期刊文献+
共找到6篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
不同遗传力和标记密度下QTL区间定位的效果 被引量:1
1
作者 李明丽 鲁绍雄 +3 位作者 连林生 苟潇 严达伟 李国治 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期690-694,共5页
采用计算机模拟方法系统比较了目标数量性状的遗传力和标记密度对F2设计下单个性状数量性状座位(QTL)区间定位效果的影响。研究结果表明:随着性状遗传力的升高,QTL的检测效率以及QTL位置估计的准确性和精确性也提高,但对QTL加性效... 采用计算机模拟方法系统比较了目标数量性状的遗传力和标记密度对F2设计下单个性状数量性状座位(QTL)区间定位效果的影响。研究结果表明:随着性状遗传力的升高,QTL的检测效率以及QTL位置估计的准确性和精确性也提高,但对QTL加性效应和显性效应估计的效果则无明显影响;在一定范围内提高遗传图谱上的标记密度对保证QTL的定位效果具有积极的意义,但当相邻标记间的图距缩小到一定程度(5-10cM)时,进一步增加标记密度并不能改进QTL定位的效果。同时,对遗传力过低的性状实施QTL定位,单纯增加标记密度无益于改进QTL定位的效果。 展开更多
关键词 遗传力 标记密度 数量性状座位 区间定位
在线阅读 下载PDF
基于标记密度分类间隔面的组类属属性学习 被引量:1
2
作者 王一宾 裴根生 程玉胜 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2020年第5期1179-1187,共9页
类属属性学习避免相同属性预测全部标记,是一种提取各标记独有属性进行分类的一种框架,在多标记学习中得到广泛的应用。而针对标记维度较大、标记分布密度不平衡等问题,已有的基于类属属性的多标记学习算法普遍时间消耗大、分类精度低... 类属属性学习避免相同属性预测全部标记,是一种提取各标记独有属性进行分类的一种框架,在多标记学习中得到广泛的应用。而针对标记维度较大、标记分布密度不平衡等问题,已有的基于类属属性的多标记学习算法普遍时间消耗大、分类精度低。为提高多标记分类性能,该文提出一种基于标记密度分类间隔面的组类属属性学习(GLSFL-LDCM)方法。首先,使用余弦相似度构建标记相关性矩阵,通过谱聚类将标记分组以提取各标记组的类属属性,减少计算全部标记类属属性的时间消耗。然后,计算各标记密度以更新标记空间矩阵,将标记密度信息加入原标记中,扩大正负标记的间隔,通过标记密度分类间隔面的方法有效解决标记分布密度不平衡问题。最后,通过将组类属属性和标记密度矩阵输入极限学习机以得到最终分类模型。对比实验充分验证了该文所提算法的可行性与稳定性。 展开更多
关键词 标记分类 标记密度 组类属属性 极限学习机 分类间隔面
在线阅读 下载PDF
不同芯片密度对华西牛重要经济性状基因组评估准确性的影响
3
作者 王元清 王泽昭 +7 位作者 朱波 陈燕 徐凌洋 张路培 高会江 李超 李俊雅 高雪 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第2期591-602,共12页
旨在基于Illumina BovineHD 770K与Cattle 110K芯片在华西牛中的实际应用情况,系统比较在不同标记密度下基因组选择预测准确性的差异,探索两款芯片在华西牛遗传评估中结合使用方法。本试验以课题组前期构建的华西牛基因组选择参考群体... 旨在基于Illumina BovineHD 770K与Cattle 110K芯片在华西牛中的实际应用情况,系统比较在不同标记密度下基因组选择预测准确性的差异,探索两款芯片在华西牛遗传评估中结合使用方法。本试验以课题组前期构建的华西牛基因组选择参考群体为研究对象,利用重测序数据将3948头华西牛770K芯片填充至790K后,分别取90K(两款芯片交集)、110K、770K、790K(两款芯片并集)4种标记密度,对华西牛遗传评估所涉及的5个性状(断奶重、育肥期平均日增重、产犊难易度、胴体重、屠宰率)进行遗传力估计,并通过GBLUP模型利用五折交叉验证对基因组评估准确性进行比较,筛选并确定华西牛遗传评估中最适标记密度。结果显示:1)4种标记密度下,估计的华西牛5个性状遗传力差异不显著,断奶重和平均日增重的遗传力为0.47~0.50,属于高遗传力;胴体重为0.37~0.39,属于中等遗传力;产犊难易度和屠宰率性状为0.14~0.21,属于中低遗传力。