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基于线粒体COI和18S rRNA基因构建舟山海域浮游动物DNA宏条形码数据库: 1; 作者冼华琳汤昌盛 +5 位作者张杨阳张晓林廖智周钰琴谢舒烨严小军《南方水产科学》北大核心 2025年第4期85-97,共13页; 为构建舟山海域浮游动物本地条形码数据库,从而为该海域浮游动物的种类鉴定、系统进化关系及种群遗传学研究提供科学依据。基于过去14年的文献报道,编制了收录23目64科96属155种浮游动物的舟山海域浮游动物物种名录,通过从NCBI GenBank... 展开更多; 关键词浮游动物 COI基因 18S rRNA基因 DNA条形码数据库舟山海域; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于线粒体COI和12S rDNA基因构建珠江河口鱼类DNA宏条形码数据库被引量：11: 2; 作者蒋佩文李敏 +2 位作者张帅陈作志徐姗楠《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期13-21,共9页; 为建立珠江河口鱼类本底DNA条形码数据库,为珠江河口鱼类种类识别和多样性研究提供信息化基础,于2020—2021年在珠江河口采集鱼类样本251尾,测定了6目10科41属99种鱼类的219条线粒体COI基因5'端的652 bp序列和247条线粒体12S rDNA基... 展开更多; 关键词鱼类 COI基因 12S rDNA基因 DNA条形码数据库珠江河口; 在线阅读下载PDF 职称材料

东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库被引量：2: 3; 作者吴峰温佩颖 +5 位作者唐志珍李青鉴朱頔王天明葛剑平王红芳《北京师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期623-628,共6页; DNA宏条形码技术已成为环境DNA分析的常用手段,选择合适的引物并建立本地微条形码数据库,对于环境DNA结果的进一步探究十分重要.本文通过数字模拟PCR技术,对食草动物环境DNA研究中常用的3个微条形码进行比较,发现psbCL具有最高或略低于... 展开更多; 关键词植物DNA微条形码环境DNA DNA宏条形码条形码数据库 psbCL; 在线阅读下载PDF 职称材料

DNA条形码技术在林业科学研究中的应用被引量：1: 4; 作者刘娟胡冬南 +2 位作者周增亮刘爽万松泽《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2019年第3期152-159,共8页; DNA条形码是利用生物体内普遍存在的一个或几个、较短的且标准化的基因片段作为通用片段,通过碱基序列差异来实现物种水平准确鉴定的工具。相对于传统的分类学,DNA条形码技术具有不依赖形态特征和发育阶段、鉴定数字化、快速准确、操作... 展开更多; 关键词条形码数据库生物多样性监测林业发展森林生态林业可持续发展; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于环境DNA-宏条形码技术的底栖动物监测及水质评价研究进展被引量：30: 5; 作者王萌金小伟 +7 位作者林晓龙杜丽娜崔永德吴小平孙红英谢志才王新华王备新《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第18期7440-7453,共14页; 底栖动物是淡水生态系统中物种多样性最高的类群,也是应用最广泛的水质监测指示生物之一。传统的底栖动物监测以形态学为基础,耗时费力,无法满足流域尺度大规模监测的需求。环境DNA-宏条形码技术是一种新兴的生物监测方法,其与传统方法... 展开更多; 关键词宏条形码大型底栖无脊椎动物生物多样性条形码数据库淡水生态系统; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于线粒体COI和18S rRNA基因构建舟山海域浮游动物DNA宏条形码数据库: 1; 作者冼华琳汤昌盛张杨阳张晓林廖智周钰琴谢舒烨严小军; 机构浙江海洋大学海洋科学与技术学院; 出处《南方水产科学》北大核心 2025年第4期85-97,共13页; 基金国家自然科学基金国际(地区)合作研究与交流项目(42020104009) 国家自然科学基金青年科学基金项目(32200083) +1 种基金浙江海洋大学人才引进基金项目(JX6311104324)。; 文摘为构建舟山海域浮游动物本地条形码数据库,从而为该海域浮游动物的种类鉴定、系统进化关系及种群遗传学研究提供科学依据。基于过去14年的文献报道,编制了收录23目64科96属155种浮游动物的舟山海域浮游动物物种名录,通过从NCBI GenBank参考数据库获取相关数据,共收集浮游动物线粒体COI基因序列195条和核糖体18S rRNA基因序列134条,初步建立了舟山海域浮游动物条形码数据库。对最优势类群桡足类进行了种间和种内遗传距离的计算分析。结果显示:桡足类COI基因序列种间平均遗传距离为0.3136,是种内平均遗传距离的34.09倍;18S rRNA基因序列的种间平均遗传距离为0.2628,是种内平均遗传距离的26.82倍。COI基因序列的种间和种内遗传距离存在明显的条形码间隔,而18S rRNA基因序列的种间和种内遗传距离存在重叠,没有明显的条形码间隔。