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题名最短尾短体线虫转录组及潜在效应蛋白分析
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作者
扈丽丽
林柏荣
王宏洪
陈建松
廖金铃
卓侃
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机构
广东省森林培育与保护利用重点实验室
华南农业大学植物线虫研究室
广东省微生物信号与病害防治重点实验室
广东生态工程职业学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期254-266,共13页
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基金
国家自然科学基金项目(31401716,31772136,31672007)。
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文摘
最短尾短体线虫(Pratylenchus brachyurus)是一种重要的迁移性内寄生植物病原线虫。对其转录组进行测序和分析,是进一步研究其寄生特点和致病机理的重要基础。通过转录组测序和分析,得到72516个unigenes,其中38266个(52.76%)unigenes注释到7个蛋白质数据库中。Cazyme分析预测到541条具有植物/真菌细胞壁降解活性的蛋白质序列,分别属于GH5、GH30、GH53、GH28、PL3、GH16、GH18和GH20家族。转录组中有56个蛋白序列与秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)的RNAi通路蛋白具有同源性。鉴定到51个与已知植物寄生线虫效应蛋白具有同源性的蛋白序列,检测了9个潜在效应蛋白在抑制植物防卫反应中的作用,其中7个能够抑制由Gpa2/Rbp-1引起的细胞程序性死亡反应。研究结果表明最短尾短体线虫转录组与同属的短体线虫基因分布特点相似,其潜在效应蛋白具有抑制植物防卫反应的特点。
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关键词
最短尾短体线虫
转录组
效应蛋白
细胞程序性死亡
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Keywords
Pratylenchus brachyurus
transcriptome
effector
programmed cell death
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分类号
S432.45
[农业科学—植物病理学]
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题名环介导等温扩增法(LAMP)检测最短尾短体线虫
被引量：4
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作者
刘星彤
林柏荣
廖金铃
卓侃
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机构
华南农业大学农学院
洛阳科技职业学院
广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室
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出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期17-24,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(31471750)
广东省林业科技创新专项(2015KJCX045)
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文摘
为了快速、简便、准确地检测重要植物病原线虫—最短尾短体线虫(Pratylenchus brachyurus),依据GenBank中短体线虫的线粒体DNA细胞色素氧化酶I(mtDNA COI)序列,设计了扩增最短尾短体线虫的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)引物,并对LAMP反应条件进行优化,成功建立了一种可特异、快速检测最短尾短体线虫的LAMP体系。该体系在64℃下反应60min,扩增效率最高。用琼脂糖凝胶电泳、酶切分析和SYBR Green Ⅰ染色均能特异检测到最短尾短体线虫的扩增产物。所建立的LAMP体系能从供试的9种短体线虫和另外10种植物线虫中特异检测出最短尾短体线虫,其灵敏度可检测到1/200条线虫DNA,是常规PCR的10倍。表明本研究建立的最短尾短体线虫的LAMP检测体系,可用于最短尾短体线虫的快速检测。
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关键词
最短尾短体线虫
环介导等温扩增
线粒体DNA细胞色素氧化酶I
快速检测
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Keywords
Pratylenchus brachyurus
loop-mediated isothermal amplification(LAMP)
mtDNA COI
rapid detection
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分类号
S432.45
[农业科学—植物病理学]
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题名寄生台湾春兰的短体线虫种类鉴定
被引量：7
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作者
章淑玲
王宏毅
金亮
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机构
福建农业职业技术学院园艺园林系
厦门出入境检验检疫局
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出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2013年第12期2463-2466,共4页
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文摘
厦门国际邮轮港口岸检疫部门在检验1批来自台湾的春兰(Cymbidium goeringii)花苗时,发现部分花苗根部腐烂。经分离检验和组织染色,从中发现1个形态特征一致的寄生线虫种群。该线虫经进一步形态学观察和测量,鉴定为最短尾短体线虫(Pratylenchus brachyurus)。此种线虫寄主范围广、危害大,是我国对外公布的检疫性有害生物。春兰是最短尾短体线虫新纪录寄主。
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关键词
新纪录寄主
春兰
最短尾短体线虫
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Keywords
New host record
Cymbidium goeringii
Pratylenchus brachyurus
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分类号
S432.4
[农业科学—植物病理学]
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题名地稔根际根腐线虫的形态和分子鉴定
被引量：4
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作者
王宏洪
黄少彬
杨晓朱
廖金铃
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机构
广东生态工程职业学院
华南农业大学
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出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2018年第9期1820-1826,共7页
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基金
广东省林业科技创新专项资金项目"广东省园林植物线虫检测与防控技术研究"(No.2015KJCX045)
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文摘
2013—2016年,广东和广西植物线虫种类调查期间,从地稔(Melastomadodecandnun)根部和根际土壤中分离到一种根腐线虫。经形态学观察、rDNA(LSUD2D3和ITS)序列分析和系统发育分析,将其鉴定为最短尾短体线虫(Pratylenchus brachyurus)。最短尾短体线虫是全球最重要的11种根腐线虫之一。地稔是最短尾短体线虫的新寄主。地稔根际线虫类群调查与鉴定,可为地稔线虫病害的发生与控制提供数据基础。
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关键词
地稔
最短尾短体线虫
根腐线虫
形态学
新寄主
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Keywords
Melastoma dodecandrum
Pratylenchus brachyurus
root-lesion nematode
morphology
new host record
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分类号
S432
[农业科学—植物病理学]
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