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题名稻曲病菌菌株GZ-2中携带的病毒基因组特征
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作者
张婷婷
滕丽
蔡小姚
刘红美
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机构
贵州医科大学生物与医学工程重点实验室
贵州医科大学环境污染与疾病监控省部共建教育部重点实验室
贵州医科大学基础医学院
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出处
《农技服务》
2020年第8期8-13,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(31760015)
贵州省科技计划项目[黔科合基础(2017)1153]
贵阳市科技计划项目[筑科合同(2017)5-24]。
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文摘
稻曲病菌是引起真菌类病害水稻稻曲病的病原。从稻曲病菌菌株GZ-2中分离到1株真菌病毒,命名为Ustilaginoidea virens Unclassified virus 2(UvUV2),对其进行了序列分析。通过CF-11纤维素粉法提取菌株GZ-2中的真菌病毒UvUV2,采用随机引物扩增法获得UvUV2的全长基因组序列,使用DNAMAN、BlastP和MEGA等软件对UvUV2的全长序列进行拼接、比对和系统进化树分析。结果表明:UvUV2全基因组长度为2 887bp,GC含量为58.8%,UvUV2基因组序列中存在2个重叠的开放阅读框(ORF1和ORF2)。ORF1长561bp,编码186个氨基酸(20.06kDa),编码1种未知蛋白;ORF2长2 394bp,编码797个氨基酸(89.42kDa),编码依赖于RNA的RNA聚合酶。ORF2编码的蛋白与Purpureocillium lilacinum nonsegmented virus 1(PINV-1)RNA的RNA聚合酶关系最密切。另外,UvUV2病毒基因组序列中发现1个类似甲型流感病毒基因组中的滑动序列(CCC_UUU_UAG),使得UvUV2的ORF1和ORF2通过+1移码机制形成融合蛋白。通过UvUV2的依赖于RNA的RNA聚合酶蛋白序列构建的系统进化树分析得出,UvUV2是一种未分类的真菌病毒。综上所述,UvUV2属于一个未分类的科。
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关键词
稻曲病菌
真菌病毒
DSRNA
UvUV2
未分类病毒科
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分类号
S85
[农业科学—兽医学]
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