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芸芥木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶基因EsXTH1的cDNA克隆和生物信息学分析 被引量:6
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作者 陈姣荣 方彦 +2 位作者 孙万仓 令利军 姜海杨 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期131-136,共6页
为了解XTH(木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶)基因在芸芥自交亲和系突变体(self-compatibility,SC)和自交不亲和系(self-incompatibility,SI)育性调控中的作用,分别以芸芥野生型SI系和突变体SC为材料,取植株的全花cDNA为模板,采用mRNA差异... 为了解XTH(木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶)基因在芸芥自交亲和系突变体(self-compatibility,SC)和自交不亲和系(self-incompatibility,SI)育性调控中的作用,分别以芸芥野生型SI系和突变体SC为材料,取植株的全花cDNA为模板,采用mRNA差异显示技术(differential display reverse transcription PCR,DDRT-PCR)筛选差异片段,获得了芸芥XTH基因的全长cDNA(EsXTH1,1 074bp)。序列分析表明,EsXTH1的5'端和3'端非翻译区分别为36bp和180bp,包含1个858bp的开放阅读框,编码一条285个氨基酸残基组成的肽链;推导的EsXTH1蛋白序列含有XTH蛋白的活性部位DEIDFEFL;芸芥EsXTH1与其它植物的XTH蛋白具有较高的同源性,与拟南芥At-XTH6同源性最高(89.1%),与拟南芥AtXTH7、番茄SlXTH7及康乃馨DcXTH4的同源性分别为73%、73%及69%。分子进化树分析表明,EsXTH1与AtXTH7、SlXTH7、DcXTH4更近。EsXTH1具有木葡聚糖内糖基转移酶(xyloglucan endotran,XET)和水解酶(xyloglucan endohydrolase,XEH)的功能结构位点,N端有一个由23个氨基酸组成的信号肽。预测认为EsXTH1与蛋白质分泌相关,与芸芥自交亲和性的调控相关。 展开更多
关键词 芸芥 自交亲和系 木葡聚糖内基转移酶 水解酶 基因克隆 功能预测
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木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(XTH)研究进展
2
作者 王大鹏 吕鑫亿 +1 位作者 闫金国 黄姗 《花卉》 2021年第18期293-294,共2页
木葡聚糖(XG)作为双子叶植物初生细胞壁中最主要的半纤维素,一直是当代植物细胞模型研究中持续关注的焦点。木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)能够催化木葡聚糖分子水解或转移,对细胞壁木葡... 木葡聚糖(XG)作为双子叶植物初生细胞壁中最主要的半纤维素,一直是当代植物细胞模型研究中持续关注的焦点。木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)能够催化木葡聚糖分子水解或转移,对细胞壁木葡聚糖主链实现剪切或重排,在植物细胞壁伸展性方面发挥重要作用。本文就酶的结构基础、作用机制及在植物生长发育中的作用等方面进行综述,以期为后续的XTH基因产物的功能研究提供相关证据。 展开更多
关键词 木葡聚 木葡聚糖内基转移酶/水解酶(xth) 结构基础与作用机制
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棉花木葡聚糖转移/水解酶基因克隆和分析 被引量:1
3
作者 李先良 李居宁 +1 位作者 李傲 夏涛 《湖北农业科学》 2017年第4期756-761,共6页
为研究XTH基因与棉花(Gossypium spp.)纤维伸长的关系,克隆了两个XTH基因,分别命名为Gh XTH1(Gen Bank:AY189971)和Gh XTH2(Gen Bank:JN968478)。Gh XTH1编码区全长870 bp,编码289个氨基酸,Gh XTH1全长885 bp,编码294个氨基酸。序列分... 为研究XTH基因与棉花(Gossypium spp.)纤维伸长的关系,克隆了两个XTH基因,分别命名为Gh XTH1(Gen Bank:AY189971)和Gh XTH2(Gen Bank:JN968478)。Gh XTH1编码区全长870 bp,编码289个氨基酸,Gh XTH1全长885 bp,编码294个氨基酸。序列分析表明,Gh XTH1和Gh XTH2均存在XTH家族保守序列DEIDFEFLG。生物信息学分析表明,Gh XTH1和Gh XTH2均含有信号肽。跨膜结构预测表明,Gh XTH1和Gh XTH2均在N端存在跨膜螺旋。系统发生学分析表明,Gh XTH1与拟南芥XTH6、XTH7亲缘关系较近,Gh XTH2与拟南芥XTH9亲缘关系较近。半定量分析表明,Gh XTH1和Gh XTH2均随着棉花纤维发育表达量降低,Gh XTH2比Gh XTH1表达量高。 展开更多
