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桃花水母的核糖体RNA基因ITS区序列分析及物种鉴定
被引量：
3
1
作者
迟艳红
陈华增
+4 位作者
杨翠华
孙玉苗
齐继光
刘光兴
王玮
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期35-40,共6页
利用PCR扩增和DNA测序技术,获得了青岛野外采集到的桃花水母(Craspedacusta)核糖体RNA基因ITS区序列。序列比对以及系统进化分析显示,在青岛采集到的桃花水母与索氏桃花水母(Craspedacusta sowerbyi)的ITS区序列相似度最高,同源性在93%...
利用PCR扩增和DNA测序技术,获得了青岛野外采集到的桃花水母(Craspedacusta)核糖体RNA基因ITS区序列。序列比对以及系统进化分析显示,在青岛采集到的桃花水母与索氏桃花水母(Craspedacusta sowerbyi)的ITS区序列相似度最高,同源性在93%以上;同时,在系统发育树中也与索氏桃花水母聚为一支。研究结果表明,青岛采集到的桃花水母为索氏桃花水母,这也是青岛地区桃花水母的新记录。
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关键词
桃花水母(Craspedacusta)
核糖体
RNA
基因its
区
基因
克隆
序列分析
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职称材料
甘肃小麦禾谷孢囊线虫rDNA-ITS和28SrDNA-D2/D3区序列特征及ITS-RFLP分析
被引量：
18
2
作者
叶文兴
徐秉良
+1 位作者
彭德良
黄文坤
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期58-65,共8页
禾谷孢囊线虫是危害禾谷类作物的重要病原,严重威胁我国小麦主产区的小麦产量和品质。利用通用引物对甘肃、河南、安徽禾谷孢囊线虫群体28SrDNA-D2/D3区和rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列测定,利用UPG-MA方法分析了甘肃省7个种群、河南1个...
禾谷孢囊线虫是危害禾谷类作物的重要病原,严重威胁我国小麦主产区的小麦产量和品质。利用通用引物对甘肃、河南、安徽禾谷孢囊线虫群体28SrDNA-D2/D3区和rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列测定,利用UPG-MA方法分析了甘肃省7个种群、河南1个种群、安徽1个种群的禾谷孢囊线虫群体D2/D3区和ITS区的系统发育关系;用9种限制性内切酶对7个甘肃禾谷孢囊线虫群体的rDNA-ITS区进行了RFLP分析。结果表明:中国甘肃的禾谷孢囊线虫rDNA-D2/D3区片段长度约为780bp,rDNA-ITS片段长度约为1040bp。7个甘肃禾谷孢囊线虫群体、1个河南安阳群体、1个安徽蚌埠群体的D2/D3区和新西兰的H.aucklandica群体亲缘关系很近;其ITS区同澳大利亚的H.australis、北京通州的H.avenae(AY148382)的亲缘关系很接近。RFLP分析表明,9种限制性内切酶酶切禾谷孢囊线虫群体的rDNA-ITS共产生了22个酶切片段,不同酶切的RFLP分布型在7个种群间没有差异。甘肃省禾谷孢囊线虫群体的rDNA-ITS区具有高度的保守性,与中国的C型群体相近,但不同于欧洲的A型群体和印度的B型群体。这是首次报道甘肃CCN种群分子特征。
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关键词
禾谷孢囊线虫
核糖体
基因
D2/D3
区
核糖体基因its区
ITS-RFLP
序列分析
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职称材料
题名
桃花水母的核糖体RNA基因ITS区序列分析及物种鉴定
被引量：
3
1
作者
迟艳红
陈华增
杨翠华
孙玉苗
齐继光
刘光兴
王玮
机构
青岛海产博物馆
中国科学院海洋研究所
中国海洋大学环境科学与工程学院
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期35-40,共6页
基金
科技基础性工作专项项目(2012FY112200)~~
文摘
利用PCR扩增和DNA测序技术,获得了青岛野外采集到的桃花水母(Craspedacusta)核糖体RNA基因ITS区序列。序列比对以及系统进化分析显示,在青岛采集到的桃花水母与索氏桃花水母(Craspedacusta sowerbyi)的ITS区序列相似度最高,同源性在93%以上;同时,在系统发育树中也与索氏桃花水母聚为一支。研究结果表明,青岛采集到的桃花水母为索氏桃花水母,这也是青岛地区桃花水母的新记录。
关键词
桃花水母(Craspedacusta)
核糖体
RNA
基因its
区
基因
克隆
序列分析
Keywords
Craspedacusta
ITS region
Gene cloning
Sequence analysis
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
甘肃小麦禾谷孢囊线虫rDNA-ITS和28SrDNA-D2/D3区序列特征及ITS-RFLP分析
被引量：
18
2
作者
叶文兴
徐秉良
彭德良
黄文坤
机构
甘肃农业大学草业学院
中国农业科学院植物保护研究所
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期58-65,共8页
基金
公益性行业(农业)科研专项(200903040)
国家自然科学基金项目(30921140411)
科技部国际合作项目(2009DFB30230)
文摘
禾谷孢囊线虫是危害禾谷类作物的重要病原,严重威胁我国小麦主产区的小麦产量和品质。利用通用引物对甘肃、河南、安徽禾谷孢囊线虫群体28SrDNA-D2/D3区和rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列测定,利用UPG-MA方法分析了甘肃省7个种群、河南1个种群、安徽1个种群的禾谷孢囊线虫群体D2/D3区和ITS区的系统发育关系;用9种限制性内切酶对7个甘肃禾谷孢囊线虫群体的rDNA-ITS区进行了RFLP分析。结果表明:中国甘肃的禾谷孢囊线虫rDNA-D2/D3区片段长度约为780bp,rDNA-ITS片段长度约为1040bp。7个甘肃禾谷孢囊线虫群体、1个河南安阳群体、1个安徽蚌埠群体的D2/D3区和新西兰的H.aucklandica群体亲缘关系很近;其ITS区同澳大利亚的H.australis、北京通州的H.avenae(AY148382)的亲缘关系很接近。RFLP分析表明,9种限制性内切酶酶切禾谷孢囊线虫群体的rDNA-ITS共产生了22个酶切片段,不同酶切的RFLP分布型在7个种群间没有差异。甘肃省禾谷孢囊线虫群体的rDNA-ITS区具有高度的保守性,与中国的C型群体相近,但不同于欧洲的A型群体和印度的B型群体。这是首次报道甘肃CCN种群分子特征。
关键词
禾谷孢囊线虫
核糖体
基因
D2/D3
区
核糖体基因its区
ITS-RFLP
序列分析
Keywords
Heterodera avenae
rDNA-D2/D3
rDNA-ITS
ITS-RFLP
sequences analysis
分类号
S435.121.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
桃花水母的核糖体RNA基因ITS区序列分析及物种鉴定
迟艳红
陈华增
杨翠华
孙玉苗
齐继光
刘光兴
王玮
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
甘肃小麦禾谷孢囊线虫rDNA-ITS和28SrDNA-D2/D3区序列特征及ITS-RFLP分析
叶文兴
徐秉良
彭德良
黄文坤
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2010
18
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