基因突变情况。方法:收集石家庄地区2018年9月—2020年11月出生的共237312例新生儿足跟血,制成滤纸干血斑,采用荧光法进行G6PD活性筛查,疑似患儿... 目的:明确葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症在石家庄地区新生儿中的患病率,进一步分析致病基因突变情况。方法:收集石家庄地区2018年9月—2020年11月出生的共237312例新生儿足跟血,制成滤纸干血斑,采用荧光法进行G6PD活性筛查,疑似患儿进行基因测序。结果:237312例新生儿中,筛查阳性142例,确诊114例,患病率为0.05%。114例患儿中男性105例,占92.1%,筛查结果均值(范围)为1.8(0.4~3.7)U/g Hb;女性9例,占7.9%,筛查结果均值(范围)为2.9(1.8~4.0)U/g Hb。114例患儿中56例进行了基因诊断(另外58例患儿家属拒绝进行基因诊断),56例患儿基因检测结果均为杂合突变,突变位点分析发现19种突变类型,其中16种已报道,分别为c.1376G>T、c.1024C>T、c.1388G>A、c.871G>A、c.95 A>G、c.487 G>A、c.1478 G>A、c.406 C>T、c.577 G>A、c.925A>T、c.185 A>G、c.961 G>A、c.482 G>T、c.653 C>T、c.392 G>T、c.1466 G>T;3种未见报道,分别为c.1316 G>A、c.575G>C、c.1400 C>T;突变频率较高的分别为c.1376G>T(0.25)、c.1024C>T(0.16)、c.1388G>A(0.14)。结论:初步明确了G6PD缺乏症在石家庄地区新生儿中的患病率;进一步明确了基因突变位点的分布情况;发现了3种新的基因突变类型,丰富了基因突变的数据库。 展开更多
关键词 葡糖磷脱氢酶缺乏 基因 突变 高通量核苷酸序列分析 婴儿 新生
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甘肃地区育龄夫妇基因扩展性携带者筛查研究
8
作者 刘芙蓉 张钏 +5 位作者 周秉博 陈雪 田芯瑗 马盼盼 惠玲 郝胜菊 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2024年第4期293-297,共5页
目的:探讨甘肃地区育龄夫妇单基因遗传病携带情况,为对高危家庭进行遗传咨询与产前诊断提供依据。方法:回顾性分析2021年1月—2023年12月在甘肃省妇幼保健院就诊的887对育龄夫妇,采用目标区域捕获二代测序技术进行100种单基因隐性遗传... 目的:探讨甘肃地区育龄夫妇单基因遗传病携带情况,为对高危家庭进行遗传咨询与产前诊断提供依据。方法:回顾性分析2021年1月—2023年12月在甘肃省妇幼保健院就诊的887对育龄夫妇,采用目标区域捕获二代测序技术进行100种单基因隐性遗传病扩展性携带者筛查(expanded carrier screening,ECS)。有3个家系的母亲于妊娠18~21周抽取羊水15 mL进行产前基因诊断。结果:在887对育龄夫妇中检出31对高风险夫妇,其中25对常染色体隐性遗传病高风险夫妇,6对X连锁隐性遗传病高风险夫妇。在1774人(887对夫妻)中,678人为常染色体隐性遗传病携带者。高风险夫妇中GJB2基因携带率最高,其次为PAH基因与CFTR基因。有3对高风险夫妇妊娠期进行了产前诊断,1对夫妇因胎儿为囊性纤维化患儿选择了终止妊娠;另两对夫妇分别因胎儿为携带者和野生型表型选择继续妊娠,2例生后新生儿表型均正常。结论:育龄夫妇进行ECS有助于实施精准的产前诊断及生育指导,对降低出生缺陷有重要意义。 展开更多
关键词 扩展性携带者筛查 单基因遗传病 遗传咨询 产前诊断 高通量核苷酸序列分析
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人类子宫内膜的单细胞组学研究进展
9
作者 姜乐然 张园 +1 位作者 王琳 刁飞扬(审校) 《国际生殖健康/计划生育杂志》 2024年第3期216-221,共6页
子宫内膜中各种亚型细胞的表达和功能对于维持正常子宫内膜功能、提供胚胎植入环境非常重要。近年单细胞组学研究因其可以在单个细胞水平上对不同来源、不同时期子宫内膜进行高通量测序,逐渐成为子宫内膜相关基础研究和临床应用的一个... 子宫内膜中各种亚型细胞的表达和功能对于维持正常子宫内膜功能、提供胚胎植入环境非常重要。近年单细胞组学研究因其可以在单个细胞水平上对不同来源、不同时期子宫内膜进行高通量测序,逐渐成为子宫内膜相关基础研究和临床应用的一个重要研究手段。通过对子宫内膜相关单细胞组学的研究进行综述,包括子宫内膜生理状态,以及复发性流产、子宫内膜异位症、子宫腺肌病、薄型子宫内膜、宫腔粘连、反复种植失败以及子宫内膜癌等病理情况下子宫内膜单细胞层面差异、细胞间相互作用。更深入地理解单细胞组学在子宫内膜研究中的应用,有助于揭示子宫内膜相关疾病的病理生理机制。 展开更多
关键词 子宫内膜 单细胞分析 高通量核苷酸序列分析 容受性 胚胎植入
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绝经后女性宫内节育器相关卵巢脓肿术后继发脑脓肿一例
10