关键词 棉花(Gossypium spp.)纤维 木葡聚转移/水解酶 克隆 表达分析 伸长
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成熟砂梨果实木葡聚糖转移酶基因PpXTH1的克隆及其在夏季货架期的表达规律 被引量:5
4
作者 丛郁 刘洪 +3 位作者 李慧 颜志梅 俞明亮 常有宏 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期143-151,共9页
木葡聚糖内糖基转移酶(XTH)通过降解细胞壁中半纤维的主要成分木葡聚糖在果实的软化过程中发挥重要作用。为探明XTH基因与砂梨品种翠冠果实软化之间的关系,本研究以翠冠果肉cDNA为模板,采用RT.PCR和RACE方法,克隆获得了编码砂梨XT... 木葡聚糖内糖基转移酶(XTH)通过降解细胞壁中半纤维的主要成分木葡聚糖在果实的软化过程中发挥重要作用。为探明XTH基因与砂梨品种翠冠果实软化之间的关系,本研究以翠冠果肉cDNA为模板,采用RT.PCR和RACE方法,克隆获得了编码砂梨XTH基因的全cDNA序列(PpXTH1,1300bp)。序列分析表明,PpXTH1的5’端和3’端非翻译区分别为125bp和293bp,它的开放阅读框为882bp,编码294个氨基酸,推导的PpXTHl蛋白序列含有XTH蛋白的催化活性部位DEIDFEFL。砂梨PpXTH1与其他植物果实中的XTH蛋白具有较高的同源性,其中与苹果MdXTH1的同源性为98.0%;与猕猴桃AdXTH5的同源性为85.0%;与番茄LeXTH4的同源性为67.6%。分子进化树分析表明,PpXTHX与MdXTHl、PeXTHl、AdXTH5、PtrXTH16A同分在一组,而这些XTH蛋白与果实成熟和细胞壁的次生结构代谢密切相关。在夏季货架期,28~32℃条件下,翠冠果肉中PpXTHI的表达量持续上升,贮藏8d时其表达量最高,之后缓慢下降,1-MCP对PpXTH1的表达起延缓作用。以上结果说明本研究所克隆的基因为砂梨XTH基因家族成员,在贮藏软化过程中它的表达受乙烯调节。 展开更多
关键词 砂梨 木葡聚糖内基转移酶(xth) 基因克隆 序列分析 表达特性
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毛白杨木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶PtoXTH35原核可溶性表达方法研究 被引量:1
5
作者 李钰华 李爽 盖颖 《江苏农业科学》 2019年第8期33-36,共4页
从毛白杨中克隆得到木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶PtoXTH35基因,根据SignalIP在线软件预测蛋白信号肽,并分别构建至pET28a、pET32a、pGEX-4t-1、pMAL-c5e、pET 43.1a等5种原核表达载体,经双酶切和测序验证后转化至BL21(DE3)感受态,使用终... 从毛白杨中克隆得到木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶PtoXTH35基因,根据SignalIP在线软件预测蛋白信号肽,并分别构建至pET28a、pET32a、pGEX-4t-1、pMAL-c5e、pET 43.1a等5种原核表达载体,经双酶切和测序验证后转化至BL21(DE3)感受态,使用终浓度为0.4 mmol/L的异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)诱导其表达目的蛋白。经SDS-PAGE检测,结果表明5种载体均可表达目的蛋白,pET28a、pET32a、pGEX-4t-1等3种载体所表达蛋白均以包涵体的形式存在,而pMAL-c5e和pET 43.1a载体携带蛋白表达量高并且所表达蛋白50%为可溶性蛋白,实现了毛白杨PtoXTH35在原核表达系统中的高效可溶性表达,该试验为后续进一步研究毛白杨PtoXTH35的体外功能奠定了基础。 展开更多
关键词 毛白杨 木葡聚糖内苷酶/水解酶 原核表达 包涵体 可溶性蛋白
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杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因(XET)的生物信息学分析 被引量:1
