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春性甘蓝型油菜FCA同源基因可变剪接体的克隆及表达研究
被引量:
4
1
作者
张生萍
罗玉秀
+7 位作者
杜德志
罗春燕
马小岗
赵志刚
许唱唱
张红生
吴鹏
晁文俊
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2016年第4期64-72,80,共10页
【目的】克隆特早熟春性甘蓝型油菜的FCA同源基因(sBnFCA)及其可变剪接体,并分析该基因的表达模式。【方法】根据拟南芥和芸薹属植物FCA基因的DNA序列和cDNA序列设计引物,用PCR和RT-PCR技术克隆特早熟春性甘蓝型油菜"86号"的...
【目的】克隆特早熟春性甘蓝型油菜的FCA同源基因(sBnFCA)及其可变剪接体,并分析该基因的表达模式。【方法】根据拟南芥和芸薹属植物FCA基因的DNA序列和cDNA序列设计引物,用PCR和RT-PCR技术克隆特早熟春性甘蓝型油菜"86号"的FCA同源基因(sBnFCA)及其可变剪接体,对克隆基因及编码蛋白序列进行生物信息学分析,构建系统进化树,并用qRT-PCR技术检测sBnFCA基因在不同发育时期根、茎、叶、茎尖中的表达量。【结果】克隆出了sBnFCA基因的全长序列(8 827bp),得到了sBnFCA-γ可变剪接体及一个新的可变剪接体(sBnFCA-5),新的可变剪接体在GenBank中的登录号为KJ701579.1。sBnFCA-5剪接体的CDS全长1 986bp,编码662个氨基酸残基,其推导的氨基酸序列具有2个保守的RRM结构域和1个WW结构域。生物信息学分析显示,sBnFCA-5与已报道甘蓝型油菜BnFCA-γ(AF414188.1)的相似性达99%,与拟南芥FCA-γ的相似性达87%。sBnFCA-5比sBnFCA-γ少了172个碱基序列,是一个跨外显子剪接体。sBnFCA蛋白相对分子质量和理论等电点分别为72.5ku和9.2。基因表达模式分析显示,sBnFCA-γ和sBnFCA-5在苗期、蕾期、花期的根、茎、叶和茎尖组织中都有表达,sBnFCA-γ在蕾期茎尖和花期叶片中表达量较高,sBnFCA-5在蕾期茎尖和花期叶片中表达量极高。【结论】克隆的sBnFCA-5为甘蓝型油菜sBnFCA基因的一个新的可变剪接体,该基因在春性特早熟甘蓝型油菜开花调控中可能有着重要的调节作用。
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关键词
春性甘蓝型油菜
基因克隆
FCA同源基因
可变剪接
自主开花途径
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职称材料
春性甘蓝型油菜小孢子培养技术研究
被引量:
5
2
作者
星晓蓉
杜德志
李秀萍
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期114-118,共5页
对一批春性甘蓝型油菜(Brassica napus)杂种F1及其亲本进行小孢子培养的结果表明,不同组合(基因型)出胚率差异比较大,2006年22份材料(基因型)中有21份出胚,其中40.91%的材料每蕾出胚数在5个以上,31.82%的材料每蕾出胚数在10个以上;杂交...
对一批春性甘蓝型油菜(Brassica napus)杂种F1及其亲本进行小孢子培养的结果表明,不同组合(基因型)出胚率差异比较大,2006年22份材料(基因型)中有21份出胚,其中40.91%的材料每蕾出胚数在5个以上,31.82%的材料每蕾出胚数在10个以上;杂交组合的出胚率大部分高于其亲本,主枝的产胚率绝大部分都高于其分枝;秋水仙碱不同处理中以0.6 g/L浓度处理5.0 h和3.4 g/L浓度处理1.5 h,植株成活率和加倍率最高;经秋水仙碱加倍后可育的植株大部分花粉活力较高,结实指数较高;而半可育的植株花粉活力低,并有50%的植株结实指数低于1。
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关键词
春性甘蓝型油菜
小孢子培养
出胚率
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职称材料
特早熟春性甘蓝型油菜sBnFLD基因的克隆及表达
被引量:
3
3
作者
罗玉秀
张生萍
+2 位作者
许唱唱
马小岗
杜德志
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2016年第11期90-96,共7页
【目的】克隆特早熟春性甘蓝型油菜A基因组上的sBnFLD基因,并对其进行表达研究,为该基因的功能及其在成花转变中的作用研究奠定基础。【方法】根据GenBank中已报道的拟南芥和白菜型油菜FLD同源基因的保守序列设计引物,采用PCR和RT-PCR...
