基于最新参考序列UM_NZW_1.0绘制家兔基因组NUMTs图谱

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作者 周鑫 杨铖 +5 位作者 朱桂名 何黔蓉 李岩 樊新忠 宁超 王丹 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第4期1660-1670,共11页

【目的】核内线粒体DNA序列(nuclear mitochondrial DNA segments, NUMTs)是线粒体DNA插入并整合到核基因组形成的。本研究基于家兔最新参考基因组序列UM_NZW_1.0绘制家兔基因组NUMTs图谱,分析NUMTs的分布特征、基因组环境偏好性并预测... 【目的】核内线粒体DNA序列(nuclear mitochondrial DNA segments, NUMTs)是线粒体DNA插入并整合到核基因组形成的。本研究基于家兔最新参考基因组序列UM_NZW_1.0绘制家兔基因组NUMTs图谱,分析NUMTs的分布特征、基因组环境偏好性并预测其生物学功能,从而解析家兔基因组中的NUMTs信息。【方法】将家兔最新版参考基因组UM_NZW_1.0的染色体DNA序列与线粒体DNA序列进行比对,获得NUMTs信息,并统计NUMTs序列长度及在染色体上的分布情况。将NUMTs片段整合为NUMTs区域分析插入事件,分析NUMTs插入核基因组位置的GC含量、重复序列比例,以及NUMTs插入基因组的环境偏好性;统计NUMTs同源序列在线粒体基因组的分布情况,对NUMTs覆盖的基因进行功能注释,并推测NUMTs生物功能。【结果】在兔基因组中共检测到237条NUMTs序列,其中3、5、6、8、10号染色体上不存在NUMTs,总长度311 549 bp,占参考基因组总大小的0.015512%,这些NUMTs可能由87个NUMTs插入事件形成。NUMTs在兔基因组中GC含量较低、重复序列较多的区域更易形成,表明家兔基因组NUMTs的形成不是随机性的。整个线粒体基因组序列都形成过NUMTs,其中COX1、COX2、ND2、tRNA-C、tRNA-A、tRNA-W、tRNA-V等基因覆盖次数≥20。通过功能注释NUMTs及其上、下游1 000 bp区域覆盖的基因,推测NUMTs可能与生殖和神经系统等功能有关。【结论】在家兔进化过程中,线粒体基因组序列都曾插入整合到染色体形成NUMTs,但并不是所有染色体都存在NUMTs, NUMTs倾向在基因组中GC含量较低、重复序列较多的区域形成,NUMTs可能与家兔生殖和神经系统等功能有关。本研究结果为家兔分子育种提供了遗传信息。 展开更多

关键词 核内线粒体DNA序列(NUMTs) 家兔 核基因组

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基于脉冲序列核的脉冲神经元监督学习算法 被引量：3

2

作者 蔺想红 王向文 党小超 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2877-2886,共10页

脉冲神经元应用脉冲时间编码神经信息,监督学习的目标是对于给定的突触输入产生任意的期望脉冲序列.但由于神经元脉冲发放过程的不连续性,构建高效的脉冲神经元监督学习算法非常困难,同时也是该研究领域的重要问题.基于脉冲序列的核函... 脉冲神经元应用脉冲时间编码神经信息,监督学习的目标是对于给定的突触输入产生任意的期望脉冲序列.但由于神经元脉冲发放过程的不连续性,构建高效的脉冲神经元监督学习算法非常困难,同时也是该研究领域的重要问题.基于脉冲序列的核函数定义,提出了一种新的脉冲神经元监督学习算法,特点是应用脉冲序列核构造多脉冲误差函数和对应的突触学习规则,并通过神经元的实际脉冲发放频率自适应地调整学习率.将该算法用于脉冲序列的学习任务,期望脉冲序列采用Poisson过程或线性方法编码,并分析了不同的核函数对算法学习性能的影响.实验结果表明该算法具有较高的学习精度和良好的适应能力,在处理复杂的时空脉冲模式学习问题时十分有效. 展开更多

关键词 脉冲神经元 监督学习 脉冲序列核 内积 脉冲序列学习

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家猪核DNA多态标记的克隆与序列分析 被引量：1

3

作者 陈建琴 常青 +2 位作者 周开亚 掌子凯 曹霄 《南京师大学报（自然科学版）》 CAS CSCD 2002年第4期95-99,共5页

　在太湖猪各类群遗传多样性RAPD分析的基础上,对太湖猪类群间或与其他猪品种间有差异的核DNA标记位点SANDX 1、SANDX 2及SANDX 3进行了克隆,并对SANDX 2、SANDX 3位点的序列进行了测定及e PCR、BLAST分析.

