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基于仿射不变性特征的冷冻电子断层图像无标记对位
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作者 俸楷文 郭珂诚 冯结青 《计算机辅助设计与图形学学报》 北大核心 2025年第5期809-820,共12页
图像对位是冷冻电子断层三维重构中的重要步骤,对位精度对于生物大分子的三维重构质量至关重要.针对无标记对位技术中图像特征信息利用不充分、对位精度不高的问题,提出一种基于仿射不变性特征的冷冻电子断层图像无标记对位方法.首先通... 图像对位是冷冻电子断层三维重构中的重要步骤,对位精度对于生物大分子的三维重构质量至关重要.针对无标记对位技术中图像特征信息利用不充分、对位精度不高的问题,提出一种基于仿射不变性特征的冷冻电子断层图像无标记对位方法.首先通过仿射变换模拟电子断层图像在投影成像时的旋转变换,以缩小特征对应搜索空间,得到对于平移、旋转、尺度、视角变换都具有不变性的图像特征点;然后通过运动一致性约束去除大量误匹配特征点,再采用RANSAC方法二次筛选获得正确的特征匹配结果;最后求解电子断层图像的对位参数.对多组电子断层图像序列数据的对位实验结果表明,所提方法相较于SIFT方法和IMOD软件,提高仿射不变性特征计算效率70%,增加所保留特征点的数量81%172%,减小重投影误差12%26%,提高了冷冻电子断层图像无标记对位方法的精度. 展开更多
关键词 冷冻电子断层三维重构 标记对 仿射不变性 特征匹配
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基于基因组标记对绵羊品种分类的机器学习方法研究
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作者 乔利英 王万年 +4 位作者 张莉 庞志旭 张思颖 李一凡 刘文忠 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第5期2157-2167,共11页
旨在评估基于基因组标记的机器学习(machine learning,ML)算法在品种分类中的有效性,检验不同ML算法在绵羊品种分类中的应用效果如何。本研究采用2种方式对10个绵羊品种进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点选... 旨在评估基于基因组标记的机器学习(machine learning,ML)算法在品种分类中的有效性,检验不同ML算法在绵羊品种分类中的应用效果如何。本研究采用2种方式对10个绵羊品种进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点选择,第一种利用群体间分化指数(fixation index,FST)进行选择,第二种方式是在FST的基础上使用Boruta特征选择算法对SNPs位点进一步筛选。采用K-近邻、支持向量机(support vector machines,SVM)和自适应增强(adaptive boosting,AdaBoost)等8种不同类别的ML算法对绵羊品种进行分类,采用准确性评估不同SNPs选择方式和不同ML算法在品种鉴定中的差异,鉴定绵羊品种分类的最佳组合方式。本研究采用的数据中既有遗传关系较远的品种,也有遗传相似的品种,保证了后续分析的可靠性。根据前1%的筛选标准,FST分析每次筛选出5361个SNPs位点,Boruta算法最终保留(328±11.7)个SNPs位点用于ML品种分类,且在多次迭代后,被标记为“确认”的SNPs位点得分稳定高于阴影特征和被标记的其他两类SNPs位点。Boruta算法保留的SNPs位点数远低于FST分析。在使用ML模型进行品种分类时,大多数模型的准确性均高于0.9。其中,经过Boruta算法选择SNPs位点之后使用SVM模型进行品种分类准确性最高(0.953),AdaBoost表现也同样优秀(0.947),仅使用FST选择SNPs位点之后使用NB模型分类效果最差(0.601)。除NB外,其余模型接收者操作特征曲线下面积均接近于1。无论使用哪种SNPs选择方式均具有较强的区分能力,使用Boruta算法后效果略好。根据上述结果表明,ML方法的实施有效提高了品种分类的准确性,在绵羊品种鉴定中有良好的应用潜力。 展开更多
关键词 机器学习 品种分类 基因组标记 绵羊 准确性
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钙黄绿素原位标记对四角蛤蜊生理影响的研究
