传统的群体细胞研究掩盖了个体细胞间的异质性,而单细胞组学以全新的研究视角揭示了细胞多样性及其关联的分子机制,为精准解析复杂生物过程提供了重要支持。针对蛋白质组常规前处理方法中难以避免的样本损失,本研究利用有源矩阵数字微...传统的群体细胞研究掩盖了个体细胞间的异质性,而单细胞组学以全新的研究视角揭示了细胞多样性及其关联的分子机制,为精准解析复杂生物过程提供了重要支持。针对蛋白质组常规前处理方法中难以避免的样本损失,本研究利用有源矩阵数字微流控芯片(active-matrix digital microfluidic, AM-DMF)构建了可操控纳升级液滴反应容器的单细胞蛋白质组集成样品处理平台,并结合timsTOF Pro 2质谱仪,开发了低损失、高灵敏的单细胞蛋白质组分析新策略。结果表明,采用AM-DMF平台和数据非依赖性采集(DIA)可从单个HeLa细胞中平均鉴定出近3 000种蛋白质,相较于其他样品前处理方法,鉴定深度增加了58%,且定量结果具有较高的重复性,该方法的稳定性和一致性较好。同时,该策略在单细胞层面实现了HeLa、A549和HepG2三种肿瘤细胞系的有效区分,证明了其在揭示单细胞异质性和解析复杂生物学问题方面的应用潜力。展开更多
文摘传统的群体细胞研究掩盖了个体细胞间的异质性,而单细胞组学以全新的研究视角揭示了细胞多样性及其关联的分子机制,为精准解析复杂生物过程提供了重要支持。针对蛋白质组常规前处理方法中难以避免的样本损失,本研究利用有源矩阵数字微流控芯片(active-matrix digital microfluidic, AM-DMF)构建了可操控纳升级液滴反应容器的单细胞蛋白质组集成样品处理平台,并结合timsTOF Pro 2质谱仪,开发了低损失、高灵敏的单细胞蛋白质组分析新策略。结果表明,采用AM-DMF平台和数据非依赖性采集(DIA)可从单个HeLa细胞中平均鉴定出近3 000种蛋白质,相较于其他样品前处理方法,鉴定深度增加了58%,且定量结果具有较高的重复性,该方法的稳定性和一致性较好。同时,该策略在单细胞层面实现了HeLa、A549和HepG2三种肿瘤细胞系的有效区分,证明了其在揭示单细胞异质性和解析复杂生物学问题方面的应用潜力。
