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芍药查尔酮异构酶基因CHI的表达特性分析 被引量:2
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作者 吴彦庆 姜宇 +1 位作者 赵大球 陶俊 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期372-376,共5页
为了揭示查尔酮异构酶基因(chalcone isomerase gene,CHI)在芍药花瓣中的表达规律与特点,以不同芍药托桂型品种(‘金辉’‘彤云金焰’‘红楼锦菊’)4个不同发育时期(花蕾期、初开期、盛开期、衰败期)中的内、外花瓣为对象,用qPCR分别检... 为了揭示查尔酮异构酶基因(chalcone isomerase gene,CHI)在芍药花瓣中的表达规律与特点,以不同芍药托桂型品种(‘金辉’‘彤云金焰’‘红楼锦菊’)4个不同发育时期(花蕾期、初开期、盛开期、衰败期)中的内、外花瓣为对象,用qPCR分别检测CHI基因的表达水平,分析其在不同芍药品种、不同发育时期以及内外花瓣之间的表达差异。结果显示:不同发育时期同一品种芍药花瓣组织CHI基因的表达量存在一定差异,从花蕾期到衰败期整体表现为上升趋势;不同品种同一发育时期‘彤云金焰’花瓣组织(内瓣和外瓣)CHI基因的表达水平明显高于‘金辉’和‘红楼锦菊’的;同一芍药品种在相同发育时期内瓣组织的CHI基因表达量均明显高于外瓣组织的。鉴于不同芍药品种、不同发育时期内外花瓣间颜色存在差异,推测CHI基因表达量可能与芍药花瓣颜色的形成有关。该结果可为深入研究芍药CHI功能并开展芍药花色遗传改良分子育种研究提供技术支撑。 展开更多
关键词 芍药 查尔酮异构酶基因chi 花瓣 基因表达
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巴西橡胶树查尔酮异构酶HbCHI基因家族的鉴定和基因功能初步验证
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作者 吴倩倩 夏玲 +3 位作者 于飞 梁晓宇 王萌 张宇 《热带作物学报》 北大核心 2025年第2期247-255,共9页
为了研究查尔酮异构酶(CHI)对橡胶树叶片发育过程中黄酮类化合物合成的影响,本研究利用CHI的功能域Chalcone(PF02431)鉴定橡胶树查尔酮异构酶Hb CHI基因家族成员,分析其蛋白序列理化性质、保守结构域、保守基序和系统进化树分析;利用qRT... 为了研究查尔酮异构酶(CHI)对橡胶树叶片发育过程中黄酮类化合物合成的影响,本研究利用CHI的功能域Chalcone(PF02431)鉴定橡胶树查尔酮异构酶Hb CHI基因家族成员,分析其蛋白序列理化性质、保守结构域、保守基序和系统进化树分析;利用qRT-PCR分析Hb CHI在橡胶树叶片发育过程中的表达模式;利用农杆菌介导的烟草瞬时表达技术分析Hb CHI2影响植物黄酮合成的功能。结果表明:从橡胶树基因组数据库中鉴定获得9个HbCHI基因家族成员(HbCHI1~HbCHI9),其编码的蛋白质包含177~474个氨基酸,等电点为5.1~9.52,主要为亲水蛋白;大部分HbCHI含有1~3个数量不等的基序,只有HbCHI1含有6个保守基序(motif1~motif6);系统进化分析显示,HbCHI1~HbCHI4是Ⅰ型CHI,HbCHI6~HbCHI9表现出脂肪酸结合位点,是Ⅲ型CHI,HbCHI5是Ⅳ型CHI;橡胶树HbCHI基因家族的相对表达量检测结果均表现出从小古铜期到成熟期先下降后上升的趋势,其中在淡绿期时的相对表达量最低,且总黄酮含量与CHI基因相对表达量变化趋势一致;相关性分析表明HbCHI2表达量与黄酮含量相关性最高,皮尔逊系数为0.97;在烟草中过表达HbCHI2促进了本氏烟草中类黄酮的生物合成,增加了叶片的总黄酮含量,是对照的2.13倍。本研究结果表明HbCHI2基因正调控橡胶树叶片中类黄酮生物合成。 展开更多
关键词 巴西橡胶树 查尔异构酶 基因表达 类黄 基因功能
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七彩红竹查尔酮异构酶基因IhCHI1的克隆与表达分析 被引量:9
