1株柯乐猪源贝莱斯芽孢杆菌的分离鉴定及生物学特性分析 被引量：1

1

作者 吴诗卉 周桂仙 +3 位作者 王敏乐 廖义潇 文明 杨颖 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第3期1437-1446,共10页

【目的】从柯乐猪粪便中筛选具有优良益生特性的益生菌,以期为筛选畜禽微生态制剂候选菌株提供参考。【方法】采集新鲜柯乐猪粪便,用0.3%胆盐初筛耐胆盐菌株,分离纯化后通过菌落形态和16S rDNA测序进行鉴定,并对分离株的生长特性、耐受... 【目的】从柯乐猪粪便中筛选具有优良益生特性的益生菌,以期为筛选畜禽微生态制剂候选菌株提供参考。【方法】采集新鲜柯乐猪粪便,用0.3%胆盐初筛耐胆盐菌株,分离纯化后通过菌落形态和16S rDNA测序进行鉴定,并对分离株的生长特性、耐受特性、产酶特性、药物敏感性以及动物安全性进行分析。【结果】分离筛选获得1株耐胆盐贝莱斯芽孢杆菌,将其命名为W1,该分离株在LB固体培养基上呈圆形、乳白色、不透明,表面皱褶干燥、边缘不整齐;革兰染色镜检可见阳性短杆菌,扫描电镜观察菌体呈短杆状。分离株在LB液体培养基中培养4 h后进入对数生长期,28 h后进入稳定期。将2%接种量的分离株菌液置于人工胃液和人工肠液中处理1 h后,其存活率分别为78.44%和86.62%。分离株在纤维素酶、淀粉酶和蛋白酶筛选培养基中形成的透明圈直径分别为(15.44±2.27)、(25.11±0.69)和(29.69±1.76)mm。药敏试验结果显示,分离株对四环素、卡那霉素、庆大霉素、阿奇霉素、诺氟沙星和环丙沙星表现敏感,对青霉素、阿莫西林和红霉素表现中介。动物安全性试验结果显示,连续20 d灌胃0.1 mL 1×10^(9) CFU/mL分离菌液,对照组和试验组小鼠生长状况良好,解剖观察脏器无肉眼可见病变,试验组小鼠平均日增重显著高于对照组(P<0.05),两组间血常规指标均无显著差异(P>0.05)。【结论】分离筛选得到1株生物学特性良好的贝莱斯芽孢杆菌,其对人工胃液和人工肠液具有一定耐受能力,产纤维素酶、淀粉酶和蛋白酶,对小鼠无毒害作用,有望作为畜禽微生态制剂的候选菌株。 展开更多

关键词 柯乐猪 贝莱斯芽孢杆菌 生物学特性 微生态制剂

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柯乐猪MSTN基因内含子2单核苷酸多态性及其对肉质性状的影响

2

作者 杨远青 张游宇 +1 位作者 朱颖 张依裕 《贵州畜牧兽医》 2025年第5期25-28,共4页

为探究柯乐猪MSTN基因单核苷酸多态性(SNPs)对肉质性状的影响,选取30头10月龄阉割柯乐猪(公母各半),采用PCR扩增结合直接测序的方法对肌肉组织MSTN基因内含子2的SNPs进行筛查,分析SNPs位点基因型对12个肉质指标的遗传效应。结果:柯乐猪M... 为探究柯乐猪MSTN基因单核苷酸多态性(SNPs)对肉质性状的影响,选取30头10月龄阉割柯乐猪(公母各半),采用PCR扩增结合直接测序的方法对肌肉组织MSTN基因内含子2的SNPs进行筛查,分析SNPs位点基因型对12个肉质指标的遗传效应。结果:柯乐猪MSTN基因内含子2存在1个SNPs位点(g.94627685 A>C),检测到纯合基因型AA和杂合基因型AC,AA和A分别为优势基因型和优势等位基因,频率分别为0.87、0.94,属于低度多态位点,多态信息含量为0.11,该SNPs位点基因型分布未偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);AA基因型个体的失水率和滴水损失显著高于AC基因型个体(P<0.05),表明MSTN基因内含子2的g.94627685 A>C突变可能影响柯乐猪肌肉的保水能力。结论:柯乐猪MSTN基因内含子2存在1个SNPs位点:g.94627685 A>C。该位点对柯乐猪肌肉品质指标失水率和滴水损失有显著影响,可作为柯乐猪肌肉保水力的重要分子标记。 展开更多

关键词 柯乐猪 MSTN基因 内含子 单核苷酸多态性 肉质性状

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柯乐猪BMP7基因SNP位点鉴定及其与繁殖性状的关联分析

3

作者 王倩倩 赵永 +6 位作者 杨齐心 杨红文 向进 吴燕 付红梅 丁义杰 张依裕 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第8期1559-1565,共7页

为了探究BMP7基因单核苷酸多态性(SNP)位点对柯乐猪繁殖性状的影响,本研究选取158头健康经产柯乐猪,采用Sanger测序技术检测BMP7基因的SNP位点,并对其与繁殖性状的相关性进行分析。结果表明,在BMP7基因第3内含子区域鉴定到3个SNP突变位... 为了探究BMP7基因单核苷酸多态性(SNP)位点对柯乐猪繁殖性状的影响,本研究选取158头健康经产柯乐猪,采用Sanger测序技术检测BMP7基因的SNP位点,并对其与繁殖性状的相关性进行分析。结果表明,在BMP7基因第3内含子区域鉴定到3个SNP突变位点,分别为g.57647887 G→A、g.57647990 C→T和g.57648145 C→G,这些位点均符合哈迪-温伯格平衡(P>0.05)。其中,g.57647887 G→A位点与g.57647990 C→T位点完全连锁。关联分析结果表明,H1H1(GG-CC-GG)、H2H2(AA-TT-CC)和H4H4(AA-TT-GG)双倍型个体的总产仔数、产活仔猪数、初生窝重、断奶仔猪数、断奶窝重等繁殖性状较好,且为纯合子,而H2H4(AA-TT-GC)双倍型个体的繁殖性状较差。本研究结果为柯乐猪育种提供了理论依据。 展开更多

