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苹果属3种检疫性疫霉的四重PCR分子检测
被引量:
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作者
朱林慧
廖芳
+4 位作者
曹保红
李碧娟
张豆豆
罗加凤
李关荣
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期7-14,共8页
为建立苹果属冬生疫霉Phytophthora hibernali、丁香疫霉P.syringae和栗黑水疫霉P.cambivora 3种检疫性疫霉的同步分子检测方法,根据疫霉属18S rRNA,ITS,HSP90和Ypt1基因分别设计通用引物,冬生疫霉、丁香疫霉及栗黑水疫霉特异引物,建立...
为建立苹果属冬生疫霉Phytophthora hibernali、丁香疫霉P.syringae和栗黑水疫霉P.cambivora 3种检疫性疫霉的同步分子检测方法,根据疫霉属18S rRNA,ITS,HSP90和Ypt1基因分别设计通用引物,冬生疫霉、丁香疫霉及栗黑水疫霉特异引物,建立了四重PCR检测方法,并进行了灵敏度和模拟带菌测试.建立了可同时检测苹果属上冬生疫霉、丁香疫霉和栗黑水疫霉的特异四重PCR检测体系:在20μL反应体系中,最佳引物浓度组合为10μmol/L的18SUF/18SUR,PHSF/PHSR,PCSF/PCSR和PSSF/PSSR分别为0.2,0.6,0.8,1.0μL;最佳退火温度和退火时间分别为63℃和20s.该体系扩增冬生疫霉出现884bp的18S rRNA条带和232bp的ITS基因特异带,丁香疫霉出现884bp的18S rRNA条带和683bp的HSP90基因特异带,扩增栗黑水疫霉出现884bp的18S rRNA条带和314bp的Ypt1基因特异带,对照菌只出现18S rRNA条带;四重PCR反应体系检测灵敏度低于单重PCR;模拟带菌试验可同时扩增出4个片段.表明该四重PCR检测方法能实现冬生疫霉、丁香疫霉和栗黑水疫霉的同步特异检测,实现苹果属类水果及种苗检疫性疫霉的快速检测.
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关键词
苹果属
检
疫
性真菌
冬生
疫
霉
丁香
疫
霉
栗黑水疫霉
四重PCR分子检测
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职称材料
题名
苹果属3种检疫性疫霉的四重PCR分子检测
被引量:
1
1
作者
朱林慧
廖芳
曹保红
李碧娟
张豆豆
罗加凤
李关荣
机构
西南大学农学与生物科技学院
天津市出入境检验检疫局
出处
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期7-14,共8页
基金
国家质检总局项目(2012IK286
2013IK290)
国家"十二五"科技支撑计划(2012BAK11B02)
文摘
为建立苹果属冬生疫霉Phytophthora hibernali、丁香疫霉P.syringae和栗黑水疫霉P.cambivora 3种检疫性疫霉的同步分子检测方法,根据疫霉属18S rRNA,ITS,HSP90和Ypt1基因分别设计通用引物,冬生疫霉、丁香疫霉及栗黑水疫霉特异引物,建立了四重PCR检测方法,并进行了灵敏度和模拟带菌测试.建立了可同时检测苹果属上冬生疫霉、丁香疫霉和栗黑水疫霉的特异四重PCR检测体系:在20μL反应体系中,最佳引物浓度组合为10μmol/L的18SUF/18SUR,PHSF/PHSR,PCSF/PCSR和PSSF/PSSR分别为0.2,0.6,0.8,1.0μL;最佳退火温度和退火时间分别为63℃和20s.该体系扩增冬生疫霉出现884bp的18S rRNA条带和232bp的ITS基因特异带,丁香疫霉出现884bp的18S rRNA条带和683bp的HSP90基因特异带,扩增栗黑水疫霉出现884bp的18S rRNA条带和314bp的Ypt1基因特异带,对照菌只出现18S rRNA条带;四重PCR反应体系检测灵敏度低于单重PCR;模拟带菌试验可同时扩增出4个片段.表明该四重PCR检测方法能实现冬生疫霉、丁香疫霉和栗黑水疫霉的同步特异检测,实现苹果属类水果及种苗检疫性疫霉的快速检测.
关键词
苹果属
检
疫
性真菌
冬生
疫
霉
丁香
疫
霉
栗黑水疫霉
四重PCR分子检测
Keywords
Malus
quarantine fungi
Phytophthora hibernalis
P. syringae
P. cambivora
quadruple PCR detection
分类号
S436.611.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苹果属3种检疫性疫霉的四重PCR分子检测
朱林慧
廖芳
曹保红
李碧娟
张豆豆
罗加凤
李关荣
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
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