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芸芥木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶基因EsXTH1的cDNA克隆和生物信息学分析 被引量：6
1
作者 陈姣荣 方彦 +2 位作者 孙万仓 令利军 姜海杨 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期131-136,共6页
为了解XTH(木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶)基因在芸芥自交亲和系突变体(self-compatibility,SC)和自交不亲和系(self-incompatibility,SI)育性调控中的作用,分别以芸芥野生型SI系和突变体SC为材料,取植株的全花cDNA为模板,采用mRNA差异... 为了解XTH(木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶)基因在芸芥自交亲和系突变体(self-compatibility,SC)和自交不亲和系(self-incompatibility,SI)育性调控中的作用,分别以芸芥野生型SI系和突变体SC为材料,取植株的全花cDNA为模板,采用mRNA差异显示技术(differential display reverse transcription PCR,DDRT-PCR)筛选差异片段,获得了芸芥XTH基因的全长cDNA(EsXTH1,1 074bp)。序列分析表明,EsXTH1的5'端和3'端非翻译区分别为36bp和180bp,包含1个858bp的开放阅读框,编码一条285个氨基酸残基组成的肽链;推导的EsXTH1蛋白序列含有XTH蛋白的活性部位DEIDFEFL;芸芥EsXTH1与其它植物的XTH蛋白具有较高的同源性,与拟南芥At-XTH6同源性最高(89.1%),与拟南芥AtXTH7、番茄SlXTH7及康乃馨DcXTH4的同源性分别为73%、73%及69%。分子进化树分析表明,EsXTH1与AtXTH7、SlXTH7、DcXTH4更近。EsXTH1具有木葡聚糖内糖基转移酶(xyloglucan endotran,XET)和水解酶(xyloglucan endohydrolase,XEH)的功能结构位点,N端有一个由23个氨基酸组成的信号肽。预测认为EsXTH1与蛋白质分泌相关,与芸芥自交亲和性的调控相关。 展开更多
关键词 芸芥 自交亲和系 木葡聚糖内糖基转移酶 水解酶 基因克隆 功能预测
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成熟砂梨果实木葡聚糖转移酶基因PpXTH1的克隆及其在夏季货架期的表达规律 被引量：5
2
作者 丛郁 刘洪 +3 位作者 李慧 颜志梅 俞明亮 常有宏 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期143-151,共9页
木葡聚糖内糖基转移酶（XTH）通过降解细胞壁中半纤维的主要成分木葡聚糖在果实的软化过程中发挥重要作用。为探明XTH基因与砂梨品种翠冠果实软化之间的关系，本研究以翠冠果肉cDNA为模板，采用RT．PCR和RACE方法，克隆获得了编码砂梨XT... 木葡聚糖内糖基转移酶（XTH）通过降解细胞壁中半纤维的主要成分木葡聚糖在果实的软化过程中发挥重要作用。为探明XTH基因与砂梨品种翠冠果实软化之间的关系，本研究以翠冠果肉cDNA为模板，采用RT．PCR和RACE方法，克隆获得了编码砂梨XTH基因的全cDNA序列（PpXTH1，1300bp）。序列分析表明，PpXTH1的5’端和3’端非翻译区分别为125bp和293bp，它的开放阅读框为882bp，编码294个氨基酸，推导的PpXTHl蛋白序列含有XTH蛋白的催化活性部位DEIDFEFL。砂梨PpXTH1与其他植物果实中的XTH蛋白具有较高的同源性，其中与苹果MdXTH1的同源性为98．0％；与猕猴桃AdXTH5的同源性为85．0％；与番茄LeXTH4的同源性为67．6％。分子进化树分析表明，PpXTHX与MdXTHl、PeXTHl、AdXTH5、PtrXTH16A同分在一组，而这些XTH蛋白与果实成熟和细胞壁的次生结构代谢密切相关。在夏季货架期，28～32℃条件下，翠冠果肉中PpXTHI的表达量持续上升，贮藏8d时其表达量最高，之后缓慢下降，1-MCP对PpXTH1的表达起延缓作用。以上结果说明本研究所克隆的基因为砂梨XTH基因家族成员，在贮藏软化过程中它的表达受乙烯调节。 展开更多
关键词 砂梨 木葡聚糖内糖基转移酶(xth) 基因克隆 序列分析 表达特性
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杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因(XET)的生物信息学分析 被引量：1
3
作者 赵慧 王遂 +4 位作者 刘笑平 林永红 王松波 宋双林 李开隆 《安徽农业科学》 CAS 2014年第34期12132-12136,共5页
