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题名芒果LAR基因的克隆及其表达分析
被引量:3
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作者
赵志常
高爱平
黄建峰
罗睿雄
刘宽亮
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机构
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点开发实验室
国家热带果树品种改良中心
海南大学农学院
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出处
《江苏农业科学》
2018年第10期31-34,共4页
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基金
国家自然科学基金(编号:31471850)
农业部热带作物种质资源保护(编号:15RZZY-07)
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文摘
无色花青素还原酶(leucoanthocyantin reductase,简称LAR)基因是植物原花色素的一个关键基因。本研究根据已经报道的LAR基因的序列设计兼并引物,采用3'RACE和5'RACE方法,从芒果(Mangifera indica)果实中克隆得到1个LAR基因,其全长c DNA序列为1 221 bp。该基因开放阅读框为1 059 bp,编码352个氨基酸,等电点为5.78,分子质量为38.38 ku。利用生物信息学在线分析软件对该蛋白组成成分、疏水性/亲水性、二级结构、功能结构域以及三级结构进行预测和分析。通过系统发育分析发现,该基因编码的蛋白与棉花、葡萄、蓝莓、柿等具有较近的亲缘关系;对不同芒果品种的LAR基因的表达进行分析发现,绿色的桂七品种中表达量较高,而黄色的金煌品种中表达量较低。
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关键词
芒果
LAR基因
克隆
表达分析
生物信息学
果实原花色素合成
果皮色泽
作用机制
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分类号
S667.701
[农业科学—果树学]
Q786
[生物学—分子生物学]
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