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平榛冷适应相关基因CBF的克隆及时空表达特性分析 被引量:11
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作者 陈新 王贵禧 +1 位作者 梁丽松 马庆华 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第1期167-172,共6页
低温是影响植物分布、进而影响生长和产量的关键因素之一。Weiser(1970)指出低温导致植物的基因表达发生变化;早在20世纪90年代研究者就发现了植物的冷适应现象(Guyetal.,1985)。虽然迄今为止植物抗寒的分子机制还没完全清楚。
关键词 平榛 CBF 荧光定量PCR 时空表达特性
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小菜蛾RyR调控蛋白FKBP基因克隆及其时空表达谱
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作者 张万里 葛天成 +4 位作者 陈琦椿 彭争科 肖勇 李振宇 尹飞 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期3023-3032,共10页
【目的】明确FK506结合蛋白(FKBP)基因在小菜蛾对氯虫苯甲酰胺抗性形成中的作用,筛选出起主要作用的关键FKBP基因,为阐明小菜蛾抗双酰胺类杀虫剂的分子机理提供新思路。【方法】以抗氯虫苯甲酰胺种群和敏感种群小菜蛾为研究对象,采用浸... 【目的】明确FK506结合蛋白(FKBP)基因在小菜蛾对氯虫苯甲酰胺抗性形成中的作用,筛选出起主要作用的关键FKBP基因,为阐明小菜蛾抗双酰胺类杀虫剂的分子机理提供新思路。【方法】以抗氯虫苯甲酰胺种群和敏感种群小菜蛾为研究对象,采用浸叶法测定不同种群小菜蛾对氯虫苯甲酰胺的敏感性差异;利用cDNA末端快速扩增(RACE)方法克隆3个FKBP基因(FKBP8、FKBP12和FKBP52)的全长序列,并通过GSDS 2.0、CDD和MEME在线分析软件分析其基因结构与蛋白保守结构域和Motif;采用实时荧光定量PCR分析抗性种群不同发育阶段和敏感、抗性种群4龄幼虫不同组织FKBP基因的时空表达特性。【结果】生物测定结果显示,抗性种群小菜蛾对氯虫苯甲酰胺的抗性倍数为122.67倍,属于高水平抗性。实时荧光定量PCR分析发现,抗性种群小菜蛾体内3个FKBP基因的相对表达量均显著高于敏感种群(P<0.05,下同),其中FKBP8基因的表达差异最显著,是敏感种群的968倍。通过RACE方法克隆得到FKBP52、FKBP8和FKBP12基因的全长序列,长度分别为1473、1525和649 bp,分别编码423、307和108个氨基酸残基,其蛋白均为亲水蛋白。FKBP52、FKBP8和FKBP12基因具有相同的基因结构,FKBP52和FKBP12蛋白具有相同的保守结构域FkpA,而FKBP8蛋白具有2个不同的保守结构域。抗性种群小菜蛾4龄幼虫体内3个FKBP基因表达量均高于蛹期,其中FKBP12和FKBP8基因在4龄幼虫中的表达量最高,显著高于其他龄期和蛹期。FKBP8基因在抗性种群小菜蛾中肠和表皮中的表达量显著高于敏感种群,分别是敏感种群的3.2和3.7倍。【结论】FKBP52、FKBP8和FKBP12基因在氯虫苯甲酰胺抗性种群小菜蛾中均过量表达,其中FKBP8基因在高抗氯虫苯甲酰胺种群小菜蛾的中肠高表达,表明其可能通过过量表达参与小菜蛾对氯虫苯甲酰胺的抗药性。 展开更多
关键词 FK506结合蛋白 FKBP基因 小菜蛾 氯虫苯甲酰胺 时空表达特性 抗药性
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草莓果实酯类合成关键酶基因SAATB2和VAATW2表达特性分析 被引量:4
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作者 董静 张运涛 +3 位作者 王桂霞 钟传飞 王丽娜 常琳琳 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期149-153,共5页