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作者 王晨晨 毕玮 +3 位作者 王娟 周旭 杨宇明 王毅 《西部林业科学》 CAS 北大核心 2014年第2期85-90,共6页
查尔酮异构酶(CHI)是花青素生物合成过程中重要的结构基因。本项实验根据转录组数据设计的特异引物,利用RT-PCR方法成功从七彩红竹红色幼茎中克隆到七彩红竹的查尔酮异构酶基因IhCHI1(GenBank登录号为KJ477333)。序列分析结果表明,IhCHI... 查尔酮异构酶(CHI)是花青素生物合成过程中重要的结构基因。本项实验根据转录组数据设计的特异引物,利用RT-PCR方法成功从七彩红竹红色幼茎中克隆到七彩红竹的查尔酮异构酶基因IhCHI1(GenBank登录号为KJ477333)。序列分析结果表明,IhCHI1包含完整的cDNA开放阅读框(ORF),由690 bp组成,编码229个氨基酸。Blast比对结果显示,该蛋白属于CHI家族蛋白;系统进化分析结果显示,七彩红竹与禾本科植物水稻、玉米等亲缘关系较近;利用RT-PCR方法对IhCHI1基因在不同组织中表达情况进行分析,结果表明,IhCHI1在七彩红竹的红色幼秆中表达量最高。 展开更多
关键词 七彩红竹 基因克隆 查尔异构酶 表达分析
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东方百合查尔酮异构酶基因LhCHI的克隆及表达 被引量:8
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作者 窦晓莹 郎利新 +4 位作者 包放 孔滢 尚宏忠 白锦荣 王乃彦 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期6-11,17,共7页
利用RT-PCR结合RACE的方法从东方百合‘索邦’花被片中克隆了查尔酮异构酶(CHI)基因,命名为Lh CHI(Gen Bank登录号为KJ784468)。该基因开放阅读框702 bp,编码233个氨基酸,预测该蛋白相对分子质量25 KD,等电点(p I)为4.7。同源比对和系... 利用RT-PCR结合RACE的方法从东方百合‘索邦’花被片中克隆了查尔酮异构酶(CHI)基因,命名为Lh CHI(Gen Bank登录号为KJ784468)。该基因开放阅读框702 bp,编码233个氨基酸,预测该蛋白相对分子质量25 KD,等电点(p I)为4.7。同源比对和系统进化分析表明,Lh CHI基因编码的氨基酸序列具有查尔酮异构酶典型的催化活性保守位点,与百合科郁金香(Tulipa fosteriana)查尔酮异构酶序列一致性为83.3%。半定量PCR和荧光实时定量PCR分析结果表明,Lh CHI基因在百合的根、茎、叶片、鳞茎、开放花被片、花药以及柱头中均有表达,花器官中相对表达量较高,花发育后期的柱头、花柱、花被片等组织中Lh CHI基因表达水平普遍高于花发育早期。 展开更多
关键词 百合 查尔异构酶 LH chi基因
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紫丁香查尔酮异构酶基因SoCHI的克隆及表达分析 被引量:13
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作者 王蕊 李彦慧 郑健 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期11-17,共7页
采用RACE技术从紫丁香(Syringa oblata Lindl.)花中克隆获得查尔酮异构酶基因(CHI)的cDNA全长序列,命名为SoCHI,其编码的蛋白质为SoCHI蛋白。序列分析结果表明:SoCHI基因的开放阅读框(ORF)长度为684bp,编码227个氨基酸残基,并且,该基因... 采用RACE技术从紫丁香(Syringa oblata Lindl.)花中克隆获得查尔酮异构酶基因(CHI)的cDNA全长序列,命名为SoCHI,其编码的蛋白质为SoCHI蛋白。序列分析结果表明:SoCHI基因的开放阅读框(ORF)长度为684bp,编码227个氨基酸残基,并且,该基因全部由外显子构成,无内含子。