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作者 高进 谢玺 +5 位作者 白永安 庞金池 刘项峰 滕炜鸣 王庆志 《大连海洋大学学报》 北大核心 2025年第1期44-54,共11页
为研究四角蛤蜊(Mactra veneriformis)增殖与资源管护中适宜的原位标记方法和标记条件,通过考察试验贝类四角蛤蜊的存活率、标记成功率、标记良好率及消化腺中抗氧化酶活性和软体部脂肪酸标志物等指标探究钙黄绿素(Calcein)最佳标记浓... 为研究四角蛤蜊(Mactra veneriformis)增殖与资源管护中适宜的原位标记方法和标记条件,通过考察试验贝类四角蛤蜊的存活率、标记成功率、标记良好率及消化腺中抗氧化酶活性和软体部脂肪酸标志物等指标探究钙黄绿素(Calcein)最佳标记浓度和浸染时间,并根据最适标记条件在辽东湾蛤蜊岗开展为期1个月的原位标记试验。结果表明:0、25、50、75 mg/L钙黄绿素浸染1.5 h与0、50 mg/L钙黄绿素浸染0.5、1.5 h两批次标记方案均未对四角蛤蜊造成明显负面影响,除25 mg/L钙黄绿素浸泡1.5 h标记良好率为54.90%±8.99%外,其余各组标记成功率和标记良好率均为100%,表明钙黄绿素具备大规模高效标记四角蛤蜊的能力,其中50~75 mg/L钙黄绿素浸染标记0.5~2 h的条件组合可作为四角蛤蜊滩涂原位标记的潜在应用方案;研究发现,75 mg/L钙黄绿素浸染2 h的效果最佳,1个月后平均回捕率为10.00%±3.33%,标记成功率为36.11%±12.73%,标记良好率为100%。本研究结果可为研发滩涂贝类原位标记技术和原生优质资源养护提供科学参考。 展开更多
关键词 四角蛤蜊 钙黄绿素 脂肪酸 化学标记 原位标记
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基于高密度SNP标记对玉米株型相关性状的QTL定位
4
作者 刘鹏飞 郭向阳 +6 位作者 王安贵 聂蕾 涂亮 吴迅 祝云芳 蒋喻林 陈泽辉 《种子》 北大核心 2025年第3期10-16,共7页
利用玉米温热改良系QB7866和QB5725构建131份F_(2∶3)家系,对其株高、穗位高、全株叶片数、穗上叶片数、雄穗主轴长和雄穗分枝数进行调查,并结合基因数据进行QTL分析。结果表明,共定位到78个与株型性状相关的QTL,其中,株高13个、穗位高... 利用玉米温热改良系QB7866和QB5725构建131份F_(2∶3)家系,对其株高、穗位高、全株叶片数、穗上叶片数、雄穗主轴长和雄穗分枝数进行调查,并结合基因数据进行QTL分析。结果表明,共定位到78个与株型性状相关的QTL,其中,株高13个、穗位高6个、全株叶片数15个、穗上叶片数14个、雄穗主轴长16个、雄穗分枝数14个。 展开更多
关键词 玉米 SNP标记 QTL
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利用微卫星DNA标记对晋江马群体遗传多样性的研究
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作者 李媛媛 毕晓昆 +2 位作者 阿尔弗雷多·拉米雷斯-雷维科 凌遥 赵春江 《中国畜禽种业》 2025年第6期12-23,共12页
该研究利用微卫星DNA标记对晋江马的遗传多样性和群体结构进行了分析,通过与蒙古马、百色马、那曲马、岔口驿马、哈萨克马、阿拉伯马、贝尔修伦马等其他马品种的比较,分析了晋江马与国内外马品种的遗传关系。结果表明:晋江马遗传多样性... 该研究利用微卫星DNA标记对晋江马的遗传多样性和群体结构进行了分析,通过与蒙古马、百色马、那曲马、岔口驿马、哈萨克马、阿拉伯马、贝尔修伦马等其他马品种的比较,分析了晋江马与国内外马品种的遗传关系。结果表明:晋江马遗传多样性较为丰富,但保种场内群体的家系较少;晋江马与我国马品种遗传关系较近,尤其是与百色马关系紧密,而与国外马品种遗传距离较远。根据该研究结果可以推测晋江马在长期的演化过程中保留了较多的本地遗传特征,且与国内其他品种有较为紧密的联系。同时,由于家系较少,保种和遗传多样性的保护应成为重点,以确保晋江马的可持续发展。 展开更多
关键词 晋江马 微卫星DNA标记 遗传多样性
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基于SNP标记对嘉定白蚕豆遗传多样性与特异性的鉴定
6
作者 杨华 陈珏 +4 位作者 龙萍 王磊 韩静 邹丹蓉 夏辉 《上海农业学报》 2024年第6期1-8,共8页