关键词 BMP7 单核苷酸多态性位点 繁殖性能 柯乐猪 关联分析

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KISS1基因SNP对柯乐猪繁殖性状的影响 被引量：1

4

作者 熊力 谭元成 +5 位作者 郭小江 杨红文 杨齐心 杨酸 向进 张依裕 《现代畜牧科技》 2023年第8期93-96,共4页

研究旨在了解KISS1基因对猪繁殖力的影响,以78头初产柯乐猪为材料,采用聚合酶链式反应(PCR)产物直接测序与人工较对相结合鉴定KISS1基因单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP位点对柯乐猪繁殖指标的影响。结果显示在KISS1基因第1外显子处发... 研究旨在了解KISS1基因对猪繁殖力的影响,以78头初产柯乐猪为材料,采用聚合酶链式反应(PCR)产物直接测序与人工较对相结合鉴定KISS1基因单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP位点对柯乐猪繁殖指标的影响。结果显示在KISS1基因第1外显子处发现g.64835073 A>G同义突变,在第1内含子处发现g.64835529 G>A突变,2个SNP位点均产生3种基因型,均为中度多态位点,且均符合Hardy-Weinberg平衡;g.64835073 A>G位点对5个繁殖指标的影响未能达到显著水平(P>0.05);其中g.64835529 G>A位点对总产仔数、初生个体重、断奶个体重的影响达显著水平,揭示g.64835529 G>A位点可能作为猪产仔数的一个分子标记。 展开更多

关键词 柯乐猪 KISS1基因 SNP 繁殖性状

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纯种柯乐猪与巴×柯杂交猪肠道菌群结构的研究 被引量：12

5

作者 杨莲 燕志宏 +8 位作者 黄维江 杨仕钰 吴光松 顾丽菊 林鹏飞 杨蓉 李平 任丽群 张芸 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期1359-1371,共13页

本试验对纯种柯乐猪与巴×柯杂交猪肠道菌群结构特性及差异性进行了研究,旨在从猪肠道微生物的角度揭示纯种柯乐猪耐粗饲特性及巴×柯杂交猪对青绿饲料的适应能力,为后期微生物添加剂的设计、柯乐猪杂交利用及标准化养殖提供依... 本试验对纯种柯乐猪与巴×柯杂交猪肠道菌群结构特性及差异性进行了研究,旨在从猪肠道微生物的角度揭示纯种柯乐猪耐粗饲特性及巴×柯杂交猪对青绿饲料的适应能力,为后期微生物添加剂的设计、柯乐猪杂交利用及标准化养殖提供依据。纯种柯乐猪和巴×柯杂交猪在同等条件下养殖,达屠宰体重后(100 kg左右),随机各选3头屠宰,取十二指肠、空肠、回肠、结肠内容物,进行高通量测序和生物学信息分析。结果显示:纯种柯乐猪与巴×柯杂交猪各肠段Alpha多样性指数差异不显著(P>0.05);Beta多样性分析显示,2个品种猪大部分样品交叉聚集到一起;肠道菌群结构分析显示,纯种柯乐猪和巴×柯杂交猪小肠阶段以厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)为优势菌门,到了结肠阶段则是以拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门为优势菌门;纯种柯乐猪与巴×柯杂交猪结肠中有大量的纤维分解菌属,巴×柯杂交猪结肠中月形单胞菌属(Selenomonas)和脱硫弧菌属(Desulfovibrio)的相对丰度显著或极显著高于纯种柯乐猪(P<0.05或P<0.01),而消化球菌属(Peptococcus)、聚乙酸菌属(Acetitomaculum)、Leeia的相对丰度则显著低于纯种柯乐猪(P<0.05);LEfSe分析后发现纯种柯乐猪结肠中富集着大量的产短链脂肪酸菌,其中纤维降解菌有聚乙酸菌属、瘤胃球菌科的不可培养瘤胃细菌4C0d_17(uncultured_rumen_bacterium_4C0d_17)、Leeia、拟杆菌纲、拟杆菌目,与纤维降解菌起协同作用的菌群有考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)、考拉杆菌属的uncultured_Veillonellaceae_bacterium;巴×柯杂交猪结肠中富集的纤维降解菌有月形单胞菌属、柔嫩梭菌(Clostridium leptum)。上述结果表明,在整个肠道菌群结构上,纯种柯乐猪和巴×柯杂交猪的优势菌在类别上非常接近,体现了环境相同效应,纯种柯乐猪和巴×柯杂交猪的肠道菌群结构相对稳定且相似度高;在属水平上,纯种柯乐猪和巴×柯杂交猪的结肠中纤维降解菌表现出差异,纯种柯乐猪结肠内纤维降解菌的比例较高,说明引入外源血对肠道菌群结构有一定的影响,巴×柯杂交猪对粗纤维的消化能力较弱于柯乐猪。 展开更多

关键词 纯种柯乐猪 巴×柯杂交猪 肠道菌群 高通量测序 生物信息学分析

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柯乐猪血液基因组甲基化修饰与细胞因子水平的相关性 被引量：1