SoCHI蛋白理论相对分子质量24 988,理论等电点p I 5.53,不稳定系数为47.58,平均亲水指数为-0.096,并包含2个氢键结合位点、2个活性催化位点和7个底物结合位点;在该蛋白质的二级结构中,α-螺旋、延伸链和无规则卷曲分别占该蛋白质氨基酸残基总数的31.7%、20.3%和48.0%。同源性比对结果表明:紫丁香与其他9种植物CHI蛋白的同源性很高(均在76%以上),与同科[木犀科(Oleaceae)]植物桂花(Osmanthus fragrans Lour.)和油橄榄(Olea europaea Linn.)CHI蛋白的同源性更高(达88%)。实时荧光定量PCR扩增结果表明:SoCHI基因的相对表达量在紫丁香的嫩叶中最高,在成熟叶中次之;该基因的相对表达量在紫丁香花发育过程中先上升后下降,并在花蕾期达到最高。研究结果显示:SoCHI基因编码的氨基酸序列相对保守,且其表达与紫丁香花呈色关系密切。 展开更多
关键词 紫丁香 查尔异构酶基因 基因克隆 序列分析 同源性分析 表达特性
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鸳鸯茉莉查尔酮异构酶基因(CHI)cDNA的克隆与生物信息学分析 被引量:3
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作者 曹玉婷 邱栋梁 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期475-481,共7页
采用RT-PCR与RACE技术克隆了鸳鸯茉莉(Brunfelsia acuminata)花瓣中查尔酮异构酶基因(CHI)的全长cDNA,GenBank登录号为JN887637。该基因全长1051 bp,含有1个792 bp的开放阅读框,编码263个氨基酸,为不稳定蛋白。对保守区功能区的分析,推... 采用RT-PCR与RACE技术克隆了鸳鸯茉莉(Brunfelsia acuminata)花瓣中查尔酮异构酶基因(CHI)的全长cDNA,GenBank登录号为JN887637。该基因全长1051 bp,含有1个792 bp的开放阅读框,编码263个氨基酸,为不稳定蛋白。对保守区功能区的分析,推导CHI蛋白具有查尔酮超级家族的保守结构域,二级结构预测显示其主要以α螺旋和β折叠为主。氨基酸同源性分析表明,鸳鸯茉莉CHI蛋白与矮牵牛(Petunia hybrida)、金花茶(Camellia nitidissima)、甜樱桃(Prunus avium)、芍药(Paeonia lactiflora)、牡丹(P.suffruticosa)、菊花(Chrysanthemum morifolium)等植物的同源性分别达到90%、89%、84%、85%、84%、80%。因此,CHI基因可能与鸳鸯茉莉的花色形成有关。 展开更多
关键词 鸳鸯茉莉 查尔异构酶 基因克隆 生物信息学
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桑树查尔酮异构酶基因的克隆与原核表达分析 被引量:14
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作者 刘长英 赵爱春 +5 位作者 李军 吕蕊花 余亚圣 王茜龄 鲁成 余茂德 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第2期39-45,共7页
以果叶兼用新桑品种‘嘉陵30号’的果实为材料,采用同源克隆法和抑制PCR法克隆桑树查尔酮异构酶基因(MaCHI)全序列。该基因的基因组序列全长2402bp,包含2112bp长的ORF和290bp长的3'UTR序列,ORF由4个外显子和3个内含子组成,该基因编... 以果叶兼用新桑品种‘嘉陵30号’的果实为材料,采用同源克隆法和抑制PCR法克隆桑树查尔酮异构酶基因(MaCHI)全序列。该基因的基因组序列全长2402bp,包含2112bp长的ORF和290bp长的3'UTR序列,ORF由4个外显子和3个内含子组成,该基因编码219个氨基酸。预测MaCHI编码蛋白质的分子质量为23.8ku,理论等电点为5.29。采用RT-PCR法分析MaCHI在不同组织中的表达水平,在叶片和果中的表达量较高,在根中表达量较低。构建pET-28a(+)-MaCHI原核表达重组质粒,并在大肠杆菌中诱导表达。 展开更多
关键词 桑树 查尔异构酶 基因克隆 组织表达 原核表达