利用RT-PCR的方法,分别从凤梨草莓栽培品种‘红颜’和森林草莓白果类型的成熟果实中克隆酯类合成关键酶基因SAATB2和VAATW2。利用半定量RT-PCR和酶活性测定分别对SAATB2、VAATW2在不同组织和花后不同发育时间果实中的表达情况进行分析... 利用RT-PCR的方法,分别从凤梨草莓栽培品种‘红颜’和森林草莓白果类型的成熟果实中克隆酯类合成关键酶基因SAATB2和VAATW2。利用半定量RT-PCR和酶活性测定分别对SAATB2、VAATW2在不同组织和花后不同发育时间果实中的表达情况进行分析。结果发现,SAATB2主要在果实中表达,而VAATW2则在叶片和果实中都有表达,说明AAT在草莓组织中的表达特性存在种间差异。而SAATB2和VAATW2在果实发育期间具有相同的表达趋势,表达量随果实发育先升高后降低,最大表达量均出现在完全成熟前后,但达到最大值的时间略有不同。‘红颜’和森林草莓的果实挥发性酯类质量分数随果实发育升高,完全成熟时达到最大质量分数,与AAT基因表达量的变化基本一致。 展开更多
关键词 凤梨草莓 森林草莓 醇酰基转移酶 时空表达特性 挥发性酯
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美国白蛾丝素蛋白基因的鉴定、时空表达及取食不同寄主植物后的表达响应 被引量:2
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作者 赵旭东 韩芷琪 +3 位作者 耿薏舒 胡天义 李文萱 郝德君 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2021年第6期1348-1358,共11页
美国白蛾Hyphantria cunea Drury被列为我国林业检疫性害虫,其l~4龄幼虫具有吐丝结网幕的习性。为探究丝素蛋白基因的表达特性,本研究利用PCR技术克隆了美国白蛾的HcP25(Genbank登录号:OL625670)、HcFib-H(Genbank登录号:OL625672)、HcF... 美国白蛾Hyphantria cunea Drury被列为我国林业检疫性害虫,其l~4龄幼虫具有吐丝结网幕的习性。为探究丝素蛋白基因的表达特性,本研究利用PCR技术克隆了美国白蛾的HcP25(Genbank登录号:OL625670)、HcFib-H(Genbank登录号:OL625672)、HcFib-L(Genbank登录号:OL625671)3条丝素蛋白基因,并进行生物信息学分析;利用RT-qPCR技术检测美国白蛾3条丝素蛋白基因的表达特性。结果表明:3条丝素蛋白基因序列比对均与车前灯蛾Arctia plantaginis丝素蛋白一致性最高,系统进化分析显示丝素蛋白HcP25、HcFib-H、HcFib-L在鳞翅目不同科之间在出现较大的分化。RT-qPCR试验结果显示HcP25、HcFib-H、HcFib-L 3基因相对表达量与网幕产生高峰期(1龄、2龄)相一致。3种丝素蛋白均在丝腺中特异性高水平表达,在头部及脂肪体中有少量表达。美国白蛾幼虫取食不同寄主植物后,3种丝素蛋白基因呈现不同的表达规律;取食杨树Populus L.处理组中HcP25与HcFib-H基因相对表达量极显著高于取食其它寄主处理,而取食山樱花Cerasus serrulata var.lannesiana和日本晚樱Cerasus serrulata处理组中HcFib-L基因表达量最高。研究结果为进一步探究丝素蛋白介导的美国白蛾对不同寄主的适应机制及其扩散机制奠定基础,也为开发美国白蛾防治新方法提供了潜在的基因靶标。 展开更多
关键词 美国白蛾 寄主植物 丝素蛋白 时空表达特性
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猪CAⅢ基因CDS区克隆、生物信息学及组织表达分析