6

作者 胡磐 冉雪琴 王嘉福 《贵州农业科学》 CAS 2015年第4期142-145,149,共5页

为探明柯乐猪血液免疫细胞的基因表达是否受甲基化调控,应用甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)和酶联免疫吸附测试技术(ELISA)对柯乐猪与大白猪血液基因组DNA的甲基化水平、血清中的细胞因子浓度进行检测,分析柯乐猪与大白猪在甲基化水平... 为探明柯乐猪血液免疫细胞的基因表达是否受甲基化调控,应用甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)和酶联免疫吸附测试技术(ELISA)对柯乐猪与大白猪血液基因组DNA的甲基化水平、血清中的细胞因子浓度进行检测,分析柯乐猪与大白猪在甲基化水平、细胞因子浓度方面的差异及其相关关系。结果表明:柯乐猪基因组总甲基化水平为32.38%,与大白猪接近(P>0.05);IL-2、IL-4、IL-6和IL-10浓度分别为(302.37±125.72)pg/mL、(88.71±32.05)pg/mL、(219.01±30.42)pg/mL和(116.95±30.24)pg/mL,其中IL-6和IL-10分别极显著、显著低于大白猪;IFN-α、IFN-γ分别为(211.09±76.08)pg/mL和(57.18±14.21)pg/mL,分别极显著、显著高于大白猪。柯乐猪基因组的全甲基化水平与IFN-γ浓度间呈弱负相关关系(ρ=-0.256)。说明,血液免疫细胞的基因表达可能受甲基化的调控,且与柯乐猪的抗病力强有关。 展开更多

关键词 柯乐猪 基因组DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性 细胞因子

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柯乐猪PAEP基因多态性及其与繁殖性状的关联分析 被引量：3

7

作者 赵永 郭小江 +6 位作者 李维 熊力 杨红文 王春源 吴燕 向进 张依裕 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1593-1602,共10页

【目的】研究孕激素相关子宫内膜蛋白(progestogen associated endometrial protein,PAEP)基因多态性对柯乐猪繁殖性状的影响,以挖掘柯乐猪的高繁殖力基因,用于提升柯乐猪的繁殖力。【方法】以189头经产柯乐猪为试验动物,采用PCR产物测... 【目的】研究孕激素相关子宫内膜蛋白(progestogen associated endometrial protein,PAEP)基因多态性对柯乐猪繁殖性状的影响,以挖掘柯乐猪的高繁殖力基因,用于提升柯乐猪的繁殖力。【方法】以189头经产柯乐猪为试验动物,采用PCR产物测序和序列比对鉴定单核苷酸多态性(SNP)位点,利用SHEsis在线软件分析SNP位点的群体遗传特性,通过RNAfold、SOPMA、SWISS-MODEL和SWISS-PdbViewer程序对SNP位点进行生物信息学分析,利用SPSS 22.0软件分析PAEP基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的相关性。【结果】在柯乐猪PAEP基因中共鉴定到3个SNPs位点:外显子4的g.1884992 T>C位点,为错义突变,导致第135位缬氨酸(V)变成丙氨酸(A);内含子4的g.1885152 G>C和g.1887834 G>A位点。3个突变位点均检测到3种基因型;g.1884992 T>C位点属于低度多态(PIC<0.25),g.1885152 G>C、g.1887834 G>A位点属于中度多态(0.25<PIC<0.5)。g.1884992 T>C位点产生的基因型分布未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);g.1885152 G>C和g.1887834 G>A位点产生的基因型分布均极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。连锁分析发现,g.1885152 G>C和g.1887834 G>A位点完全连锁,共产生3种单倍型和6种双倍型。g.1884992 T>C位点引起PAEP基因mRNA及蛋白的二级结构发生改变。关联分析结果表明,g.1884992 T>C位点对柯乐猪总产仔数和产活仔数的影响均达到显著水平(P<0.05),g.1885152 G>C、g.1887834 G>A位点对柯乐猪总产仔数、产活仔数、断奶仔数和断奶窝重的影响均达到显著水平(P<0.05);双倍型H3H3个体总产仔数、产活仔数、断奶仔数和断奶窝重均显著高于其他5种双倍型(P<0.05),初生窝重显著高于双倍型H1H1、H2H2和H2H3(P<0.05);双倍型H1H3个体的总产仔数和断奶仔数显著高于双倍型H1H1、H1H2、H2H2和H2H3(P<0.05),产活仔数显著高于双倍型H2H3(P<0.05)。【结论】PAEP基因中存在的3个SNPs对柯乐猪繁殖性状有显著影响,其中H3H3为有利双倍型,可作为柯乐猪繁殖性状选择的遗传标记。 展开更多

关键词 柯乐猪 PAEP基因 单核苷酸多态性 繁殖性状

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柯乐猪XDH基因多态性鉴定及其对繁殖性状的影响 被引量：1

8

作者 向进 熊力 +6 位作者 李维 谢婷婷 杨齐心 杨红文 王春源 吴燕 张依裕 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1863-1872,共10页