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查尔酮合酶与查尔酮异构酶基因特征及转基因应用 被引量:36
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作者 张党权 谭晓风 王晓红 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期87-91,108,共6页
查尔酮合酶和查尔酮异构酶一起构成了黄酮类化合物生物合成的限速酶.底物先是由查尔酮合酶的作用形成袖皮素查尔酮化合物,然后再由查尔酮异构酶异构化成不同的黄酮类化合物.查尔酮合酶和查尔酮异构酶广泛存在于多种植物中,涉及了苯丙氨... 查尔酮合酶和查尔酮异构酶一起构成了黄酮类化合物生物合成的限速酶.底物先是由查尔酮合酶的作用形成袖皮素查尔酮化合物,然后再由查尔酮异构酶异构化成不同的黄酮类化合物.查尔酮合酶和查尔酮异构酶广泛存在于多种植物中,涉及了苯丙氨酸代谢途径中各种具有防御性产物的生物合成,在植物的抗菌机制、抗胁迫、细胞的发育和分化、色素的积累和外源基因的表达等方面起着重要的作用.就查尔酮合酶和查尔酮异构酶的结构特点、编码基因的克隆及序列特征、基因的表达调控以及转基因应用等方面进行了系统的综述,并对其今后进一步的研究提出了适宜的建议. 展开更多
关键词 查尔合酶 查尔异构酶 基因表达与调控 植物基因工程 综述
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茶树查尔酮异构酶基因克隆及序列分析 被引量:13
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作者 马春雷 赵丽萍 +1 位作者 张亚丽 陈亮 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期127-132,共6页
茶叶是世界上最流行的无酒精饮品之一,含有许多有价值的次生代谢产物,如儿茶素类物质。分离和克隆重要的茶树功能基因,对利用基因工程技术进行茶树遗传调控具有重要意义。本文采用EST测序技术和T4RNA连接酶介导的5′RACE技术,获得了一... 茶叶是世界上最流行的无酒精饮品之一,含有许多有价值的次生代谢产物,如儿茶素类物质。分离和克隆重要的茶树功能基因,对利用基因工程技术进行茶树遗传调控具有重要意义。本文采用EST测序技术和T4RNA连接酶介导的5′RACE技术,获得了一个茶树儿茶素代谢中的重要基因—查尔酮异构酶(CHI)基因,在GenBank登录(DQ904329),其序列全长1163bp,其中开放阅读框长723bp,编码240个氨基酸,3′端有一个明显的多聚腺苷酸加尾信号,推测的蛋白分子量约为26.4kD,理论等电点为5.19。序列分析表明它与番茄CHI基因序列的亲缘关系比较近。 展开更多
关键词 茶树 查尔异构酶 基因克隆 序列分析
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金花茶查尔酮异构酶基因全长克隆与表达的初步研究 被引量:17
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作者 周兴文 李纪元 范正琪 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2012年第1期93-99,共7页
利用RT-PCR和RACE技术,从我国珍稀濒危植物金花茶花瓣中获得了查尔酮异构酶(Chalcone isomerase,CHI)基因的cDNA全长,命名为Cn-CHI,GenBank登录号HQ269805.1。碱基序列分析表明,Cn-CHI基因全长953bp,包含56 bp的5’非翻译区、204 bp的3... 利用RT-PCR和RACE技术,从我国珍稀濒危植物金花茶花瓣中获得了查尔酮异构酶(Chalcone isomerase,CHI)基因的cDNA全长,命名为Cn-CHI,GenBank登录号HQ269805.1。碱基序列分析表明,Cn-CHI基因全长953bp,包含56 bp的5’非翻译区、204 bp的3’非翻译区和一个长为693 bp编码230个氨基酸的开放阅读框。氨基酸序列比对分析表明,Cn-CHI基因编码蛋白与蔷薇科、杜鹃花科、茄科等植物的CHI蛋白同源性都在75%以上,与山茶科山茶属茶树CHI蛋白同源性高达99%。相对荧光定量PCR分析表明,Cn-CHI基因在金花茶花蕾发育过程中呈现先急剧上升后平缓下降的趋势;在花器官的不同部位中,Cn-CHI基因表达量最高的是雌蕊,其次是雄蕊,在萼片和花瓣中的表达量较低且相差不大。 展开更多
