根据哈尔滨地区豇豆感病植株的症状，初步鉴定感染豇豆的病毒为菜豆普通花叶病毒（Bean common mosaic， virus,SCMV）。利用马铃薯Y病毒属通用引物扩增出病毒基因组3’末端序列，经BLAST检索表明该病毒为BCMV，将该序列与GenBank上的21...根据哈尔滨地区豇豆感病植株的症状，初步鉴定感染豇豆的病毒为菜豆普通花叶病毒（Bean common mosaic， virus,SCMV）。利用马铃薯Y病毒属通用引物扩增出病毒基因组3’末端序列，经BLAST检索表明该病毒为BCMV，将该序列与GenBank上的21个BCMV分离物的3＇末端序列进行比较，显示其核苷酸序列与其他分离物的序列同源性为91.7％-97.3％。系统进化分析显示不同分离物可聚为5个类群，并显示出一定的寄主相关性。哈尔滨分离物BCMV-X与2个浙江分离物、1个澳大利亚分离物聚为一支，且该4株分离物的寄主均为豇豆。RNA二级结构分析显示BCMV基因组3’末端非编码区形成4个茎环结构，不同分离物的序列变化并未引起茎环结构的明显变化。展开更多
为确定从江苏省农科院蔬菜所温室大棚所采集到的表现花叶、皱缩、明脉症状的绿豆植株是由何种病毒引起的,采取了透射电子显微镜观察、RT-PCR、序列测序以及酶联免疫吸附法(ELISA)等方法进行鉴定。结果表明,在透射电镜下可观察到风轮状...为确定从江苏省农科院蔬菜所温室大棚所采集到的表现花叶、皱缩、明脉症状的绿豆植株是由何种病毒引起的,采取了透射电子显微镜观察、RT-PCR、序列测序以及酶联免疫吸附法(ELISA)等方法进行鉴定。结果表明,在透射电镜下可观察到风轮状、束状病毒内含体,与Potyvirus属病毒粒子形态一致;对所提取的病样总RNA使用Potyvirus通用引物进行RT-PCR扩增,得到由1 082个核苷酸组成的序列,包含编码228个氨基酸的完整cp基因,产物通过NCBI比对,发现和已报道的菜豆普通花叶病毒(Bean common mosaic virus,BCMV)HB分离物同源性高达95%,初步判定该病原为菜豆普通花叶病毒(BCMV),命名为BCMV-JAAS分离物;通过扩增得到的cp基因,构建系统发育树,表明BCMV-JAAS与BCMV的其他中国分离物亲缘关系较近;通过ELISA检测,进一步确定是由菜豆普通花叶病毒(BCMV)感染引起的绿豆病毒病,这是我国第一次在绿豆上发现菜豆普通花叶病毒。展开更多
研究烟草病害预测方法,可提前预警病害的发生,为制定综合治理方案以及农药合理施用方案等提供有效指导.研究首先引入非线性关联测度方法(Maximal information coefficient,MIC),并以此筛选与烟草普通花叶病毒病相关的气象因子;进一步以...研究烟草病害预测方法,可提前预警病害的发生,为制定综合治理方案以及农药合理施用方案等提供有效指导.研究首先引入非线性关联测度方法(Maximal information coefficient,MIC),并以此筛选与烟草普通花叶病毒病相关的气象因子;进一步以支持向量机(Support Vector Machine,SVM)多轮末位汰选进行自变量精细筛选;然后以地统计学(Geostatistics,GS)确定公用变程;对每一个预测样本都从训练集中找出距离小于公用变程的k个近邻,以SVR训练建模完成个体化预测.结果表明:基于k近邻的预测模型独立测试结果明显优于基于全部训练样本参与的预测模型的独立测试精度,且基于私有最近邻样本的个性化预测模型结果最优.展开更多
文摘根据哈尔滨地区豇豆感病植株的症状，初步鉴定感染豇豆的病毒为菜豆普通花叶病毒（Bean common mosaic， virus,SCMV）。利用马铃薯Y病毒属通用引物扩增出病毒基因组3’末端序列，经BLAST检索表明该病毒为BCMV，将该序列与GenBank上的21个BCMV分离物的3＇末端序列进行比较，显示其核苷酸序列与其他分离物的序列同源性为91.7％-97.3％。系统进化分析显示不同分离物可聚为5个类群，并显示出一定的寄主相关性。哈尔滨分离物BCMV-X与2个浙江分离物、1个澳大利亚分离物聚为一支，且该4株分离物的寄主均为豇豆。RNA二级结构分析显示BCMV基因组3’末端非编码区形成4个茎环结构，不同分离物的序列变化并未引起茎环结构的明显变化。
文摘为确定从江苏省农科院蔬菜所温室大棚所采集到的表现花叶、皱缩、明脉症状的绿豆植株是由何种病毒引起的,采取了透射电子显微镜观察、RT-PCR、序列测序以及酶联免疫吸附法(ELISA)等方法进行鉴定。结果表明,在透射电镜下可观察到风轮状、束状病毒内含体,与Potyvirus属病毒粒子形态一致;对所提取的病样总RNA使用Potyvirus通用引物进行RT-PCR扩增,得到由1 082个核苷酸组成的序列,包含编码228个氨基酸的完整cp基因,产物通过NCBI比对,发现和已报道的菜豆普通花叶病毒(Bean common mosaic virus,BCMV)HB分离物同源性高达95%,初步判定该病原为菜豆普通花叶病毒(BCMV),命名为BCMV-JAAS分离物;通过扩增得到的cp基因,构建系统发育树,表明BCMV-JAAS与BCMV的其他中国分离物亲缘关系较近;通过ELISA检测,进一步确定是由菜豆普通花叶病毒(BCMV)感染引起的绿豆病毒病,这是我国第一次在绿豆上发现菜豆普通花叶病毒。
文摘研究烟草病害预测方法,可提前预警病害的发生,为制定综合治理方案以及农药合理施用方案等提供有效指导.研究首先引入非线性关联测度方法(Maximal information coefficient,MIC),并以此筛选与烟草普通花叶病毒病相关的气象因子;进一步以支持向量机(Support Vector Machine,SVM)多轮末位汰选进行自变量精细筛选;然后以地统计学(Geostatistics,GS)确定公用变程;对每一个预测样本都从训练集中找出距离小于公用变程的k个近邻,以SVR训练建模完成个体化预测.结果表明:基于k近邻的预测模型独立测试结果明显优于基于全部训练样本参与的预测模型的独立测试精度,且基于私有最近邻样本的个性化预测模型结果最优.