【目的】明确黄嘌呤脱氢酶基因(XDH)单核苷酸多态性(SNP)位点与柯乐猪繁殖性状的关联性,为加速柯乐猪的育种进程提供理论依据。【方法】选取87头健康经产柯乐母猪为研究对象,采用Sanger测序法筛查出XDH基因SNP位点,利用SPSS 22.0中的一... 【目的】明确黄嘌呤脱氢酶基因(XDH)单核苷酸多态性(SNP)位点与柯乐猪繁殖性状的关联性,为加速柯乐猪的育种进程提供理论依据。【方法】选取87头健康经产柯乐母猪为研究对象,采用Sanger测序法筛查出XDH基因SNP位点,利用SPSS 22.0中的一般线性模型(GLM)分析SNP位点与柯乐猪繁殖性状指标(产活仔数、初生窝重、平均初生重、断奶仔猪数、断奶窝重及平均断奶重)的关联性,并通过RNAfold web server、ExPASy-ProtParam、NovoPro和SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析。【结果】在柯乐猪XDH基因上共筛选获得12个SNPs位点,分别是第33内含子上的g.108047658C>G和g.108047680C>A位点,第34内含子上的g.108048009C>T、g.108048044T>C、g.108048046T>C、g.108048047C>T、g.108048054C>T、g.108048153A>T、g.108048208A>G、g.108048212T>C和g.108048242C>T位点,第34外显子上的g.108047915G>A位点。12个SNPs位点均存在3种基因型,属于中度多态位点(0.25<PIC<0.50);g.108048047C>T、g.108048208A>G、g.108048242C>T、g.108048044T>C、g.108048046T>C和g.108048212T>C位点的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡状态(PHWE>0.05),其余6个SNPs位点的基因型分布则显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(PHWE<0.05)。除g.108047658C>G位点与g.108047680C>A位点、g.108048044T>C位点与g.108048046T>C位点、g.108048046T>C位点与g.108048047C>T位点间存在强连锁不平衡关系外,其余各SNP位点间均不存在强连锁不平衡关系。g.108047658C>G和g.108047915G>A位点对柯乐猪产活仔数的影响达显著水平(P<0.05,下同),g.108047658C>G位点表现为CG基因型个体的产活仔数显著高于GG基因型个体,g.108047915G>A位点表现为AG基因型个体的产活仔数显著高于AA基因型个体。g.108047915G>A位点突变导致柯乐猪XDH基因mRNA二级结构发生改变,最小自由能由-1508.90 kcal/mol上升到-1507.80 kcal/mol;且XDH基因等位基因G的突变还导致其编码蛋白分子式、相对分子量、理论等电点(pI)、不稳定系数及蛋白高级结构发生改变。【结论】柯乐猪XDH基因第33内含子g.108047658C>G位点和第34外显子g.108047915G>A位点对其产活仔数的影响达显著水平,可作为柯乐猪繁殖性状改良的潜在分子辅助标记。 展开更多

关键词 柯乐猪 XDH基因 SNP位点 繁殖性状 产活仔数

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柯乐猪异常乳腺组织的TMT蛋白组学分析 被引量：1

9

作者 王春源 熊力 +4 位作者 杨红文 郭小江 张依裕 谭元成 杨酸 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期69-78,共10页

【目的】基于串联体量标记(TMT)定量蛋白组学技术探讨柯乐猪母猪乳腺发育的调控机制,为选育工作提供依据。【方法】选取乳腺发育正常和异常的柯乐猪母猪各3头,采集乳腺组织,利用TMT定量蛋白组学技术探究正常和异常乳腺组织的差异表达蛋... 【目的】基于串联体量标记(TMT)定量蛋白组学技术探讨柯乐猪母猪乳腺发育的调控机制,为选育工作提供依据。【方法】选取乳腺发育正常和异常的柯乐猪母猪各3头,采集乳腺组织,利用TMT定量蛋白组学技术探究正常和异常乳腺组织的差异表达蛋白,筛选与乳腺发育相关的差异关键蛋白,并对差异表达蛋白进行生物信息学分析。【结果】从柯乐猪乳腺组织中共筛选出474个差异表达蛋白,包括245个上调蛋白、229个下调蛋白;基因本体(GO)功能注释和富集分析显示,差异表达蛋白主要富集在上皮细胞分化、皮肤形成和肾小管上皮细胞分化等生物学过程中,主要分布在胞外区和细胞外空隙中,参与调节肽酶抑制剂活性和肽链内切酶活性;京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析显示,差异表达蛋白主要富集在补体系统、过氧化物酶体增殖物激活受体和金黄色葡萄球菌感染等信号通路上;结合差异表达蛋白互作网络分析,筛选出10个核心差异表达蛋白[上调蛋白有P14287(骨桥蛋白)、F1RXF9(角蛋白25)、I3LDS3(角蛋白10)、Q75QW1(上皮细胞黏附分子)、A0A5S8KLN1(丛生蛋白)、F1RW75(桥粒素),下调蛋白有A0A286ZT13(白蛋白)、P06867(血纤维蛋白溶酶原)、F1SCC9(含丝氨酸蛋白酶抑制剂结构域的蛋白)、P50447(α-1-抗胰蛋白酶)]。【结论】采用TMT定量蛋白组学技术能有效筛选出母猪正常和异常乳腺组织中的差异表达蛋白。 展开更多

关键词 柯乐猪 串联体量标记(TMT)技术 乳腺组织 差异表达蛋白

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柯乐猪PRLR基因多态性与繁殖性状的关联性 被引量：10

10

作者 杨酸 郭小江 +5 位作者 杨红文 熊力 李晨 谭元成 王春源 张依裕 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期556-564,共9页