为了在基因组水平上揭示嘉定白蚕豆的遗传特性,基于简化基因组测序技术,研究了嘉定白蚕豆种质的遗传多样性,及其与其他来源蚕豆种质的遗传差异,并利用检测到的SNP进行了主成分分析、聚类分析与群体遗传结构分析。结果表明:142份蚕豆种... 为了在基因组水平上揭示嘉定白蚕豆的遗传特性,基于简化基因组测序技术,研究了嘉定白蚕豆种质的遗传多样性,及其与其他来源蚕豆种质的遗传差异,并利用检测到的SNP进行了主成分分析、聚类分析与群体遗传结构分析。结果表明:142份蚕豆种质资源中共检测到30984个SNP。主成分分析可大致区分嘉定材料与其他材料,聚类分析将这142份材料划分为上海嘉定、上海其他和其他省份材料为主的三簇,而群体遗传结构分析则显著区分了嘉定材料与其他材料。从上述SNP中筛选了18个在嘉定和其他材料间存在高分化的SNP标记,均匀分布在6对染色体上,利用这些SNP可准确鉴定(准确率78%)嘉定白蚕豆核心材料。本研究可为嘉定白蚕豆种质资源的保护、研究和利用提供重要的技术支撑。 展开更多
关键词 嘉定白蚕豆 遗传多样性 遗传特异性 简化基因组测序 SNP标记
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基于高密度SNP标记对112份温热改良玉米自交系的遗传特征鉴定与表型性状评价 被引量:2
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作者 王栋 郭爽 +9 位作者 聂蕾 何玥 涂亮 蒋喻林 刘鹏飞 王安贵 祝云芳 郭向阳 吴迅 陈泽辉 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第6期77-83,共7页
种质资源表型和基因型鉴定评价是深入发掘优势基因资源、创制优势种质材料的前提和基础,对于培育优势玉米杂交种具有十分重要的意义。以112份温热改良玉米自交系为供试材料,利用包含6万个SNP标记的Maize SNP 50芯片对其进行基因型鉴定,... 种质资源表型和基因型鉴定评价是深入发掘优势基因资源、创制优势种质材料的前提和基础,对于培育优势玉米杂交种具有十分重要的意义。以112份温热改良玉米自交系为供试材料,利用包含6万个SNP标记的Maize SNP 50芯片对其进行基因型鉴定,并结合该群体在不同生态环境下的表型鉴定结果,对不同自交系的抗性、所属杂种优势类群等进行评价。基因型分析结果发现,112份自交系首先被划分为Iodent种质(Ⅰ类)、Suwan种质(Ⅱ类)和温热改良种质(Ⅲ类)3类,再次被划分为分别以HCL645、T32、QR273、黄早四、PH4CV和B73为代表自交系的6个亚群;进一步被划分为以HCL645、T32、QB446、QR273、黄早四、PH4CV、郑58、齐319和B73为代表自交系的9个亚群。结果显示,112份自交系的散粉期、株高、穗位高、穗长、穗粗、穗行数、行粒数、秃尖长、茎腐病、南方锈病和白斑病等不同性状之间呈现出一定的相关性。散粉期与株高、穗位高呈极显著正相关,与茎腐病、南方锈病和白斑病病级均呈极显著负相关,相关系数分别为0.19、0.32、-0.28、-0.32和-0.21。此外,Iodent种质表现出生育期短、穗行数多等优点;Suwan种质表现出生育期长、植株高大和抗病性强的特点;温热改良种质表现出生育期较短的优点。其中,Iodent种质和Suwan种质表现出优势互补,具有丰富的育种利用价值。 展开更多
关键词 玉米自交系 遗传多样性 性状评价 SNP标记
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基于表型与分子标记对浙贝母不同育种群体的分子鉴定与亲缘关系研究
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作者 董莉莉 徐志浩 +3 位作者 严灿龙 范小平 金泽兰 王忠华 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第8期1719-1730,共12页
为了对浙贝母种质资源评价、新品种选育提供理论支撑,该研究利用SCoT分子标记技术,对来源于宁波章水种植基地的146份浙贝母种质资源进行遗传多样性分析;利用Pearson's相关分析计算浙贝母种质资源表型及其与生物碱含量的相关性。结... 为了对浙贝母种质资源评价、新品种选育提供理论支撑,该研究利用SCoT分子标记技术,对来源于宁波章水种植基地的146份浙贝母种质资源进行遗传多样性分析;利用Pearson's相关分析计算浙贝母种质资源表型及其与生物碱含量的相关性。结果显示,5条引物共扩增出111个位点,其中多态性位点96个,平均多态性位点比率为86.29%;在整体样本水平的遗传多样性分析中,Na、Ne、H、I分别为2.000、1.585 8、0.340 5、0.509 8,表明引物的多态性较高,能有效揭示146份浙贝母种质资源的多样性。