[目的]通过生物信息学方法对杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因的DNA序列、蛋白质序列进行分析预测,为进一步研究奠定基础。[方法]以XET基因及其氨基酸序列为研究对象,利用多种网络数据库及生物信息学软件对其进行分析预测。[结果]该基... [目的]通过生物信息学方法对杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因的DNA序列、蛋白质序列进行分析预测,为进一步研究奠定基础。[方法]以XET基因及其氨基酸序列为研究对象,利用多种网络数据库及生物信息学软件对其进行分析预测。[结果]该基因编码290个氨基酸残基,相对分子质量33 672.0 D,理论等电点(p I)7.04;该酶可能存在3个卷曲结构部位、1个信号肽剪切位点和1个跨膜区,是典型的分泌蛋白;三级结构同源建模预测结果较好,二级结构预测中的螺旋、卷曲和折叠均可见。相似性比对和进化分析显示其与葡萄等的序列相似度较高;而蛋白质三级结构的预测则发现,该酶与几种杆菌的蛋白较接近。[结论]XET基因可能在很多生物中具有较高的保守性。 展开更多
关键词 杨树 木葡聚糖内糖基转移酶 生物信息学
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木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(XTH)研究进展
4
作者 王大鹏 吕鑫亿 +1 位作者 闫金国 黄姗 《花卉》 2021年第18期293-294,共2页
木葡聚糖(XG)作为双子叶植物初生细胞壁中最主要的半纤维素,一直是当代植物细胞模型研究中持续关注的焦点。木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)能够催化木葡聚糖分子水解或转移,对细胞壁木葡... 木葡聚糖(XG)作为双子叶植物初生细胞壁中最主要的半纤维素,一直是当代植物细胞模型研究中持续关注的焦点。木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)能够催化木葡聚糖分子水解或转移,对细胞壁木葡聚糖主链实现剪切或重排,在植物细胞壁伸展性方面发挥重要作用。本文就酶的结构基础、作用机制及在植物生长发育中的作用等方面进行综述,以期为后续的XTH基因产物的功能研究提供相关证据。 展开更多
关键词 木葡聚糖 木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(xth) 结构基础与作用机制
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海巴戟果实软化相关基因McXTH的克隆和表达分析 被引量：3
5
作者 李佳莹 宫树森 +2 位作者 秦英 金璨 吴田 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期94-102,共9页
【目的】了解诺丽果实软化规律,克隆木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)基因,初步明确其表达模式。【方法】用果实硬度计测量后熟阶段的诺丽果实在25℃放置及乙烯利处理两种状态下的硬度变化。从诺丽果实采后0~48 h转录组数据中筛选差异表... 【目的】了解诺丽果实软化规律,克隆木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)基因,初步明确其表达模式。【方法】用果实硬度计测量后熟阶段的诺丽果实在25℃放置及乙烯利处理两种状态下的硬度变化。从诺丽果实采后0~48 h转录组数据中筛选差异表达的XTH候选基因。通过生物信息学分析,克隆目的基因全长,并利用荧光定量PCR技术分析基因表达模式,同时用便携式乙烯测量仪测定内源乙烯释放量。【结果】后熟阶段的海巴戟果实采后表皮硬度随贮藏时间增加而下降,且乙烯利处理后的软化趋势较室温自然放置更为显著。从海巴戟果实采后0~48 h转录组数据中筛选出基因XTH(DN16278g1)的表达量高、差异大。该基因具有完整的开放阅读框(ORF),克隆测序后将其命名为McXTH,并将其提交Genbank获得登录号为ON512442。McXTH基因ORF全长1062 bp,共编码353个氨基酸,与其他植物中的XTH基因氨基酸序列的相似性为75%~88%。RT-qPCR结果和内源乙烯释放量表明,在海巴戟果实成熟阶段McXTH的表达量与同时期的内源乙烯释放量在趋势上大体相同。【结论】海巴戟果实的软化受乙烯和关键基因XTH调控,Mc XTH的克隆为进一步进行XTH基因在海巴戟果实成熟软化过程的功能研究夯实基础。 展开更多
关键词 海巴戟 木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xth) 果实软化 果实成熟 乙烯
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XTH家族基因在植物生长发育及胁迫响应中的研究进展
6
作者 刘林秀 吴雪莲 彭福田 《山东农业大学学报（自然科学版）》 北大核心 2024年第5期720-726,共7页