本研究旨在探究催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因的单核苷酸突变位点(single nucleotide polymorphism,SNP)及其对柯乐猪繁殖性状的遗传效应,以期为提高柯乐猪的繁殖性能研究提供基因标记。采用PCR产物直接测序法对204头柯乐猪P... 本研究旨在探究催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因的单核苷酸突变位点(single nucleotide polymorphism,SNP)及其对柯乐猪繁殖性状的遗传效应,以期为提高柯乐猪的繁殖性能研究提供基因标记。采用PCR产物直接测序法对204头柯乐猪PRLR基因外显子区的SNP位点进行筛查鉴定,同时利用SPSS软件中单因子方差法分析各SNPs不同基因型和双倍型与7个繁殖性状的相关性,并通过在线软件分析碱基变异对mRNA二级结构的影响。结果显示,在柯乐猪PRLR基因第8外显子检测到g.20655220 C>T突变,其导致丝氨酸变成脯氨酸,为错义突变;在第4内含子检测到2个同义突变位点g.20648859 C>T和g.20648931 C>T,3个SNPs均存在3种基因型,g.20648931 C>T属于低度多态,其余2个位点属于中度多态;经卡方χ^(2)检验,g.20655220 C>T位点的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),g.20648859 C>T和g.20648931 C>T位点的基因型分布极显著(P<0.01)偏离Hardy-Weinberg平衡;g.20655220 C>T位点导致PRLR基因mRNA序列二级结构发生改变,致使mRNA二级结构稳定性降低;3个SNPs共组成5种单倍型和9种双倍型,优势单倍型H1(CCC)频率为0.610,优势双倍型H1H1(CCCCCC)频率为0.382。关联性分析结果显示,g.20655220 C>T位点CC基因型母猪的初生个体重、断奶窝重和断奶个体重均显著(P<0.05)高于CT基因型,g.20648931 C>T位点CT基因型母猪的初生个体重、初生窝重和断奶窝重均显著(P<0.05)高于CC基因型和TT基因型,且该位点在初生个体重上,CC基因型显著(P<0.05)高于TT基因型;双倍型H1H5(CTCTCT)在产仔数和活仔数上为优势双倍型,H2H3(CCTTCT)在断奶窝重和断奶个体重上为较优双倍型。综上,PRLR基因可作为候选基因参与柯乐猪繁殖性状的分子标记辅助选择。 展开更多

关键词 PRLR基因 柯乐猪 多态性 繁殖性状

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柯乐猪BMP7基因SNP位点与繁殖性能的关联分析 被引量：2

11

作者 向进 吴燕 +4 位作者 王春源 赵永 付红梅 丁义杰 张依裕 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期2495-2503,共9页

【目的】明确骨形态发生蛋白7基因(BMP7)单核苷酸多态性(SNP)位点与柯乐猪繁殖性能的关联性,挖掘柯乐猪繁殖性状的分子辅助标记,为加速柯乐猪繁殖性能提升及推进其品种改良进程提供技术支撑。【方法】选取150头健康经产柯乐母猪为研究对... 【目的】明确骨形态发生蛋白7基因(BMP7)单核苷酸多态性(SNP)位点与柯乐猪繁殖性能的关联性,挖掘柯乐猪繁殖性状的分子辅助标记,为加速柯乐猪繁殖性能提升及推进其品种改良进程提供技术支撑。【方法】选取150头健康经产柯乐母猪为研究对象,采用Sanger测序法筛查鉴定BMP7基因SNP位点,计算各SNP位点的群体遗传参数,并通过SPSS 22.0中的一般线性模型(GLM)分析SNP位点与柯乐猪总产仔数、初生窝重、平均初生重、断奶仔猪数、断奶窝重及平均断奶重等6个繁殖性状指标的关联性。【结果】在柯乐猪BMP7基因上共发现5个SNPs位点:g.57602289C>T(第2外显子)、g.57602334C>T(第2外显子)、g.57602404C>T(第2内含子)、g.57602418C>T(第2内含子)和g.57602561G>T(第2内含子),均存在3种基因型;5个SNPs位点的优势基因型分别为CT、CT、CT、CT和GT,对应的多态信息含量(PIC)介于0.358~0.375,均表现为中度多态(0.25<PIC<0.50)。5个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡状态(P_(HWE)>0.05),且各SNP位点间均存在强连锁不平衡关系[LD系数(Dʼ)>0.800,相关系数(R^(2))>0.330]。关联分析结果显示,g.57602289C>T、g.57602334C>T和g.57602418C>T等3个位点TT基因型个体的初生窝重均显著高于CC基因型个体(P<0.05),TT基因型个体的断奶仔猪数极显著高于CC基因型和CT基因型个体(P<0.01,下同);g.57602404C>T位点TT基因型个体的总产仔猪数极显著高于CC基因型个体;g.57602561G>T位点TT基因型个体的总产仔猪数极显著高于GG基因型个体。此外,双倍型H2H2和H3H3个体的总产仔数、初生窝重、断奶仔猪数和断奶窝重均高于其他双倍型个体,尤其是H2H2个体在断奶仔猪数和初生窝重方面表现出明显优势。【结论】在柯乐猪BMP7基因上发现的5个SNPs位点均与其繁殖性能存在较强的关联性,BMP7基因可作为柯乐猪繁殖性状的候选基因,而双倍型H2H2可作为繁殖性状分子标记辅助选择的参考。 展开更多

关键词 柯乐猪 BMP7基因 SNP位点 繁殖性能 关联分析

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柯乐猪TAC3第1内含子多态对繁殖性状的影响 被引量：1

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作者 郭小江 熊力 +5 位作者 谭元成 杨红文 杨齐心 杨酸 向进 张依裕 《中国猪业》 2023年第3期90-93,共4页

TAC3基因参与哺乳动物繁殖相关的生命活动。试验以78头初产柯乐猪为材料,通过PCR产物直接测序和序列比对鉴定TAC3基因的遗传变异,分析遗传变异对繁殖性状的影响。结果显示,在柯乐猪TAC3基因第1内含子中检测到1个中度多态位点:g.22329038... TAC3基因参与哺乳动物繁殖相关的生命活动。试验以78头初产柯乐猪为材料,通过PCR产物直接测序和序列比对鉴定TAC3基因的遗传变异,分析遗传变异对繁殖性状的影响。结果显示,在柯乐猪TAC3基因第1内含子中检测到1个中度多态位点:g.22329038 T>C,产生3种基因型TT、TC和CC,TC和T分别为优势基因型和优势等位基因,基因型分布未偏离Hardy-Weinberg平衡,TT基因型个体的产活仔数显著高于CC基因型(P<0.05),其他指标在不同基因型间差异未能达到显著水平(P>0.05),揭示g.22329038 T>C位点可能是柯乐猪产活仔数的一个重要分子标记。 展开更多