关键词 金花茶 查尔异构酶基因 序列分析 相对定量PCR 表达特性
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油茶查尔酮合酶和异构酶基因的cDNA克隆 被引量:5
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作者 谭晓风 张党权 +4 位作者 陈鸿鹏 谢禄山 王晓红 石明旺 胡芳名 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期9-13,共5页
查尔酮合酶和查尔酮异构酶是类黄酮代谢与色素苷代谢的关键酶.以油茶近成熟种子cDNA文库和EST文库为材料,通过分子克隆方法鉴定了1条查尔酮合酶基因全长cDNA和1条查尔酮异构酶全长cDNA.结果表明:油茶查尔酮合酶基因的cDNA含1479 bp,编码... 查尔酮合酶和查尔酮异构酶是类黄酮代谢与色素苷代谢的关键酶.以油茶近成熟种子cDNA文库和EST文库为材料,通过分子克隆方法鉴定了1条查尔酮合酶基因全长cDNA和1条查尔酮异构酶全长cDNA.结果表明:油茶查尔酮合酶基因的cDNA含1479 bp,编码412个氨基酸,为目前最长的查尔酮合酶,与其它物种的查尔酮合酶具有极高的相似性,在进化上高度同源;油茶查尔酮异构酶基因的cDNA含899 bp,编码206个氨基酸,与茶的查尔酮异构酶基因高度同源,但与其它物种的相似性较低. 展开更多
关键词 经济林 油茶 查尔合酶 查尔异构酶 全长CDNA 序列分析 基因克隆
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中国水仙查尔酮异构酶基因的克隆与表达分析 被引量:9
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作者 蔡雪玲 陈晓静 +2 位作者 叶一江 何玮毅 申艳红 《热带作物学报》 CSCD 2011年第12期2287-2292,共6页
查尔酮异构酶(CHI)是影响类黄酮合成的一个重要限速酶,在植物花色发育过程中起着重要作用。通过RT-PCR和RACE技术从中国水仙的花瓣中克隆得到3条CHI基因,分别命名为NtCHIW、NtCHIJ和NtCHIY。3个基因均含有一个735 bp的开放阅读框(ORF),... 查尔酮异构酶(CHI)是影响类黄酮合成的一个重要限速酶,在植物花色发育过程中起着重要作用。通过RT-PCR和RACE技术从中国水仙的花瓣中克隆得到3条CHI基因,分别命名为NtCHIW、NtCHIJ和NtCHIY。3个基因均含有一个735 bp的开放阅读框(ORF),编码244个氨基酸。氨基酸序列分析表明:白花水仙与金盏银台、黄花水仙、洋葱、粳稻、拟南芥、油棕榈、葡萄相应基因的氨基酸序列同源性分别为93.03%、93.44%、64.75%、55.42%、50.58%、59.43%、58.20%。荧光定量PCR分析表明:随着花开放的过程,中国水仙的CHI基因转录水平发生变化,说明CHI基因可能参与花色变化的过程。 展开更多
关键词 中国水仙 查尔异构酶 基因克隆 序列分析 表达分析
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大豆查尔酮异构酶基因的克隆及粟酒裂殖酵母表达载体的构建 被引量:5
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作者 张卓 王丕武 +1 位作者 付永平 刘洪禹 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2010年第11期23-26,共4页