关键词 家猪 核DNA序列变异 NDNA 核基因组 分子标记 克隆 遗传多样性 太湖猪

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BS69的亚细胞定位及其核输出信号序列的分析鉴定 被引量：1

4

作者 张超 于波 +3 位作者 邵勇 杨虹 张伟 万峻 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期2145-2149,共5页

目的:分析腺病毒E1A相关蛋白BS69不同亚型的DNA序列,寻找新的核输出信号序列,并在Cos7细胞中表达确定其亚细胞定位。方法:分析数据库中不同BS69亚型DNA序列,与传统和输出信号序列比对,寻找可能的新的核输出信号序列。采用DNA重组技术把B... 目的:分析腺病毒E1A相关蛋白BS69不同亚型的DNA序列,寻找新的核输出信号序列,并在Cos7细胞中表达确定其亚细胞定位。方法:分析数据库中不同BS69亚型DNA序列,与传统和输出信号序列比对,寻找可能的新的核输出信号序列。采用DNA重组技术把BS69不同亚型片段的cDNA插入到真核表达载体pcDNA3.1上,转染Cos7细胞,用免疫荧光染色方法确定其亚细胞定位,用Western blotting方法验证不同亚型BS69在细胞中的功能。结果:在BS69亚型2上面发现1段富含亮氨酸的基因序列,与核输出信号序列极为相似。免疫荧光染色方法显示BS69亚型2定位于细胞浆中,而BS69亚型1和2个亚型共同序列编码的蛋白质则定位于细胞核中。BS69亚型2参与了EB病毒潜伏膜蛋白1(Epstein-Barrvirus latent membrane protein1,LMP1)介导的信号转导途径。结论:BS69不同亚型具有不同的亚细胞定位,因此具有不同的生物学功能,其中核蛋白是转录调控因子,细胞浆蛋白则可能参与鼻咽癌发生发展的调控。 展开更多

关键词 腺病毒EIA相关蛋白BS69 核输出信号序列 亚细胞定位 转录因子

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基于新序列核支持向量机的说话人识别 被引量：1

5

作者 李杰 王成儒 《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2009年第B10期25-28,共4页

为了更好地将区分式分类方法应用于说话者确认系统中,构建序列核支持向量机已成为说话人识别领域的研究热点与趋势。本文在研究可再生希尔伯特空间框架的基础之上构建出一个新的序列核来对语音序列间的相似性进行度量,并结合近年来提出... 为了更好地将区分式分类方法应用于说话者确认系统中,构建序列核支持向量机已成为说话人识别领域的研究热点与趋势。本文在研究可再生希尔伯特空间框架的基础之上构建出一个新的序列核来对语音序列间的相似性进行度量,并结合近年来提出针对支持向量机(SVM)跨信道子空间特征差异(ISV)所提出的归整技术(LFA,NAP,CSP),进一步优化序列核系统。在美国国家标准与技术研究所(NIST)2004年评测数据集的实验中,新序列核系统的识别率高于传统高斯混合模型(GMM)和基于广义线性区分性核(GLDS)的支持向量机。 展开更多

关键词 支持向量机 序列核 CSP NAP 说话人识别

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序列捕获的序列核变换方法

6

作者 田竹梅 吉江 +1 位作者 任国凤 李海霞 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2013年第5期1255-1259,共5页