6
作者 赵慧 王遂 +4 位作者 刘笑平 林永红 王松波 宋双林 李开隆 《安徽农业科学》 CAS 2014年第34期12132-12136,共5页
[目的]通过生物信息学方法对杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因的DNA序列、蛋白质序列进行分析预测,为进一步研究奠定基础。[方法]以XET基因及其氨基酸序列为研究对象,利用多种网络数据库及生物信息学软件对其进行分析预测。[结果]该基... [目的]通过生物信息学方法对杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因的DNA序列、蛋白质序列进行分析预测,为进一步研究奠定基础。[方法]以XET基因及其氨基酸序列为研究对象,利用多种网络数据库及生物信息学软件对其进行分析预测。[结果]该基因编码290个氨基酸残基,相对分子质量33 672.0 D,理论等电点(p I)7.04;该酶可能存在3个卷曲结构部位、1个信号肽剪切位点和1个跨膜区,是典型的分泌蛋白;三级结构同源建模预测结果较好,二级结构预测中的螺旋、卷曲和折叠均可见。相似性比对和进化分析显示其与葡萄等的序列相似度较高;而蛋白质三级结构的预测则发现,该酶与几种杆菌的蛋白较接近。[结论]XET基因可能在很多生物中具有较高的保守性。 展开更多
关键词 杨树 木葡聚糖内基转移酶 生物信息学
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杨树PtoXTH34基因过表达提高烟草抗旱性 被引量:1
7
作者 郝玄瑞 姜妍 +1 位作者 王宇倩 盖颖 《北京林业大学学报》 北大核心 2025年第1期63-71,共9页
【目的】探究杨树木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶基因PtoXTH34在植物响应干旱胁迫过程中发挥的功能。【方法】将杨树PtoXTH34基因在烟草中异源表达,并进行干旱胁迫,分析过表达烟草表型以及光合作用、抗逆等指标的变化。【结果】(1)过表达Pto... 【目的】探究杨树木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶基因PtoXTH34在植物响应干旱胁迫过程中发挥的功能。【方法】将杨树PtoXTH34基因在烟草中异源表达,并进行干旱胁迫,分析过表达烟草表型以及光合作用、抗逆等指标的变化。【结果】(1)过表达PtoXTH34基因能够显著降低离体烟草叶片的失水率。(2)干旱处理14 d后,对照植株出现明显的枯萎现象,而过表达PtoXTH34烟草叶片生长良好,仍为绿色,且过表达PtoXTH34植株的株高和茎直径均显著高于对照植株。(3)干旱处理14 d后,对照植株的净光合速率、气孔导度和蒸腾速率均趋近于0,而过表达PtoXTH34烟草的各项光合指标均极其显著高于对照植株,且高于干旱处理前。(4)干旱处理14 d后,对照植株体内的H2O2和MDA含量均出现大幅上升,且显著高于过表达PtoXTH34植株,对照植株出现活性氧积累现象,且叶片损伤程度较大,而过表达PtoXTH34植株并未出现此现象。【结论】过表达PtoXTH34烟草通过降低叶片失水率,提升光合作用,清除活性氧积累,进而提高植株的抗旱性。本研究为揭示杨树PtoXTH34的基因功能奠定了基础,丰富了林木分子育种的基因资源。 展开更多
关键词 杨树 基因表达 木葡聚糖内苷酶/水解酶基因 抗旱性 光合作用 烟草
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红皮柳SpXTHs基因家族鉴定及表达分析
8
作者 胡志宝 荆烁 +4 位作者 林阳 申逸男 胡芳媛 张皓凯 王洪江 《林业与环境科学》 2025年第2期10-19,共10页
为进一步鉴定红皮柳Salix purpurea的SpXTHs基因家族的生物学功能,通过生物信息学方法从红皮柳基因组中鉴定了31个SpXTHs基因,并对该家族成员的理化性质、表达模式、进化等进行分析。通过系统发育分析,表明31个SpXTHs成员可分为4个进化... 为进一步鉴定红皮柳Salix purpurea的SpXTHs基因家族的生物学功能,通过生物信息学方法从红皮柳基因组中鉴定了31个SpXTHs基因,并对该家族成员的理化性质、表达模式、进化等进行分析。通过系统发育分析,表明31个SpXTHs成员可分为4个进化分枝,每个分枝内的基因具有相似的基因结构;通过分析SpXTHs家族成员的蛋白保守结构域,发现SpXTHs家族成员均含有Glyco_hydro_16和XET_C两个蛋白保守结构域,具有高度相似的保守基序;SpXTHs含有241~374个氨基酸残基,该蛋白家族成员长度及分子量有较大差异,相对分子质量约为27~42 kDa,等电点均为酸性。根据全基因组分析结果,SpXTHs基因经历了全基因组复制事件和片段重复事件。红皮柳与拟南芥Arabidopsis thaliana、甘蓝Brassica oleracea var.capitata和水稻Oryza sativa的比较同线图表明,红皮柳与拟南芥、甘蓝和水稻XTHs基因均具有同线关系。通过对SpXTHs基因启动子区域进行顺式作用元件预测,共鉴定出7种顺式作用元件。在3%NaCl溶液处理后,红皮柳根部共有包括SpXTH1、SpXTH5等7个基因高表达。该研究鉴定了红皮柳SpXTHs基因家族共计31个成员,并进行了生物信息学分析,为红皮柳SpXTHs蛋白功能的后续分子机制解析提供了实验数据支撑。 展开更多
