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家蚕微粒子病原虫(Nosema bombycis)小亚基核糖体RNA全基因的克隆及其二级结构的构建
被引量:
15
1
作者
王见杨
黄可威
陆长德
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第3期290-295,共6页
在用PCR技术扩增、克隆、测序了家蚕微粒子病原虫Nosemabombycis (镇江株 )小亚基核糖体RNA基因核心序列(5′ 端起 12 0 0bp)的基础上 ,用SSP PCR技术克隆了核心序列 3′ 端下游序列 ,从而获得了家蚕微粒子病原虫小亚基核糖体RNA基因的...
在用PCR技术扩增、克隆、测序了家蚕微粒子病原虫Nosemabombycis (镇江株 )小亚基核糖体RNA基因核心序列(5′ 端起 12 0 0bp)的基础上 ,用SSP PCR技术克隆了核心序列 3′ 端下游序列 ,从而获得了家蚕微粒子病原虫小亚基核糖体RNA基因的全序列共 12 33bp。用RnaViz、Forcon、DCSE等生物软件构建了家蚕微粒子病原虫小亚基核糖体RNA的二级结构 ,与其它微孢子虫及真核生物小亚基核糖体RNA的二级结构相比 ,该二级结构缺乏螺旋 10、E10 1、 11、 18、E2 3 n和43。
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关键词
家蚕微粒子病原虫
SSP-PCR
小亚
基
核糖体
rna
SSUr
rna
全
基
因
二级结构
螺旋
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职称材料
玉溪霍尔多巴吉鹅感染贝氏隐孢子虫的分子鉴定
2
作者
陈俊蓉
谢昕言
+2 位作者
贺君君
杨建发
王萍
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2024年第3期54-57,共4页
为了对云南省玉溪市某养殖场的霍尔多巴吉鹅进行隐孢子虫检测,本试验采集疑似感染隐孢子虫的霍尔多巴吉鹅的粪便样品,利用饱和盐水漂浮法进行镜检,并结合分子生物学鉴定方法,提取粪便样品DNA,采用巢氏PCR扩增隐孢子虫核糖体小亚基RNA(SS...
为了对云南省玉溪市某养殖场的霍尔多巴吉鹅进行隐孢子虫检测,本试验采集疑似感染隐孢子虫的霍尔多巴吉鹅的粪便样品,利用饱和盐水漂浮法进行镜检,并结合分子生物学鉴定方法,提取粪便样品DNA,采用巢氏PCR扩增隐孢子虫核糖体小亚基RNA(SSU rRNA)基因,测序后通过NCBI进行Blast在线比对,构建系统发育进化树。结果显示,所采集的鹅粪便样品中,隐孢子虫检出率为20.45%(9/44);隐孢子虫SSU rRNA基因的PCR扩增结果显示,该鹅源隐孢子虫与贝氏隐孢子虫同源性达100%;系统进化分析显示,二者位于同一分支。结果表明,该养殖场的霍尔多巴吉鹅存在贝氏隐孢子虫感染。
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关键词
核糖体小亚基rna
(SSU
r
rna
)
贝氏隐孢子虫
霍尔多巴吉鹅
分子鉴定
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职称材料
陕南白山羊感染泰勒虫的种类鉴定及其遗传进化分析
被引量:
8
3
作者
于正青
宋军科
+3 位作者
张会军
刘婷丽
范现成
赵光辉
《动物医学进展》
北大核心
2018年第8期1-5,共5页
为了解陕南地区白山羊泰勒虫的感染情况,采用形态学和分子生物学相结合的方法对121份来自陕西省陕南地区白山羊的血液样品进行检测。血液涂片染色后形态学检测结果表明,112份血液涂片的红细胞中存在大小约1μm,呈圆点形、卵圆形或短杆...
