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斜纹夜蛾抗菌肽基因Moricin和Cecropin时空表达模式及微生物敏感性的分析 被引量:1
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作者 许小霞 王爽 +3 位作者 张文庆 孙强 王超 金丰良 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期1008-1013,共6页
抗菌肽是一类具有广谱抗菌活性的小分子多肽,包括抗细菌、病毒和真菌。本研究以斜纹夜蛾Spodoptera litura(Fabricius)为研究对象,利用Real-timePCR和半定量RT-PCR检测了其体内两个重要抗菌肽基因Cecropin和Moricin的时空表达模式及其... 抗菌肽是一类具有广谱抗菌活性的小分子多肽,包括抗细菌、病毒和真菌。本研究以斜纹夜蛾Spodoptera litura(Fabricius)为研究对象,利用Real-timePCR和半定量RT-PCR检测了其体内两个重要抗菌肽基因Cecropin和Moricin的时空表达模式及其对微生物的敏感性。Real-timePCR检测结果表明,抗菌肽基因Cecropin和Moricin在斜纹夜蛾各个龄期(1,2,3,4,5和6龄幼虫、蛹、成虫)都有表达,随着龄期的增长,表达量逐渐增加,6龄幼虫中表达量达到最高。半定量RT-PCR检测表明,抗菌肽基因Cecropin和Moricin在7个不同组织(气管、卵巢、马氏管、体壁、中肠、脂肪体和血细胞)中都有表达,Cecropin在脂肪体中表达量最高,而Moricin在血细胞中表达量相对较高;RT-PCR检测表明,Cecropin和Moricin的表达在大肠杆菌Escherichia coli诱导后迅速上升,其中诱导后8h达到高峰期,一直持续到48h。不同病原微生物(大肠杆菌E.coli、金黄色葡萄球菌Staphyloccocus aureus和白僵菌Beauveria bassiana)分别诱导后,Real-timePCR检测表明,斜纹夜蛾抗菌肽基因Cecropin和Moricin对大肠杆菌的刺激最为敏感。本研究结果为进一步研究斜纹夜蛾抗菌肽基因Cecropin和Moricin的功能奠定基础。 展开更多
关键词 斜纹夜蛾 抗菌肽 Moricin CECROPIN 时空表达模式 微生物敏感性
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硫化氢信号对大白菜FLCs时空表达模式的调控作用
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作者 张丽萍 张林林 +6 位作者 曹海艳 郝雪峰 刘纹琪 刘志强 刘旦梅 金竹萍 裴雁曦 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期972-979,共8页
硫化氢(H_(2)S)是一种气体信号分子,可以促进植物的开花,且这一过程与开花的关键因子FLOWERING LOCUS C(FLC)有关。大白菜中已报道的FLC同源基因有4种。本研究对这4种FLC同源基因进行了时空表达模式和功能分化研究,以及H_(2)S对BrFLCs... 硫化氢(H_(2)S)是一种气体信号分子,可以促进植物的开花,且这一过程与开花的关键因子FLOWERING LOCUS C(FLC)有关。大白菜中已报道的FLC同源基因有4种。本研究对这4种FLC同源基因进行了时空表达模式和功能分化研究,以及H_(2)S对BrFLCs的表达模式的调控作用进行了探讨。结果表明:4种BrFLCs同源基因的表达表现出不同的时空特异性。其中,BrFLC 1、2和3的发育时期表达模式与拟南芥AtFLC相似,而BrFLC 5未表现出发育时期特异性。BrFLC 1只在叶中表达,而BrFLC 2在不同组织中均有表达,BrFLC 3在各组织中的表达量最高,但组织特异性差异不明显,BrFLC 5表达量不高且不具有组织特异性。经外源H_(2)S处理,BrFLCs表达略有下调,叶片中的BrFLC 2表达量最低。H_(2)S还能够不同程度地调节BrFLCs下游基因的表达,这可能和BrFLCs的表达模式改变有关。综上所述,H_(2)S可能通过调节大白菜中4个BrFLCs基因的表达模式影响其植株的开花时间。 展开更多
关键词 大白菜 FLC同源基因 硫化氢 时空表达模式 下游基因
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日本医蛭摄食前后不同组织中水蛭素基因(hirudin)的时空表达模式
