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染色质免疫沉淀技术在研究DNA与蛋白质相互作用中的应用
被引量：
5
1
作者
王春雨
石建党
+1 位作者
朱彦
张琚
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期801-807,共7页
在后基因组时代,DNA-蛋白质的相互作用是研究基因表达调控的一个重要领域。与其他方法相比,染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP)是一种在体内研究DNA-蛋白质相互作用的理想的方法。近年来这种方法与DNA芯片...
在后基因组时代,DNA-蛋白质的相互作用是研究基因表达调控的一个重要领域。与其他方法相比,染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP)是一种在体内研究DNA-蛋白质相互作用的理想的方法。近年来这种方法与DNA芯片和分子克隆技术相结合,可用于高通量的筛选已知蛋白因子的未知DNA靶点和研究反式作用因子在整个基因组上的分布情况,这将有助于深入理解DNA-蛋白质相互作用的调控网络。总结了染色质免疫沉淀技术的方法,特别介绍了使用这些方法取得的最新进展。
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关键词
DNA-蛋白质相互作用
染色质免疫沉淀技术
(ChIP)
DNA芯片
ChIP-克隆
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职称材料
人大肠癌细胞PRL-3基因启动子Snail结合位点的初步研究
被引量：
3
2
作者
杨发达
李建明
+2 位作者
周军
柳玉红
丁彦青
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期401-405,共5页
目的确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子区结合。方法应用生物信息学方法获得PRL-3基因启动子区域,并对其潜在的Snail结合位点进行预测,进一步应用Snail抗体染色质免疫共沉淀技术结合PCR技术检测PRL-3基因启动子序列,以确定转录因子S...
目的确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子区结合。方法应用生物信息学方法获得PRL-3基因启动子区域,并对其潜在的Snail结合位点进行预测,进一步应用Snail抗体染色质免疫共沉淀技术结合PCR技术检测PRL-3基因启动子序列,以确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子结合。结果应用TRED在线分析系统确定PRL-3基因的启动子区域位于PRL-3基因上游-700bp至299bp之间,在该启动子区域存在多个转录因子如Snail、n-MYC、ARNT、E74A、NF-kappaB、NRF-2及AML-1等的结合位点;在启动子区域的-500bp至-451bp之间存在Snail结合的核心寡核苷酸序列CACCTG,在其他多个区域存在多个类似这一核心序列的DNA序列;应用染色质免疫沉淀技术结合PCR扩增的方法对人大肠癌细胞株SW480细胞进行分析,发现Snail可与人大肠癌细胞株SW480PRL-3基因的启动子区域的DNA片断结合。结论转录因子Snail可与人大肠癌细胞SW480PRL-3基因启动子结合,参与PRL-3基因的调控。
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关键词
染色质免疫沉淀技术
SNAIL
启动子
PRL-3
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职称材料
题名
染色质免疫沉淀技术在研究DNA与蛋白质相互作用中的应用
被引量：
5
1
作者
王春雨
石建党
朱彦
张琚
机构
南开大学分子生物学研究所教育部生物活性材料重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期801-807,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(编号:30471733
30271297)
+1 种基金
留学人员短期回国工作讲学项目("两个基地"项目编号:30410403237)
2002年度高等学校博士学科点专项科研基金(编号:20020055026)~~
文摘
在后基因组时代,DNA-蛋白质的相互作用是研究基因表达调控的一个重要领域。与其他方法相比,染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay,ChIP)是一种在体内研究DNA-蛋白质相互作用的理想的方法。近年来这种方法与DNA芯片和分子克隆技术相结合,可用于高通量的筛选已知蛋白因子的未知DNA靶点和研究反式作用因子在整个基因组上的分布情况,这将有助于深入理解DNA-蛋白质相互作用的调控网络。总结了染色质免疫沉淀技术的方法,特别介绍了使用这些方法取得的最新进展。
关键词
DNA-蛋白质相互作用
染色质免疫沉淀技术
(ChIP)
DNA芯片
ChIP-克隆
Keywords
DNA-protein interactions
chromatin immunoprecipitation assay （ChIP）
DNA microarray
ChiP-cloning
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
人大肠癌细胞PRL-3基因启动子Snail结合位点的初步研究
被引量：
3
2
作者
杨发达
李建明
周军
柳玉红
丁彦青
机构
南方医科大学南方医院病理科
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期401-405,共5页
基金
国家自然科学基金(30500241
30670968)~~
文摘
目的确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子区结合。方法应用生物信息学方法获得PRL-3基因启动子区域,并对其潜在的Snail结合位点进行预测,进一步应用Snail抗体染色质免疫共沉淀技术结合PCR技术检测PRL-3基因启动子序列,以确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子结合。结果应用TRED在线分析系统确定PRL-3基因的启动子区域位于PRL-3基因上游-700bp至299bp之间,在该启动子区域存在多个转录因子如Snail、n-MYC、ARNT、E74A、NF-kappaB、NRF-2及AML-1等的结合位点;在启动子区域的-500bp至-451bp之间存在Snail结合的核心寡核苷酸序列CACCTG,在其他多个区域存在多个类似这一核心序列的DNA序列;应用染色质免疫沉淀技术结合PCR扩增的方法对人大肠癌细胞株SW480细胞进行分析,发现Snail可与人大肠癌细胞株SW480PRL-3基因的启动子区域的DNA片断结合。结论转录因子Snail可与人大肠癌细胞SW480PRL-3基因启动子结合,参与PRL-3基因的调控。
关键词
染色质免疫沉淀技术
SNAIL
启动子
PRL-3
Keywords
chromatin immunoprecipitation assay
Snail
promoter, PRL-3 gene
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
染色质免疫沉淀技术在研究DNA与蛋白质相互作用中的应用
王春雨
石建党
朱彦
张琚
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2005
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
人大肠癌细胞PRL-3基因启动子Snail结合位点的初步研究
杨发达
李建明
周军
柳玉红
丁彦青
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
3
在线阅读
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职称材料
已选择
0
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引证文献
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