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利用DNA条形编码探讨云南野柞蚕的分类学地位 被引量:14
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作者 朱绪伟 刘彦群 +3 位作者 李喜升 霍锡敏 姜义仁 秦利 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期424-428,共5页
2001年在云南曲靖发现的野生柞蚕(云南野柞蚕,A.pernyiwild)拥有一些与放养型柞蚕(A.pernyi)不同的特性。测定了云南野柞蚕线粒体细胞色素酶C亚基I基因5′端的部分片段(658 bp,GenBank:EU532613),并利用该DNA条形编码探讨其分类学地位... 2001年在云南曲靖发现的野生柞蚕(云南野柞蚕,A.pernyiwild)拥有一些与放养型柞蚕(A.pernyi)不同的特性。测定了云南野柞蚕线粒体细胞色素酶C亚基I基因5′端的部分片段(658 bp,GenBank:EU532613),并利用该DNA条形编码探讨其分类学地位。基于Kimura-2-Parameter计算的4个放养型柞蚕品种之间的平均遗传距离仅0.003,而云南野柞蚕与放养型柞蚕之间的遗传距离为0.016,小于已确定分类学地位的放养型柞蚕与印度野蚕(A.rolyii)之间的遗传距离(0.028),但与家蚕(B.mori)同其祖先中国野桑蚕(B.mandarinaChina)之间的遗传距离相近(0.015)。NJ树中云南野柞蚕与放养型柞蚕也最先聚在一起,从分子水平证实其仍属于柞蚕种。初步认为,云南野柞蚕可以考虑成为柞蚕种的一个亚种——野柞蚕亚种。 展开更多
关键词 DNA条形编码 野生柞蚕 分子分类
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珍稀绢丝昆虫柳蚕的DNA条形编码与系统进化初步分析 被引量:11
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作者 濮佳明 武松 +6 位作者 霍锡敏 王欢 夏润玺 李喜升 王振东 罗朝斌 刘彦群 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期154-159,共6页
利用DNA测序技术获得柳蚕(Actias selene)线粒体细胞色素酶C亚基Ⅰ基因(COI)5′端574 bp的片段,作为用于柳蚕种质资源分子鉴定的DNA条形编码(GenBank:FJ358505)。测定的柳蚕COI基因序列与其它大蚕蛾科绢丝昆虫的COI序列一样,均表现出偏... 利用DNA测序技术获得柳蚕(Actias selene)线粒体细胞色素酶C亚基Ⅰ基因(COI)5′端574 bp的片段,作为用于柳蚕种质资源分子鉴定的DNA条形编码(GenBank:FJ358505)。测定的柳蚕COI基因序列与其它大蚕蛾科绢丝昆虫的COI序列一样,均表现出偏好于碱基T的倾向(AT skew=-0.179)。在所分析的蚕类昆虫中,柳蚕与合目大蚕蛾的遗传距离最小(0.120),而与蓖麻蚕之间的遗传距离最大(0.138)。构建的NJ和UPGMA分子树中,大蚕蛾科的柳蚕属、柞蚕属、蓖麻蚕属、大乌桕蚕属、栗蚕属均各自形成一个支系,并且明显形成两个分支:大蚕蛾族(saturni-ini),包括柳蚕、柞蚕和栗蚕;眉纹大蚕蛾族(attacini),包括蓖麻蚕和大乌桕蚕。这一结果与传统分类一致。 展开更多
关键词 柳蚕 线粒体细胞色素酶C亚基Ⅰ基因 DNA条形编码 系统进化
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樗蚕和蓖麻蚕的DNA条形编码与系统进化分析 被引量:5
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作者 武松 李玉萍 +5 位作者 夏润玺 王欢 石生林 李喜升 王振东 刘彦群 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期533-538,共6页
