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涮辣和昆明皱皮椒Kas生物信息学及表达分析
1
作者
周慧丹
李孟娟
+4 位作者
吴睿
李平平
张芮豪
吕俊恒
邓明华
《安徽农业科学》
CAS
2024年第1期90-97,114,共9页
[目的]探究涮辣与昆明皱皮椒3-氧酰基[酰基载体蛋白]还原酶(3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]synthase,Kas)的差异。[方法]特异性扩增了Kas,并进行了生物信息学分析。利用荧光定量PCR及酶活性测定方法测定了不同发育时期、不同环境及6...
[目的]探究涮辣与昆明皱皮椒3-氧酰基[酰基载体蛋白]还原酶(3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]synthase,Kas)的差异。[方法]特异性扩增了Kas,并进行了生物信息学分析。利用荧光定量PCR及酶活性测定方法测定了不同发育时期、不同环境及6种外源因子处理下Kas表达量及酶活性。[结果]扩增得到的涮辣和昆明皱皮椒Kas基因均为1467 bp,编码488个氨基酸。Kas为脂溶性、亲水性的稳定蛋白,无信号肽与跨膜结构,主要定位于质膜。在不同发育阶段,2种辣椒Kas表达水平与酶活性的趋势均为先升高后急剧降低,且在大部分发育阶段均表现为露地栽培高于大棚栽培;同一环境条件下,涮辣Kas表达与酶活性整体高于昆明皱皮椒;且不同外源物质在一定时间内可影响涮辣Kas的表达,其中MeJA和SA处理对Kas表达量影响较大。[结论]涮辣与昆明皱皮椒Kas基因和蛋白特性相似,但存在差异,在辣椒生长发育、环境和外源物质响应方面有重要功能。
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关键词
涮辣
昆明皱皮椒
3-氧酰基[酰基载体蛋白]还原酶(Kas)
生物信息学
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职称材料
涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(PAL)的生物信息学及表达分析
被引量：
2
2
作者
张祥
刘雨婷
+4 位作者
张婧柔
李平平
谢志和
张芮豪
邓明华
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期320-329,共10页
【目的】解析涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)的差异,研究不同发育时期、不同环境和外源因子处理下PAL基因表达规律。【方法】基于基因克隆和生物信息学方法研究PAL基因和蛋白特性;利用荧光定量PCR及...
【目的】解析涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)的差异,研究不同发育时期、不同环境和外源因子处理下PAL基因表达规律。【方法】基于基因克隆和生物信息学方法研究PAL基因和蛋白特性;利用荧光定量PCR及酶活性测定方法测定PAL表达量及酶活性。【结果】克隆得到涮辣PAL基因为2166 bp,昆明皱皮椒PAL基因为2154 bp,分别编码721和717个氨基酸。顺式元件预测结果显示:辣椒PAL可能受赤霉素、光与干旱的影响。PAL蛋白预测结果表明:PAL为脂溶性、亲水性的稳定蛋白,主要定位于质膜,无信号肽与跨膜结构,含58个磷酸化位点。在进化上PAL有保守性,但在亚组上存在一定差异。在不同发育阶段,2种辣椒PAL表达水平与酶活性的趋势都为先升高后急剧降低,且在大部分发育阶段均表现为露地栽培高于大棚栽培;同一环境条件下,涮辣PAL表达与酶活性整体高于昆明皱皮椒;且不同外源物质在一定时间内可影响涮辣PAL的表达。【结论】涮辣与昆明皱皮椒PAL基因和蛋白特性相似但存在差异,在辣椒生长发育、环境和外源物质响应方面有重要功能。
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关键词
涮辣
昆明皱皮椒
苯丙氨酸解氨酶(PAL)
生物信息学
外源因子
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职称材料
题名
涮辣和昆明皱皮椒Kas生物信息学及表达分析
1
作者
周慧丹
李孟娟
吴睿
李平平
张芮豪
吕俊恒
邓明华
机构
云南农业大学园林园艺学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2024年第1期90-97,114,共9页
