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辣椒果实颜色性状与SSR分子标记的关联分析及指纹图谱构建
1
作者
段敏杰
李怡斐
+3 位作者
王春萍
黄任中
黄启中
张世才
《生物技术通报》
北大核心
2025年第7期81-94,共14页
【目的】对辣椒种质材料进行遗传多样性分析,挖掘与果实颜色性状关联的分子标记。【方法】以57份辣椒种质为供试材料,利用7个果实颜色性状与20个SSR标记进行遗传多样性分析,使用Tassel 5.0软件的一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进...
【目的】对辣椒种质材料进行遗传多样性分析,挖掘与果实颜色性状关联的分子标记。【方法】以57份辣椒种质为供试材料,利用7个果实颜色性状与20个SSR标记进行遗传多样性分析,使用Tassel 5.0软件的一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进行SSR标记和性状的关联分析,并构建种质指纹图谱。【结果】7个果实颜色性状遗传多样性指数变幅为1.58(果皮L值)-2.08(果肉a值),变异系数变幅为9.07%-51.84%,果实色价与果皮和果肉的Lab值之间存在一定的相关性。20个SSR标记检测出107个多态性位点,平均每个标记5.1个;引物多态性信息含量(PIC)变幅为0.221-0.864,平均0.624;香农信息指数(I)和Nei’s遗传多样性指数(H)平均值分别为1.3和0.646;57份辣椒种质遗传相似性系数变幅为0.069-0.9151,平均0.294。系统聚类将57份种质划分为2个亚族,亚族Ⅰ和亚族Ⅱ分别包含28和29份种质,群体结构分析将种质划分为2个亚群,亚群Ⅰ和亚群Ⅱ分别有33和24份种质,与聚类分析结果交叉重叠度较高。利用GLM和MLM两种模型共检测到与辣椒果实颜色性状相关的16个标记,表型解释率为6.6%-13.8%;标记SSR4与果实色价极显著关联(P<0.01),标记SSR6、SSR9和SSR17在2种模型中均被检测到与同一性状显著关联。利用9对核心引物构建了57份辣椒种质的指纹图谱。【结论】对57份辣椒果实色价和Lab值的遗传多样性和基于SSR标记的遗传多样性进行综合分析,并构建种质指纹图谱,为辣椒种质资源鉴定、优异种质筛选及分子辅助育种提供了一定的理论依据。
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关键词
辣椒
果实颜色性状
SSR标记
遗传多样性
关联分析
指纹图谱
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职称材料
题名
辣椒果实颜色性状与SSR分子标记的关联分析及指纹图谱构建
1
作者
段敏杰
李怡斐
王春萍
黄任中
黄启中
张世才
机构
重庆市农业科学院
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第7期81-94,共14页
基金
重庆市农业科学院市级财政科技创新类项目(KYLX20240500086)
现代农业产业技术体系建设专项资助(CARS-24-A-04)。
文摘
【目的】对辣椒种质材料进行遗传多样性分析,挖掘与果实颜色性状关联的分子标记。【方法】以57份辣椒种质为供试材料,利用7个果实颜色性状与20个SSR标记进行遗传多样性分析,使用Tassel 5.0软件的一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进行SSR标记和性状的关联分析,并构建种质指纹图谱。【结果】7个果实颜色性状遗传多样性指数变幅为1.58(果皮L值)-2.08(果肉a值),变异系数变幅为9.07%-51.84%,果实色价与果皮和果肉的Lab值之间存在一定的相关性。20个SSR标记检测出107个多态性位点,平均每个标记5.1个;引物多态性信息含量(PIC)变幅为0.221-0.864,平均0.624;香农信息指数(I)和Nei’s遗传多样性指数(H)平均值分别为1.3和0.646;57份辣椒种质遗传相似性系数变幅为0.069-0.9151,平均0.294。系统聚类将57份种质划分为2个亚族,亚族Ⅰ和亚族Ⅱ分别包含28和29份种质,群体结构分析将种质划分为2个亚群,亚群Ⅰ和亚群Ⅱ分别有33和24份种质,与聚类分析结果交叉重叠度较高。利用GLM和MLM两种模型共检测到与辣椒果实颜色性状相关的16个标记,表型解释率为6.6%-13.8%;标记SSR4与果实色价极显著关联(P<0.01),标记SSR6、SSR9和SSR17在2种模型中均被检测到与同一性状显著关联。利用9对核心引物构建了57份辣椒种质的指纹图谱。【结论】对57份辣椒果实色价和Lab值的遗传多样性和基于SSR标记的遗传多样性进行综合分析,并构建种质指纹图谱,为辣椒种质资源鉴定、优异种质筛选及分子辅助育种提供了一定的理论依据。
关键词
辣椒
果实颜色性状
SSR标记
遗传多样性
关联分析
指纹图谱
Keywords
pepper
fruit color traits
SSR markers
genetic diversity
association analysis
fingerprint maps
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
辣椒果实颜色性状与SSR分子标记的关联分析及指纹图谱构建
段敏杰
李怡斐
王春萍
黄任中
黄启中
张世才
《生物技术通报》
北大核心
2025
0
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