为了解陕南地区白山羊泰勒虫的感染情况,采用形态学和分子生物学相结合的方法对121份来自陕西省陕南地区白山羊的血液样品进行检测。血液涂片染色后形态学检测结果表明,112份血液涂片的红细胞中存在大小约1μm,呈圆点形、卵圆形或短杆状多形性虫体。基于泰勒虫SSU rRNA基因位点对提取的血液样品DNA进行套式PCR扩增。结果表明,陕南地区白山羊的血液样品中泰勒虫阳性率为92.6%(112/121),且该结果与形态学检测结果相一致。通过比对发现,所获得的泰勒虫分离株与获取自GenBank中的吕氏泰勒虫相应基因序列序列同源性在99%以上。进一步构建遗传进化树发现,获得的泰勒虫分离株与吕氏泰勒虫(登录号:JN676988、AF081136)归于同一支,提示陕南地区白山羊感染的泰勒虫种为吕氏泰勒虫。
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关键词
陕南白山羊
泰勒虫
核糖体小亚基rna
种类
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职称材料
云南绵羊感染吕氏泰勒虫的鉴定及其遗传进化分析
被引量:
2
4
作者
王天葆
杨红远
+1 位作者
信爱国
高华峰
《上海畜牧兽医通讯》
2020年第3期13-16,共4页
为了解云南高海拔地区绵羊泰勒虫的分型,从临床上出现焦虫可疑临床症状的绵羊养殖场采集病料,通过形态学和分子生物学相结合的方法对16份来自高海拔地区昭通永善县的绵羊血液样品进行检测。血液涂片染色后形态学检测结果表明,其中4份血...
为了解云南高海拔地区绵羊泰勒虫的分型,从临床上出现焦虫可疑临床症状的绵羊养殖场采集病料,通过形态学和分子生物学相结合的方法对16份来自高海拔地区昭通永善县的绵羊血液样品进行检测。血液涂片染色后形态学检测结果表明,其中4份血液涂片的红细胞内虫体直径约0.5~1.5μm,呈圆点形、卵圆形或短杆状。血液样品DNA PCR扩增、焦虫18S序列比对及基于核糖体小亚基RNA(small subunit ribosamal RNA,SSU rRNA)基因位点分析结果表明,本次可疑送检绵羊的血液病原为吕氏泰勒虫,检测株与国内报道的感染株同源性为99.6%~100%,属同一亚型,未出现变异虫株。
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关键词
吕氏泰勒虫
鉴定
核糖体小亚基rna
遗传进化分析
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职称材料
芽囊原虫LAMP检测方法的建立及其在牦牛中的应用
被引量:
2
5
作者
王品雪
李云香
+3 位作者
姚倩
任玫
王丹
林青
《动物医学进展》
北大核心
2019年第10期18-23,共6页
环介导等温扩增技术(LAMP)作为一种新的分子检测技术,具有广阔的应用前景,为了将该技术应用于牦牛粪便样品中芽囊原虫的检测,提高芽囊原虫的筛查效率,利用芽囊原虫SSU rRNA基因设计引物,建立与优化芽囊原虫的LAMP检测方法,同时对已建立...
环介导等温扩增技术(LAMP)作为一种新的分子检测技术,具有广阔的应用前景,为了将该技术应用于牦牛粪便样品中芽囊原虫的检测,提高芽囊原虫的筛查效率,利用芽囊原虫SSU rRNA基因设计引物,建立与优化芽囊原虫的LAMP检测方法,同时对已建立的芽囊原虫LAMP检测方法进行特异性、灵敏度及重复性的试验,用102份牦牛粪便样品进行临床验证。结果表明,该方法在进行芽囊原虫检测时具有较高的特异性,优于PCR的敏感性、重复性与临床应用性。
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关键词
牦牛
芽囊原虫
环介导等温扩增技术
小亚
基
核糖体
rna
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职称材料
广西部分地区猪芽囊原虫的分子流行病学调查和亚型鉴定
6
作者
褚梦洁
宋雅菲
+4 位作者
卢惠红
刘洋
黄飞
王树艳
周东辉
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期645-649,共5页
目的了解广西部分地区猪芽囊原虫的感染情况和人兽共患特征,以评估人兽共患传播风险。方法本研究采用芽囊原虫小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因常规PCR检测技术对广西贺州、玉林、南宁、贵港、柳州5个地市猪场采集的894份猪粪便样品进行...