聚类分析表明,所有样品的遗传相似系数为0.55~1.00,系统优选与种子辐照两组中后代表型性状基本遗传亲本的特点;杂交处理后代的亲缘关系与表型性状基本上偏向父本,与种质资源性状考察一致。Pearson's相关分析表明,花型与叶片数量、花朵颜色与叶片数量、叶片颜色与结籽程度呈极显著正相关,花型与叶片颜色呈显著正相关;花朵内壁颜色分别与叶片数量、花型,花色分别与茎秆粗细、结籽程度呈极显著负相关,叶片颜色与花色、叶片宽度与结籽程度、花型与结籽程度呈显著负相关;叶宽与贝母甲素、贝母乙素和总生物碱含量呈极显著负相关。综上,利用SCoT分子标记技术揭示了宁波章水的浙贝母种质资源的遗传多样性,可以有效地为浙贝母种质资源的优势育种提供依据,为浙贝母种质资源的分子辅助育种和开发利用提供参考。 展开更多
关键词 浙贝母 SCoT分子标记 遗传多样性 聚类分析 相关性分析
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基于EST-SSR分子标记对乌天麻和红天麻的鉴定
9
作者 何薇 胡艺镨 +2 位作者 李胜男 徐娇 欧小宏 《耕作与栽培》 2024年第6期57-62,共6页
本研究利用MISA软件对乌天麻转录组筛选得到SSR位点并对其特征进行分析,通过设计引物对25份乌天麻和红天麻样本进行PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,对扩增条带进行聚类分析。结果表明,利用MISA软件共筛选得到EST-SSR位点12744个,发生... 本研究利用MISA软件对乌天麻转录组筛选得到SSR位点并对其特征进行分析,通过设计引物对25份乌天麻和红天麻样本进行PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,对扩增条带进行聚类分析。结果表明,利用MISA软件共筛选得到EST-SSR位点12744个,发生率27.9%,其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸为主要重复类型,复合型和多复合型总数1071个,占比8.41%。利用Primer 3软件进行SSR引物设计并随机筛选出40对,进行PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,其中4对扩增表现出多态性,均为复合型和多复合型SSR,平均有3个等位基因,2.31个有效等位基因,Shannon'多样性指数为0.69~1.33,平均为0.87,Nei's多样性指数为0.4992~0.6784,平均为0.5528。人工读取扩增条带,利用PCoA分析、聚类树、STRUCTURE分析均能将25份天麻样本明显地区分为乌天麻和红天麻。 展开更多
关键词 天麻 分子标记 EST-SSR 鉴定
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禁忌语翻译的“语用标记对应”原则 被引量:2
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作者 周晔 《外语研究》 CSSCI 北大核心 2009年第4期83-85,共3页
在小说作品中,禁忌语的运用往往是塑造人物、揭示主题的表现手法之一,但同时也给翻译带来了一定的困难,而现有译本中对禁忌语的翻译常缺乏明确的指导思想。本文通过对海明威《永别了,武器》两个现有汉译本的比较,提出"语用标记对应... 在小说作品中,禁忌语的运用往往是塑造人物、揭示主题的表现手法之一,但同时也给翻译带来了一定的困难,而现有译本中对禁忌语的翻译常缺乏明确的指导思想。本文通过对海明威《永别了,武器》两个现有汉译本的比较,提出"语用标记对应"可以作为禁忌语翻译的一种指导原则。作者并已尝试将这一原则应用于该书的重译。 展开更多
关键词 禁忌语 翻译 文学表现手法 语用标记对
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用EST-SSR标记对茶树种质资源的研究 被引量:63
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作者 金基强 崔海瑞 +2 位作者 龚晓春 陈文岳 忻雅 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期103-108,共6页
