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题名地黄属植物的DNA条形码研究
被引量：20
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作者
程芳婷
李忠虎
刘春艳
原超
李雪童
刘占林
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机构
西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室
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出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期25-32,共8页
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基金
国家自然科学基金项目资助(31170311
31370353)
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文摘
地黄属（Rehmannia）为玄参科（Scrophulariaceae）药用植物,广泛分布于中国中东部及北部地区。由于地黄属植物经历了快速成种,导致其属内物种间形态性状差异较小,运用传统的形态学分类方法已难以准确地鉴定物种,近年来迅速发展起来的DNA条形码技术为快速、准确地鉴别物种提供了新思路。本研究选用3个叶绿体DNA非编码区片段（trn L-trn F、trn M-trn V和trn S-trn G）及核基因ITS片段,运用PWG-distance和TreeBuilding两种方法对地黄属5个物种75个个体进行了DNA条形码分析。结果表明：单个叶绿体DNA片段或核基因ITS片段对地黄属物种的鉴别率较低（0%~20%）,组合的叶绿体DNA片段分辨能力虽然高于单个DNA片段,但并不能将地黄属5个物种完全区分开;trn S-trn G＋ITS片段组合的分辨率可达100%,能够将地黄属5个物种准确区分,与所有叶绿体DNA片段和核基因ITS片段组合（trn L-trn F＋trn M-trn V＋trn S-trn G＋ITS）的辨别率相同,因此推荐trn S-trn G＋ITS作为地黄属植物的标准条形码。此外,利用DNA条形码鉴别物种时,可采用叶绿体DNA片段和核DNA片段组合的方法来提高物种鉴定的成功率。
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关键词
DNA条形码
地黄属
叶绿体DNA
核基因its片段
分辨率
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Keywords
DNA barcoding
Rehmannia
Chloroplast DNA
nr DNA ITS
Discrimination rate
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分类号
Q949.777.8
[生物学—植物学]
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题名鸡爪槭种下分类群的DNA条形码筛选
被引量：9
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作者
高健
孟婉姮
杜芳
李俊清
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机构
北京林业大学林学院
北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室
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出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期734-743,共10页
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基金
北京市科技新星(Z151100000315056)
国家环境保护公益性行业科研专项(201509042)
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文摘
槭属鸡爪槭（Acer palmatum Thunb.）是北温带广泛分布的一类园艺观赏树种,由于频繁的种内杂交渐渗导致其种下分类群的形态性状特征趋同,致使传统的形态学分类难以准确鉴定,新兴的DNA条形码技术为快速、准确的鉴定鸡爪槭种下分类群提供了新的思路。本研究采用5个叶绿体DNA片段（rpl16、psbA-trnH、trnL-trnF、rbcL、matK）和核基因组ITS片段,运用PWG-distance和Tree-Building两种方法对鸡爪槭的8个分类群共32个个体进行DNA条形码分析。结果显示,单个叶绿体基因组片段（分辨率为0%~25%）或核rDNA ITS片段（12.5%）的分辨率较低,不同组合的叶绿体DNA片段（0%~62.5%）、叶绿体片段与核rDNA ITS片段（12.5%~50%）的分辨率则相对较高。其中,rpl16＋psbA-trnH＋trnL-trnF片段组合的分辨率最高（62.5%）,较为符合DNA条形码快速、准确鉴定的要求,因此建议将其作为鸡爪槭种下分类群鉴定的DNA条形码。
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关键词
鸡爪槭
DNA条形码
叶绿体DNA片段
核基因组its片段
物种分辨率
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Keywords
Acer palmatum
DNA barcoding
Chloroplast DNA fragment
nrDNA ITS region
Discrimination rate
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分类号
Q949.755.3
[生物学—植物学]
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