关键词 柯乐猪 TAC3基因 多态性 繁殖性状

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柯乐猪TAC3R基因SNP位点鉴定及其对繁殖性状的影响 被引量：1

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作者 曾辅琴 谭元成 +7 位作者 黄雯 王春源 向进 吴燕 蒙炳盛 孟忠名 魏婷 张依裕 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1502-1509,共8页

【目的】探究速激肽受体3基因(TAC3R)单核苷酸多态性(SNP)位点与柯乐猪繁殖性能的关联性,筛选出与繁殖性状相关的遗传标记,为加速柯乐猪的品种改良提供技术支撑。【方法】选取195头2胎以上的健康经产柯乐猪为研究对象,运用Sanger直接测... 【目的】探究速激肽受体3基因(TAC3R)单核苷酸多态性(SNP)位点与柯乐猪繁殖性能的关联性,筛选出与繁殖性状相关的遗传标记,为加速柯乐猪的品种改良提供技术支撑。【方法】选取195头2胎以上的健康经产柯乐猪为研究对象,运用Sanger直接测序法鉴定TAC3R基因SNP位点,利用SHEsisPlus计算各SNP位点的群体遗传参数,并以SPSS 22.0中的一般线性模型(GLM)分析SNP位点基因型和双倍型对柯乐猪5个繁殖指标的遗传效应。【结果】在柯乐猪TAC3R基因上共检测到5个SNPs位点:g.117686266T>C、g.117686381A>G、g.117686384A>G、g.117688503T>C和g.117688518T>C。g.117686381A>G位点与g.117686384A>G位点间完全连锁,g.117688503T>C位点与g.117686266T>C、g.117686381A>G和g.117686384A>G位点间不存在连锁关系,而其他各SNP位点间均存在强连锁不平衡关系。5个SNPs位点联合共检测到5种单倍型和10种双倍型,单倍型中以H5的频率最高(0.433)、H2的频率最低(0.059),双倍型中以H3H5的频率最高(0.221)、H1H4的频率最低(0.031)。5个SNPs位点在柯乐猪群体中均呈中度多态性(0.25<PIC<0.50),且其基因型分布均未偏离Hardy-Weinberg平衡(χ^(2)-HWE<5.991)。g.117688503T>C位点显著影响窝均产仔数和断奶仔猪数,TT基因型个体的窝均产仔数和断奶仔猪数显著高于CC基因型个体;g.117688518T>C位点显著影响断奶仔猪数,CC基因型个体显著高于TT基因型个体。柯乐猪TAC3R基因SNP位点双倍型与其繁殖性状的关联分析发现,H2H4型为窝均产仔数、窝均产活仔数和窝断奶仔猪数3个指标的最优双倍型,H1H3型为平均断奶重指标的最优双倍型。【结论】在柯乐猪TAC3R基因上检测到5个SNPs位点,其中g.117688503T>C和g.117688518T>C位点对柯乐猪的繁殖性能有显著影响。TAC3R基因可作为柯乐猪繁殖性状的候选基因,双倍型H2H4可作为分子标记辅助选择的参考。 展开更多

关键词 柯乐猪 TAC3R基因 SNP位点 繁殖性状 关联性

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柯乐猪CRISP 3基因SNP鉴定及其对繁殖性状的影响 被引量：1

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作者 向进 王春源 +3 位作者 吴燕 谭元成 杨酸 张依裕 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1270-1278,共9页

为分析富半胱氨酸的分泌蛋白3(cysteine rich secretory protein 3,CRISP3)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点对柯乐猪繁殖性状的影响,采用Sanger测序法检测250头健康经产柯乐猪母猪CRISP 3基因的SNP突变位点... 为分析富半胱氨酸的分泌蛋白3(cysteine rich secretory protein 3,CRISP3)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点对柯乐猪繁殖性状的影响,采用Sanger测序法检测250头健康经产柯乐猪母猪CRISP 3基因的SNP突变位点,利用SPSS 22.0软件分析SNP位点与柯乐猪产活仔猪数、初生窝重、初生均重、断奶窝重、断奶仔猪数和断奶均重6个指标的关联性。结果显示,在柯乐猪CRISP 3基因第4内含子共发现3个SNP突变位点,即g.43796318T>C、g.43796424T>A和g.43796425G>T,均存在3种基因型。g.43796318T>C和g.43796424T>A位点的优势基因型为TT,优势等位基因为T;g.43796425G>T位点的优势基因型为GG,优势等位基因为G。χ^(2)检验显示,g.43796318T>C位点基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);g.43796424T>A和g.43796425G>T位点基因型分布均极显著(P<0.01)偏离Hardy-Weinberg平衡状态。3个SNP位点的多态信息含量(PIC)为0.25~0.50,表现为中度多态。连锁不平衡分析显示,g.43796424T>A与g.43796425G>T之间存在强连锁不平衡。关联分析显示,g.43796318T>C位点TT和CC基因型个体的初生窝重和初生均重均显著(P<0.05)高于TC基因型;g.43796424T>A位点TA基因型个体的产活仔猪数、初生窝重和断奶仔猪数均显著(P<0.05)高于TT和AA基因型;g.43796425G>T位点GT基因型个体的产活仔猪数、初生窝重和断奶仔猪数均显著(P<0.05)高于GG和TT基因型。双倍型关联分析显示,双倍型H2H4(CCTAGT)个体的产活仔猪数、初生窝重、断奶仔猪数和断奶窝重显著(P<0.05)高于H1H2(TCTAGT)个体和H2H2(CCAATT)个体;双倍型H2H2(CCAATT)个体的初生均重显著(P<0.05)高于除H4H4(CCTTGG)个体外的其他个体,且其断奶均重显著(P<0.05)高于其他双倍型个体。CRISP 3基因第4内含子上的3个突变位点与柯乐猪的6个繁殖性状均存在显著关联,可作为柯乐猪繁殖性状选择的候选分子标记。 展开更多