采用16对EST-SSR引物对42份茶树品种资源进行了分析。在这些引物中,有13对可扩增出清晰条带,其中10对引物具有多态性,占76.9%。各多态性引物的PIC值变化范围为0.522~0.866,平均PIC值为0.730。10对多态性引物共检测到84种等位... 采用16对EST-SSR引物对42份茶树品种资源进行了分析。在这些引物中,有13对可扩增出清晰条带,其中10对引物具有多态性,占76.9%。各多态性引物的PIC值变化范围为0.522~0.866,平均PIC值为0.730。10对多态性引物共检测到84种等位基因型和74个等位变异,每对引物可检测到基因型和等位基因数分别为4—12和3~10种。42份供试材料间遗传距离为0.074~0.667,平均遗传距离为0.363,说明本实验所测试的材料具有较广的遗传变异。在相似系数为0.55的水平可将这些材料聚为3类,多数材料包含在第一类中。本研究表明,利用EST-SSR标记进行茶树资源评价是有效的。 展开更多
关键词 茶树 EST-SSR标记 种质资源分析
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利用SSR标记对29个热带和温带玉米自交系进行杂种优势群的划分 被引量:39
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作者 番兴明 谭静 +5 位作者 张世煌 李明顺 黄云霄 杨峻芸 彭泽斌 李新海 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期835-840,共6页
以代表中国温带玉米 4个主要杂种优势群瑞得、兰卡斯特、旅大红骨和四平头的标准测验种 (B73、Mo17、丹 340和黄早四 )和来自 5个主要热带玉米群体Suwan1、POP2 1、POP32、POP2 8和Antigua种族的 2 5个典型自交系为材料 ,利用SSR标记进... 以代表中国温带玉米 4个主要杂种优势群瑞得、兰卡斯特、旅大红骨和四平头的标准测验种 (B73、Mo17、丹 340和黄早四 )和来自 5个主要热带玉米群体Suwan1、POP2 1、POP32、POP2 8和Antigua种族的 2 5个典型自交系为材料 ,利用SSR标记进行杂种优势群划分。从 70对SSR引物中筛选出 39对扩增带清晰且具有多态性的引物 ,在供试材料中共检测到 12 7个等位基因变异 ,平均多态性信息量为 0 .4 9。依据 2 9个自交系间的遗传相似系数作聚类分析 ,供试自交系被分为 4个大类群。第一大类群是热带种质 ,包括除M9以外的 2 4个热带自交系 ,其中又分为A和B两个杂种优势群。其中A群属于马齿型的Tuxpeno种质 ,包括群体POP2 1的 5个自交系和来自POP32 (ETO)的自交系M17。B群基本是硬粒型种质 ,包括来自Suwan1、Antigua、POP32 (ETO)和POP2 8的 18个自交系。第二大类群为自交系丹 340和黄早四 ,第三大类群是Mo17和属于Antigua地理族的M9,第四大类群是B73。 展开更多
关键词 SSR标记 热带 温带 玉米自交系 杂种优势群
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利用微卫星标记对中国4种小型猪的遗传多样性研究 被引量:32
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作者 王昕 曹红鹤 +3 位作者 耿社民 李宏滨 马月辉 郑友民 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期530-532,共3页
本研究通过 1 0个微卫星位点对我国特有的 4个小型猪种 (五指山猪、滇南小耳猪、贵州小型香猪、巴马香猪 )进行了遗传学检测 ,结果表明 :除S0 0 0 3位点表现为单态外 ,其它 9个位点均为高度或中度多态位点 ;4个小型猪种群体内的遗传多... 本研究通过 1 0个微卫星位点对我国特有的 4个小型猪种 (五指山猪、滇南小耳猪、贵州小型香猪、巴马香猪 )进行了遗传学检测 ,结果表明 :除S0 0 0 3位点表现为单态外 ,其它 9个位点均为高度或中度多态位点 ;4个小型猪种群体内的遗传多样性比较高 ,平均基因杂合度分别为 0 71 65、0 661 1、0 660 2、0 5990 ;多态信息含量在 0 5774~0 6871之间 ;五指山猪与贵州小型香猪的遗传距离较近 ,与滇南小耳猪次之 。 展开更多
关键词 微卫星标记 中国 小型猪 遗传多样性
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利用RAPD标记对我国主栽的汕优杂交稻和其亲本进行区别和鉴定 被引量:22
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作者 向太和 汪秀峰 +2 位作者 李莉 吴家道 杨剑波 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期292-296,共5页