【目的】克隆特早熟春性甘蓝型油菜A基因组上的sBnFLD基因,并对其进行表达研究,为该基因的功能及其在成花转变中的作用研究奠定基础。【方法】根据GenBank中已报道的拟南芥和白菜型油菜FLD同源基因的保守序列设计引物,采用PCR和RT-PCR扩增特早熟春性甘蓝型油菜86号品系(光周期不敏感)的FLD同源基因,用qRT-PCR技术检测sBnFLD基因在86号品系不同发育时期茎、叶和茎尖中的表达情况。【结果】克隆出了sBnFLD基因,命名为sBnFLD,在GenBank中的登录号为KR003079.1。sBnFLD基因cDNA全长2 376bp,有3个内含子,4个外显子,编码791个氨基酸残基,分子量86.5ku,等电点8.5;sBnFLD为非分泌蛋白和非膜蛋白;sBnFLD蛋白N端有2个保守的结构域α螺旋结构域(SWIRM)和NAD(P)-binding-8结构域,该蛋白有多个α螺旋和β折叠。生物信息学分析显示,sBnFLD蛋白与已报道的甘蓝型油菜未知蛋白(CDX73929.1)和电子克隆的白菜型油菜FLD(XP_009135110.1)氨基酸序列相似性达99%,与拟南芥FLD氨基酸序列相似性达87%。qRT-PCR分析结果显示,sBnFLD基因在油菜苗期和现蕾初期茎、叶、茎尖中均有表达,但在蕾期茎尖中表达量最高。【结论】克隆出的sBnFLD基因为甘蓝型油菜的FLD同源基因,该基因在春性特早熟甘蓝型油菜开花调控中可能起着重要的调节作用。
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关键词
春性甘蓝型油菜
基因克隆
FLD同源基因
开花时间
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职称材料
春性甘蓝型油菜抗倒伏资源评价与筛选
被引量:
8
4
作者
谢晋
殷婷
+2 位作者
孙欢
赵志刚
余青兰
《江苏农业科学》
2019年第10期109-113,共5页
以34份春性甘蓝型油菜为材料,于2016年对供试材料的倒伏指数、茎秆特性、株型结构以及产量性状进行测定。结果表明,茎秆折断率与上层生物量呈显著正相关,倒伏指数与茎秆抗拉力呈极显著负相关,茎秆抗折力与茎壁厚度呈显著正相关;同时,倒...