目的了解广西部分地区猪芽囊原虫的感染情况和人兽共患特征,以评估人兽共患传播风险。方法本研究采用芽囊原虫小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因常规PCR检测技术对广西贺州、玉林、南宁、贵港、柳州5个地市猪场采集的894份猪粪便样品进行芽囊原虫流行病学调查。结果芽囊原虫总感染率为21.9%(196/894)。在本次调查的地区中,贵港市的感染率最高为37.3%(66/177)、其余依次为玉林市24.1%(35/145)、南宁市20.6%(44/214)、贺州市19.7%(37/188)、柳州市8.2%(14/170)。此外,在不同群体猪中芽囊原虫感染率由高到低依次为仔猪39.5%(96/243)、育肥猪23.1%(52/225)、种猪14.1%(29/205)、保育猪8.6%(19/221)。集约化感染率20.9%(121/580),散户猪群感染率23.9%(75/314)。统计学分析表明,芽囊原虫在不同地区,不同群体猪中感染率差异有统计学意义,在不同养殖方式中感染率差异无统计学意义。在所有阳性样品中共发现ST1、ST5两种人兽共患亚型分别占总阳性率的4.6%(9/196)和95.4%(187/196),表明广西地区猪芽囊原虫存在潜在的人兽共患风险。结论本研究首次对广西5地市猪场芽囊原虫感染情况进行了调查,初步评估了广西地区猪芽囊原虫存在的人兽共患风险,为公共卫生学、猪场生物安全防控提供相关的流行病学参考。
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关键词
芽囊原虫
猪
小亚
基
核糖体
rna
ST1
ST5
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职称材料
题名
家蚕微粒子病原虫(Nosema bombycis)小亚基核糖体RNA全基因的克隆及其二级结构的构建
被引量:
15
1
作者
王见杨
黄可威
陆长德
机构
中国农业科学院蚕业研究所
中国科学院上海生物化学研究所
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第3期290-295,共6页
基金
国家"九五"科技攻关专题 ( 96 6 16 0 2 0 3)
江苏省"九五"科技攻关课题 (BE96 36 9 1)
文摘
在用PCR技术扩增、克隆、测序了家蚕微粒子病原虫Nosemabombycis (镇江株 )小亚基核糖体RNA基因核心序列(5′ 端起 12 0 0bp)的基础上 ,用SSP PCR技术克隆了核心序列 3′ 端下游序列 ,从而获得了家蚕微粒子病原虫小亚基核糖体RNA基因的全序列共 12 33bp。用RnaViz、Forcon、DCSE等生物软件构建了家蚕微粒子病原虫小亚基核糖体RNA的二级结构 ,与其它微孢子虫及真核生物小亚基核糖体RNA的二级结构相比 ,该二级结构缺乏螺旋 10、E10 1、 11、 18、E2 3 n和43。
关键词
家蚕微粒子病原虫
SSP-PCR
小亚
基
核糖体
rna
SSUr
rna
全
基
因
二级结构
螺旋
Keywords
Nosema bombycis
SSP-PCR
SSUr
rna
gene
secondary structure
helix
分类号
Q965.8 [生物学—昆虫学]
Q522 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
玉溪霍尔多巴吉鹅感染贝氏隐孢子虫的分子鉴定
2
作者
陈俊蓉
谢昕言
贺君君
杨建发
王萍
机构
云南农业大学动物医学院
玉溪农业职业技术学院动物科技学院
出处
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2024年第3期54-57,共4页
基金
云南省朱兴全专家工作站项目(202005AF150041)
云南农业大学兽医公共卫生省创新团队项目(202105AE160014)。
文摘
为了对云南省玉溪市某养殖场的霍尔多巴吉鹅进行隐孢子虫检测,本试验采集疑似感染隐孢子虫的霍尔多巴吉鹅的粪便样品,利用饱和盐水漂浮法进行镜检,并结合分子生物学鉴定方法,提取粪便样品DNA,采用巢氏PCR扩增隐孢子虫核糖体小亚基RNA(SSU rRNA)基因,测序后通过NCBI进行Blast在线比对,构建系统发育进化树。结果显示,所采集的鹅粪便样品中,隐孢子虫检出率为20.45%(9/44);隐孢子虫SSU rRNA基因的PCR扩增结果显示,该鹅源隐孢子虫与贝氏隐孢子虫同源性达100%;系统进化分析显示,二者位于同一分支。结果表明,该养殖场的霍尔多巴吉鹅存在贝氏隐孢子虫感染。
关键词
核糖体小亚基rna
(SSU