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作者 石萍 游华建 +2 位作者 邓小书 陈仕江 鲁增辉 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第7期1400-1405,共6页
【目的】探究日本医蛭在不同摄食阶段、各个组织(唾液腺、肠、嗉囊、皮肤及精/卵巢)中水蛭素基因(hirudin)的时空表达模式,为水蛭药材的科学合理利用提供理论依据。【方法】基于水蛭唾液腺转录组数据筛选结果及基因克隆获得的水蛭素基... 【目的】探究日本医蛭在不同摄食阶段、各个组织(唾液腺、肠、嗉囊、皮肤及精/卵巢)中水蛭素基因(hirudin)的时空表达模式,为水蛭药材的科学合理利用提供理论依据。【方法】基于水蛭唾液腺转录组数据筛选结果及基因克隆获得的水蛭素基因序列信息,利用实时荧光定量PCR方法,对水蛭关键活性成分的编码基因hirudin在不同摄食阶段、不同组织中的表达量进行检测分析,研究该基因的时空表达模式。【结果】水蛭素基因(hirudin)在日本医蛭的唾液腺、肠、嗉囊、皮肤及精/卵巢组织中均有表达,且在唾液腺中的表达量显著高于其他组织;Hirudin基因在不同摄食阶段的唾液腺组织中表达结果显示,摄食后第2天表达量显著升高,之后随着摄食时间的推延而呈下降趋势;Hirudin基因在嗉囊、肠中的表达量呈先升高后下降趋势,分别于摄食后第1、第2天达到最高,之后会随着停食时间延长呈下降趋势,尤其是在摄食后第7、第8天的表达量呈显著性降低;Hirudin基因在皮肤组织中也有表达,并随着停食时间的延长呈先升后降趋势,最高峰出现在摄食后第2天;在精/卵巢组织中,摄食期间hirudin基因的表达量最高,与其他摄食阶段的表达呈显著性差异。【结论】水蛭素基因(hirudin)在日本医蛭的唾液腺、肠、嗉囊、皮肤和精/卵巢组织中均有不同程度的表达,在唾液腺中的表达量显著高于其他组织。摄食行为及食物刺激可能影响水蛭素基因(hirudin)的表达,在不同摄食阶段的表达量存在显著差异。研究结果可为水蛭药材的科学采收加工、提取部位的科学选取、合理入药提供理论依据和技术支撑,对未来水蛭药材资源的可持续利用具有重要的参考价值。 展开更多
关键词 日本医蛭 水蛭素基因(hirudin) 摄食 时空表达模式
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龟纹瓢虫胰岛素信号通路AKT、MAPK、RPS6KB基因序列结构与时空表达模式分析 被引量:1
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作者 陈露露 皇甫宁博 +5 位作者 赵利康 张开心 李东阳 姬继超 马德英 崔金杰 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2023年第2期280-288,共9页
为明确龟纹瓢虫Propylea japonica胰岛素信号通路中AKT、MAPK和RPS6KB三个基因的序列结构和时空表达模式,基于龟纹瓢虫全基因组序列数据,选取AKT、MAPK和RPS6KB三个基因全长进行序列结构分析,蛋白序列结构分析发现其分别编码522、332和... 为明确龟纹瓢虫Propylea japonica胰岛素信号通路中AKT、MAPK和RPS6KB三个基因的序列结构和时空表达模式,基于龟纹瓢虫全基因组序列数据,选取AKT、MAPK和RPS6KB三个基因全长进行序列结构分析,蛋白序列结构分析发现其分别编码522、332和375个氨基酸。利用qRT-PCR检测其在龟纹瓢虫雌虫不同发育时期(羽化后1、3、5、7 d)、不同组织(头、胸、腹、肠)中的表达模式,结果显示AKT、MAPK和RPS6KB基因表达量均在龟纹瓢虫雌虫羽化第7 d显著上调,并达到最高水平;AKT在雌虫羽化第1 d和3 d高表达部位均为头部,第5 d和7 d高表达部位分别为肠道和胸部;MAPK基因在龟纹瓢虫雌虫羽化第1 d、3 d、5 d和7 d,头部表达水平均显著高于胸、腹和肠道;RPS6KB基因在其羽化后第1 d、3d、5d和7d,腹部表达水平均显著高于头、胸和肠道。AKT、MAPK、RPS6KB基因在龟纹瓢虫不同发育时期及不同组织中的表达量存在差异,为进一步研究胰岛素信号通路在龟纹瓢虫生殖发育中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 龟纹瓢虫 胰岛素信号通路 时空表达模式 QRT-PCR