利用RT-PCR克隆Ⅱ型大豆查尔酮异构酶基因(CHI1A),然后将目的片段与克隆载体pMD18-T质粒相连接,检测后将目的基因重组于粟酒裂殖酵母表达载体pESP-2的MCS序列之中,使用电击法将重组质粒转化进入粟酒裂殖酵母中,用PCR和双酶切的方法来检... 利用RT-PCR克隆Ⅱ型大豆查尔酮异构酶基因(CHI1A),然后将目的片段与克隆载体pMD18-T质粒相连接,检测后将目的基因重组于粟酒裂殖酵母表达载体pESP-2的MCS序列之中,使用电击法将重组质粒转化进入粟酒裂殖酵母中,用PCR和双酶切的方法来检测试验结果,表明获得了CHI1A完整开放阅读框(670bp),与已报道序列(NO:AY595413)的同源性达到99%。PCR和酶切鉴定表明,CHI1A已导入到酵母表达载体中。查尔酮异构酶基因的克隆、粟酒裂殖酵母表达载体的构建,为该基因的应用提供了依据。有望利用基因工程技术将该基因重组于酵母基因组中并表达目的蛋白,以此来催化合成黄酮和异黄酮类化合物。 展开更多
关键词 大豆 查尔异构酶基因 粟酒裂殖酵母 表达载体
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大豆查尔酮异构酶基因的克隆及乳酸菌表达载体的构建 被引量:4
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作者 刘洪禹 王丕武 +2 位作者 付永平 张卓 马超 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第19期9995-9997,共3页
[目的]将特异存在于豆科植物的II型查尔酮异构酶基因CHI1A构建到目前最有效的食品级乳酸乳球菌NICE诱导表达系统中。[方法]利用RT-PCR技术从大豆总RNA中克隆CHI1A基因,连入pMD18-T克隆载体中并进行测序,然后重组到乳酸乳球菌表达载体PNZ... [目的]将特异存在于豆科植物的II型查尔酮异构酶基因CHI1A构建到目前最有效的食品级乳酸乳球菌NICE诱导表达系统中。[方法]利用RT-PCR技术从大豆总RNA中克隆CHI1A基因,连入pMD18-T克隆载体中并进行测序,然后重组到乳酸乳球菌表达载体PNZ8149-CHI1A,利用电穿孔方法转入乳酸乳球菌NZ3900中。[结果]克隆得到CHI1A完整开放阅读框670bp,与已报导序列(GenBankAY595413)的同源性达到99%;通过PCR和酶切鉴定,成功地将CHI1A导入到NICE表达系统中。[结论]含有CHI1A基因的乳酸乳球菌高效诱导表达载体的构建为利用微生物发酵产生类黄酮奠定基础。 展开更多
关键词 大豆 查尔异构酶基因 乳酸乳球菌 NICE系统
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油菜查尔酮异构酶基因的克隆及SNP分析 被引量:1
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作者 王阳 卢虹 +5 位作者 黄镇 刘璐 刘霞 刘亚萍 田正书 徐爱遐 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期102-108,共7页
类黄酮是一种重要的植物次生代谢产物,查耳酮异构酶(CHI)是类黄酮生物合成早期阶段的一个关键酶,在种皮发育和颜色形成过程中具有重要的调控作用。为深入研究CHI基因在种皮发育和颜色形成中的作用及生物学功能。以16份三大类型黄、褐籽... 类黄酮是一种重要的植物次生代谢产物,查耳酮异构酶(CHI)是类黄酮生物合成早期阶段的一个关键酶,在种皮发育和颜色形成过程中具有重要的调控作用。为深入研究CHI基因在种皮发育和颜色形成中的作用及生物学功能。以16份三大类型黄、褐籽油菜为试验材料,采用同源克隆法克隆得到CHI基因的序列,并进行分子进化分析。将克隆得到的序列利用NCBI在线软件预测ORF Finder分析该基因的开发阅读框(ORF),结果发现,CHI基因ORF长度为756 bp或759 bp,编码251个或252个氨基酸。利用DNAMAN(v5.0)软件进行序列同源比对分析结果表明,CHI基因在三大类型油菜中的同源率为96.41%;利用NCBI在线软件CDD预测其保守结构域,发现它们都具有查尔酮超家族保守结构域。利用MEGA 5.2软件进行系统进化分析,结果表明,CHI基因在白菜型油菜与甘蓝型油菜中亲缘关系较近,与芥菜型油菜亲缘关系较远,并发现油菜与萝卜、拟南芥的CHI亲缘关系较近。比较三大类型油菜中黄籽油菜与褐籽油菜中CHI基因序列,结果发现,该基因在第202(C/A)位核苷酸处存在差异,可导致第68位氨基酸(P/T)的差异,这可能与油菜种皮的颜色的变化有关。该研究揭示了CHI基因的特征,为阐明CHI基因在油菜种皮颜色形成过程中的作用机制及其功能特征奠定基础。 展开更多
