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题名海南木豆丛枝植原体质粒全序列测定及分析
被引量：1
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作者
李玲婷
车海彦
曹学仁
杨毅
罗大全
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机构
中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室
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出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2014年第7期1404-1408,共5页
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基金
海南省自然科学基金(No.310069)
中国热带农业科学院环境与植物保护研究所引进人才科研启动基金项目(No.Hzs1004)
中央级科研院所基本科研业务费专项(No.2011hzs1J007,No.2012hzs1J001)
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文摘
提取木豆叶片基因组总DNA,通过克隆,测序木豆丛枝植原体海南株系质粒(pPPWB-Hn)的完整DNA序列,并使用生物信息学软件对该质粒全长序列进行分析。分析结果显示:pPPWB-Hn质粒全长4 218 bp,含有4个开放阅读框,分别编码Rep、dnaG、threonine synthase和未知蛋白。其中,Rep是2次跨膜蛋白,dnaG是单次跨膜蛋白,Rep和dnaG均与质粒自主复制有关。Rep和未知蛋白可能分布在细胞质中,dnaG可能定位到细胞膜上或膜外,Threonine synthase可能定位到线粒体膜上或线粒体内腔。系统进化树显示:pPPWB-Hn与植原体16SrⅡ组的pPNWB(AY270152),pTBBperi(DQ119297)及pTBBcap(DQ119296)处在同一进化分支。
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关键词
木豆丛枝植原体
质粒
序列分析
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Keywords
Pigeon pea witches＇-broom phytoplasma
Plasmid
Sequence analysis
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分类号
S432.42
[农业科学—植物病理学]
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