利用 RAPD技术 ,从 50 0个随机寡核苷酸引物 ( 10聚体 )中筛选出 8个引物能在 3个主栽的汕优系统杂交稻组合汕优 63、汕优 64和汕优晚 3及其亲本之间稳定地扩增出 12个强的多态性标记。利用这些多态性标记能够有效地区别汕优 63、汕优 6... 利用 RAPD技术 ,从 50 0个随机寡核苷酸引物 ( 10聚体 )中筛选出 8个引物能在 3个主栽的汕优系统杂交稻组合汕优 63、汕优 64和汕优晚 3及其亲本之间稳定地扩增出 12个强的多态性标记。利用这些多态性标记能够有效地区别汕优 63、汕优 64和汕优晚 展开更多
关键词 RAPD技术 多态性标记 杂交水稻 鉴定
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利用RAPD标记对彩色棉遗传多样性的分析 被引量:15
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作者 郭江勇 王义琴 +5 位作者 吴明刚 张利明 刘丰疆 李文彬 刘海峰 孙勇如 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2003年第5期269-273,共5页
以新彩棉1号、2号和71份彩色棉材料为基础,利用RAPD标记对彩棉品种之间分子标记遗传差异进行研究。从240个随机引物中筛选出10个引物能在73份彩棉材料间扩增出稳定性较好的多态性片段。73份彩棉材料的欧氏遗传距离在1.00~4.79之间。按... 以新彩棉1号、2号和71份彩色棉材料为基础,利用RAPD标记对彩棉品种之间分子标记遗传差异进行研究。从240个随机引物中筛选出10个引物能在73份彩棉材料间扩增出稳定性较好的多态性片段。73份彩棉材料的欧氏遗传距离在1.00~4.79之间。按类平均距离法进行聚类分析表明,这些彩色棉材料可分为7组,品种间的遗传关系与品种自身的系谱有关,大多数品种的遗传基础比较狭窄。 展开更多
关键词 RAPD标记 彩色棉 遗传多样性 品种 分子标记 遗传差异 欧氏遗传距离 聚类分析
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用RAPD和SCAR复合分子标记对黄颡鱼属进行种质鉴定 被引量:22
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作者 童芳芳 汤明亮 +2 位作者 杨星 彭智 刘思阳 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期465-468,共4页
关键词 分子标记 黄颡鱼 种质鉴定 RAPD SCAR
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利用 RAPD和微卫星标记对协优杂交稻及其亲本进行区别与鉴定(英文) 被引量:24
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作者 李莉 杨剑波 +2 位作者 汪秀峰 向太和 吴家道 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期203-207,共5页
选用 40 0个随机寡核苷酸和 40个荧光标记的微卫星引物对 ,对我国主栽的协优杂交稻组合及其亲本进行多态性分析。RAPD分析显示 ,40 0个随机寡核苷酸引物中 ,有 36 4个能够在供试基因型材料中扩增出肉眼可见的 DNA条带 ,其中 2 8个显示... 选用 40 0个随机寡核苷酸和 40个荧光标记的微卫星引物对 ,对我国主栽的协优杂交稻组合及其亲本进行多态性分析。RAPD分析显示 ,40 0个随机寡核苷酸引物中 ,有 36 4个能够在供试基因型材料中扩增出肉眼可见的 DNA条带 ,其中 2 8个显示扩增的多态性 ,这中间 9个引物产生的 13条多态性条带具有清晰、易分辨的特点 ,可以在供试的水稻组合与亲本之间 ,以及杂交组合之间进行区别和鉴定。微卫星分析指出 ,40对荧光标记引物中 ,13对引物产生的 31条标记带 ,能够在供试基因型材料中显示稳定的多态性 ,且杂种表现为双亲的互补型。与 RAPD相比 ,微卫星分析具有多态性强、精确性高和重复性好的特点。 展开更多
关键词 杂交水稻 亲本鉴定 随机扩增多态性 DNA 标记
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应用形态学与RAPD标记对朝天椒遗传多样性的分析 被引量:10
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作者 蒋向辉 佘朝文 +2 位作者 许栋 张青桦 赵旺 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第3期810-813,共4页