关键词 红皮柳 木葡聚糖内转葡基酶/水解酶 生物信息学 表达特征
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海巴戟果实软化相关基因McXTH的克隆和表达分析 被引量:3
9
作者 李佳莹 宫树森 +2 位作者 秦英 金璨 吴田 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期94-102,共9页
【目的】了解诺丽果实软化规律,克隆木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)基因,初步明确其表达模式。【方法】用果实硬度计测量后熟阶段的诺丽果实在25℃放置及乙烯利处理两种状态下的硬度变化。从诺丽果实采后0~48 h转录组数据中筛选差异表... 【目的】了解诺丽果实软化规律,克隆木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)基因,初步明确其表达模式。【方法】用果实硬度计测量后熟阶段的诺丽果实在25℃放置及乙烯利处理两种状态下的硬度变化。从诺丽果实采后0~48 h转录组数据中筛选差异表达的XTH候选基因。通过生物信息学分析,克隆目的基因全长,并利用荧光定量PCR技术分析基因表达模式,同时用便携式乙烯测量仪测定内源乙烯释放量。【结果】后熟阶段的海巴戟果实采后表皮硬度随贮藏时间增加而下降,且乙烯利处理后的软化趋势较室温自然放置更为显著。从海巴戟果实采后0~48 h转录组数据中筛选出基因XTH(DN16278g1)的表达量高、差异大。该基因具有完整的开放阅读框(ORF),克隆测序后将其命名为McXTH,并将其提交Genbank获得登录号为ON512442。McXTH基因ORF全长1062 bp,共编码353个氨基酸,与其他植物中的XTH基因氨基酸序列的相似性为75%~88%。RT-qPCR结果和内源乙烯释放量表明,在海巴戟果实成熟阶段McXTH的表达量与同时期的内源乙烯释放量在趋势上大体相同。【结论】海巴戟果实的软化受乙烯和关键基因XTH调控,Mc XTH的克隆为进一步进行XTH基因在海巴戟果实成熟软化过程的功能研究夯实基础。 展开更多
关键词 海巴戟 木葡聚糖内苷酶/水解酶(xth) 果实软化 果实成熟 乙烯
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XTH家族基因在植物生长发育及胁迫响应中的研究进展
10
作者 刘林秀 吴雪莲 彭福田 《山东农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2024年第5期720-726,共7页
木葡聚糖内转糖基酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase, XTH)是参与植物细胞壁的重塑的关键酶之一,可以切割和重新连接木葡聚糖。许多物种中都已经鉴定出了XTH基因家族,发现其广泛参与植物生命周期各种生命活动的调节... 木葡聚糖内转糖基酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase, XTH)是参与植物细胞壁的重塑的关键酶之一,可以切割和重新连接木葡聚糖。许多物种中都已经鉴定出了XTH基因家族,发现其广泛参与植物生命周期各种生命活动的调节。因此,研究XTH基因家族对理解植物的生长发育有着重要的意义。在这里,我们综述了XTH家族基因在植物生长发育中的作用,主要包括参与植物根、茎、叶的生长,花器官的开放与脱落,果实的成熟与软化等;还讨论了XTHs在非生物胁迫和生物胁迫响应中的作用,为深入研究XTHs的功能和作用机制提供参考。 展开更多
关键词 细胞壁修饰酶 木葡聚糖内基酶/水解酶(xth) 生长发育 胁迫响应
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大丽花花瓣生长与衰老相关基因DpXTH的表达分析 被引量:3
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作者 孙悦 王蕾 +2 位作者 姬筱雅 郑必平 谈建中 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第7期28-31,共4页