在序列扩频、加扰通信系统中,通常采用连续接收信号并进行滑动相关运算的方法,通过搜索相关峰进行序列捕获,需要接收多个完整周期的序列。随着序列周期的加大,一方面需要花费大量的接收端存储资源,另一方面,相关运算的计算开销会呈指数... 在序列扩频、加扰通信系统中,通常采用连续接收信号并进行滑动相关运算的方法,通过搜索相关峰进行序列捕获,需要接收多个完整周期的序列。随着序列周期的加大,一方面需要花费大量的接收端存储资源,另一方面,相关运算的计算开销会呈指数增长,导致很难实时捕获长周期序列。为解决这一问题,提出了一种序列核变换方法,变换后的每个元素均包含有完整的序列信息,实现了序列信息压缩。然后,基于该变换方法将捕获过程分为序列检测和序列捕获两个阶段,只在检测到目标序列后才开始捕获,进一步降低了计算开销。理论分析和仿真验证表明,算法通过牺牲部分低信噪比环境下的捕获成功率换取了计算资源的大量减少,算法可在一个序列周期内快速捕获不同周期的m序列,并且所节省的计算资源随序列周期变大而增多。 展开更多

关键词 序列核变换 序列捕获 M序列 离散傅里叶变换

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基于多尺度序列谱核半定规划优化的签名认证方法

7

作者 邱德红 潘昕昕 陈传波 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第B12期44-49,共6页

变化尺度进行签名序列的相似性描述有利于获得更准确的相似性描述结果.本文定义了签名序列的变化尺度的谱核矩阵,在多个尺度的核变换空间上进行序列的相似性描述,并利用半定规划对多尺度谱核矩阵进行优化,结合支持向量机建立起一种能够... 变化尺度进行签名序列的相似性描述有利于获得更准确的相似性描述结果.本文定义了签名序列的变化尺度的谱核矩阵,在多个尺度的核变换空间上进行序列的相似性描述,并利用半定规划对多尺度谱核矩阵进行优化,结合支持向量机建立起一种能够自动优化签名序列多尺度相似性描述的认证方法.该方法能够适应不同个人的签名特点,克服统一尺度下相似性描述的缺陷,提高签名序列相似性描述的准确性,在相同签名数据集上的实验结果显示该方法可以获得更高的认证准确率. 展开更多

关键词 半定规划 序列谱核 签名认证

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一种概率序列核在说话人识别中的应用

8

作者 雷震春 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2011年第6期151-155,共5页

以说话人识别中的背景模型为基础,根据模型中的各个高斯分量,构造出说话人特征空间,将长度不一样的语句映射成为空间中大小相同的向量,且经过相关矩阵进行规整后,采用线性支持向量机进行说话人识别。借鉴几种常见的特征规整方式,结合语... 以说话人识别中的背景模型为基础,根据模型中的各个高斯分量,构造出说话人特征空间,将长度不一样的语句映射成为空间中大小相同的向量,且经过相关矩阵进行规整后,采用线性支持向量机进行说话人识别。借鉴几种常见的特征规整方式,结合语句映射后的向量,提出四种不同的规整方法:均值/方差规整、权重规整、WLOG规整和球形规整,并与概率序列核进行比较研究。根据语音特征向量序列中相邻的特征向量的前后转移关系,结合提出的概率序列核,构造出转移概率序列核。实验在NIST2001库上进行,结果表明概率序列核模型识别性能接近经典的UBM-MAP模型,将这两类模型得分进行融合,可非常明显地提高识别性能,进一步融合转移概率序列核后,性能还可提高19.1%。 展开更多

关键词 说话人识别 概率序列核 通用背景模型 支持向量机

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遗传性痉挛性截瘫患者ERDA1和SEF2-1基因三核苷酸重复序列的研究

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作者 郭辉 拉布 +8 位作者 耿德勤 刘焯霖 李洵桦 王学峰 徐评议 张成 陈素琴 徐兴顺 王一鸣 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期244-247,共4页