以34份春性甘蓝型油菜为材料,于2016年对供试材料的倒伏指数、茎秆特性、株型结构以及产量性状进行测定。结果表明,茎秆折断率与上层生物量呈显著正相关,倒伏指数与茎秆抗拉力呈极显著负相关,茎秆抗折力与茎壁厚度呈显著正相关;同时,倒伏指数与分枝位点/株高值呈显著负相关。初步选出5个抗倒品种和5个易倒品种,并在2017年通过小区重复试验,得到了验证,为今后对植株抗倒伏的深入研究提供了理论基础与试验材料。
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关键词
春性甘蓝型油菜
抗倒伏
相关性分析
方差分析
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职称材料
题名
春性甘蓝型油菜FCA同源基因可变剪接体的克隆及表达研究
被引量:
4
1
作者
张生萍
罗玉秀
杜德志
罗春燕
马小岗
赵志刚
许唱唱
张红生
吴鹏
晁文俊
机构
青海大学生态环境工程学院
青海大学农林科学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2016年第4期64-72,80,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31360345)
青海省科技厅项目(2013-Z-716)
+2 种基金
国家863项目(2011AA10A104)
高层次人才项目(2012-QGC-3)
科技部项目(2013BAD01B05-3)
文摘
【目的】克隆特早熟春性甘蓝型油菜的FCA同源基因(sBnFCA)及其可变剪接体,并分析该基因的表达模式。【方法】根据拟南芥和芸薹属植物FCA基因的DNA序列和cDNA序列设计引物,用PCR和RT-PCR技术克隆特早熟春性甘蓝型油菜"86号"的FCA同源基因(sBnFCA)及其可变剪接体,对克隆基因及编码蛋白序列进行生物信息学分析,构建系统进化树,并用qRT-PCR技术检测sBnFCA基因在不同发育时期根、茎、叶、茎尖中的表达量。【结果】克隆出了sBnFCA基因的全长序列(8 827bp),得到了sBnFCA-γ可变剪接体及一个新的可变剪接体(sBnFCA-5),新的可变剪接体在GenBank中的登录号为KJ701579.1。sBnFCA-5剪接体的CDS全长1 986bp,编码662个氨基酸残基,其推导的氨基酸序列具有2个保守的RRM结构域和1个WW结构域。生物信息学分析显示,sBnFCA-5与已报道甘蓝型油菜BnFCA-γ(AF414188.1)的相似性达99%,与拟南芥FCA-γ的相似性达87%。sBnFCA-5比sBnFCA-γ少了172个碱基序列,是一个跨外显子剪接体。sBnFCA蛋白相对分子质量和理论等电点分别为72.5ku和9.2。基因表达模式分析显示,sBnFCA-γ和sBnFCA-5在苗期、蕾期、花期的根、茎、叶和茎尖组织中都有表达,sBnFCA-γ在蕾期茎尖和花期叶片中表达量较高,sBnFCA-5在蕾期茎尖和花期叶片中表达量极高。【结论】克隆的sBnFCA-5为甘蓝型油菜sBnFCA基因的一个新的可变剪接体,该基因在春性特早熟甘蓝型油菜开花调控中可能有着重要的调节作用。
关键词
春性甘蓝型油菜
基因克隆
FCA同源基因
可变剪接
自主开花途径
Keywords
spring rape(Brassica napus L.)
gene cloning
FCAhomologue
alternative splicing
autonomous flowering pathway
分类号
S634.3 [农业科学—蔬菜学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
春性甘蓝型油菜小孢子培养技术研究
被引量:
5
2
作者
星晓蓉
杜德志
李秀萍
机构
青海大学
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期114-118,共5页
基金
国家863项目(高产双低高含油量甘蓝型油菜新品种选育)
文摘
对一批春性甘蓝型油菜(Brassica napus)杂种F1及其亲本进行小孢子培养的结果表明,不同组合(基因型)出胚率差异比较大,2006年22份材料(基因型)中有21份出胚,其中40.91%的材料每蕾出胚数在5个以上,31.82%的材料每蕾出胚数在10个以上;杂交组合的出胚率大部分高于其亲本,主枝的产胚率绝大部分都高于其分枝;秋水仙碱不同处理中以0.6 g/L浓度处理5.0 h和3.4 g/L浓度处理1.5 h,植株成活率和加倍率最高;经秋水仙碱加倍后可育的植株大部分花粉活力较高,结实指数较高;而半可育的植株花粉活力低,并有50%的植株结实指数低于1。
关键词
春性甘蓝型油菜
小孢子培养
出胚率
Keywords
Spring-planted Brassica napus
Microspore culture
Ratio of embryos
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
在线阅读
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职称材料
题名
特早熟春性甘蓝型油菜sBnFLD基因的克隆及表达
被引量:
3
3
作者
罗玉秀
张生萍
许唱唱
马小岗
杜德志
机构
青海大学生态环境工程学院