为阐明朝天椒种质资源的遗传基础,结合运用形态标记与RAPD标记对7份朝天椒种质资源的遗传多样性进行分析。结果表明,形态标记以10.25的遗传距离将7个朝天椒辣椒种质材料分成了5类,RAPD分子标记以15的遗传距离将供试辣椒种质分成4类,扩... 为阐明朝天椒种质资源的遗传基础,结合运用形态标记与RAPD标记对7份朝天椒种质资源的遗传多样性进行分析。结果表明,形态标记以10.25的遗传距离将7个朝天椒辣椒种质材料分成了5类,RAPD分子标记以15的遗传距离将供试辣椒种质分成4类,扩增片段的多态性比例为24.4%,扩增多态性位点多,材料间遗传相似系数变幅不明显,对于亲缘关系较近的品种,从分子水平和传统形态学方法进行聚类分析的结果相似。 展开更多
关键词 朝天椒 形态学标记 RAPD标记 遗传多样性 聚类分析
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以SSR标记对普通菜豆抗炭疽病基因定位 被引量:14
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作者 王坤 王晓鸣 +3 位作者 朱振东 赵晓彦 张晓艳 王述民 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期432-437,共6页
由菜豆炭疽菌引起的菜豆炭疽病是危害我国菜豆生产的主要病害之一,鉴定和发掘新的抗病基因对于菜豆抗病育种具有十分重要的意义。以来自安第斯基因库的我国菜豆抗炭疽病地方品种红花芸豆与感病地方品种京豆杂交的F2群体为试验材料,通过... 由菜豆炭疽菌引起的菜豆炭疽病是危害我国菜豆生产的主要病害之一,鉴定和发掘新的抗病基因对于菜豆抗病育种具有十分重要的意义。以来自安第斯基因库的我国菜豆抗炭疽病地方品种红花芸豆与感病地方品种京豆杂交的F2群体为试验材料,通过人工接种菜豆炭疽菌81号小种进行抗病性鉴定,发现该分离群体中抗病植株数与感病植株数符合3:1的分离比例,确定红花芸豆对菜豆炭疽菌81号小种的抗性由显性单基因控制,将此基因命名为Co-F2533。用分离群体分组分析法(BSA)和微卫星多态性分析(SSR)技术对红花芸豆中的抗炭疽病基因进行分子标记鉴定,用Mapmaker3.0计算标记与目的基因间的遗传距离,发现B6连锁群上的4个SSR标记BM170、Clon1429、BMD37、Clon410与抗炭疽病基因Co-F2533连锁,遗传距离分别为6.6、18.4、20.9和30.9cM,这些SSR标记与Co-F2533基因在B6连锁群上的排列顺序为Clon1429-Co-F2533-BM170-BMD37-Clon410。根据基因所在连锁群的位置、抗病基因的基因库来源可知Co-F2533是一个新的来源于安第斯基因库的抗炭疽病基因。 展开更多
关键词 普通菜豆 菜豆炭疽病 抗病基因 SSR标记
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微卫星标记对黑龙江流域大麻哈鱼遗传多样性的研究 被引量:22
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作者 陈金平 董崇智 +2 位作者 孙大江 王喆 张树义 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期607-612,共6页
采用 12个微卫星标记 ,对中国 3个大麻哈鱼洄游群体 (乌苏里江、黑龙江和绥芬河 )的遗传多样性进行了检测。计算出各个种群的基因杂合度、遗传多样性和各个座位的多态信息含量。结果表明 ,3个大麻哈鱼洄游种群的平均基因杂合度分别为 :0... 采用 12个微卫星标记 ,对中国 3个大麻哈鱼洄游群体 (乌苏里江、黑龙江和绥芬河 )的遗传多样性进行了检测。计算出各个种群的基因杂合度、遗传多样性和各个座位的多态信息含量。结果表明 ,3个大麻哈鱼洄游种群的平均基因杂合度分别为 :0 .6 732、0 5 995、0 .6 917,种群遗传多样性分别为 0 .70 82、0 .6 5 11、0 .76 16。这些结果表明大麻哈鱼遗传多样性还比较丰富 ,其资源的恢复具有良好的前景 ,说明当前中国大麻哈鱼资源数量下降并非由遗传因素引起 ,主要原因可能是由于过度捕捞和水域环境污染等人为因素造成。人工增殖放流为恢复中国大麻哈鱼资源起到了重要作用 。 展开更多
关键词 微卫星标记 大麻哈鱼 遗传多样性 种群 黑龙江流域
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