目的　对ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重复序列数目的遗传性痉挛性截瘫 (HSP)患者及正常人群中的分布和二者在逐代传递中的动态变化进行研究。方法　采用PCR扩增 ,聚丙烯酰胺凝胶电泳 ,GeneS can和Genotype软件分析的方法 ,对 7个... 目的　对ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重复序列数目的遗传性痉挛性截瘫 (HSP)患者及正常人群中的分布和二者在逐代传递中的动态变化进行研究。方法　采用PCR扩增 ,聚丙烯酰胺凝胶电泳 ,GeneS can和Genotype软件分析的方法 ,对 7个有 2～ 3代样本的HSP家系中的 6 2名HSP患者和家系中 10 5名表型正常的患者亲属 ,2 2名散发患者和 31名散发患者的一级亲属 ,以及 116名无血缘关系的正常人检测ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重复序列的数目。结果　ERDA1基因CAG/CTG重复序列的数目在正常人中范围为 9～ 82 (平均2 6 35± 2 0 35 ) ,HSP患者为 9～ 85 (平均 2 8 35± 2 3 4 1) ,患者亲属为 9～ 87(平均 2 6 36± 2 2 0 6 )。SEF2 1基因CTG重复序列的数目在正常人中范围为 2 3～ 4 9(平均 30 90± 6 95 ) ,HSP患者为 2 4～ 5 7(平均 31 17± 7 99) ,患者亲属为 18～ 5 3(平均 30 37± 7 0 2 )。两种三核甘酸重复序列数目在HSP患者与患者亲属之间 ,以及患者与无关正常人群之间比较均无显著性差异。尽管在逐代传递中ERDA1基因CAG/CTG重复序列数目有一定的动态变化 ,但与发病年龄和疾病的严重程度无关。而SEF2 1基因CTG重复序列数目在各代间稳定传递。结论　ERDA1基因CAG/CTG和SEF2 1基因CTG重? 展开更多

关键词 遗传性痉挛性截瘫 三核甘酸序列 相关关系

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基于脉冲序列合成核的脉冲神经元在线监督学习算法 被引量：3

10

作者 蔺想红 李丹 +1 位作者 王向文 张宁 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期197-202,共6页

脉冲神经网络使用时间编码的方式进行数据处理,是进行复杂时空信息处理的有效工具。为此,将多脉冲序列合成核引入脉冲序列处理过程,提出一种在线监督学习算法,采用累加和累积合成核机制进行实验学习,并与基于单一核函数的在线PSD算法进... 脉冲神经网络使用时间编码的方式进行数据处理,是进行复杂时空信息处理的有效工具。为此,将多脉冲序列合成核引入脉冲序列处理过程,提出一种在线监督学习算法,采用累加和累积合成核机制进行实验学习,并与基于单一核函数的在线PSD算法进行比较。实验结果表明,该算法具有较好的学习性能,特别在数据样本较大时优势更为突出。同时结果也表明,通过多个核函数的组合可以获得更稳定高效的脉冲序列合成核表示。 展开更多

关键词 脉冲神经元 在线学习 多脉冲序列核 卷积 监督学习

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番茄斑萎病毒属病毒SRNA序列比对 被引量：3

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作者 徐小刚 刘雅婷 +3 位作者 李永忠 何婷婷 韩毅 孙文涛 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期142-146,共5页

从生物信息数据库NCBI中搜索并下载最新有关番茄萎斑病毒属Tospovirus各种间SRNA片段全长序列以及该片段上NSs、N的核酸和蛋白质序列着手,运用DNAstar和DNAMAN以及NPSA等生物信息软件对其进行比对分析,结果发现,以NSs蛋白序列建立的系... 从生物信息数据库NCBI中搜索并下载最新有关番茄萎斑病毒属Tospovirus各种间SRNA片段全长序列以及该片段上NSs、N的核酸和蛋白质序列着手,运用DNAstar和DNAMAN以及NPSA等生物信息软件对其进行比对分析,结果发现,以NSs蛋白序列建立的系统进化树显示CCSV和TZSV之间的同源性为85.8%,IYSV和TYRV之间的同源性达90%,MYSV和PSMV间的同源性为97.5%;通过N蛋白序列分析显示,Tospovirus属中有7组同源性较高的种;在Tospovirus属病毒中非极性氨基酸含量最高,极性酸性氨基酸最少,比较TSWV中抗性破坏RB株系与普通株系在NSs、N核酸、蛋白质序列、氨基酸含量和蛋白质二级结构之间的差异,发现差异不显著. 展开更多