关键词 油菜 查尔异构酶 chi 克隆 SNP
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花生查尔酮异构酶基因的克隆及其序列分析 被引量:1
16
作者 温世杰 邱金梅 +3 位作者 刘海燕 朱方何 王文皓 梁炫强 《热带作物学报》 CSCD 2011年第11期2084-2087,共4页
利用RT-PCR及RACE技术从花生种子中克隆得到查尔酮异构酶基因(chi)的cDNA全长序列,命名为Ahchi,NCBI登录号:JN412735,该序列全长共1 061 bp,编码209个氨基酸,其氨基酸组成与其它已知的高等植物具有很高的同源性,与大豆、倒捻子、蓖麻、... 利用RT-PCR及RACE技术从花生种子中克隆得到查尔酮异构酶基因(chi)的cDNA全长序列,命名为Ahchi,NCBI登录号:JN412735,该序列全长共1 061 bp,编码209个氨基酸,其氨基酸组成与其它已知的高等植物具有很高的同源性,与大豆、倒捻子、蓖麻、毛果杨的同源性分别为81%、71%、70%和69%,且含有高度保守的活性位点。 展开更多
关键词 花生 查尔异构酶基因() 基因克隆
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分蘖洋葱查尔酮异构酶基因的克隆及表达载体的构建 被引量:1
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作者 刘丹 吴凤芝 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期88-93,共6页
旨在得到分蘖洋葱查尔酮异构酶基因,探明该基因的功能。克隆查尔酮异构酶基因并构建了其超表达和干扰载体,以期得到用于研究查尔酮异构酶基因功能的表达载体。从分蘖洋葱叶片中克隆得到查尔酮异构酶基因cDNA全长743 bp,GenBank登录号为K... 旨在得到分蘖洋葱查尔酮异构酶基因,探明该基因的功能。克隆查尔酮异构酶基因并构建了其超表达和干扰载体,以期得到用于研究查尔酮异构酶基因功能的表达载体。从分蘖洋葱叶片中克隆得到查尔酮异构酶基因cDNA全长743 bp,GenBank登录号为KJ489062。结果显示,该基因633 bp的开放读码框编码210个氨基酸的多肽序列。将PCR扩增克隆得到的分蘖洋葱查尔酮异构酶基因片段连接到干扰载体pCAMBIA1 301和超表达载体SOL2095中,成功构建了35S启动子控制的植物表达双元载体pCAMBIA1301-CHI和SOL2095-CHI。 展开更多
关键词 分蘖洋葱 查尔异构酶 基因克隆 载体构建
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红花查尔酮异构酶基因的克隆及表达分析 被引量:7
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作者 任超翔 唐小慧 +3 位作者 何雯 陈江 裴瑾 吴清华 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1521-1525,1574,共6页
实验通过下载已报道查尔酮异构酶基因序列,设计简并引物,利用RACE克隆红花查尔酮异构酶基因全长,克隆了两个红花查尔酮异构酶基因,分别命名为CtCHI1和CtCHI2,NCBI登录号分别为MF996507和MF996508。用在线软件对序列进行分析,并用MEGA进... 实验通过下载已报道查尔酮异构酶基因序列,设计简并引物,利用RACE克隆红花查尔酮异构酶基因全长,克隆了两个红花查尔酮异构酶基因,分别命名为CtCHI1和CtCHI2,NCBI登录号分别为MF996507和MF996508。用在线软件对序列进行分析,并用MEGA进行进化树分析,CtCHI1全长967 bp,CtCHI2全长997bp,属查尔酮异构酶家族基因。定量PCR分析红花查尔酮异构酶基因表达得出,CtCHI1在花中且在时期2表达量较高,而在叶、茎及根中不表达,CtCHI2仅在茎中有少量表达。实验还发现,MeJA显著促进CtCHI1基因的表达,而对CtCHI2无调控作用,推测CtCHI1参与红花花中类黄酮的生物合成。实验成功克隆了两个查尔酮异构酶基因并对其进行表达分析,为红花类黄酮的生物合成及调控机理研究奠定基础。 展开更多
