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题名基于染色质交互数据的基因组组装方法
被引量：2
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作者
陶婧芬
谢婷
郑觉非
杨庆勇
张红雨
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机构
华中农业大学信息学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期43-50,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(31301005)
中央高校基本科研业务费专项基金(2015BQ037)
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文摘
伴随着高通量DNA测序技术的不断推陈出新和价格持续下调,如何将scaffolds定位于染色体逐渐成为完整参考基因组获得的关键。高通量染色质构象捕获技术(High-throughput chromosome conformation capture,简称Hi-C)的出现为基因组组装过程中scaffolds快速锚位提供了契机。相比于传统的基因组组装方法,基于染色质交互组装基因组的策略实验操作简易、实验和时间成本较低、正确率及分辨率高,在基因组相对复杂的多倍型和高度杂合的物种中有着更大的应用前景。但由于技术本身的限制,该方法还存在分辨率、背景噪声等问题需要解决,有待进一步改进和提高。
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关键词
高通量染色质构象捕获技术
染色质交互
基因组组装
scaffolds锚位
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Keywords
high-throughput chromosome conformation capture
chromatin interaction
genome assembly
scaffolds anchoring
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分类号
Q78
[生物学—分子生物学]
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题名三维基因组学及其应用概述
被引量：1
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作者
邱格格
林胜男
黄浩
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机构
福建师范大学生命科学学院
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出处
《生物学教学》
2021年第10期4-6,共3页
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基金
福建省发育与神经生物学重点实验室开放性课题,No.FJDNBL202102。
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文摘
基因组携带着生命体完整的遗传信息。人类基因组计划和DNA元件百科全书计划分别在一维和二维水平上研究了基因组序列、基因组结构及其调控组件。但是,对于基因组信息调控基因在特定时空中表达仍然知之甚少。基因组测序技术的发展催生了一门新兴学科——三维基因组学。本文就三维基因组学的诞生和发展、研究内容和技术以及应用前景进行综述。
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关键词
基因组
三维基因组学
染色质构象捕获技术
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分类号
Q811.4
[生物学—生物工程]
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