r
rna
)
贝氏隐孢子虫
霍尔多巴吉鹅
分子鉴定
Keywords
small subunit ribosomal
rna
(SSU r
rna
)
Cryptosporidium baileyi
Hortobagyi
molecular identification
分类号
S855.9 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
陕南白山羊感染泰勒虫的种类鉴定及其遗传进化分析
被引量:
8
3
作者
于正青
宋军科
张会军
刘婷丽
范现成
赵光辉
机构
西北农林科技大学动物医学院
出处
《动物医学进展》
北大核心
2018年第8期1-5,共5页
基金
陕西省科学技术研究发展计划项目(2014K01-17-01)
西北农林科技大学大学生创新创业训练计划项目(2017校重点)
文摘
为了解陕南地区白山羊泰勒虫的感染情况,采用形态学和分子生物学相结合的方法对121份来自陕西省陕南地区白山羊的血液样品进行检测。血液涂片染色后形态学检测结果表明,112份血液涂片的红细胞中存在大小约1μm,呈圆点形、卵圆形或短杆状多形性虫体。基于泰勒虫SSU rRNA基因位点对提取的血液样品DNA进行套式PCR扩增。结果表明,陕南地区白山羊的血液样品中泰勒虫阳性率为92.6%(112/121),且该结果与形态学检测结果相一致。通过比对发现,所获得的泰勒虫分离株与获取自GenBank中的吕氏泰勒虫相应基因序列序列同源性在99%以上。进一步构建遗传进化树发现,获得的泰勒虫分离株与吕氏泰勒虫(登录号:JN676988、AF081136)归于同一支,提示陕南地区白山羊感染的泰勒虫种为吕氏泰勒虫。
关键词
陕南白山羊
泰勒虫
核糖体小亚基rna
种类
Keywords
Shaannan white goat
Theileria
small subunit ribosomal
rna
species
分类号
S852.723 [农业科学—基础兽医学]
S858.27 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
云南绵羊感染吕氏泰勒虫的鉴定及其遗传进化分析
被引量:
2
4
作者
王天葆
杨红远
信爱国
高华峰
机构
云南省畜牧兽医科学院
广南县旧莫乡畜牧兽医站
出处
《上海畜牧兽医通讯》
2020年第3期13-16,共4页
基金
省产业技术领军人才专项(YNWR-CYJS-2018-047)
云南省肉羊产业技术体系。
文摘
为了解云南高海拔地区绵羊泰勒虫的分型,从临床上出现焦虫可疑临床症状的绵羊养殖场采集病料,通过形态学和分子生物学相结合的方法对16份来自高海拔地区昭通永善县的绵羊血液样品进行检测。血液涂片染色后形态学检测结果表明,其中4份血液涂片的红细胞内虫体直径约0.5~1.5μm,呈圆点形、卵圆形或短杆状。血液样品DNA PCR扩增、焦虫18S序列比对及基于核糖体小亚基RNA(small subunit ribosamal RNA,SSU rRNA)基因位点分析结果表明,本次可疑送检绵羊的血液病原为吕氏泰勒虫,检测株与国内报道的感染株同源性为99.6%~100%,属同一亚型,未出现变异虫株。
关键词
吕氏泰勒虫
鉴定
核糖体小亚基rna
遗传进化分析
分类号
S858.26 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
芽囊原虫LAMP检测方法的建立及其在牦牛中的应用
被引量:
2
5
作者
王品雪
李云香
姚倩
任玫
王丹
林青
机构
西北农林科技大学动物医学院
青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室
青海大学农牧学院
出处
《动物医学进展》
北大核心
2019年第10期18-23,共6页
基金
青海省科技厅项目(2016-ZJ-754
2016-ZJ-Y01)
青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室自主课题项目(2017-ZZ-08)
文摘
环介导等温扩增技术(LAMP)作为一种新的分子检测技术,具有广阔的应用前景,为了将该技术应用于牦牛粪便样品中芽囊原虫的检测,提高芽囊原虫的筛查效率,利用芽囊原虫SSU rRNA基因设计引物,建立与优化芽囊原虫的LAMP检测方法,同时对已建立的芽囊原虫LAMP检测方法进行特异性、灵敏度及重复性的试验,用102份牦牛粪便样品进行临床验证。结果表明,该方法在进行芽囊原虫检测时具有较高的特异性,优于PCR的敏感性、重复性与临床应用性。
关键词
牦牛
芽囊原虫
环介导等温扩增技术
小亚
基
核糖体
rna
Keywords
yak
Blastocystis