关键词 柯乐猪 CRISP 3基因 单核苷酸多态性 繁殖性状

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柯乐猪KRT10基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

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作者 赵永 杨齐心 +6 位作者 李维 熊力 杨红文 王春源 吴燕 向进 张依裕 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期2508-2516,共9页

【目的】研究角蛋白10(keratin 10,KRT10)基因多态性对柯乐猪繁殖性状的影响,以提高柯乐猪的繁殖力。【方法】以255头柯乐猪为研究对象,采用PCR产物测序、DANMAN序列比对软件及人工校对相结合的方法鉴定KRT10基因单核苷酸多态性(single ... 【目的】研究角蛋白10(keratin 10,KRT10)基因多态性对柯乐猪繁殖性状的影响,以提高柯乐猪的繁殖力。【方法】以255头柯乐猪为研究对象,采用PCR产物测序、DANMAN序列比对软件及人工校对相结合的方法鉴定KRT10基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,利用SHEsis在线软件分析SNP位点的群体遗传特性,通过RNAfold在线工具对SNP位点进行生物信息学分析,使用SPSS 22.0软件中的一般线性模型分析KRT10基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的关联性。【结果】在柯乐猪KRT10基因中共鉴定到3个SNPs位点:第4内含子的g.21643703 C>T和g.21643714 G>A;第5外显子的g.21643741 G>A。g.21643741 G>A突变导致密码子由AAG突变为AAA,编码氨基酸均为赖氨酸(K),为同义突变,引起编码的mRNA二级结构发生改变。3个SNPs位点均检测到3种基因型,g.21643703 C>T和g.21643741 G>A属于中度多态位点(0.25A)属于低度多态位点(PIC<0.25)。g.21643703 C>T和g.21643741 G>A位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),g.21643714 G>A位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05);3个SNPs位点间均不存在强连锁不平衡。KRT10基因3个SNPs位点共产生4种单倍型和10种双倍型。关联分析结果表明,g.21643703 C>T位点对柯乐猪初生窝重、断奶仔数和断奶窝重的影响均达到显著水平(P<0.05);g.21643714 G>A位点对柯乐猪总产仔数和断奶窝重的影响均达到显著水平(P<0.05);g.21643741 G>A位点对柯乐猪总产仔数、产活仔数、断奶仔数和断奶窝重的影响均达到显著水平(P<0.05)。双倍型H3H3对柯乐猪总产仔数、产活仔数、断奶仔数和断奶窝重的影响最明显。【结论】KRT10基因中存在的3个SNPs位点对柯乐猪繁殖性状有显著影响,其中H3H3为有利双倍型,可作为柯乐猪繁殖性状选择的遗传标记。 展开更多

关键词 柯乐猪 KRT10基因 单核苷酸多态性(SNP) 繁殖性状

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柯乐猪的肉品质和风味指标测定及相关性分析 被引量：6

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作者 赵春萍 张雄 +8 位作者 张静 王婧 周思旋 杜春林 齐婧 卢昱希 唐远江 赵宇 史开志 《贵州畜牧兽医》 2022年第1期12-16,共5页

为进一步了解贵州地方猪品种柯乐猪的肉质风味特性,试验选取健康去势的公猪及母猪各25头进行屠宰,测定肉品质和风味指标,并分析柯乐猪肉质、风味及各性状间的相关性。结果:(1)柯乐猪屠宰率为(78.15±2.63)%,背膘厚(51.50±13.08... 为进一步了解贵州地方猪品种柯乐猪的肉质风味特性,试验选取健康去势的公猪及母猪各25头进行屠宰,测定肉品质和风味指标,并分析柯乐猪肉质、风味及各性状间的相关性。结果:(1)柯乐猪屠宰率为(78.15±2.63)%,背膘厚(51.50±13.08)mm,眼肌面积(26.41±4.73)cm^(2);肌肉滴水损失为(1.96±0.51)%,剪切力(2.83±0.82)kgf,肌内脂肪(5.71±2.62)%。(2)去势公猪肌肉脂肪酸中的棕榈酸、亚麻酸含量显著高于去势母猪(P<0.05);去势母猪肌肉中各氨基酸含量均高于去势公猪(P>0.05)。(3)各氨基酸含量之间极显著正相关(P<0.01);肌内脂肪、油酸、亚油酸、花生三烯酸、花生四烯酸、天冬氨酸、谷氨酸与肉质性状、脂肪酸、氨基酸相关性较高。结论:柯乐猪肉质和风味性状较好;去势公猪脂肪酸含量及组成较优,去势母猪氨基酸含量更高;肌内脂肪、油酸、亚油酸、花生三烯酸、花生四烯酸、天冬氨酸、谷氨酸可作为其肉质风味评价的关键指标。 展开更多

关键词 柯乐猪 肉品质 脂肪酸 氨基酸 相关性

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柯乐猪与大白猪胴体性状、肉质性状研究及相关性分析 被引量：5

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作者 齐婧 谭娅 +6 位作者 张静 张雄 赵春萍 杜春林 王婧 周思旋 史开志 《现代畜牧科技》 2023年第7期1-6,共6页

