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鲤鱼乳酸脱氢酶活性的QTL检测
被引量:
27
1
作者
毛瑞鑫
刘福军
+5 位作者
张晓峰
张研
曹顶臣
鲁翠云
梁利群
孙效文
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期407-411,共5页
利用SSR分子标记结合"拟测交"策略,以荷包红鲤抗寒品系和柏氏鲤远缘杂交所产生F1代为亲本及其F2代为作图群体,应用Windows Map Manager2.0软件的标记回归法进行乳酸脱氢酶(Lactate dehydrogenase,LDH)活性数量性状基因座单标...
利用SSR分子标记结合"拟测交"策略,以荷包红鲤抗寒品系和柏氏鲤远缘杂交所产生F1代为亲本及其F2代为作图群体,应用Windows Map Manager2.0软件的标记回归法进行乳酸脱氢酶(Lactate dehydrogenase,LDH)活性数量性状基因座单标记定位分析。在乳酸脱氢酶性状的标记回归研究中,共发现12个标记与LDH性状关联,对性状的贡献率为4.00%~10.00%,其中HLJE222达到极显著水平(P<0.01)。为了进一步验证,利用已有的生物信息学工具,将与性状连锁的EST序列与公共数据库中的核酸序列进行同源搜索分析,发现标记HLJE222的EST序列与斑马鱼DAZ associated protein1的mRNA序列相匹配(相似性为94%),与公共数据库中的已知蛋白序列进行相似性比较,同样发现HLJE222的EST与斑马鱼DAZ associated protein1相匹配(相似性为97%)。结果表明HLJE222位点与影响乳酸脱氢酶活性相关的基因连锁。
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关键词
鲤鱼
标记回归分析
乳酸脱氢酶
拟测交策略
EST—SSR
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职称材料
题名
鲤鱼乳酸脱氢酶活性的QTL检测
被引量:
27
1
作者
毛瑞鑫
刘福军
张晓峰
张研
曹顶臣
鲁翠云
梁利群
孙效文
机构
中国水产科学院黑龙江水产研究所
上海海洋大学水产与生命学院
大连水产学院生命科学与技术学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期407-411,共5页
基金
国家重点基础研究发展规划(973计划)项目(编号:2004CB117405)资助
文摘
利用SSR分子标记结合"拟测交"策略,以荷包红鲤抗寒品系和柏氏鲤远缘杂交所产生F1代为亲本及其F2代为作图群体,应用Windows Map Manager2.0软件的标记回归法进行乳酸脱氢酶(Lactate dehydrogenase,LDH)活性数量性状基因座单标记定位分析。在乳酸脱氢酶性状的标记回归研究中,共发现12个标记与LDH性状关联,对性状的贡献率为4.00%~10.00%,其中HLJE222达到极显著水平(P<0.01)。为了进一步验证,利用已有的生物信息学工具,将与性状连锁的EST序列与公共数据库中的核酸序列进行同源搜索分析,发现标记HLJE222的EST序列与斑马鱼DAZ associated protein1的mRNA序列相匹配(相似性为94%),与公共数据库中的已知蛋白序列进行相似性比较,同样发现HLJE222的EST与斑马鱼DAZ associated protein1相匹配(相似性为97%)。结果表明HLJE222位点与影响乳酸脱氢酶活性相关的基因连锁。
关键词
鲤鱼
标记回归分析
乳酸脱氢酶
拟测交策略
EST—SSR
Keywords
common carp(Cyprinus carpio)
marker regression
lactate dehydrogenase
double pseudo-testcross strategy
EST-SSR
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鲤鱼乳酸脱氢酶活性的QTL检测
毛瑞鑫
刘福军
张晓峰
张研
曹顶臣
鲁翠云
梁利群
孙效文
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009
27
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