关键词 番茄斑萎病毒属 核壳体序列 S RNA上的非结构蛋白序列 抗性破坏

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二元互补序列的特征序列 被引量：5

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作者 张成 赵晓群 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第5期819-824,共6页

本文引入互补序列的特征序列的概念 ,定义每个互补序列包含两种特征序列 ,分别记为 1 特征序列和2 特征序列 .特征序列对研究互补序列的特性具有重要意义 .经分析发现当序列长度时N≥ 4 ,可以根据特征序列来判断互补序列等价类空间大小... 本文引入互补序列的特征序列的概念 ,定义每个互补序列包含两种特征序列 ,分别记为 1 特征序列和2 特征序列 .特征序列对研究互补序列的特性具有重要意义 .经分析发现当序列长度时N≥ 4 ,可以根据特征序列来判断互补序列等价类空间大小是 32还是 6 4 ,这对实际应用中互补序列的选取具有一定意义 ;本文对互补序列的各种构造方法进行了分析 ,发现通过每种构造方法构造出的互补序列其特征序列均具有某种特性 ,本文论证得出可以通过特征序列来判断互补序列是否是可构造的以及可以由哪种构造方法构造 ,并通过特征序列证实了长度为 2 0的互补序列的核的存在性 . 展开更多

关键词 互补序列 特征序列 等价类 互补序列的核

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AXI4总线核信号实时读出系统 被引量：1

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作者 王明 刘易 +1 位作者 洪旭 周建斌 《核电子学与探测技术》 CAS 北大核心 2020年第5期840-845,共6页

为了给核信号数字处理方法研究提供准确、可靠的数据,设计了AXI4总线核信号实时读出系统。系统以Zynq系列芯片为核心,采用乒乓方式缓存高速流式数据,使用AXI4总线实现可编程逻辑阵列与内部微处理器之间高速数据通信,最后通过千兆以太网... 为了给核信号数字处理方法研究提供准确、可靠的数据,设计了AXI4总线核信号实时读出系统。系统以Zynq系列芯片为核心,采用乒乓方式缓存高速流式数据,使用AXI4总线实现可编程逻辑阵列与内部微处理器之间高速数据通信,最后通过千兆以太网将微处理中的数据实时传输到PC机上,并保存数据到文件。结合NaI(T1)探测器和17Cs源,采用25MHz ADC对设计系统进行了实验测试。实验结果表明,系统实测180s,可实时读取9GB核信号数据,实现核信号高速.零丢失读出;168h长期稳定性测试表明系统最大数据丢失率为0.0146%,满足长期稳定工作要求。 展开更多

关键词 核信号序列 AXI4总线 乒乓缓存 Zynq XC7Z020

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不同亚细胞定位的alpha-突触核蛋白对SK-N-SH细胞的毒性影响 被引量：2

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作者 赵云 韩玉坤 +2 位作者 郑焱 杨慧 张建亮 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期164-170,共7页

在帕金森病中,alpha-突触核蛋白(α-synuclein)累积与聚集所产生的细胞毒性是发病的重要原因。本文目的是探求不同亚细胞定位的α-突触核蛋白对于细胞的毒性影响。分别在α-突触核蛋白前插入核输出序列(nuclear export sequence,NES)或... 在帕金森病中,alpha-突触核蛋白(α-synuclein)累积与聚集所产生的细胞毒性是发病的重要原因。本文目的是探求不同亚细胞定位的α-突触核蛋白对于细胞的毒性影响。分别在α-突触核蛋白前插入核输出序列(nuclear export sequence,NES)或核定位序列(nuclear localization sequence,NLS),使其特定地表达在细胞质或细胞核中。构建成功的质粒分别在神经母细胞瘤SK-N-SH细胞中表达,通过免疫荧光与Western印迹法检测蛋白质的表达情况。结果显示,NES-α-synuclein特异性地在细胞质中表达,NLS-α-synuclein特异性地在细胞核中表达。乳酸脱氢酶法检测结果表明,相较于WT-α-synuclein组,NES-α-synuclein组的乳酸脱氢酶的释放量减少26. 54%,NLS-α-synuclein组的乳酸脱氢酶释放量增加12. 85%。CCK8法检测细胞活性结果表明,相较于WT-α-synuclein组,NES-α-synuclein组的细胞活力提高35. 51%,NLS-α-synuclein组的细胞活力减少7. 93%。上述结果提示,胞质内表达α-synuclein对于细胞的毒性更小,而细胞核内表达的α-synuclein对细胞有更强的毒性作用。这些发现为研究帕金森病的分子机制提供了新的研究思路。 展开更多