樗蚕(Philosamia cynthia cynthia)与蓖麻蚕(Philosamia cynthia ricini)均是鳞翅目大蚕蛾科吐丝营茧的昆虫,二者的血缘关系很近,成虫的外形也极其相似。为了获得用于樗蚕与蓖麻蚕分子鉴定的DNA条形编码,测定了二者的线粒体细胞色素... 樗蚕(Philosamia cynthia cynthia)与蓖麻蚕(Philosamia cynthia ricini)均是鳞翅目大蚕蛾科吐丝营茧的昆虫,二者的血缘关系很近,成虫的外形也极其相似。为了获得用于樗蚕与蓖麻蚕分子鉴定的DNA条形编码,测定了二者的线粒体细胞色素酶C亚基I基因(COI)574 bp的DNA片段序列(GenBank登录号:FJ788507,FJ772004),对序列特征及与同科其它绢丝昆虫同源序列的系统进化关系进行了分析。在大蚕蛾科绢丝昆虫中,樗蚕与蓖麻蚕COI序列表现出最强的碱基T偏好性(ATskew=-0.194),二者的COI序列之间具有明显差异,共鉴定出25个变异位点,表明所测定COI序列可以作为各自的DNA条形编码。樗蚕与蓖麻蚕之间基于Kimura-2-Parameter的遗传距离为0.041,而与同科其它绢丝昆虫之间的遗传距离则在0.076~0.159之间,二者与惜古比天蚕(Hyalophora ce-cropia)之间的亲缘关系较近。 展开更多
关键词 樗蚕 蓖麻蚕 COI基因 DNA条形编码 系统进化
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DNA条形编码技术在动物分类中的研究进展 被引量:48
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作者 王鑫 黄兵 《生物技术通报》 CAS CSCD 2006年第4期67-72,共6页
DNA条形编码(DNA Barcoding)技术是一种新的生物分类方法,它是分子生物学和生物信息学相结合的产物。这一概念认为,就像在商店里扫描仪读取条形码那样,对地球上每一种生物也能通过快速分析其DNA中的一小段(线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基,... DNA条形编码(DNA Barcoding)技术是一种新的生物分类方法,它是分子生物学和生物信息学相结合的产物。这一概念认为,就像在商店里扫描仪读取条形码那样,对地球上每一种生物也能通过快速分析其DNA中的一小段(线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基,mt COI)加以识别。在最近3年里,该技术已成为生物分类学中研究的热点。理论上,DNA条形编码在生物分类鉴定中具有重要作用,但目前国际上对其的争论也不少。综述了DNA条形编码技术的产生、发展概况、原理与操作及其在动物分类中的应用,突出了该技术在寄生虫分类中应用的意义与可行性,并讨论了DNA条形编码在生物分类应用中可能存在的问题。 展开更多
关键词 DNA条形编码 动物 寄生虫 分类 线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(mt COI)
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柞园栎树林中刺蛾科昆虫的DNA条形编码及其在系统分类中的应用 被引量:1
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作者 杨瑞生 姜义仁 +2 位作者 石生林 王勇 秦利 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期613-619,共7页
刺蛾科昆虫是柞园栎树林中的重要害虫类群。克隆了栎树林中主要刺蛾科昆虫的线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因(mtDNA COⅠ,Gen Bank登录号:KP727647~KP727664),以此作为供试刺蛾科昆虫的DNA条形编码基因分析其碱基组成特点和遗传进... 刺蛾科昆虫是柞园栎树林中的重要害虫类群。克隆了栎树林中主要刺蛾科昆虫的线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因(mtDNA COⅠ,Gen Bank登录号:KP727647~KP727664),以此作为供试刺蛾科昆虫的DNA条形编码基因分析其碱基组成特点和遗传进化规律,探讨将其应用于栎树林中刺蛾科害虫的分类鉴定和系统进化关系研究的可行性。刺蛾科昆虫各物种间的mtDNA COⅠ基因碱基组成差异不明显,碱基T、C、A、G的平均含量分别为38.0%、16.2%、30.7%和15.1%,AT含量为68.7%,显著高于GC含量(31.3%),表现出明显的AT使用趋向性;碱基明显倾向于使用T(AT偏倚度为-0.106 26),具有较弱的C偏好性(GC偏倚度为-0.035 14),不同物种间该基因碱基T使用偏好程度差异较大。