为了研究木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(XTH)基因在大丽花花瓣生长和衰老过程中的功能,本试验以大丽花(Dahlia pinnata Cav)花瓣为材料,在克隆大丽花花瓣XTH基因cDNA序列(DpXTH)的基础上,以18S rRNA为内参基因,利用半定量RT-PCR技术,检... 为了研究木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(XTH)基因在大丽花花瓣生长和衰老过程中的功能,本试验以大丽花(Dahlia pinnata Cav)花瓣为材料,在克隆大丽花花瓣XTH基因cDNA序列(DpXTH)的基础上,以18S rRNA为内参基因,利用半定量RT-PCR技术,检测了大丽花花瓣生长与衰老过程中DpXTH基因的表达变化。结果显示,大丽花开花过程中DpXTH的表达量急剧增加,盛花期达到最大,而衰老期又迅速下降,表明DpXTH与花瓣的生长发育密切相关,可能在大丽花花瓣生长的不同阶段DpXTH对细胞壁中木葡聚糖的代谢具有不同的调控方式。 展开更多
关键词 大丽花 花瓣 生长 衰老 木葡聚糖内基转移酶/水解酶(xth) 基因表达
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辣椒基因组中XTH基因家族的鉴定与表达特征分析 被引量:6
12
作者 李宁 沈瑶 +3 位作者 夏碧波 梁关生 吴智明 刘海清 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期317-324,共8页
为全面了解木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)基因在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了所有辣椒XTH基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域等进行... 为全面了解木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)基因在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了所有辣椒XTH基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域等进行了预测,同时基于转录组数据集分析了XTH基因在辣椒不同器官、不同发育时期果实中的表达特征。结果表明,辣椒XTH家族包含23个基因成员,不均衡分布在除10号染色体外的其余11条染色体上;23个基因包含1~5个不等的内含子;系统进化分析表明,辣椒XTH蛋白可分为3个亚家族;基因表达特征分析显示,大多数辣椒XTH的表达具有组织特异性,CaXTH2、CaXTH21、CaXTH13和CaXTH23极有可能与辣椒果实的膨大与成熟相关。本研究为深入了解辣椒XTH基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 辣椒 木葡聚糖内苷酶/水解酶 基因表达 果实发育与成熟
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过表达胡杨XTH基因能够提高烟草抗旱性 被引量:5
13
作者 韩彦莎 仪慧兰 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期919-925,共7页
胡杨是典型的抗旱树种。挖掘和鉴定胡杨的耐旱基因对于提高植物抗旱性具有重要意义。木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)是植物细胞壁重构过程中的关键酶,在植物逆境胁迫响应中发挥重要作用。我们前期已从胡杨叶片中克隆了Pe XTH基因。... 胡杨是典型的抗旱树种。挖掘和鉴定胡杨的耐旱基因对于提高植物抗旱性具有重要意义。木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)是植物细胞壁重构过程中的关键酶,在植物逆境胁迫响应中发挥重要作用。我们前期已从胡杨叶片中克隆了Pe XTH基因。本文利用Real-time PCR检测Pe XTH基因在干旱胁迫下的表达水平。在此基础上,构建植物表达载体p MDC85-Pe XTH,通过农杆菌介导法将Pe XTH基因转入烟草,分析过表达Pe XTH基因烟草的抗旱性。研究发现,胡杨叶片中Pe XTH基因的表达受干旱胁迫诱导。干旱处理后,转Pe XTH基因烟草的萌发率明显高于野生型烟草;与野生型植株相比,转基因植株的叶片失水速率明显降低。干旱胁迫下,转基因烟草的气孔开度仅为野生型烟草的51.2%~53.6%。结果表明,过表达Pe XTH基因能够提高烟草的抗旱性。本研究丰富了对胡杨Pe XTH基因功能的认识,为植物抗旱分子育种提供了重要的基因资源。 展开更多
关键词 胡杨 木葡聚糖内苷酶/水解酶 烟草 抗旱性
