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浙江省水稻种质资源的遗传相似度分析
1
作者
严志琴
章孟臣
+6 位作者
陈小央
李燕
徐群
王珊
冯跃
魏兴华
杨窑龙
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第9期1734-1743,I0001-I0009,共19页
浙江省水稻栽培历史悠久,拥有丰富的稻种资源。目前保存在国家水稻种质资源中期库(杭州)的浙江省稻种资源共有2000余份,但并没有进行系统的筛选鉴定,导致一些稻种资源重复保存。以1970份浙江省原产稻种资源为研究材料,利用第二代重测序...
浙江省水稻栽培历史悠久,拥有丰富的稻种资源。目前保存在国家水稻种质资源中期库(杭州)的浙江省稻种资源共有2000余份,但并没有进行系统的筛选鉴定,导致一些稻种资源重复保存。以1970份浙江省原产稻种资源为研究材料,利用第二代重测序技术构建了浙江省稻种资源的基因组变异图谱,通过测序深度、连锁不平衡、缺失率等条件对SNP进行过滤,筛选10532个核心SNP标记用于遗传相似度计算。对13组主要的同名品种进行分析,同名品种之间的遗传相似度均未超过0.95,且相互之间存在较大的表型变异,因此同名材料间实际为不同的水稻品种。同时利用1970份材料的核心SNP标记,通过计算两两遗传相似度,筛选出11个高遗传相似度的材料组合。比较表型鉴定结果、植株形态特征发现,高遗传相似度的材料具有高度相似的表型与田间表现,在一定程度上证实了遗传相似度在水稻品种鉴定中的有效性。本研究基本摸清了浙江省水稻种质资源保存现状,揭示了同名品种不一定为重复品种,而异名品种也可能属于同一品种,为浙江省水稻种质资源的保护和利用提供了重要的科学依据。
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关键词
稻种资源
核心snp标记
遗传相似度
表型变异
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题名
浙江省水稻种质资源的遗传相似度分析
1
作者
严志琴
章孟臣
陈小央
李燕
徐群
王珊
冯跃
魏兴华
杨窑龙
机构
中国水稻研究所/水稻生物育种全国重点实验室
浙江省种子管理总站
中国农业科学院国家南繁研究院
出处
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第9期1734-1743,I0001-I0009,共19页
基金
浙江省水稻精准鉴定项目(2022JZJD001)
中国农业科学院南繁专项(YBXM2421)
中国农业科学院科技创新工程。
文摘
浙江省水稻栽培历史悠久,拥有丰富的稻种资源。目前保存在国家水稻种质资源中期库(杭州)的浙江省稻种资源共有2000余份,但并没有进行系统的筛选鉴定,导致一些稻种资源重复保存。以1970份浙江省原产稻种资源为研究材料,利用第二代重测序技术构建了浙江省稻种资源的基因组变异图谱,通过测序深度、连锁不平衡、缺失率等条件对SNP进行过滤,筛选10532个核心SNP标记用于遗传相似度计算。对13组主要的同名品种进行分析,同名品种之间的遗传相似度均未超过0.95,且相互之间存在较大的表型变异,因此同名材料间实际为不同的水稻品种。同时利用1970份材料的核心SNP标记,通过计算两两遗传相似度,筛选出11个高遗传相似度的材料组合。比较表型鉴定结果、植株形态特征发现,高遗传相似度的材料具有高度相似的表型与田间表现,在一定程度上证实了遗传相似度在水稻品种鉴定中的有效性。本研究基本摸清了浙江省水稻种质资源保存现状,揭示了同名品种不一定为重复品种,而异名品种也可能属于同一品种,为浙江省水稻种质资源的保护和利用提供了重要的科学依据。
关键词
稻种资源
核心snp标记
遗传相似度
表型变异
Keywords
rice germplasm resources
core
snp
markers
genetic similarity
phenotypic variation
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
浙江省水稻种质资源的遗传相似度分析
严志琴
章孟臣
陈小央
李燕
徐群
王珊
冯跃
魏兴华
杨窑龙
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025
0
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