作者 白若妍 王炎强 陈京霞 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2024年第6期485-489,500,共6页
脑脓肿是卵巢脓肿的罕见并发症,在卵巢脓肿术后,即使经过抗感染治疗,仍可发生。报告1例57岁女性,在当地基层医院行宫内节育器取出术后出现排尿障碍伴下腹痛,考虑卵巢脓肿,行卵巢脓肿切除术。术后1个月患者出现持续性高热、头痛,磁共振... 脑脓肿是卵巢脓肿的罕见并发症,在卵巢脓肿术后,即使经过抗感染治疗,仍可发生。报告1例57岁女性,在当地基层医院行宫内节育器取出术后出现排尿障碍伴下腹痛,考虑卵巢脓肿,行卵巢脓肿切除术。术后1个月患者出现持续性高热、头痛,磁共振成像提示为脑脓肿,给予抗感染、降低颅内压、纠正低白蛋白血症等治疗,病情稳定后出院。患者定期门诊复查,出院8个月后影像结果提示痊愈。结合该病例,总结卵巢脓肿术后继发脑脓肿的发病机制、临床表现、诊疗方法及预防。 展开更多
关键词 卵巢 脓肿 脑脓肿 人葡萄球菌 宫内节育器 宏基因组 高通量核苷酸序列分析
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人类变应性鼻炎基因表达谱的研究 被引量:5
11
作者 刘冰 吴建 +3 位作者 赵舒薇 范静平 孙爱华 陈珏 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 北大核心 2008年第3期149-152,共4页
目的利用基因表达谱芯片研究变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)基因表达谱的改变,从基因水平上探索AR发病机制。方法应用包含14500条人类全长基因的PCR产物为靶基因制成寡聚核苷酸基因芯片HG-U133A2.0(Affymetrix公司)检测6例AR鼻黏膜... 目的利用基因表达谱芯片研究变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)基因表达谱的改变,从基因水平上探索AR发病机制。方法应用包含14500条人类全长基因的PCR产物为靶基因制成寡聚核苷酸基因芯片HG-U133A2.0(Affymetrix公司)检测6例AR鼻黏膜组织以及6例正常鼻黏膜组织的基因表达谱,分析差异表达基因,并选择其中有差异表达的部分基因进行实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription- polymerase chain reaction,RT-PCR)验证。结果基因芯片筛选出差异表达基因161条,包括47条上调表达基因和114条下调表达基因。其中部分差异表达基因是炎性反应、免疫应答、免疫调控及信号传导的相关基因,实时荧光定量RT-PCR测定差异表达基因CCL20和GPK4的表达水平与基因芯片结果一致。结论AR的基因表达谱存在差异,这些差异表达基因为研究AR发病机制提供了线索,其中差异表达基因CCL20与GPK4可能通过影响细胞信号传导通路从而在AR发病中发挥一定作用。 展开更多
关键词 基因表达谱 鼻炎 变应性 常年性 寡聚核苷酸序列分析 逆转录聚合酶链反应
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从A型产气荚膜梭菌C57-1中发现β2毒素基因 被引量:3
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作者 陈小云 万建青 +2 位作者 程君生 关孚时 张存帅 《中国兽药杂志》 2005年第5期6-9,共4页
为了进一步研究A型产气荚膜梭菌C571株的遗传学背景,应用聚合酶链式反应(PCR)技术,从该菌株中扩增出大小为726bp的β2毒素基因(cpb2基因)的部分序列,并将其克隆入pMD18-T载体中。转化至受体菌DH5α后,经Amp/IPTG/X-Gal选择培养,提取质粒... 为了进一步研究A型产气荚膜梭菌C571株的遗传学背景,应用聚合酶链式反应(PCR)技术,从该菌株中扩增出大小为726bp的β2毒素基因(cpb2基因)的部分序列,并将其克隆入pMD18-T载体中。转化至受体菌DH5α后,经Amp/IPTG/X-Gal选择培养,提取质粒,筛选阳性重组克隆。核苷酸序列分析证实,该基因片段与文献报道的β2毒素基因序列一致。 展开更多
关键词 A型产气荚膜梭菌 毒素基因 聚合酶链式反应 核苷酸序列分析 IPTG 重组克隆 基因序列 文献报道 基因片段 遗传学 T载体 受体菌 Gal Amp
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牛线粒体DNA的研究方法 被引量:4
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作者 彭华 许尚忠 昝林森 《中国畜牧兽医》 CAS 2004年第9期29-31,共3页
mt DNA是真核生物核外唯一的遗传物质。由于 m t DNA的进化速率比单拷贝的 r DNA高 5~ 1 0倍 ,因此 m t DNA成为系统发育研究的有用工具。作者概述了迄今为止在研究牛的 mt DNA时所使用的方法 ,即 RFL P,核苷酸序列分析法及PCR- SSCP... mt DNA是真核生物核外唯一的遗传物质。由于 m t DNA的进化速率比单拷贝的 r DNA高 5~ 1 0倍 ,因此 m t DNA成为系统发育研究的有用工具。作者概述了迄今为止在研究牛的 mt DNA时所使用的方法 ,即 RFL P,核苷酸序列分析法及PCR- SSCP。并对这 3种方法进行了比较。 展开更多
