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中间球海胆CS基因克隆及其响应急性高温胁迫的表达模式
1
作者
孙继红
任丽媛
+3 位作者
崔东遥
赵谭军
常亚青
湛垚垚
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期586-597,共12页
【目的】明确中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)柠檬酸合酶(CS)基因(SiCS)的序列特征、组织表达情况及其应对急性高温胁迫的响应规律,为研究SiCS基因功能及揭示其参与中间球海胆高温应答的分子机制提供理论依据。【方法】利用...
【目的】明确中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)柠檬酸合酶(CS)基因(SiCS)的序列特征、组织表达情况及其应对急性高温胁迫的响应规律,为研究SiCS基因功能及揭示其参与中间球海胆高温应答的分子机制提供理论依据。【方法】利用RACE克隆SiCS基因cDNA序列,通过BLASTx、EXPASY Proteomics Server、HMMER、PSIRED v3.3及SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析;然后采用分光光度法检测中间球海胆管足和性腺线粒体肿胀度,运用实时荧光定量PCR检测SiCS基因的组织表达规律,并以Epoch酶标仪测定中间球海胆管足和性腺总SiCS活性变化情况。【结果】SiCS基因cDNA序列全长2971 bp,5'端非编码区(5'-UTR)和3'端非编码区(3'-UTR)分别为96和1480 bp,开放阅读框(ORF)为1395 bp,共编码464个氨基酸残基。SiCS蛋白分子量约51.48 kD,理论等电点(pI)为6.09,总平均亲水性(GRAVY)为-0.178,为稳定的温和疏水性蛋白;SiCS蛋白不存在信号肽和跨膜结构域,其二级结构中α-螺旋占43.86%、β-折叠占7.02%、无规则卷曲占49.12%,三维结构模型与野猪CS蛋白晶体结构的一致性为73.97%。SiCS氨基酸序列与紫球海胆(S.purpuratus)的CS氨基酸序列相似性最高,为92.90%。SiCS基因在中间球海胆的5种组织中均有表达,其相对表达量排序为体腔细胞>围口膜>性腺>管足>肠道;总SiCS活性排序则为管足>肠道>围口膜>性腺>体腔细胞;与对照组(20℃)相比,经23和26℃急性高温胁迫后中间球海胆管足和性腺的SiCS基因相对表达量及总SiCS活性均呈波动变化规律,但在不同高湿胁迫下和不同组织中有所差异。【结论】中间球海胆可能通过调整组织中的SiCS基因相对表达及SiCS活性来响应急性高温胁迫,且这种响应策略存在一定的组织和温度特异性,具体表现为性腺对急性高温胁迫较管足更敏感。
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关键词
中间球海胆
柠檬酸
合
酶
(
cs
)
急性高温胁迫
表达模式
酶
活性
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职称材料
膨大剂对早熟枇杷品种‘早钟6号’有机酸代谢与积累的影响
被引量：
3
2
作者
吴敏兰
林锦锦
+2 位作者
吴锦程
陈进树
王美容
《福建热作科技》
2022年第3期5-10,共6页
为了研究膨大剂处理对枇杷果实酸代谢与积累的影响,以早熟枇杷品种‘早钟6号’Eriobotrya japonica Lindl.cv.‘Zaozhong No.6’为试验材料,花后40 d的枇杷幼果进行膨大剂(0.01‰氯吡脲)处理,测定膨大剂处理果和对照果发育过程中不同有...
为了研究膨大剂处理对枇杷果实酸代谢与积累的影响,以早熟枇杷品种‘早钟6号’Eriobotrya japonica Lindl.cv.‘Zaozhong No.6’为试验材料,花后40 d的枇杷幼果进行膨大剂(0.01‰氯吡脲)处理,测定膨大剂处理果和对照果发育过程中不同有机酸含量及代谢酶活性的变化。结果表明,在枇杷果实发育过程中,苹果酸与柠檬酸含量呈“先升后降”的变化趋势,乳酸含量呈下降趋势,丙酮酸含量基本维持不变。经膨大剂处理的果实4种有机酸中除丙酮酸外,其含量在发育早期均高于对照,而发育后期直至成熟均低于对照;经膨大剂处理的果实丙酮酸含量始终与对照相近。膨大剂处理组和对照组果实磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)活性随发育过程均呈“升—降—升”的变化规律,膨大剂处理组果实PEPC活性低于对照;膨大剂处理组果实柠檬酸合酶(CS)活性随发育过程呈“降—升—降”的变化趋势,发育早期CS活性与对照差异较小,发育中后期低于对照;膨大剂处理组果实NADP-苹果酸酶(NADP-ME)、异柠檬酸脱氢酶(NADP-IDH)、NAD-苹果酸脱氢酶(NAD-MDH)活性随发育过程均呈“先降后升降”的变化规律,且3种酶活性均低于对照。膨大剂处理抑制了枇杷果实PEPC、CS、NADP-ME、NADP-IDH、NAD-MDH等有机酸代谢酶的活性,并最终导致果实有机酸含量降低。
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关键词
膨大剂
枇杷果实
有机酸
磷酸烯醇式丙酮酸羧化
酶
(PEPC)
柠檬酸
合
酶
(
cs
)
苹果酸
酶
(ME)
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职称材料
题名
中间球海胆CS基因克隆及其响应急性高温胁迫的表达模式
1
作者
孙继红
任丽媛
崔东遥
赵谭军
常亚青
湛垚垚
机构
大连海洋大学/农业农村部北方海水增养殖重点实验室
沈阳农业大学生命科学学院
辽宁师范大学生命科学学院
