目的·分析线粒体核糖体蛋白L12(mitochondrial ribosomal protein L12,MRPL12)在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)和正常组织中的表达差异和对患者预后的影响,以及预测其生物学功能。方法·利用肿瘤浸润性免疫细胞分析数据库T...目的·分析线粒体核糖体蛋白L12(mitochondrial ribosomal protein L12,MRPL12)在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)和正常组织中的表达差异和对患者预后的影响,以及预测其生物学功能。方法·利用肿瘤浸润性免疫细胞分析数据库TIMER和GEPIA(gene expression profiling and interactive analyses)交互式网站服务器分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中MRPL12在不同癌组织中的表达情况的影响。利用Sangerbox生物信息分析平台对MRPL12差异表达的癌症类型进行Cox回归和Kaplan-Meier生存分析,评估风险比(hazard ratio,HR)、95%置信区间(confidence interval,CI)和Log-rank P值。采用UALCAN数据分析平台评估MRPL12蛋白表达与临床病理参数的关系。使用LinkedOmics数据库筛选与MRPL12表达相关的基因。采用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。定量聚合酶链反应验证MRPL12在细胞中的转录水平。结果·MRPL12在多种癌组织中显著高表达,但只有在LUAD中MRPL12的高表达与患者较差的总体生存期(overall suivival,OS)和疾病特异性生存期(disease-specific survival,DSS)相关;肿瘤分级程度越高的LUAD患者MRPL12蛋白表达水平越高;在LUAD基因表达数据集中与MRPL12负相关的基因富集到癌症通路(P=0.000)、癌症蛋白聚糖(P=0.000)、非小细胞肺癌(P=0.000)等癌症相关的通路。MRPL12在LUAD细胞(H1395、H1975和HCC827)中的mRNA表达水平高于正常细胞(Beas-2B),差异有统计学意义(P<0.05)。结论·MRPL12高表达的LUAD患者可能预后较差;MRPL12可以作为LUAD预后不良的潜在生物标志物和潜在的治疗新靶点。展开更多
目的:儿童白血病细胞全基因组芯片数据聚类分析发现,核糖体蛋白L4(ribosomal protein L4,RPL4)启动子区域具有转录因子Runx1的结合位点TTCATTCT,由此推测Runx1可能与该基因启动子之间存在调控作用。本研究通过观察Runx1蛋白与RPL4启动...目的:儿童白血病细胞全基因组芯片数据聚类分析发现,核糖体蛋白L4(ribosomal protein L4,RPL4)启动子区域具有转录因子Runx1的结合位点TTCATTCT,由此推测Runx1可能与该基因启动子之间存在调控作用。本研究通过观察Runx1蛋白与RPL4启动子之间的相互作用,了解Runx1对RPL4启动子转录活性的影响,探讨其在儿童白血病发生机制中的意义。方法:构建含RPL4启动子及其突变体的荧光素酶报告质粒,与Runx1的表达质粒共转染293T细胞,进行荧光素酶活性分析。结果:Runx1蛋白可使RPL4启动子的转录活性降低(P<0.01);随着Runx1剂量的增加,RPL4启动子的转录水平呈剂量依赖性降低(P<0.01);Runx1蛋白对RPL4启动子的突变体转录活性无调控作用(P>0.05)。结论:Runx1蛋白对RPL4启动子具有转录抑制作用,且具有明显的剂量依赖性;Runx1蛋白通过结合RPL4启动子区域的TTCATTCT位点发挥调控作用。展开更多
文摘目的·分析线粒体核糖体蛋白L12(mitochondrial ribosomal protein L12,MRPL12)在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)和正常组织中的表达差异和对患者预后的影响,以及预测其生物学功能。方法·利用肿瘤浸润性免疫细胞分析数据库TIMER和GEPIA(gene expression profiling and interactive analyses)交互式网站服务器分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中MRPL12在不同癌组织中的表达情况的影响。利用Sangerbox生物信息分析平台对MRPL12差异表达的癌症类型进行Cox回归和Kaplan-Meier生存分析,评估风险比(hazard ratio,HR)、95%置信区间(confidence interval,CI)和Log-rank P值。采用UALCAN数据分析平台评估MRPL12蛋白表达与临床病理参数的关系。使用LinkedOmics数据库筛选与MRPL12表达相关的基因。采用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。定量聚合酶链反应验证MRPL12在细胞中的转录水平。结果·MRPL12在多种癌组织中显著高表达,但只有在LUAD中MRPL12的高表达与患者较差的总体生存期(overall suivival,OS)和疾病特异性生存期(disease-specific survival,DSS)相关;肿瘤分级程度越高的LUAD患者MRPL12蛋白表达水平越高;在LUAD基因表达数据集中与MRPL12负相关的基因富集到癌症通路(P=0.000)、癌症蛋白聚糖(P=0.000)、非小细胞肺癌(P=0.000)等癌症相关的通路。MRPL12在LUAD细胞(H1395、H1975和HCC827)中的mRNA表达水平高于正常细胞(Beas-2B),差异有统计学意义(P<0.05)。结论·MRPL12高表达的LUAD患者可能预后较差;MRPL12可以作为LUAD预后不良的潜在生物标志物和潜在的治疗新靶点。
文摘目的:儿童白血病细胞全基因组芯片数据聚类分析发现,核糖体蛋白L4(ribosomal protein L4,RPL4)启动子区域具有转录因子Runx1的结合位点TTCATTCT,由此推测Runx1可能与该基因启动子之间存在调控作用。本研究通过观察Runx1蛋白与RPL4启动子之间的相互作用,了解Runx1对RPL4启动子转录活性的影响,探讨其在儿童白血病发生机制中的意义。方法:构建含RPL4启动子及其突变体的荧光素酶报告质粒,与Runx1的表达质粒共转染293T细胞,进行荧光素酶活性分析。结果:Runx1蛋白可使RPL4启动子的转录活性降低(P<0.01);随着Runx1剂量的增加,RPL4启动子的转录水平呈剂量依赖性降低(P<0.01);Runx1蛋白对RPL4启动子的突变体转录活性无调控作用(P>0.05)。结论:Runx1蛋白对RPL4启动子具有转录抑制作用,且具有明显的剂量依赖性;Runx1蛋白通过结合RPL4启动子区域的TTCATTCT位点发挥调控作用。