关键词 MTDNA RFLP 核苷酸序列分析 PCR—SSCP
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复发性流产患者阴道菌群特征 被引量:4
14
作者 程阳 赵敏 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2022年第3期184-188,共5页
目的:分析复发性流产(recurrent spontaneous abortion,RSA)患者阴道菌群特征。方法:采集2020年12月—2021年9月就诊于山西省妇幼保健院的20例不明原因RSA患者(RSA组)和20例正常早孕人工流产患者(对照组)的阴道分泌物,采用16S rRNA高通... 目的:分析复发性流产(recurrent spontaneous abortion,RSA)患者阴道菌群特征。方法:采集2020年12月—2021年9月就诊于山西省妇幼保健院的20例不明原因RSA患者(RSA组)和20例正常早孕人工流产患者(对照组)的阴道分泌物,采用16S rRNA高通量测序技术分析2组患者阴道菌群的差异。结果:α多样性分析显示,2组Chao1指数、Shannon指数、Observed_OTU指数比较,差异无统计学意义(均P>0.05)。β多样性分析显示,2组阴道细菌群落结构显著不同(P<0.05)。分类学分析显示,在门、科、属水平,2组共同的优势菌为假单胞菌(变形菌门),假单胞菌在RSA组中门、科、属水平的丰度分别为22.8%、21.9%、21.9%,在对照组中的丰度分别为17.9%、17.3%、17.3%,RSA组假单胞菌的丰度明显增加。结论:RSA患者存在阴道菌群失衡,特定菌属(如假单胞菌)可能与RSA发生、发展有关。 展开更多
关键词 流产 习惯性 阴道 高通量核苷酸序列分析 阴道菌群 高通量测序
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辅助生殖领域中的精准医学 被引量:3
15
作者 郎鹏 时晓丹 张军强 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2021年第2期121-125,146,共6页
精准医学及其前沿技术促进了生殖医学的发展。高通量测序、全基因组关联研究(GWAS)、蛋白质组学技术成功用于不孕不育症的病因诊断、遗传病检测和胚胎植入前遗传学检测(PGT)的临床实践,单细胞全基因组扩增(eWGA)、生物大数据分析等近年... 精准医学及其前沿技术促进了生殖医学的发展。高通量测序、全基因组关联研究(GWAS)、蛋白质组学技术成功用于不孕不育症的病因诊断、遗传病检测和胚胎植入前遗传学检测(PGT)的临床实践,单细胞全基因组扩增(eWGA)、生物大数据分析等近年也应用于人类配子和胚胎早期发育的研究。例如通过GWAS确定了11个基因座、17个单核苷酸多态性(SNPs)与多囊卵巢综合征(PCOS)有很强的相关性;eWGA应用到PGT中,就可通过分析植入前胚胎中的单个细胞推断出卵子本身的全部基因组信息,从而减少先天性遗传缺陷婴儿的出生,降低辅助生殖的医源性风险;人工智能辅助(AI)方法在体外受精-胚胎移植过程中用于卵母细胞或胚胎选择,显示出越来越大的优势。本文综述精准医学在辅助生殖领域中的应用。 展开更多
关键词 精准医学 生殖技术 辅助 高通量核苷酸序列分析 不育 基因组学 人工智能
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高通量转录组测序技术在评价子宫内膜容受性中的应用价值 被引量:1
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作者 白塔吉 何金英 马玉珍 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2021年第1期49-52,78,共5页
良好的子宫内膜容受性是胚胎植入的关键因素,容受期子宫内膜组织的基因表达与容受性密切相关。通过高通量转录组测序技术可以获得月经不同时期子宫内膜基因表达图谱以及调控基因表达的微小RNA(miRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)序列,结合... 良好的子宫内膜容受性是胚胎植入的关键因素,容受期子宫内膜组织的基因表达与容受性密切相关。通过高通量转录组测序技术可以获得月经不同时期子宫内膜基因表达图谱以及调控基因表达的微小RNA(miRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)序列,结合生物信息学分析,可以更好地了解容受期子宫内膜特异基因表达,并为其调控机制的研究提供技术支持,对于不孕症患者以及反复植入失败患者的诊治具有非常重要的临床应用价值。对高通量转录组测序在子宫内膜容受性及胚胎植入方面的相关研究进行了综述。 展开更多
关键词 高通量核苷酸序列分析 植入窗 基因 子宫内膜 后成说 遗传 体外受精 胚胎移植
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