基金
国家自然科学基金项目(32160708)
云南省科技计划项目(202102AE090005,202205AR070001)。
文摘
[目的]探究涮辣与昆明皱皮椒3-氧酰基[酰基载体蛋白]还原酶(3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]synthase,Kas)的差异。[方法]特异性扩增了Kas,并进行了生物信息学分析。利用荧光定量PCR及酶活性测定方法测定了不同发育时期、不同环境及6种外源因子处理下Kas表达量及酶活性。[结果]扩增得到的涮辣和昆明皱皮椒Kas基因均为1467 bp,编码488个氨基酸。Kas为脂溶性、亲水性的稳定蛋白,无信号肽与跨膜结构,主要定位于质膜。在不同发育阶段,2种辣椒Kas表达水平与酶活性的趋势均为先升高后急剧降低,且在大部分发育阶段均表现为露地栽培高于大棚栽培;同一环境条件下,涮辣Kas表达与酶活性整体高于昆明皱皮椒;且不同外源物质在一定时间内可影响涮辣Kas的表达,其中MeJA和SA处理对Kas表达量影响较大。[结论]涮辣与昆明皱皮椒Kas基因和蛋白特性相似,但存在差异,在辣椒生长发育、环境和外源物质响应方面有重要功能。
关键词
涮辣
昆明皱皮椒
3-氧酰基[酰基载体蛋白]还原酶(Kas)
生物信息学
Keywords
Capsicum chinense
C.annuum
3-oxoacyl-[Acyl-carrier-protein]synthase(Kas)
Bioinformatics
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(PAL)的生物信息学及表达分析
被引量：
2
2
作者
张祥
刘雨婷
张婧柔
李平平
谢志和
张芮豪
邓明华
机构
云南农业大学园林园艺学院
云南省通海县经济作物工作站
出处
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期320-329,共10页
基金
云南省科技厅重大专项(2018BB020)
玉溪市专家基层科研工作站。
文摘
【目的】解析涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)的差异,研究不同发育时期、不同环境和外源因子处理下PAL基因表达规律。【方法】基于基因克隆和生物信息学方法研究PAL基因和蛋白特性;利用荧光定量PCR及酶活性测定方法测定PAL表达量及酶活性。【结果】克隆得到涮辣PAL基因为2166 bp,昆明皱皮椒PAL基因为2154 bp,分别编码721和717个氨基酸。顺式元件预测结果显示:辣椒PAL可能受赤霉素、光与干旱的影响。PAL蛋白预测结果表明:PAL为脂溶性、亲水性的稳定蛋白,主要定位于质膜,无信号肽与跨膜结构,含58个磷酸化位点。在进化上PAL有保守性,但在亚组上存在一定差异。在不同发育阶段,2种辣椒PAL表达水平与酶活性的趋势都为先升高后急剧降低,且在大部分发育阶段均表现为露地栽培高于大棚栽培;同一环境条件下,涮辣PAL表达与酶活性整体高于昆明皱皮椒;且不同外源物质在一定时间内可影响涮辣PAL的表达。【结论】涮辣与昆明皱皮椒PAL基因和蛋白特性相似但存在差异,在辣椒生长发育、环境和外源物质响应方面有重要功能。
关键词
涮辣
昆明皱皮椒
苯丙氨酸解氨酶(PAL)
生物信息学
外源因子
Keywords
ShuanLa
Kunming wrinkled pepper
phenylalanine-ammonia-lyase(PAL)
bioinformatics
exogenous factor
分类号
S641.301 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
涮辣和昆明皱皮椒Kas生物信息学及表达分析
周慧丹
李孟娟
吴睿
李平平
张芮豪
吕俊恒
邓明华
《安徽农业科学》
CAS
2024
0
在线阅读
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职称材料
2
涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(PAL)的生物信息学及表达分析
张祥
刘雨婷
张婧柔
李平平
谢志和
张芮豪
邓明华
《云南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
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