为探究地方品种柯乐猪与引进品种大白猪的种质特性,试验从2个品种中分别选择19头和12头进行胴体及肉质性状等相关指标的测定,并进行性状间相关性分析。相关性分析表明,柯乐猪和大白猪的宰前活重与胴体重均极显著正相关(P<0.01),瘦肉... 为探究地方品种柯乐猪与引进品种大白猪的种质特性,试验从2个品种中分别选择19头和12头进行胴体及肉质性状等相关指标的测定,并进行性状间相关性分析。相关性分析表明,柯乐猪和大白猪的宰前活重与胴体重均极显著正相关(P<0.01),瘦肉率与宰前活重均显著负相关(P<0.05);柯乐猪眼肌的L_(45min*)与b_(45min*)呈极显著正相关(r=0.701,P<0.01),大白猪眼肌的L_(45min*)与b_(45min*)呈显著正相关(r=0.671,P<0.05)。结果表明,在相同饲养环境条件下,大白猪的胴体性能优于柯乐猪,但柯乐猪肉质优于大白猪,性状间也存在一定的相关性。 展开更多

关键词 柯乐猪 大白猪 胴体性状 肉质性状 相关性分析

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柯乐猪与国外品种猪精子活力的比较分析 被引量：1

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作者 冯文武 李平 +5 位作者 陈大芳 李俊 杨蓉 蒋桂荣 王钦 苏娜芬 《养猪》 2021年第3期47-49,共3页

人工授精技术在猪繁殖育种上广为使用,种公猪精液质量是繁殖生产的关键因素,精液质量直接影响着养殖业的效益。试验针对贵州地方猪种柯乐猪和国外常见品种种公猪精液质量对比分析,结果表明,柯乐猪12 h及72 h精子活力优于杜洛克猪和长白... 人工授精技术在猪繁殖育种上广为使用,种公猪精液质量是繁殖生产的关键因素,精液质量直接影响着养殖业的效益。试验针对贵州地方猪种柯乐猪和国外常见品种种公猪精液质量对比分析,结果表明,柯乐猪12 h及72 h精子活力优于杜洛克猪和长白猪,72 h后保持良好活力,活力高于70%。这显示了柯乐猪种较强的精液活力,也为进一步研究与开发该猪种精液潜在价值以促进猪产业发展提供基础。 展开更多

关键词 精子活力 柯乐猪 杜洛克猪 长白猪

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柯乐猪PAEP基因单核苷酸多态性对繁殖性能的影响

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作者 赵永 杨齐心 +6 位作者 李维 熊力 杨红文 王春源 吴燕 向进 张依裕 《贵州畜牧兽医》 2024年第3期20-24,共5页

为了分析孕激素相关子宫内膜蛋白(PAEP)基因单核苷酸突变位点(SNPs)对柯乐猪繁殖性状的影响,采用Sanger测序法筛选鉴定柯乐猪母猪PAEP基因的SNPs,SHEsis在线软件分析SNPs的群体遗传特性,SPSS 22.0软件分析SNPs单、双倍型与柯乐猪母猪群... 为了分析孕激素相关子宫内膜蛋白(PAEP)基因单核苷酸突变位点(SNPs)对柯乐猪繁殖性状的影响,采用Sanger测序法筛选鉴定柯乐猪母猪PAEP基因的SNPs,SHEsis在线软件分析SNPs的群体遗传特性,SPSS 22.0软件分析SNPs单、双倍型与柯乐猪母猪群体的总产仔数、初生窝重、初生平均重、断奶仔猪数、断奶窝重5个繁殖性状指标的相关性。结果:柯乐猪母猪PAEP基因第4内含子存在3个SNPs,分别为g.1885136 G>A、g.1885158 G>A、g.1885223 G>A,各SNPs均存在3种基因型。g.1885136 G>A和g.1885158 G>A位点完全连锁,3个位点均表现为中度多态(0.25<PIC<0.5)。3个位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。3个突变位点共产生3种单倍型和6种双倍型。g.1885136 G>A和g.1885158 G>A位点AA基因型个体的总产仔数、断奶仔猪数、断奶窝重显著高于GA、GG基因型(P<0.05),g.1885136 G>A和g.1885158 G>A位点GA和GG基因型个体的初生平均重显著高于AA基因型(P<0.05)。双倍型H2H2对总产仔数、断奶仔猪数、断奶窝重3个性状都达到了显著正相关,为较优双倍型。结论:PAEP基因可作为柯乐猪母猪繁殖性状选育的候选基因,其中双倍型H2H2可作为柯乐猪母猪繁殖性状分子标记。 展开更多

关键词 柯乐猪 PAEP基因 SNP 繁殖性状

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贵州省赫章县柯乐猪产业现状及可持续性发展探索

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作者 王圣 宋德荣 +1 位作者 侯健 吴瑛 《养殖与饲料》 2024年第7期42-45,共4页

为全面了解贵州省赫章县柯乐猪产业发展现状,摸清存在的问题,寻找到科学可行的发展模式,本文对赫章县近3年来的柯乐猪畜牧统计数据、养殖主体、加工主体等方面的情况展开了调查、分析,结果发现赫章县柯乐猪产业发展存在核心种群数量少... 为全面了解贵州省赫章县柯乐猪产业发展现状,摸清存在的问题,寻找到科学可行的发展模式,本文对赫章县近3年来的柯乐猪畜牧统计数据、养殖主体、加工主体等方面的情况展开了调查、分析,结果发现赫章县柯乐猪产业发展存在核心种群数量少、单胎产仔数少、瘦肉率低、养殖周期长等问题;对此提出了加大品种保护力度、加大对育种新技术的引入、探索新型养殖模式、加强全产业链建设等发展策略,以期推进赫章县地方特色优势柯乐猪产业可持续发展。 展开更多

关键词 柯乐猪 发展现状 存在问题 发展模式

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