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期586-597,共12页
基金
辽宁省“兴辽英才计划”项目(XLYC2002107)
辽宁省高等学校创新人才支持计划项目(LR2020065)。
文摘
【目的】明确中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)柠檬酸合酶(CS)基因(SiCS)的序列特征、组织表达情况及其应对急性高温胁迫的响应规律,为研究SiCS基因功能及揭示其参与中间球海胆高温应答的分子机制提供理论依据。【方法】利用RACE克隆SiCS基因cDNA序列,通过BLASTx、EXPASY Proteomics Server、HMMER、PSIRED v3.3及SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析;然后采用分光光度法检测中间球海胆管足和性腺线粒体肿胀度,运用实时荧光定量PCR检测SiCS基因的组织表达规律,并以Epoch酶标仪测定中间球海胆管足和性腺总SiCS活性变化情况。【结果】SiCS基因cDNA序列全长2971 bp,5'端非编码区(5'-UTR)和3'端非编码区(3'-UTR)分别为96和1480 bp,开放阅读框(ORF)为1395 bp,共编码464个氨基酸残基。SiCS蛋白分子量约51.48 kD,理论等电点(pI)为6.09,总平均亲水性(GRAVY)为-0.178,为稳定的温和疏水性蛋白;SiCS蛋白不存在信号肽和跨膜结构域,其二级结构中α-螺旋占43.86%、β-折叠占7.02%、无规则卷曲占49.12%,三维结构模型与野猪CS蛋白晶体结构的一致性为73.97%。SiCS氨基酸序列与紫球海胆(S.purpuratus)的CS氨基酸序列相似性最高,为92.90%。SiCS基因在中间球海胆的5种组织中均有表达,其相对表达量排序为体腔细胞>围口膜>性腺>管足>肠道;总SiCS活性排序则为管足>肠道>围口膜>性腺>体腔细胞;与对照组(20℃)相比,经23和26℃急性高温胁迫后中间球海胆管足和性腺的SiCS基因相对表达量及总SiCS活性均呈波动变化规律,但在不同高湿胁迫下和不同组织中有所差异。【结论】中间球海胆可能通过调整组织中的SiCS基因相对表达及SiCS活性来响应急性高温胁迫,且这种响应策略存在一定的组织和温度特异性,具体表现为性腺对急性高温胁迫较管足更敏感。
关键词
中间球海胆
柠檬酸
合
酶
(
cs
)
急性高温胁迫
表达模式
酶
活性
Keywords
Strongylocentrotus intermedius
citrate synthase(
cs
)
acute heat stress
gene expression
enzyme activity
分类号
S968.9 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
膨大剂对早熟枇杷品种‘早钟6号’有机酸代谢与积累的影响
被引量：
3
2
作者
吴敏兰
林锦锦
吴锦程
陈进树
王美容
机构
漳州城市职业学院
枇杷种质资源创新与利用福建省高校重点实验室莆田学院
出处
《福建热作科技》
2022年第3期5-10,共6页
文摘
为了研究膨大剂处理对枇杷果实酸代谢与积累的影响,以早熟枇杷品种‘早钟6号’Eriobotrya japonica Lindl.cv.‘Zaozhong No.6’为试验材料,花后40 d的枇杷幼果进行膨大剂(0.01‰氯吡脲)处理,测定膨大剂处理果和对照果发育过程中不同有机酸含量及代谢酶活性的变化。结果表明,在枇杷果实发育过程中,苹果酸与柠檬酸含量呈“先升后降”的变化趋势,乳酸含量呈下降趋势,丙酮酸含量基本维持不变。经膨大剂处理的果实4种有机酸中除丙酮酸外,其含量在发育早期均高于对照,而发育后期直至成熟均低于对照;经膨大剂处理的果实丙酮酸含量始终与对照相近。膨大剂处理组和对照组果实磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)活性随发育过程均呈“升—降—升”的变化规律,膨大剂处理组果实PEPC活性低于对照;膨大剂处理组果实柠檬酸合酶(CS)活性随发育过程呈“降—升—降”的变化趋势,发育早期CS活性与对照差异较小,发育中后期低于对照;膨大剂处理组果实NADP-苹果酸酶(NADP-ME)、异柠檬酸脱氢酶(NADP-IDH)、NAD-苹果酸脱氢酶(NAD-MDH)活性随发育过程均呈“先降后升降”的变化规律,且3种酶活性均低于对照。膨大剂处理抑制了枇杷果实PEPC、CS、NADP-ME、NADP-IDH、NAD-MDH等有机酸代谢酶的活性,并最终导致果实有机酸含量降低。
关键词
膨大剂
枇杷果实
有机酸
磷酸烯醇式丙酮酸羧化
酶
(PEPC)
柠檬酸
合
酶
(
cs
)
苹果酸
酶
(ME)
分类号
S667.3 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中间球海胆CS基因克隆及其响应急性高温胁迫的表达模式
孙继红
任丽媛
崔东遥
赵谭军
常亚青
湛垚垚
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
膨大剂对早熟枇杷品种‘早钟6号’有机酸代谢与积累的影响
吴敏兰
林锦锦
吴锦程
陈进树
王美容
《福建热作科技》
2022
3
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职称材料
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0
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参考文献
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