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陆地棉XTH基因家族全基因组鉴定及在纤维发育过程的表达分析 被引量:4
14
作者 安亚茹 杨君 +3 位作者 刘正文 张桂寅 马峙英 王省芬 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1179-1192,共14页
本研究从陆地棉TM-1基因组中鉴定出72个XTH家族基因,编码木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH,xyloglucan endotransglycosylase/hydrolase),分别命名为Gh XTH01~Gh XTH72,分析了其基因结构、保守基序、系统进化、理化性质、亚细胞定位,并探... 本研究从陆地棉TM-1基因组中鉴定出72个XTH家族基因,编码木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH,xyloglucan endotransglycosylase/hydrolase),分别命名为Gh XTH01~Gh XTH72,分析了其基因结构、保守基序、系统进化、理化性质、亚细胞定位,并探究其在棉纤维发育不同时期的表达规律。结果表明,XTH家族基因分布在除At 07、Dt 07以外的24条棉花染色体上,根据系统发育树,将XTH家族基因分为3个亚组;XTH氨基酸序列有3个保守基序,保守性较强;多数XTH蛋白定位在细胞外。根据XTHs在纤维发育不同时期的表达量变化,将其分为4类。通过构建陆地棉与拟南芥XTH氨基酸序列进化树,推测Gh XTH15、Gh XTH28、Gh XTH36、Gh XTH49、Gh XTH59、Gh XTH62、Gh XTH63等基因在棉纤维发育过程中发挥重要作用。通过比较XTH家族基因在不同纤维品质陆地棉品种中的表达差异,推测在优质棉花品种中优势表达基因Gh XTH03、Gh XTH12、Gh XTH17、Gh XTH22、Gh XTH23、Gh XTH28、Gh XTH33、Gh XTH44、Gh XTH46、Gh XTH59等在纤维发育伸长过程中可能发挥着重要作用。上述结果为研究陆地棉XTH基因家族在棉纤维发育中的功能提供了参考依据。 展开更多
关键词 陆地棉 木葡聚糖内苷酶/水解酶家族 生物信息学分析 纤维发育 表达量
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荷花NnXTH6基因克隆、亚细胞定位及表达分析 被引量:1
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作者 翟允汝 王婉茹 +5 位作者 倪梦辉 贺丹 刘红利 张曼 孔德政 刘艺平 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2022年第4期599-610,共12页
【目的】明确荷花(Nelumbo nucifera)木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglycosy-lase/hydrolase,XTH)的基因结构特征及在荷花花瓣不同发育时期的表达差异情况。探究NnXTH6基因对荷花花瓣发育和衰老的调控功能,以期为研究... 【目的】明确荷花(Nelumbo nucifera)木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglycosy-lase/hydrolase,XTH)的基因结构特征及在荷花花瓣不同发育时期的表达差异情况。探究NnXTH6基因对荷花花瓣发育和衰老的调控功能,以期为研究荷花花瓣生长和衰老的分子机制奠定理论依据。【方法】在荷花花发育转录组数据分析的基础上,利用已获得的荷花XTH基因序列,通过RT-PCR方法从荷花重瓣品种‘晚霞’(Nelumbo nucifera‘Wan xia’)中克隆得到NnXTH6基因序列,对基因结构和所编码蛋白质的理化性质进行生物信息学分析,并通过分析其亚细胞定位情况,以及在荷花不同花发育时期花瓣中的表达差异情况初步揭示基因功能。【结果】荷花NnXTH6基因序列完整开放阅读框(ORF)为870 bp,编码289个氨基酸,理论等电点为6.38,预测其相对分子质量为33.18 kD。NnXTH6蛋白质定位在细胞质中,与其他物种同源XTH蛋白进行的序列对比及系统进化树分析结果显示,荷花NnXTH6蛋白与本源植物荷花(Nelumbo nucifera)XTH蛋白的同源性最高(84.08%),与沉水樟(Cinnamomum micranthum)和芝麻(Sesamum indicum)的亲缘关系更近。实时荧光定量PCR结果表明,NnXTH6基因在初花时期(IF)的表达量远远大于喧蕾时期(SB)的表达量,在转色时期(CC)表达量最低,并且在谢花时期(FW)显著下调。【结论】荷花NnXTH6基因的表达随荷花的花发育时期的不同而变化,推测NnXTH6很大程度上参与调控了荷花的开花和衰老过程。 展开更多
