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柑橘3种病毒类病原多重RT-PCR检测技术的建立及应用
1
作者
袁琳凯
马崇欢
+5 位作者
李丁山
陈志炜
江宵烽
丁新伦
张洁
吴祖建
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期339-344,共6页
【目的】建立柑橘黄化脉明病毒(citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)、柑橘衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)和啤酒花矮化类病毒(hop stunt viroid,HSVd)的多重RT-PCR检测体系。【方法】设计多重RT-PCR引物,分析其特异性,确...
【目的】建立柑橘黄化脉明病毒(citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)、柑橘衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)和啤酒花矮化类病毒(hop stunt viroid,HSVd)的多重RT-PCR检测体系。【方法】设计多重RT-PCR引物,分析其特异性,确定其最佳浓度比、最适退火温度及灵敏度,在此基础上对福建地区的柑橘样品进行检测。【结果】确定了CYVCV-F/R、CTV-F/R和HSVd-F/R等3对引物的最佳浓度比例为1∶1∶2,最适退火温度为52.9℃,灵敏度结果显示该体系可检测模板稀释到10^(-2)的阳性样品。应用该体系对采自福建部分地区的157份柑橘样品进行检测,结果发现,CYVCV、CTV和HSVd的检出率分别为47.1%、56.7%和22.9%。【结论】成功建立了柑橘CYVCV、CTV和HSVd病原的多重RT-PCR检测方法,为该类病害的检测提供准确、快速的检测方法。
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关键词
柑橘黄化脉明病毒
柑橘
衰退
病毒
啤酒花矮化类
病毒
多重RT-PCR
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职称材料
杨树-蚜虫互作体系中植物病毒种类的鉴定
2
作者
李征
申宛娜
+2 位作者
索宇田
付宇辰
赵嘉平
《林业科学研究》
北大核心
2025年第2期90-97,共8页
[目的]为研究侵染杨树的蚜虫可能传播的植物病毒病害害,控制蚜虫对于杨树生长的影响。[方法]本研究在1年生新疆杨叶片上接种白毛蚜,通过高通量测序与序列组装技术,采用系统发育分析与RT-PCR方法确定蚜虫可能传播的病毒种类。[结果]对转...
[目的]为研究侵染杨树的蚜虫可能传播的植物病毒病害害,控制蚜虫对于杨树生长的影响。[方法]本研究在1年生新疆杨叶片上接种白毛蚜,通过高通量测序与序列组装技术,采用系统发育分析与RT-PCR方法确定蚜虫可能传播的病毒种类。[结果]对转录组测序数据使用Trinity进行拼接组装,并与NCBI Genbank已知序列进行匹配,共发现793条可能的病毒碱基序列,47个可能的病毒种类,通过发育树比对与基因序列的同源性验证可知,侵染杨树的白毛蚜主要传播的病毒为苹果茎沟病毒与柑橘黄化脉明病毒。[结论]本研究采用一种不同于传统植物病毒鉴定、更加便捷的方法来对蚜虫可能传播的植物病毒病害进行研究,最终确定了白毛蚜在杨树体内主要传播的病毒种类,使用本方法有助于快速、准确的确定蚜虫-杨树互作体系中可能存在的病毒性植物病害,为杨树的病虫害防治提供了理论基础。
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关键词
杨树
蚜虫
植物
病毒
序列组装
苹果茎沟
病毒
柑橘黄化脉明病毒
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职称材料
柠檬VQ家族成员鉴定及其响应CYVCV侵染分析
3
作者
方书洁
张晓男
+3 位作者
郭雪扬
李向
易龙
周俊
《桉树科技》
2025年第3期93-104,共12页
解析柠檬VQ家族基因特征及柠檬抗病毒侵染分子机制,为柠檬VQ基因的结构与功能及抗病机理研究提供可靠理论依据。通过生物信息学方法鉴定柠檬VQ家族成员,分析其理化性质、保守基序以及顺式作用元件等结构,将柑橘黄化脉明病毒(CYVCV)嫁接...