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栉孔扇贝LTR逆转录转座子的基因组分布特征及时空表达模式分析
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作者 刘盼盼 李语丽 +3 位作者 刘福云 于洪伟 包振民 王师 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期47-54,共8页
长末端重复序列(LTR)逆转录转座子在真核生物中是普遍存在的,通过“复制-黏贴”的方式插入到基因组的其它位置,影响基因的活性及基因组的结构。DNA测序技术的快速发展为分子生物学研究提供了大量的组学资源,也为全基因组水平逆转录转座... 长末端重复序列(LTR)逆转录转座子在真核生物中是普遍存在的,通过“复制-黏贴”的方式插入到基因组的其它位置,影响基因的活性及基因组的结构。DNA测序技术的快速发展为分子生物学研究提供了大量的组学资源,也为全基因组水平逆转录转座子的系统分析提供了数据支持。本研究基于已发表的栉孔扇贝(Chlamys farreri)基因组信息,系统分析了栉孔扇贝LTR逆转录转座子的基因组分布特征及在胚胎发育各个时期和成体各个组织的表达模式。研究发现栉孔扇贝LTR总长度与染色体长度呈正相关关系,而LTR密度(每Mb染色体上的LTR拷贝数)与染色体长度呈负相关关系;Gypsy、Ngaro和DIRS是栉孔扇贝基因组中数量最多、总长度最长的三类LTR亚家族,且主要分布在基因间区;相比于其它种类的LTR,Gypsy和Ngaro在胚胎发育各个时期和各个成体组织/器官中具有显著的表达优势,而且在胚胎发育过程中呈现动态表达模式,其中表达量的峰值和低谷分别出现在担轮幼虫时期和壳顶幼虫时期;Gypsy和Ngaro在大部分组织/器官中占据表达优势,唯一例外的组织是肝胰腺,其表达量最高的LTR类型为ERV1。本研究对栉孔扇贝逆转录转座子基因组分布特征及时空表达模式的系统分析为进一步理解转座子的功能以及对基因组进化的作用提供了重要线索。 展开更多
关键词 栉孔扇贝 LTR逆转录转座子 分布特征 时空表达模式
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谷子m^(6)A甲基转移酶基因SiMTA1的启动子序列特征和基因表达模式分析
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作者 沈傲 刘敏 +1 位作者 倪迪安 刘炜 《作物学报》 北大核心 2025年第7期1969-1978,共10页
MTA作为植物m^(6)A甲基转移酶之一,主要参与RNA的甲基化修饰,同时还可与其他酶相互作用,影响胚胎发育,在植物的生长发育中扮演着关键角色。本研究通过拟南芥甲基转移酶序列同源比对,得到谷子SiMTA1基因(accession no. PQ801843),该基因... MTA作为植物m^(6)A甲基转移酶之一,主要参与RNA的甲基化修饰,同时还可与其他酶相互作用,影响胚胎发育,在植物的生长发育中扮演着关键角色。本研究通过拟南芥甲基转移酶序列同源比对,得到谷子SiMTA1基因(accession no. PQ801843),该基因DNA序列全长4239 bp, CDS序列2121 bp,包含706个氨基酸残基。对其核苷酸及蛋白序列进行生物信息学分析、并解析其启动子顺式作用元件,通过qRT-PCR方法对SiMTA1在时空表达和各种胁迫及激素处理下的表达模式进行研究。结果显示, SiMTA1具有MT-A70结构域,即N^(6)-腺苷-甲基转移酶(MTase)的S-腺苷甲硫氨酸(SAM)结合亚基;二级结构预测显示,SiMTA1主要是由无规则卷曲和α-螺旋组成;SiMTA1启动子包含多种胁迫和植物激素信号应答元件;SiMTA1在孕穗期的茎节部的表达量较高;盐、干旱、生长素、细胞分裂素等均可诱导SiMTA1表达。本研究通过对谷子中甲基转移酶基因SiMTA1启动子特性及其在正常及胁迫条件下时空表达模式的研究发现, SiMTA1可能在谷子发育及胁迫和植物激素响应过程中发挥作用。研究结果为后续谷子耐逆品种的改良及新品种培育提供了理论依据及候选基因资源。 展开更多
关键词 谷子 甲基转移酶SiMTA1 启动子序列特征 胁迫及植物激素响应 时空表达模式
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C-型咽侧体抑制素(AST-C)和促前胸腺激素释放激素(PTTH)基因在家蚕脑组织中的时空表达分析