基于COI和18S rRNA基因序列构建的系统发育树表明,2种条形码基因在目和科水平上均能有效区分不同的浮游动物类群。舟山海域浮游动物DNA宏条形码数据库的建立,有利于浮游动物种类鉴定及多样性评估,并为该海域海洋生态环境状况评价提供科学依据。; 关键词浮游动物 COI基因 18S rRNA基因 DNA条形码数据库舟山海域; Keywords Zooplankton COI gene 18S rRNA gene DNA barcoding database Zhoushan sea area; 分类号 Q953 [生物学—动物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于线粒体COI和12S rDNA基因构建珠江河口鱼类DNA宏条形码数据库被引量：11: 2; 作者蒋佩文李敏张帅陈作志徐姗楠; 机构上海海洋大学水产与生命学院中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部外海渔业可持续利用重点实验室/广东省渔业生态环境重点实验室南方海洋科学与工程广东省实验室(广州); 出处《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期13-21,共9页; 基金广东省基础与应用基础研究重大项目(2019B030302004-05) 广东省科技计划项目(2019B121201001) +1 种基金中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2019TS13,2021SD18)。; 文摘为建立珠江河口鱼类本底DNA条形码数据库,为珠江河口鱼类种类识别和多样性研究提供信息化基础,于2020—2021年在珠江河口采集鱼类样本251尾,测定了6目10科41属99种鱼类的219条线粒体COI基因5'端的652 bp序列和247条线粒体12S rDNA基因5'端的163~185 bp序列。同时,从GenBank数据库下载珠江河口鱼类COI序列165条和12S rDNA序列128条,共获得172种鱼类的384条COI序列与375条12S rDNA序列,初步构建了珠江河口鱼类条形码数据库。研究发现:COI序列种内平均遗传距离为0.20%,种间平均遗传距离为25.54%;12S rDNA序列种内平均遗传距离为0.12%,种间平均遗传距离为34.39%。基于COI基因的DNA条形码可形成明显的条形码间隙;而基于12S rDNA基因的DNA条形码不能形成明显的条形码间隙,11个物种(占总种类的6.4%)存在区分困难的情况。珠江河口鱼类DNA条形码数据库的建立,有利于推进该河口鱼类生态系统的环境DNA分析,并为珠江河口鱼类生物多样性的保护和种群动态监测提供可靠的技术支持。; 关键词鱼类 COI基因 12S rDNA基因 DNA条形码数据库珠江河口; Keywords Fish COI gene 12S rDNA gene DNA barcode database Pearl River Estuary; 分类号 S917.4 [农业科学—水产科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库被引量：2: 3; 作者吴峰温佩颖唐志珍李青鉴朱頔王天明葛剑平王红芳; 机构生物多样性与生态工程教育部重点实验室; 出处《北京师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期623-628,共6页; 基金国家自然科学基金资助项目(32071494)。; 文摘 DNA宏条形码技术已成为环境DNA分析的常用手段,选择合适的引物并建立本地微条形码数据库,对于环境DNA结果的进一步探究十分重要.本文通过数字模拟PCR技术,对食草动物环境DNA研究中常用的3个微条形码进行比较,发现psbCL具有最高或略低于最高的覆盖度和分辨率,在环境DNA分析中推荐优先使用.利用psbCL建立了东北虎豹国家公园本地微条形码库,同时利用psbCL扩增梅花鹿粪便中的进食物种,以比较本地微条形码库和公共数据库在物种鉴别能力方面的差异.结果表明,本地数据库在属和种水平均提高了鉴别能力.因此,本研究推荐环境DNA分析中建立本地微条形码库,以提高研究的精度,本研究所建立的东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库也将为未来高精度的环境DNA分析提供基础.; 关键词植物DNA微条形码环境DNA DNA宏条形码条形码数据库 psbCL; Keywords plant DNA mini-barcode environmental DNA DNA metabarcoding barcode libraries psbCL; 分类号 Q943 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名DNA条形码技术在林业科学研究中的应用被引量：1: 4; 作者刘娟胡冬南周增亮刘爽万松泽; 机构江西农业大学江西特色林木资源培育与利用协同创新中心; 出处《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2019年第3期152-159,共8页; 基金国家自然科学基金“沿海拔和纬度梯度的中亚热带常绿阔叶林群落系统发育beta多样性研究(31500341)”,“中国-日本森林植物亚区亚热带地区木本植物系统发育区系地理学研究(31570210)”; 文摘 DNA条形码是利用生物体内普遍存在的一个或几个、较短的且标准化的基因片段作为通用片段,通过碱基序列差异来实现物种水平准确鉴定的工具。