刺蛾科昆虫mtDNA COⅠ基因碱基变异率为26.64%,碱基颠换明显高于转换(R值为0.75)。刺蛾科昆虫各物种mtDNA COⅠ基因的平均进化率为11.5%,进化率最大的发生在锯纹岐刺蛾Austrapoda seres与中国扁刺蛾Thosea sinensis间,进化率最小的发生在黄刺蛾Monema flavescens与梨娜刺蛾Narosoideus flavidorsalis之间。在刺蛾科昆虫mtDNA COⅠ基因的系统进化树中,中国绿刺蛾Parasa sinica和中国扁刺蛾Thosea sinensis聚在一起形成一个单系,其他物种聚在一起形成另外一个单系。以上结果表明,mtDNA COⅠ基因可作为DNA条形编码用于栎树林刺蛾科害虫的分类鉴定和系统进化研究。 展开更多
关键词 栎树林 害虫 刺蛾科 DNA条形编码 系统分类 线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因
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DNA条形编码技术及其在叶蝉科昆虫中的应用 被引量:2
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作者 李虎 戴仁怀 李子忠 《山地农业生物学报》 2012年第5期432-438,共7页
DNA条形编码技术(DNA barcoding)是近十年来一种新兴的DNA分类(DNA Taxonomy)方法,已经成功应用于大多数动物的分类鉴定及相关研究。本文从DNA条形编码技术的产生、原理及操作步骤,简要回顾近十年来的发展和应用,总结其优点,并介绍条形... DNA条形编码技术(DNA barcoding)是近十年来一种新兴的DNA分类(DNA Taxonomy)方法,已经成功应用于大多数动物的分类鉴定及相关研究。本文从DNA条形编码技术的产生、原理及操作步骤,简要回顾近十年来的发展和应用,总结其优点,并介绍条形编码技术在叶蝉科昆虫中的应用发展和前景。 展开更多
关键词 DNA条形编码 MT CO I 叶蝉科 应用
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利用DNA条形编码探讨柞蚕饰腹寄蝇的分类学地位 被引量:7
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作者 曾彩云 刘彦群 +3 位作者 李喜升 杨润生 夏瑞玺 石生林 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期262-267,共6页
柞蚕饰腹寄蝇(Blepharipa tibialis Chao)是柞蚕的主要寄生性害虫之一。测定了柞蚕饰腹寄蝇的线粒体细胞色素酶C亚基I(COI)基因5′端的部分片段(657bp,GenBank登录号EU433559),并利用该DNA条形编码探讨了其分类学地位。将GenBank数据库... 柞蚕饰腹寄蝇(Blepharipa tibialis Chao)是柞蚕的主要寄生性害虫之一。测定了柞蚕饰腹寄蝇的线粒体细胞色素酶C亚基I(COI)基因5′端的部分片段(657bp,GenBank登录号EU433559),并利用该DNA条形编码探讨了其分类学地位。将GenBank数据库登载的寄蝇科11个属的15个代表种的序列组成数据集,基于Kimura-2-Parameter计算了序列间的遗传距离,采用邻近距离法(Neighbour-Joining)构建了系统树。Blast检索表明这段序列可以作为DNA条形编码用于柞蚕饰腹寄蝇的鉴定。柞蚕饰腹寄蝇与饰腹寄蝇属内5个种间的平均遗传距离(0.122)是饰腹寄蝇属内种间平均遗传距离(0.063)的2倍,而11个形态学属间的平均遗传距离(0.122)则与柞蚕饰腹寄蝇和这11个形态学属之间的平均遗传距离(0.124)基本一致;柞蚕饰腹寄蝇在构建的NJ树中也没有与饰腹寄蝇属的种类聚在一起。基于上述结果,建议将柞蚕饰腹寄蝇从饰腹寄蝇属划分出来,单独作为一个新的属。 展开更多
关键词 DNA条形编码 柞蚕饰腹寄蝇 寄蝇科 分类学地位
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危害野蚕的4种寄生蝇的DNA条形编码鉴定 被引量:2