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作者 乐宝玉 张宁芳 +9 位作者 成志敏 秦本源 吴怡琦 王媛媛 王鹤洁 蔡春波 高鹏飞 郭晓红 李步高 曹果清 《山西农业科学》 2019年第6期1069-1074,1084,共7页
对猪碳酸酐酶Ⅲ(Carbonic anhydrase Ⅲ,CAⅢ)基因进行克隆及生物信息学分析,并分析该基因的时空表达特性。通过RT-PCR和克隆测序技术获得猪CAⅢ基因的CDS序列,综合利用多种生物信息学软件,对该基因编码的蛋白质生物学特性进行预测,采用... 对猪碳酸酐酶Ⅲ(Carbonic anhydrase Ⅲ,CAⅢ)基因进行克隆及生物信息学分析,并分析该基因的时空表达特性。通过RT-PCR和克隆测序技术获得猪CAⅢ基因的CDS序列,综合利用多种生物信息学软件,对该基因编码的蛋白质生物学特性进行预测,采用qRT-PCR技术检测CAⅢ基因的组织表达谱和时序表达规律。结果表明,猪CAⅢ基因CDS区长783bp,编码260个氨基酸;CAⅢ蛋白为亲水性碱性蛋白,无信号肽,主要在细胞质中发挥作用;CAⅢ基因在心脏、肝脏、胰脏、肺、胃、背最长肌、皮下脂肪、脾脏、盲肠等9种组织中均有表达,但在背最长肌中表达量最高,极显著地高于其他组织。从初生到5月龄,大白猪背最长肌中CAⅢ基因mRNA表达量呈上升—下降—上升—下降的趋势,初生时最低,随后表达量逐渐升高,到3月龄时达到峰值,之后开始下降;马身猪中,从初生到5月龄,CAⅢ基因mRNA的表达量基本呈上升趋势,在5月龄时达到峰值,极显著地高于其他各个阶段。2个不同品种相比,3月龄和4月龄时,大白猪CAⅢmRNA表达量显著或极显著地高于马身猪;而在5月龄时,马身猪CAⅢmRNA表达量极显著地高于大白猪,其他阶段2个品种CAⅢmRNA表达量无显著差异。CAⅢ基因可能直接或间接参与猪骨骼肌的生长发育过程。 展开更多
关键词 CAⅢ基因 生物信息学分析 时空表达特性
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辣椒MIKC型MADS-box基因家族鉴定及胁迫响应 被引量:2
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作者 罗希榕 祝晓云 +4 位作者 杨仕梅 李唐燕 李靖 陀海燕 覃成 《种子》 北大核心 2024年第1期59-67,113,共10页
MADS-box家族在花的诱导和发育中作用广泛,有些基因在明显不相关的发育阶段具有多种功能。本研究通过生物信息学对辣椒MIKC型MADS-box家族系统发育树、保守结构、基因特征、GO和KEGG富集分析、时空表达等进行系统分析。在辣椒中共鉴定... MADS-box家族在花的诱导和发育中作用广泛,有些基因在明显不相关的发育阶段具有多种功能。本研究通过生物信息学对辣椒MIKC型MADS-box家族系统发育树、保守结构、基因特征、GO和KEGG富集分析、时空表达等进行系统分析。在辣椒中共鉴定到25条MIKC_MADS基因,均具有MIKC_MADS的N端SRF-TF和C端K-box保守结构域,氨基酸数为122~278 aa,为两性亲水性蛋白。Motif分析发现,25条CaMADS-box基因均含有Motif1、Motif2、Motif4共3个保守基序。染色体定位发现,25条基因不均匀地分布在12条染色体上,其中染色体Chr02定位基因最多,共计5条基因。共线性分析发现MIKC_MADS在野生种Chiltepin中存在多个共线性区块。GO富集分析发现,MIKC_MADS主要参与植物生长初期发育过程,主要是花器官、胚乳发育过程,KEGG富集到甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢(ko00260),乙醛酸盐和二羧酸盐代谢(ko00630),碳代谢(ko01200)。顺式作用元件发现,与光响应元件、水杨酸、胚乳等元件相关。在时空表达过程中,MIKC_MADS在茎、叶、芽和花过程表达呈现上调表达趋势。 展开更多
关键词 辣椒 MADS-BOX基因 基因特征 时空表达特性
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