解析柠檬VQ家族基因特征及柠檬抗病毒侵染分子机制,为柠檬VQ基因的结构与功能及抗病机理研究提供可靠理论依据。通过生物信息学方法鉴定柠檬VQ家族成员,分析其理化性质、保守基序以及顺式作用元件等结构,将柑橘黄化脉明病毒(CYVCV)嫁接至‘尤力克’柠檬上,通过RT-q PCR验证候选基因表达量。结果表明:共鉴定52个柠檬VQ家族基因(ClVQs),分布于16条染色体,编码121~488个氨基酸,相对分子量为13.26~51.85 k Da,等电点为4.42~10.78,多为碱性不稳定蛋白,多数由含单外显子的基因编码,多数定位于细胞核。所有ClVQs均含有高度保守的VQ基序Fxxx VQx(L/V/F)TG,系统进化分析将其分为8个亚家族,其中7个与拟南芥、水稻同源基因聚簇;52个Cl VQs间存在39对片段复制基因;其启动子区域富含光敏、茉莉酸、脱落酸及逆境应答等顺式作用元件。在CYVCV侵染‘尤力克’柠檬后,RT-q PCR数据显示9个ClVQs呈现显著差异表达模式。
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关键词
柠檬
VQ基因家族
表达分析
柑橘黄化脉明病毒
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职称材料
题名
柑橘3种病毒类病原多重RT-PCR检测技术的建立及应用
1
作者
袁琳凯
马崇欢
李丁山
陈志炜
江宵烽
丁新伦
张洁
吴祖建
机构
福建农林大学植物病毒研究所/闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室
出处
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期339-344,共6页
基金
福建省三明市横向项目(KH210264A、KH210295A、KH220062A)。
文摘
【目的】建立柑橘黄化脉明病毒(citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)、柑橘衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)和啤酒花矮化类病毒(hop stunt viroid,HSVd)的多重RT-PCR检测体系。【方法】设计多重RT-PCR引物,分析其特异性,确定其最佳浓度比、最适退火温度及灵敏度,在此基础上对福建地区的柑橘样品进行检测。【结果】确定了CYVCV-F/R、CTV-F/R和HSVd-F/R等3对引物的最佳浓度比例为1∶1∶2,最适退火温度为52.9℃,灵敏度结果显示该体系可检测模板稀释到10^(-2)的阳性样品。应用该体系对采自福建部分地区的157份柑橘样品进行检测,结果发现,CYVCV、CTV和HSVd的检出率分别为47.1%、56.7%和22.9%。【结论】成功建立了柑橘CYVCV、CTV和HSVd病原的多重RT-PCR检测方法,为该类病害的检测提供准确、快速的检测方法。
关键词
柑橘黄化脉明病毒
柑橘
衰退
病毒
啤酒花矮化类
病毒
多重RT-PCR
Keywords
Citrus yellow vein clearing virus
citrus tristeza virus
hop stunt viroid
multiplex RT-PCR
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
杨树-蚜虫互作体系中植物病毒种类的鉴定
2
作者
李征
申宛娜
索宇田
付宇辰
赵嘉平
机构
中国林业科学研究院生态保护与修复研究所林木遗传育种全国重点实验室
出处
《林业科学研究》
北大核心
2025年第2期90-97,共8页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(CAFYBB2020ZY001-2)
国家自然科学基金面上项目(32171776)。
文摘
[目的]为研究侵染杨树的蚜虫可能传播的植物病毒病害害,控制蚜虫对于杨树生长的影响。[方法]本研究在1年生新疆杨叶片上接种白毛蚜,通过高通量测序与序列组装技术,采用系统发育分析与RT-PCR方法确定蚜虫可能传播的病毒种类。[结果]对转录组测序数据使用Trinity进行拼接组装,并与NCBI Genbank已知序列进行匹配,共发现793条可能的病毒碱基序列,47个可能的病毒种类,通过发育树比对与基因序列的同源性验证可知,侵染杨树的白毛蚜主要传播的病毒为苹果茎沟病毒与柑橘黄化脉明病毒。[结论]本研究采用一种不同于传统植物病毒鉴定、更加便捷的方法来对蚜虫可能传播的植物病毒病害进行研究,最终确定了白毛蚜在杨树体内主要传播的病毒种类,使用本方法有助于快速、准确的确定蚜虫-杨树互作体系中可能存在的病毒性植物病害,为杨树的病虫害防治提供了理论基础。
关键词
杨树
蚜虫
植物
病毒
序列组装
苹果茎沟
病毒
柑橘黄化脉明病毒
Keywords
poplar trees
aphids
plant viruses
sequence assembly
Apple stem grooving virus
Citrus yellow vein clearing virus
分类号
Q939.46 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
柠檬VQ家族成员鉴定及其响应CYVCV侵染分析
3
作者
方书洁
张晓男
郭雪扬
李向
易龙
周俊
机构
赣南师范大学生命科学学院/国家脐橙工程技术研究中心
出处
《桉树科技》
2025年第3期93-104,共12页
基金
国家重点研发计划(2021YFD1400805)
江西省科技项目(20225BCJ22005)
国家自然科学基金项目(32160625)。
文摘
解析柠檬VQ家族基因特征及柠檬抗病毒侵染分子机制,为柠檬VQ基因的结构与功能及抗病机理研究提供可靠理论依据。通过生物信息学方法鉴定柠檬VQ家族成员,分析其理化性质、保守基序以及顺式作用元件等结构,将柑橘黄化脉明病毒(CYVCV)嫁接至‘尤力克’柠檬上,通过RT-q PCR验证候选基因表达量。结果表明:共鉴定52个柠檬VQ家族基因(ClVQs),分布于16条染色体,编码121~488个氨基酸,相对分子量为13.26~51.85 k Da,等电点为4.42~10.78,多为碱性不稳定蛋白,多数由含单外显子的基因编码,多数定位于细胞核。所有ClVQs均含有高度保守的VQ基序Fxxx VQx(L/V/F)TG,系统进化分析将其分为8个亚家族,其中7个与拟南芥、水稻同源基因聚簇;52个Cl VQs间存在39对片段复制基因;其启动子区域富含光敏、茉莉酸、脱落酸及逆境应答等顺式作用元件。在CYVCV侵染‘尤力克’柠檬后,RT-q PCR数据显示9个ClVQs呈现显著差异表达模式。
关键词
柠檬
VQ基因家族
表达分析
柑橘黄化脉明病毒
Keywords
Citrus×limon
VQ gene family
expression analysis
citrus yellow vein clearing virus
分类号
S432.1 [农业科学]
Q943.2 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
柑橘3种病毒类病原多重RT-PCR检测技术的建立及应用
袁琳凯
马崇欢
李丁山
陈志炜
江宵烽
丁新伦
张洁
吴祖建
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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下载PDF
职称材料
2
杨树-蚜虫互作体系中植物病毒种类的鉴定
李征
申宛娜
索宇田
付宇辰
赵嘉平
《林业科学研究》
北大核心
2025
0
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职称材料
3
柠檬VQ家族成员鉴定及其响应CYVCV侵染分析
方书洁
张晓男
郭雪扬
李向
易龙
周俊
《桉树科技》
2025
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