青海大学农林科学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2016年第11期90-96,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31360345)
青海省科技厅项目(2016-ZJ-787)
+1 种基金
国家"863计划"项目(2011AA10A104)
科技部科技支撑计划项目(2013BAD01B05-3)
文摘
【目的】克隆特早熟春性甘蓝型油菜A基因组上的sBnFLD基因,并对其进行表达研究,为该基因的功能及其在成花转变中的作用研究奠定基础。【方法】根据GenBank中已报道的拟南芥和白菜型油菜FLD同源基因的保守序列设计引物,采用PCR和RT-PCR扩增特早熟春性甘蓝型油菜86号品系(光周期不敏感)的FLD同源基因,用qRT-PCR技术检测sBnFLD基因在86号品系不同发育时期茎、叶和茎尖中的表达情况。【结果】克隆出了sBnFLD基因,命名为sBnFLD,在GenBank中的登录号为KR003079.1。sBnFLD基因cDNA全长2 376bp,有3个内含子,4个外显子,编码791个氨基酸残基,分子量86.5ku,等电点8.5;sBnFLD为非分泌蛋白和非膜蛋白;sBnFLD蛋白N端有2个保守的结构域α螺旋结构域(SWIRM)和NAD(P)-binding-8结构域,该蛋白有多个α螺旋和β折叠。生物信息学分析显示,sBnFLD蛋白与已报道的甘蓝型油菜未知蛋白(CDX73929.1)和电子克隆的白菜型油菜FLD(XP_009135110.1)氨基酸序列相似性达99%,与拟南芥FLD氨基酸序列相似性达87%。qRT-PCR分析结果显示,sBnFLD基因在油菜苗期和现蕾初期茎、叶、茎尖中均有表达,但在蕾期茎尖中表达量最高。【结论】克隆出的sBnFLD基因为甘蓝型油菜的FLD同源基因,该基因在春性特早熟甘蓝型油菜开花调控中可能起着重要的调节作用。
关键词
春性甘蓝型油菜
基因克隆
FLD同源基因
开花时间
Keywords
spring rape(Brassica napus L.)
gene cloning
FLDhomologue
flowering time
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
春性甘蓝型油菜抗倒伏资源评价与筛选
被引量:
8
4
作者
谢晋
殷婷
孙欢
赵志刚
余青兰
机构
青海大学农林科学院春油菜研究所/国家油料改良青海分中心/农业农村部春油菜科学观测实验站/青海省春油菜遗传改良重点实验室/青海省春油菜研究开发中心
出处
《江苏农业科学》
2019年第10期109-113,共5页
基金
国家重点研发计划(编号:2016YFD0100202)
农业农村部“引进国际先进农业科学技术”自由申报项目(编号:2014-Z58)
+2 种基金
青海省春油菜遗传改良重点实验室(编号:2017-ZJ-Y09)
青海省春油菜研究开发中心能力建设(编号:2015-GX-Q15A)
青海省科学技术厅推广项目(编号:2015-NK-111)
文摘
以34份春性甘蓝型油菜为材料,于2016年对供试材料的倒伏指数、茎秆特性、株型结构以及产量性状进行测定。结果表明,茎秆折断率与上层生物量呈显著正相关,倒伏指数与茎秆抗拉力呈极显著负相关,茎秆抗折力与茎壁厚度呈显著正相关;同时,倒伏指数与分枝位点/株高值呈显著负相关。初步选出5个抗倒品种和5个易倒品种,并在2017年通过小区重复试验,得到了验证,为今后对植株抗倒伏的深入研究提供了理论基础与试验材料。
关键词
春性甘蓝型油菜
抗倒伏
相关性分析
方差分析
分类号
S634.301 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
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操作
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春性甘蓝型油菜FCA同源基因可变剪接体的克隆及表达研究
张生萍
罗玉秀
杜德志
罗春燕
马小岗
赵志刚
许唱唱
张红生
吴鹏
晁文俊
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2016
4
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职称材料
2
春性甘蓝型油菜小孢子培养技术研究
星晓蓉
杜德志
李秀萍
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
5
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职称材料
3
特早熟春性甘蓝型油菜sBnFLD基因的克隆及表达
罗玉秀
张生萍
许唱唱
马小岗
杜德志
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2016
3
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职称材料
4
春性甘蓝型油菜抗倒伏资源评价与筛选
谢晋
殷婷
孙欢
赵志刚
余青兰
《江苏农业科学》
2019
8
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