木葡聚糖内转糖基酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase, XTH)是参与植物细胞壁的重塑的关键酶之一,可以切割和重新连接木葡聚糖。许多物种中都已经鉴定出了XTH基因家族,发现其广泛参与植物生命周期各种生命活动的调节... 木葡聚糖内转糖基酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase, XTH)是参与植物细胞壁的重塑的关键酶之一,可以切割和重新连接木葡聚糖。许多物种中都已经鉴定出了XTH基因家族,发现其广泛参与植物生命周期各种生命活动的调节。因此,研究XTH基因家族对理解植物的生长发育有着重要的意义。在这里,我们综述了XTH家族基因在植物生长发育中的作用,主要包括参与植物根、茎、叶的生长,花器官的开放与脱落,果实的成熟与软化等;还讨论了XTHs在非生物胁迫和生物胁迫响应中的作用,为深入研究XTHs的功能和作用机制提供参考。 展开更多
关键词 细胞壁修饰酶 木葡聚糖内转糖基酶/水解酶(xth) 生长发育 胁迫响应
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大丽花花瓣生长与衰老相关基因DpXTH的表达分析 被引量：3
7
作者 孙悦 王蕾 +2 位作者 姬筱雅 郑必平 谈建中 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第7期28-31,共4页
为了研究木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(XTH)基因在大丽花花瓣生长和衰老过程中的功能,本试验以大丽花(Dahlia pinnata Cav)花瓣为材料,在克隆大丽花花瓣XTH基因cDNA序列(DpXTH)的基础上,以18S rRNA为内参基因,利用半定量RT-PCR技术,检... 为了研究木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(XTH)基因在大丽花花瓣生长和衰老过程中的功能,本试验以大丽花(Dahlia pinnata Cav)花瓣为材料,在克隆大丽花花瓣XTH基因cDNA序列(DpXTH)的基础上,以18S rRNA为内参基因,利用半定量RT-PCR技术,检测了大丽花花瓣生长与衰老过程中DpXTH基因的表达变化。结果显示,大丽花开花过程中DpXTH的表达量急剧增加,盛花期达到最大,而衰老期又迅速下降,表明DpXTH与花瓣的生长发育密切相关,可能在大丽花花瓣生长的不同阶段DpXTH对细胞壁中木葡聚糖的代谢具有不同的调控方式。 展开更多
关键词 大丽花 花瓣 生长 衰老 木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(xth) 基因表达
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拟南芥XTH33基因的CRISPR/Cas9高效敲除质粒构建
8
作者 王大鹏 孔丽娜 +1 位作者 黄姗 闫金国 《花卉》 2021年第20期197-198,共2页
为解决XTH33基因高效敲除质粒的构建难题,本文对拟南芥CRISPR/Cas9高效敲除质粒的gRNA靶点进行研究,提出靶向拟南芥XTH33基因的gRNA经体外活性检测,可初步筛选高效高活性的gRNA,3条靶向拟南芥XTH33基因的gRNA,XTH33-G3敲除活性最高,达到... 为解决XTH33基因高效敲除质粒的构建难题,本文对拟南芥CRISPR/Cas9高效敲除质粒的gRNA靶点进行研究,提出靶向拟南芥XTH33基因的gRNA经体外活性检测,可初步筛选高效高活性的gRNA,3条靶向拟南芥XTH33基因的gRNA,XTH33-G3敲除活性最高,达到50%以上,将XTH33-G3靶点插入质粒骨架pUbi-atU6-gRNA,经测序鉴定成功构建载体pUbi-atU6-gRNA-XTH33。以期为进一步进行XTH33基因功能鉴定奠定基础。 展开更多
关键词 木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(xth) gRNA活性 CRISPR/Cas9质粒
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大白菜温度敏感雄性不育育性转化相关XET基因的电子克隆
9
作者 张少丽 张鲁刚 +1 位作者 张明科 惠麦侠 《中国蔬菜》 北大核心 2010年第24期19-24,共6页
以从大白菜温敏雄性育性转化相关基因差异表达的分析中获得的EST-58为标签,采用电子克隆的方法对其进行延伸,并对电子克隆的结果进行RT-PCR验证,结果表明:电子克隆到1个由1197bp核苷酸组成的序列,该序列具有完整的开放阅读框架(ORF),编... 以从大白菜温敏雄性育性转化相关基因差异表达的分析中获得的EST-58为标签,采用电子克隆的方法对其进行延伸,并对电子克隆的结果进行RT-PCR验证,结果表明:电子克隆到1个由1197bp核苷酸组成的序列,该序列具有完整的开放阅读框架(ORF),编码蛋白为292个氨基酸。经RT-PCR扩增,连续样品间EST-58表达的带型变化趋势与cDNA-AFLP的差异显示情况一致,且RT-PCR获得的序列与电子克隆的序列一致性达98%。用该序列在GenBank数据库中进行blastX同源性分析,确定该序列为大白菜的XET基因(GenBank登陆号为EU579461)。 展开更多
关键词 大白菜 育性转化 木葡聚糖内糖基转移酶基因(XET) 电子克隆
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