2)在GBLUP评估模型中,Cattle 110K在各个性状上的预测准确性均表现良好,并较Illumina BovineHD 770K芯片有显著提升(P<0.05),其中胴体重、产犊难易度和屠宰率3个性状提升较为明显,分别提升了14.9%、13.8%和8.4%;断奶重和育肥期平均日增重分别提升2.8%和4.5%。3)各性状预测准确性随着遗传力的升高而增加,不同标记密度的回归系数分别为0.4392(90K)、0.3741(110K)、0.4136(770K)、0.4593(790K)。因此,在华西牛实际遗传评估中,可直接使用Cattle 110K芯片进行评估,在获得较好评估准确性的同时降低成本。 展开更多
关键词 华西牛 基因组选择 标记密度 育种芯片 中国肉牛基因组选择指数
在线阅读 下载PDF
基于全基因组选择预测玉米籽粒含水率
4
作者 董春林 张利 +5 位作者 李昊洋 宋莹璐 张鹏艳 张正 卜华虎 常建忠 《山西农业科学》 2025年第5期1-7,共7页
玉米作为我国重要的粮食作物,在保障我国粮食安全等方面发挥着重要作用。玉米成熟期籽粒含水率是玉米机械化粒收的重要衡量指标之一。培育成熟期低籽粒含水率的玉米品种是当前玉米育种的重要方向之一。籽粒含水率受复杂数量性状控制,单... 玉米作为我国重要的粮食作物,在保障我国粮食安全等方面发挥着重要作用。玉米成熟期籽粒含水率是玉米机械化粒收的重要衡量指标之一。培育成熟期低籽粒含水率的玉米品种是当前玉米育种的重要方向之一。籽粒含水率受复杂数量性状控制,单靠表型选择效率较低,全基因组选择技术能够对复杂数量性状进行快速筛选改良。在忻州和榆次2个地点对组配的250份玉米杂交种的籽粒含水率进行鉴定,结合基因型数据,利用9种GS模型开展全基因组选择分析。结果表明,玉米杂交种平均籽粒含水率为21.51%,变异系数为5.31%,广义遗传力为0.41,特殊和一般配合力方差比值σ^(2) SCA/σ^(2) GCA为0.20,表明玉米杂交种的籽粒含水率主要受加性效应控制。全基因组选择分析结果表明,9个GS模型的预测准确度平均为0.592,其中,rrBLUP、RKHS、BayesC、SVM等4个模型预测准确性较高,准确度均为0.600,LASSO模型的预测准确性最低,为0.572;当标记密度为2000个、训练群体大小为70%时,预测准确性就能达到较高水平。在此基础上,利用rrBLUP模型对4700份玉米杂交种GMC进行预测,发现Top 100杂交种的籽粒含水率平均为22.63%,Bottom 100杂交种的籽粒含水率平均为18.56%。选择籽粒含水率预测结果的Bottom 100杂交种进行育种,新玉米品种籽粒含水率相对于Top 100降低4.08%,相当于17.98%的增益。 展开更多
关键词 玉米 复杂数量性状 籽粒含水率 全基因组选择分析 标记密度 预测准确度
在线阅读 下载PDF
中科院海洋所构建凡纳滨对虾遗传图谱
5
作者 徐承旭 《水产科技情报》 2016年第3期162-163,共2页
日前,中科院海洋研究所利用高通量测序技术对凡纳滨对虾的基因组进行了基因组探查分析,成功构建了全球标记密度最高的对虾遗传连锁图谱。凡纳滨对虾是我国及世界养殖产量最高的对虾,也是世界单一种类产值最高的水产养殖对象,
关键词 凡纳滨对虾 中科院海洋所 遗传图谱 遗传连锁图谱 养殖对象 海洋研究所 测序技术 标记密度
在线阅读 下载PDF
中科院海洋所构建凡纳滨对虾遗传图谱
6
《当代水产》 2016年第4期27-27,共1页
3月28日讯,中科院海洋研究所利用高通量测序技术对凡纳滨对虾的基因组进行了基因组探查分析,成功构建全球标记密度最高的对虾遗传连锁图谱。据悉,凡纳滨对虾基因组中重复序列和杂合度比例均很高,其高复杂出监管函。3月29日,中水渔... 3月28日讯,中科院海洋研究所利用高通量测序技术对凡纳滨对虾的基因组进行了基因组探查分析,成功构建全球标记密度最高的对虾遗传连锁图谱。据悉,凡纳滨对虾基因组中重复序列和杂合度比例均很高,其高复杂出监管函。3月29日,中水渔业又公告称,收到了北京证监局发来的责令整改决定。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 中科院海洋所 遗传图谱 遗传连锁图谱 海洋研究所 基因组 测序技术 标记密度
在线阅读 下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部