关键词 alpha-突触核蛋白 核定位序列 核输出序列 细胞毒性

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新信息Verhulst直接模型区间灰数预测 被引量：2

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作者 王健 《辽宁工程技术大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2014年第2期280-283,共4页

针对传统Verhulst模型以实数序列为建模对象,而对区间灰数的预测还比较缺乏的问题,利用直接建模思想,得到一利新信息Verhulst直接模型形式;在核与灰半径的基础上,构建相应的区间灰数预测模型;通过核与灰半径,推导出所建预测模型区间灰... 针对传统Verhulst模型以实数序列为建模对象,而对区间灰数的预测还比较缺乏的问题,利用直接建模思想,得到一利新信息Verhulst直接模型形式;在核与灰半径的基础上,构建相应的区间灰数预测模型;通过核与灰半径,推导出所建预测模型区间灰数上下界的时间响应式.应用实例表明:区间灰数预测模型具有很好的有效性和实用性,拓宽了灰色预测模型的使用范围. 展开更多

关键词 灰色系统理论 新信息 传统Verhulst模型 直接建模 区间灰数 核序列 灰半径

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一类区间灰数预测模型直接建模法

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作者 王健 《辽宁工程技术大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2014年第11期1581-1584,共4页

为利用直接建模思想,推导得出了一类新信息GM(1,1)直接模型形式.传统模型只能针对实数序列进行建立模型.以区间灰数的"核序列"为基础,并结合"信息域不减"原则,构建相应的GM(1,1)区间灰数预测模型;通过以"核序... 为利用直接建模思想,推导得出了一类新信息GM(1,1)直接模型形式.传统模型只能针对实数序列进行建立模型.以区间灰数的"核序列"为基础,并结合"信息域不减"原则,构建相应的GM(1,1)区间灰数预测模型;通过以"核序列"为中心,推导出所建模型区间灰数上下界的时间响应式.实例结果表明:该改进模型可以有效提高预测精度. 展开更多

关键词 灰色系统 直接模型 近似非齐次指数 时间响应函数 区间灰数序列 核序列

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基于SVM-UBM的语言辨识系统

17

作者 张文林 李弼程 屈丹 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2007年第10期41-43,共3页

支持向量机作为强大的理论和计算工具,已成功地应用在模式识别的众多领域中。研究了将支持向量机模型(SVM)应用于语言辨识的理论框架,提出了将Louradour序列核应用于语言辨识,并利用高斯混合模型(GMM)构造全局背景模型(UBM)对其进行了改... 支持向量机作为强大的理论和计算工具,已成功地应用在模式识别的众多领域中。研究了将支持向量机模型(SVM)应用于语言辨识的理论框架,提出了将Louradour序列核应用于语言辨识,并利用高斯混合模型(GMM)构造全局背景模型(UBM)对其进行了改进,从而导出了基于SVM-UBM的语言辨识系统。相关实验结果表明,该系统的识别率高于经典的高斯混合模型(GMM)和基于广义线性区分性核(GLDS)的支持向量机模型。 展开更多