关键词 红花 查尔异构酶基因 RACE 表达分析 类黄
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荸荠查尔酮异构酶基因的克隆与表达分析 被引量:4
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作者 陈夏鑫 陈振林 +3 位作者 帅良 段振华 商飞飞 宋慕波 《保鲜与加工》 CAS 北大核心 2020年第4期30-36,共7页
查尔酮异构酶(CHI)是植物黄酮合成途径的关键酶,为了研究鲜切荸荠贮藏过程中表面黄化的机理,利用RACE技术对荸荠CHI基因编码区cDNA全长进行克隆,并分析其在不同组织和鲜切荸荠贮藏过程中的表达。结果表明,荸荠CHI基因(CwCHI)cDNA序列长... 查尔酮异构酶(CHI)是植物黄酮合成途径的关键酶,为了研究鲜切荸荠贮藏过程中表面黄化的机理,利用RACE技术对荸荠CHI基因编码区cDNA全长进行克隆,并分析其在不同组织和鲜切荸荠贮藏过程中的表达。结果表明,荸荠CHI基因(CwCHI)cDNA序列长度为1003 bp(GeneBank:MG719238),含有一个744 bp的最大开放阅读框,其DNA包含3个内含子和4个外显子。Cw CHI可编码247个氨基酸,经预测其分子量为26.410 kD,理论等电点为4.89。Cw CHI蛋白的二级结构以α-螺旋为主,占38.06%。通过多重比对发现,CwCHI具有该家族特有的保守结构域,决定底物偏好性的第201位氨基酸为Ser,与其他Ⅰ型CHI蛋白相同。系统进化分析表明CwCHI与油棕榈和菠萝的CHI蛋白亲缘关系较近。荧光定量PCR分析表明,CwCHI基因在荸荠皮中的表达量最高,而在荸荠肉中的表达最低。鲜切荸荠黄化过程中CHI活性和CwCHI表达量快速上升,水杨酸处理抑制了CHI活性的上升和CwCHI的表达。 展开更多
关键词 荸荠 查尔异构酶 基因克隆 表达分析
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杨树桑黄查尔酮异构酶基因克隆鉴定与表达分析 被引量:3
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作者 周园园 辛伽惠 +2 位作者 李子豪 胡清秀 邹亚杰 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2022年第4期10-16,共7页
对杨树桑黄(Sanghuangporus vaninii)查尔酮异构酶基因(SvCHI)进行克隆和生物信息学分析,利用荧光定量PCR方法研究SvCHI在菌丝体、一年生和三年生子实体中的表达情况,并测定查尔酮异构酶(SvCHI)活性。结果表明:SvCHI含有873 bp开放阅读... 对杨树桑黄(Sanghuangporus vaninii)查尔酮异构酶基因(SvCHI)进行克隆和生物信息学分析,利用荧光定量PCR方法研究SvCHI在菌丝体、一年生和三年生子实体中的表达情况,并测定查尔酮异构酶(SvCHI)活性。结果表明:SvCHI含有873 bp开放阅读框,编码290个氨基酸;SvCHI相对分子质量为32170,理论等电点(pI)为10.22,不稳定系数为49.47,总平均亲水性GRAVY值为-0.172;SvCHI为非跨膜蛋白,定位于线粒体,无信号肽,含有1个保守的CHI-3结构域(25~278 aa);SvCHI二级结构中无规卷曲、α螺旋、延伸链占比分别为50.69%、32.41%、16.90%;SvCHI氨基酸序列与暴马桑黄(S.baumii)和红皮孔菌(Pyrrhoderma noxium)查尔酮异构酶的相似性较高;菌丝体中SvCHI表达量显著低于一年生和三年生桑黄子实体,菌丝体中SvCHI活性显著高于一年生和三年生桑黄子实体。研究结果为进一步探讨杨树桑黄中黄酮类化合物的生物合成提供参考。 展开更多
关键词 杨树桑黄 查尔异构酶 基因克隆 表达特性 酶活
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