关键词 荷花 木葡聚糖内苷酶/水解酶 Nnxth6基因 基因克隆 表达分析
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拟南芥XTH33基因的CRISPR/Cas9高效敲除质粒构建
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作者 王大鹏 孔丽娜 +1 位作者 黄姗 闫金国 《花卉》 2021年第20期197-198,共2页
为解决XTH33基因高效敲除质粒的构建难题,本文对拟南芥CRISPR/Cas9高效敲除质粒的gRNA靶点进行研究,提出靶向拟南芥XTH33基因的gRNA经体外活性检测,可初步筛选高效高活性的gRNA,3条靶向拟南芥XTH33基因的gRNA,XTH33-G3敲除活性最高,达到... 为解决XTH33基因高效敲除质粒的构建难题,本文对拟南芥CRISPR/Cas9高效敲除质粒的gRNA靶点进行研究,提出靶向拟南芥XTH33基因的gRNA经体外活性检测,可初步筛选高效高活性的gRNA,3条靶向拟南芥XTH33基因的gRNA,XTH33-G3敲除活性最高,达到50%以上,将XTH33-G3靶点插入质粒骨架pUbi-atU6-gRNA,经测序鉴定成功构建载体pUbi-atU6-gRNA-XTH33。以期为进一步进行XTH33基因功能鉴定奠定基础。 展开更多
关键词 木葡聚糖内基转移酶/水解酶(xth) gRNA活性 CRISPR/Cas9质粒
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大白菜温度敏感雄性不育育性转化相关XET基因的电子克隆
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作者 张少丽 张鲁刚 +1 位作者 张明科 惠麦侠 《中国蔬菜》 北大核心 2010年第24期19-24,共6页
以从大白菜温敏雄性育性转化相关基因差异表达的分析中获得的EST-58为标签,采用电子克隆的方法对其进行延伸,并对电子克隆的结果进行RT-PCR验证,结果表明:电子克隆到1个由1197bp核苷酸组成的序列,该序列具有完整的开放阅读框架(ORF),编... 以从大白菜温敏雄性育性转化相关基因差异表达的分析中获得的EST-58为标签,采用电子克隆的方法对其进行延伸,并对电子克隆的结果进行RT-PCR验证,结果表明:电子克隆到1个由1197bp核苷酸组成的序列,该序列具有完整的开放阅读框架(ORF),编码蛋白为292个氨基酸。经RT-PCR扩增,连续样品间EST-58表达的带型变化趋势与cDNA-AFLP的差异显示情况一致,且RT-PCR获得的序列与电子克隆的序列一致性达98%。用该序列在GenBank数据库中进行blastX同源性分析,确定该序列为大白菜的XET基因(GenBank登陆号为EU579461)。 展开更多
关键词 大白菜 育性转化 木葡聚糖内基转移酶基因(XET) 电子克隆
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环糊精酶改性对淀粉结构及消化特性的影响 被引量:2
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作者 纪杭燕 金征宇 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期48-56,共9页
淀粉是人类主食的主要组分和能量供应的主要来源,提升淀粉的营养品质对人体健康具有重要价值。酶法改性具有高效、专一性强和符合清洁标签等优势,是提升淀粉品质的重要手段。作者研究了环糊精葡萄糖基转移酶(Cyclodextrin glucosyltrans... 淀粉是人类主食的主要组分和能量供应的主要来源,提升淀粉的营养品质对人体健康具有重要价值。酶法改性具有高效、专一性强和符合清洁标签等优势,是提升淀粉品质的重要手段。作者研究了环糊精葡萄糖基转移酶(Cyclodextrin glucosyltransferase,CGTase)和环糊精水解酶(Cyclodextrinase,CDase)对玉米淀粉的协同改性效果。分别采用CGTase单独添加、CGTase和CDase同时添加、CGTase和CDase顺序添加3种改性方式,并对改性后淀粉产物的结构以及消化性进行分析。结果表明,双酶改性使得产物中麦芽低聚糖比例显著提升,而对应的环糊精比例显著下降。经3种方式改性后淀粉结构发生明显解聚,DP 13~24、DP 25~36和DP> 37的链长比例下降,而DP <13的链长比例显著提升。此外,酶改性显著提升了抗性淀粉组分的含量。因此,CGTase和CDase双酶改性在提升淀粉营养品质中具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 环糊精葡萄基转移酶 环糊精水解酶 淀粉结构 低聚 淀粉消化
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