相对于传统的分类学,DNA条形码技术具有不依赖形态特征和发育阶段、鉴定数字化、快速准确、操作简单规范等优势。已成功应用在生物多样性监控、海关、中药材真伪鉴定、法医鉴定、动植物检疫、生物入侵、食品和药物市场监督等诸多领域。经过15年时间发展,DNA条形码研究已基本确定针对不同生物类群使用不同的通用片段,同时构建了标准的全球生命条形码数字化数据库。目前DNA条形码研究主要集中在如何提高近缘类群物种分辨率和构建区域条形码数据库两个方向。在林业科学研究中,DNA条形码在木材识别、森林群落生态和生物多样性监控与评估等领域发展迅猛,但同时也面临一些问题,如木材DNA降解、整条片段的扩增等,需要在条形码片段选择、数据库构建、数据库与高通量测序技术结合、分析方法改进等进一步深入研究。未来DNA条形码将在林业资源评价、保护和可持续利用等方向具有广阔的应用前景。; 关键词条形码数据库生物多样性监测林业发展森林生态林业可持续发展; Keywords DNA barcoding library biodiversity monitoring forest ecology sustainable forestry development; 分类号 S718 [农业科学—林学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于环境DNA-宏条形码技术的底栖动物监测及水质评价研究进展被引量：30: 5; 作者王萌金小伟林晓龙杜丽娜崔永德吴小平孙红英谢志才王新华王备新; 机构南京农业大学植物保护学院中国环境监测总站南开大学生命科学学院广西师范大学珍稀濒危动植物生态与环境保护教育部重点实验室中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室南昌大学生命科学学院南京师范大学生命科学学院; 出处《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第18期7440-7453,共14页; 基金国家自然科学基金项目(41771255) 江苏省科技项目(BE2018681)。; 文摘底栖动物是淡水生态系统中物种多样性最高的类群,也是应用最广泛的水质监测指示生物之一。传统的底栖动物监测以形态学为基础,耗时费力,无法满足流域尺度大规模监测的需求。环境DNA-宏条形码技术是一种新兴的生物监测方法,其与传统方法相比优势在于采样方法简单、低成本、高灵敏度,不受生物样本和环境状况的影响,不依赖分类专家和鉴定资料,能够快速准确地对多个类群进行大规模、高通量的物种鉴定。然而,在实际应用中该方法的效果受诸多因素的影响,不同的方法、流程往往会产生差异较大的结果。鉴于此,着重分析总结了应用环境DNA-宏条形码技术监测底栖动物的关键影响因素,包括样品采集与处理流程、分子标记选择、引物设计、PCR偏好性、参考数据库的完整性及相应的优化。并基于此探讨了提高环境DNA宏条形码技术在底栖动物监测效率和准确率的途径,以期为底栖动物环境DNA-宏条形码监测方案的制定提供可靠的参考。最后对该技术在底栖动物监测和水质评价中的最新发展方向进行了展望。; 关键词宏条形码大型底栖无脊椎动物生物多样性条形码数据库淡水生态系统; Keywords metabarcoding macroinvertebrates biodiversity barcode reference database freshwater ecosystem; 分类号 Q958.8 [生物学—动物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于线粒体COI和18S rRNA基因构建舟山海域浮游动物DNA宏条形码数据库	冼华琳汤昌盛张杨阳张晓林廖智周钰琴谢舒烨严小军	《南方水产科学》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	基于线粒体COI和12S rDNA基因构建珠江河口鱼类DNA宏条形码数据库	蒋佩文李敏张帅陈作志徐姗楠	《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心	2022	11	在线阅读下载PDF 职称材料
3	东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库	吴峰温佩颖唐志珍李青鉴朱頔王天明葛剑平王红芳	《北京师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2023	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	DNA条形码技术在林业科学研究中的应用	刘娟胡冬南周增亮刘爽万松泽	《林业科学研究》 CSCD 北大核心	2019	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	基于环境DNA-宏条形码技术的底栖动物监测及水质评价研究进展	王萌金小伟林晓龙杜丽娜崔永德吴小平孙红英谢志才王新华王备新	《生态学报》 CAS CSCD 北大核心	2021	30	在线阅读下载PDF 职称材料