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作者 陈东斌 鲁迎新 +5 位作者 张汝松 边海旭 杨瑞生 朱绪伟 王欢 刘彦群 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期77-84,共8页
危害柞蚕(Antheraea pernyi)、栗蚕(Dictyoploca japonica)等野蚕的寄生蝇种类较多,准确鉴定其种类是害虫防治的基础。对采集自不同年份(2007年和2016年)、不同地理区域(辽宁、吉林和河南)寄生柞蚕和栗蚕的50份寄生蝇蛹样品的DN... 危害柞蚕(Antheraea pernyi)、栗蚕(Dictyoploca japonica)等野蚕的寄生蝇种类较多,准确鉴定其种类是害虫防治的基础。对采集自不同年份(2007年和2016年)、不同地理区域(辽宁、吉林和河南)寄生柞蚕和栗蚕的50份寄生蝇蛹样品的DNA条形编码进行了研究。来自辽宁6个地区和吉林2个地区的38份柞蚕寄生蝇样品属于柞蚕饰腹寄蝇(Blepharipa tibialis),它们的DNA条形编码序列的碱基一致性达100%,表明辽宁和吉林的柞蚕饰腹寄蝇均来源于一个扩散点,而且扩散历史极短。来自河南的柞蚕寄生蝇样品HN6的DNA条形编码序列与家蚕追寄蝇(Exorista sorbillans)的序列一致性达到96%,属于家蚕追寄蝇;而另外的5份样品HN1~5的序列一致性为100%,推测属于蚕饰腹寄蝇(Blepharipa zebina)。来自辽宁的寄生栗蚕的6份寄生蝇样品DJY1~6的DNA条形编码序列完全一致,但其分类学地位有待于进一步确认。有趣的是,来自河南同一个柞蚕茧内的寄生蝇样品HN3~5和HN6分属于2种寄生蝇。上述结果表明,利用DNA条形编码技术进行危害野蚕的寄生蝇种类鉴定和种群发生监测是可行的。 展开更多
关键词 柞蚕 栗蚕 寄生蝇 种类鉴定 DNA条形编码
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DNA条形编码技术在缓步动物分类中的研究进展 被引量:1
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作者 肖欣 李晓晨 《安徽农学通报》 2010年第9期55-56,138,共3页
缓步动物是一种十分微小的水生无脊椎动物,用传统的形态分类学方法对其进行物种鉴定难度较大。DNA条形编码技术是近几年用于物种分类、鉴定等研究的一种新兴的分子学技术。
关键词 DNA条形编码 缓步动物 分类 物种鉴定
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东海带鱼DNA条形码的建立及COⅠ序列变异分析 被引量:10
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作者 李鹏飞 朱文斌 +3 位作者 贺舟挺 徐开达 薛利建 张洪亮 《浙江海洋学院学报(自然科学版)》 CAS 2013年第1期6-9,共4页
采用聚合酶链反应(PCR)技术对浙江近海水域带鱼群体(n=15)的mtDNA COⅠ基因序列进行扩增,获得了大小约为650 bp的扩增产物。对PCR产物进行双向测序,得到了609 bp的基因片段(除去两端的部分序列),获得了带鱼的DNA条形编码。用DNAMAN软件... 采用聚合酶链反应(PCR)技术对浙江近海水域带鱼群体(n=15)的mtDNA COⅠ基因序列进行扩增,获得了大小约为650 bp的扩增产物。对PCR产物进行双向测序,得到了609 bp的基因片段(除去两端的部分序列),获得了带鱼的DNA条形编码。用DNAMAN软件进行了排序比较发现,东海带鱼的COⅠ基因序列同源性高达99.69%;用DNASP软件分析得知,15个序列共有10个单倍型(在GenBank登录号:GU970070-GU970075,GU970079-GU970082),在15个个体中,共检测到13个变异位点,包括11个转换和2个颠换位点。运用MEGA软件计算出了不同个体间的遗传距离,并据此构建了UPGMA和NJ系统树。用DNASP软件计算出的多态位点数为13、核苷酸多样性指数和平均核苷酸差异数分别为0.005 13和3.124。研究结果表明,东海带鱼的COI基因个体变异程度比较小,对研究带鱼的种群结构和不同地理种群的遗传分化具有一定的应用价值。 展开更多
关键词 东海 带鱼 DNA条形编码 COⅠ 遗传多样性