关键词 语言辨识 支持向量机 序列核 高斯混合模型 全局背景模型

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新城疫病毒每“小”序列撬动“大”变化

18

《甘肃畜牧兽医》 2025年第4期19-19,共1页

近日,中国农业科学院上海兽医研究所家禽病毒病监测预警和防控团队揭示影响新城疫病毒复制和毒力的机制,相关研究成果发表在《兽医研究(Veterinary Research)》上。该研究通过对比不同基因型新城疫病毒的基质蛋白核输出序列,发现该序列... 近日,中国农业科学院上海兽医研究所家禽病毒病监测预警和防控团队揭示影响新城疫病毒复制和毒力的机制,相关研究成果发表在《兽医研究(Veterinary Research)》上。该研究通过对比不同基因型新城疫病毒的基质蛋白核输出序列,发现该序列随病毒进化存在显著差异,影响基质蛋白出核和出芽效率,进而影响病毒复制和毒力。进一步研究首次证实该序列通过经典核输出途径介导基质蛋白出核,更新了对新城疫病毒基质蛋白出核机制的认识,为副黏病毒防控提供了新理论依据。 展开更多

关键词 新城疫病毒 基质蛋白 核输出序列

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基于类内方差归一化和SVM的说话人识别方法 被引量：5

19

作者 高新建 李弼程 屈丹 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2009年第10期168-171,共4页

支持向量机(SVM)由于其强大的分类能力,引起人们广泛的重视,并且成功地应用于说话人识别。其中基于GLDS核的SVM系统性能比较优异。引入类内方差归一化(WCCN)方法来处理SVM的输入特征向量,并和GLDS核相结合,提出一种基于类内方差归一化和... 支持向量机(SVM)由于其强大的分类能力,引起人们广泛的重视,并且成功地应用于说话人识别。其中基于GLDS核的SVM系统性能比较优异。引入类内方差归一化(WCCN)方法来处理SVM的输入特征向量,并和GLDS核相结合,提出一种基于类内方差归一化和SVM的说话人识别方法。该方法利用WCCN方法对SVM的输入特征向量进行变换,增强特征向量的类间区分能力,再采用GLDS核函数进行SVM的训练,以提高SVM的分类效果。实验表明,新方法是有效的,其性能优于基于GLDS核的SVM系统。 展开更多

关键词 支持向量机 广义线性序列核 类内方差归一化

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尖毛虫属ActinⅠ、α-TBP和DNA polα乱序基因的模式研究 被引量：1

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作者 杨然 陈天兵 +3 位作者 黄俊 石文俊 区淑青 伊珍珍 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期285-295,共11页

研究旨在对尖毛虫属内现有物种的3种乱序小核基因结构进行比较,探讨其乱序模式。于湛江湖光红树林水域中采集到一个尖毛虫属物种Oxytricha sp.(ZJ),成功扩增了其肌动蛋白Ⅰ(ActinⅠ)、端粒结合蛋白(α-TBP)、DNA聚合酶α(DNA polα)3个... 研究旨在对尖毛虫属内现有物种的3种乱序小核基因结构进行比较,探讨其乱序模式。于湛江湖光红树林水域中采集到一个尖毛虫属物种Oxytricha sp.(ZJ),成功扩增了其肌动蛋白Ⅰ(ActinⅠ)、端粒结合蛋白(α-TBP)、DNA聚合酶α(DNA polα)3个乱序基因的完整大核基因序列和完整/部分小核基因序列,并结合已有资料对比研究了尖毛虫属这3个乱序基因的进化。结果表明:(1)Oxytricha sp.(ZJ)与O.nova的小核ActinⅠ基因具有相同的乱序模式,区别于其余的尖毛虫属物种;在增加尖毛虫属物种的基础上,对前人推测提出了质疑,我们认为MDS-IES接合处移动现象在乱序MDSs之间并非比非乱序MDSs之间更保守。(2)Oxytricha sp.(ZJ)与O.nova的小核α-TBP基因具有相同乱序模式和相似长度的IESs。(3)Oxytricha sp.(ZJ)的小核DNA polα基因乱序模式,区别于任一已报道物种,与属内O.trifallax最为相近。基于序列分析,在DNA polα基因中发现了一例IES转换为MDS的痕迹,以及由此导致原先MDS的丢失。研究发现在编码区内IES向MDS的转变,使得本应删除的序列成为基因组永久保留的一部分。 展开更多

关键词 尖毛虫 乱序基因 大核命运序列 内部删除序列 肌动蛋白Ⅰ型 端粒结合蛋白 DNA聚合酶α

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