loop-mediated isothermal amplification
small subunit ribosomal
rna
分类号
S852.729 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
广西部分地区猪芽囊原虫的分子流行病学调查和亚型鉴定
6
作者
褚梦洁
宋雅菲
卢惠红
刘洋
黄飞
王树艳
周东辉
机构
福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)
广西农业职业技术大学
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期645-649,共5页
基金
福建省自然科学基金项目(No.2022J01131)
广西自然科学基金项目(No.2019GXNSFBA185009)
教育教学改革项目(No.712018270377)联合资助。
文摘
目的了解广西部分地区猪芽囊原虫的感染情况和人兽共患特征,以评估人兽共患传播风险。方法本研究采用芽囊原虫小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因常规PCR检测技术对广西贺州、玉林、南宁、贵港、柳州5个地市猪场采集的894份猪粪便样品进行芽囊原虫流行病学调查。结果芽囊原虫总感染率为21.9%(196/894)。在本次调查的地区中,贵港市的感染率最高为37.3%(66/177)、其余依次为玉林市24.1%(35/145)、南宁市20.6%(44/214)、贺州市19.7%(37/188)、柳州市8.2%(14/170)。此外,在不同群体猪中芽囊原虫感染率由高到低依次为仔猪39.5%(96/243)、育肥猪23.1%(52/225)、种猪14.1%(29/205)、保育猪8.6%(19/221)。集约化感染率20.9%(121/580),散户猪群感染率23.9%(75/314)。统计学分析表明,芽囊原虫在不同地区,不同群体猪中感染率差异有统计学意义,在不同养殖方式中感染率差异无统计学意义。在所有阳性样品中共发现ST1、ST5两种人兽共患亚型分别占总阳性率的4.6%(9/196)和95.4%(187/196),表明广西地区猪芽囊原虫存在潜在的人兽共患风险。结论本研究首次对广西5地市猪场芽囊原虫感染情况进行了调查,初步评估了广西地区猪芽囊原虫存在的人兽共患风险,为公共卫生学、猪场生物安全防控提供相关的流行病学参考。
关键词
芽囊原虫
猪
小亚
基
核糖体
rna
ST1
ST5
Keywords
Blastocystis
swine
SSU r
rna
ST1
ST5
分类号
R382 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
家蚕微粒子病原虫(Nosema bombycis)小亚基核糖体RNA全基因的克隆及其二级结构的构建
王见杨
黄可威
陆长德
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2002
15
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职称材料
2
玉溪霍尔多巴吉鹅感染贝氏隐孢子虫的分子鉴定
陈俊蓉
谢昕言
贺君君
杨建发
王萍
《中国兽医杂志》
CAS
北大核心
2024
0
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职称材料
3
陕南白山羊感染泰勒虫的种类鉴定及其遗传进化分析
于正青
宋军科
张会军
刘婷丽
范现成
赵光辉
《动物医学进展》
北大核心
2018
8
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职称材料
4
云南绵羊感染吕氏泰勒虫的鉴定及其遗传进化分析
王天葆
杨红远
信爱国
高华峰
《上海畜牧兽医通讯》
2020
2
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职称材料
5
芽囊原虫LAMP检测方法的建立及其在牦牛中的应用
王品雪
李云香
姚倩
任玫
王丹
林青
《动物医学进展》
北大核心
2019
2
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职称材料
6
广西部分地区猪芽囊原虫的分子流行病学调查和亚型鉴定
褚梦洁
宋雅菲
卢惠红
刘洋
黄飞
王树艳
周东辉
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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