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空间全方位可视编码基准尺的设计和识别
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作者 王君 董明利 +1 位作者 孙鹏 燕必希 《工具技术》 2018年第8期146-149,共4页
为了解决大尺寸近景摄影测量中基准尺的成像角度限制问题,设计了一种全方位成像基准尺,该基准尺采用球形自反射标志点代替平面标志点,并设计了用于基准尺自动识别定位的条形编码标志环,实现了基准尺在测量空间的全方位成像。针对设计方... 为了解决大尺寸近景摄影测量中基准尺的成像角度限制问题,设计了一种全方位成像基准尺,该基准尺采用球形自反射标志点代替平面标志点,并设计了用于基准尺自动识别定位的条形编码标志环,实现了基准尺在测量空间的全方位成像。针对设计方案,设计了全方位基准尺识别算法,并通过实验验证了算法的有效性,证明该基准尺适用于大尺寸近景摄影测量系统。 展开更多
关键词 摄影测量 全方位成像 基准尺 条形编码
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商品身份证──条形码
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《农业装备技术》 1994年第3期27-27,共1页
商品身份证──条形码在进口商品中,常可见到一种由若干黑白条纹组成。下面有两组数字的图案印在色彩艳丽的商品包装上。原来,这是一种商品识别标记,是供光电扫描阅读器给电脑输入数据的特殊代码,叫条形码。美国人在1970年最早... 商品身份证──条形码在进口商品中,常可见到一种由若干黑白条纹组成。下面有两组数字的图案印在色彩艳丽的商品包装上。原来,这是一种商品识别标记,是供光电扫描阅读器给电脑输入数据的特殊代码,叫条形码。美国人在1970年最早应用它于超级市场。当顾客把自选的商... 展开更多
关键词 身份证 条形码技术 商品包装 黑白条纹 调整生产计划 自动化生产线 数字 现代管理 自动分拣 条形编码
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现代分子生物学技术在木霉鉴定及多样性分析中的应用 被引量:5
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作者 董楠 许艳丽 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期1-5,共5页
木霉是一类重要的生防真菌,具有很大的农业应用潜力。对分离培养的木霉准确鉴定,对其在农业生产中的应用至关重要。近年来,分子生物学技术在木霉鉴定方面得到了广泛应用,本文综述了rDNA-ITS序列分析、通用引物PCR(UP-PCR)、随机扩增多态... 木霉是一类重要的生防真菌,具有很大的农业应用潜力。对分离培养的木霉准确鉴定,对其在农业生产中的应用至关重要。近年来,分子生物学技术在木霉鉴定方面得到了广泛应用,本文综述了rDNA-ITS序列分析、通用引物PCR(UP-PCR)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)等分子技术在木霉鉴定与多样性分析中的应用。 展开更多
关键词 木霉 DNA寡核苷酸条形编码 UP-PCR RAPD AFLP
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机器视觉系统小波算法应用网络视频优化研究 被引量:1
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作者 李兴春 《科学技术与工程》 北大核心 2013年第17期4866-4872,共7页
提出提升小波变换,在此基础上,对由MPEG—4标准编码产生的根据提升小波变换的双向相邻图像质量剧烈波动的缺陷进行调整。利用三次样条函数进行样条逼近算法,对调整后的图像进行压缩。通过对图像进行分析与仿真,使图像质量和压缩比提高,... 提出提升小波变换,在此基础上,对由MPEG—4标准编码产生的根据提升小波变换的双向相邻图像质量剧烈波动的缺陷进行调整。利用三次样条函数进行样条逼近算法,对调整后的图像进行压缩。通过对图像进行分析与仿真,使图像质量和压缩比提高,与此同时优化了边缘效应。 展开更多
关键词 小波算法 条形编码 边缘优化
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