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极端嗜盐古菌TRM51^T的多相分类研究 被引量:2
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作者 任敏 歹明辉 夏占峰 《塔里木大学学报》 2013年第1期58-63,共6页
从新疆硝尔库勒盐湖分离纯化到一株极端嗜盐古菌TRM 51T,其菌落颜色为白色/粉红,细胞为杆状,能运动,革兰氏染色为阴性,生长温度范围是28~50℃(最适温度37℃),NaCl浓度生长范围是2.1~4.3 M(最适浓度为3.1 M),Mg2+生长范围是0.03~1.0 M... 从新疆硝尔库勒盐湖分离纯化到一株极端嗜盐古菌TRM 51T,其菌落颜色为白色/粉红,细胞为杆状,能运动,革兰氏染色为阴性,生长温度范围是28~50℃(最适温度37℃),NaCl浓度生长范围是2.1~4.3 M(最适浓度为3.1 M),Mg2+生长范围是0.03~1.0 M(最适0.3 M),pH生长范围5.5~9.0(最适pH8.0)。细胞可在蒸馏水中裂解,避免细胞裂解的最低NaCl浓度为8%(w/v)。TRM 51T主要的极性脂是PG(磷脂酰甘油)、PGP-Me(磷脂酰甘油磷酸甲基酯)、TGD-2(葡糖苷甘露糖苷葡糖二醚),基于16S rDNA基因的系统发育分析显示,菌株TRM 51T与相近属Halopiger的成员相似性仅为94.2%~95.3%,与Haloterrigena类群的相似性为92.4%~94.6%,菌株TRM 51T基因组DNA的G+C mol%为63.2mol%。多相分类结果表明,菌株TRM 51T不能归入嗜盐古菌科的已描述属,建议成立新属级的新分类单元。 展开更多
关键词 极端嗜盐古菌 多相分类学 鉴定 16S RDNA基因 极性脂
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极端嗜盐古菌的分离与纯化方法初探
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作者 陈绍兴 刘毅 +2 位作者 谢昆 田学军 谢志雄 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2009年第2期291-292,共2页
从一平浪盐矿采集到的一块盐矿石样品中分离到2株极端嗜盐古菌(命名为CY1和CY2)。方法是用嗜盐培养基培养,采用连续传代法和NaCl浓度(m/V)梯度法分离该样品中的极端嗜盐古菌,结合平板划线纯化得到两株菌种。对分离得到的菌落进行观察,... 从一平浪盐矿采集到的一块盐矿石样品中分离到2株极端嗜盐古菌(命名为CY1和CY2)。方法是用嗜盐培养基培养,采用连续传代法和NaCl浓度(m/V)梯度法分离该样品中的极端嗜盐古菌,结合平板划线纯化得到两株菌种。对分离得到的菌落进行观察,结果表明已分离纯化得到的这两株菌种为极端嗜盐古菌。由此,建立了分离纯化极端嗜盐古菌的一套可行的实验方法。 展开更多
关键词 极端嗜盐古菌 连续传代法 Nacl浓度(m/V)梯度法 分离 纯化
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1株来自陕西盐湖的极端嗜盐古菌的分离及鉴定 被引量:5
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作者 赵萍 邹正中 王革娇 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期573-576,共4页
从陕西榆林苟池盐湖水中分离到1株嗜盐古菌GS1并对其进行了系统鉴定。通过形态鉴定、革兰氏染色、生长盐浓度试验、Mg2+浓度试验、生长pH范围、生理生化鉴定、16S rRNA基因序列等分析,确认该菌为1株新型的极端嗜盐古菌,属于盐红菌属(Hal... 从陕西榆林苟池盐湖水中分离到1株嗜盐古菌GS1并对其进行了系统鉴定。通过形态鉴定、革兰氏染色、生长盐浓度试验、Mg2+浓度试验、生长pH范围、生理生化鉴定、16S rRNA基因序列等分析,确认该菌为1株新型的极端嗜盐古菌,属于盐红菌属(Halorubrum)。GS1与Halorubrum saccharovorum(U17346)的16S rRNA基因序列同源性为97%。命名为Halorubrumsp.GS1。其16S rRNA基因序列已被GenBank数据库收录,序列号为FJ793266。 展开更多
关键词 极端嗜盐古菌 陕西省 16S RRNA基因
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内蒙古额吉淖尔盐碱湖一株产视紫红质的极端嗜盐古菌的分离及其bop基因核心序列及最适生长条件的分析 被引量:1
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作者 宋倩 韩瑞 宝力德 《科学技术与工程》 北大核心 2014年第13期11-15,共5页
从内蒙古额吉淖尔湖分离得到一株产视紫红质的极端嗜盐古菌,初步鉴定为属于Natrinema属,并扩增出了其bop基因,该bop基因序列已在Genbank中注册,编号为KF863690,分析了其核心序列。结果表明bop基因开放阅读框为303 bp,编码101个氨基酸。b... 从内蒙古额吉淖尔湖分离得到一株产视紫红质的极端嗜盐古菌,初步鉴定为属于Natrinema属,并扩增出了其bop基因,该bop基因序列已在Genbank中注册,编号为KF863690,分析了其核心序列。结果表明bop基因开放阅读框为303 bp,编码101个氨基酸。blastp结果表明该蛋白属于Bac-rhodopsin蛋白家族,具有典型的细菌视紫红质蛋白结构域。利用BLAST进行相似性分析发现bop编码蛋白氨基酸序列与Genbank中编号AAS87571.1、WP-007110705和AFB77278.1的视紫红质蛋白相似性达到98%以上。此结果表明视紫红质蛋白在细菌及古菌中结构上具有很高的保守性,与其质子泵功能紧密相关。。最后分析了该菌株的最适生长条件。该菌株在分离培养基中适宜生长的NaCl浓度范围为1.0~3.0 mol/L,适宜生长pH为6.5~8.5,适宜生长镁离子浓度为0.4~0.8 mol/L。通过分析比较得出该嗜盐古生菌株生长最适NaCl盐浓度为1.5 mol/L,最适pH为7.5,最适镁离子浓度为0.4 mol/L。该实验结果为今后进一步研究产视紫红质的极端嗜盐古生菌株的生理生化特征及遗传学特征奠定了基础。 展开更多
关键词 极端嗜盐古菌 bop基因 视紫红质 最适生长条件
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应用PCR-RFLP技术研究云南楚雄地区嗜盐古菌生物多样性
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作者 陈绍兴 刘白艳 +3 位作者 杨权芬 董艳 陆明生 马自成 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2010年第3期56-58,共3页
采用限制片段长度多态性-聚合酶链式反应(PCR-RFLP)技术对从我国云南省楚雄市一平浪盐矿样品中所分离的39株极端嗜盐古菌进行生物多样性分析研究。提取39株嗜盐古菌染色体DNA,将其作为模板,进行PCR扩增,PCR产物再用HinfⅠ酶切,琼脂糖凝... 采用限制片段长度多态性-聚合酶链式反应(PCR-RFLP)技术对从我国云南省楚雄市一平浪盐矿样品中所分离的39株极端嗜盐古菌进行生物多样性分析研究。提取39株嗜盐古菌染色体DNA,将其作为模板,进行PCR扩增,PCR产物再用HinfⅠ酶切,琼脂糖凝胶电泳,结果显示电泳的条带和数目存在较大差异,说明云南地区嗜盐古菌资源丰富,且有较显著的遗传多样性。根据39株菌株所形成条带的相对位置和数目,初步将它们分为11个类群。 展开更多
关键词 极端嗜盐古菌 PCR-RFLP技术 生物多样性 云南楚雄
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