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作者 甘玲 刘喜龙 何宁佳 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期706-711,共6页
【目的】咽侧体抑制素在昆虫体内具有重要的调控功能。本研究比较了家蚕Bombyx mori C-型咽侧体抑制素(allatostatin C,AST-C)与促前胸腺激素释放激素(prothoracicotropic hormone,PTTH)基因在不同发育阶段家蚕脑组织中转录表达的模式... 【目的】咽侧体抑制素在昆虫体内具有重要的调控功能。本研究比较了家蚕Bombyx mori C-型咽侧体抑制素(allatostatin C,AST-C)与促前胸腺激素释放激素(prothoracicotropic hormone,PTTH)基因在不同发育阶段家蚕脑组织中转录表达的模式及其在脑组织的表达定位,以期为家蚕AST-C的功能研究提供重要的线索。【方法】利用脑组织芯片数据分析比较AST-C和PTTH基因在家蚕脑组织中的发育表达特征,RT-PCR验证其芯片数据,分析AST-C在不同发育阶段家蚕中枢神经系统中的表达模式,并用全组织包埋原位杂交技术对AST-C和PTTH在脑组织的表达进行定位。【结果】AST-C和PTTH在不同发育阶段家蚕脑组织中有相似的转录表达模式,且都在脑组织外侧一对神经分泌细胞中表达。【结论】AST-C可能与PTTH以相同的转录表达模式共同参与家蚕的变态发育调控。 展开更多
关键词 家蚕 C-型咽侧体抑制素 转录 表达模式 原位杂交 时空表达模式
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Fox家族在非洲爪蟾胚胎发育中的表达模式及作用
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作者 申姗姗 任斐 陈晓虹 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期136-138,I0001,共4页
Forkhead转录因子家族具有一段高度保守的DNA结合结构域,具有转录活化、抑制作用,能够通过信号转导和转录调控对细胞周期、分化、代谢、凋亡、免疫及生长发育等产生影响。非洲爪蟾是胚胎学研究中主要的两栖类动物模型,很多Fox家族成员... Forkhead转录因子家族具有一段高度保守的DNA结合结构域,具有转录活化、抑制作用,能够通过信号转导和转录调控对细胞周期、分化、代谢、凋亡、免疫及生长发育等产生影响。非洲爪蟾是胚胎学研究中主要的两栖类动物模型,很多Fox家族成员对非洲爪蟾胚胎发育的不同阶段都有影响。阐述了Fox家族的结构特征及其成员在非洲爪蟾胚胎发育过程中的时空表达模式,以及其对非洲爪蟾胚胎发育的影响。 展开更多
关键词 Forkhead转录因子 胚胎发育 时空表达模式 非洲爪蟾
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西方蜜蜂m 6A甲基转移酶的基因克隆、多克隆抗体制备及表达模式 被引量:9
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作者 吴鹰 刘治滩 +9 位作者 赵浩东 郭思佳 刘小玉 张艺琼 冯佩林 赵红霞 徐细建 陈大福 付中民 郭睿 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期885-895,共11页
【目的】本研究旨在克隆西方蜜蜂Apis mellifera RNA m 6A甲基转移酶14(methyltransferase 14,METTL14)基因AmMETTL14,分析AmMETTL14的理化性质和分子特性以及AmMETTL14在工蜂不同发育阶段和不同组织中的表达模式,并制备AmMETTL14多克... 【目的】本研究旨在克隆西方蜜蜂Apis mellifera RNA m 6A甲基转移酶14(methyltransferase 14,METTL14)基因AmMETTL14,分析AmMETTL14的理化性质和分子特性以及AmMETTL14在工蜂不同发育阶段和不同组织中的表达模式,并制备AmMETTL14多克隆抗体,为持续深入开展AmMETTL14的功能研究提供参考和基础。【方法】通过PCR扩增西方蜜蜂AmMETTL14的CDS并进行Sanger测序验证。使用相关生物信息学软件对AmMETTL14进行生物信息学分析,并构建系统进化树。通过原核表达系统诱导表达AmMETTL14融合蛋白,免疫新西兰白兔以制备多克隆抗体,利用ELISA和Western blot分别检测抗体的效价及特异性。采用RT-qPCR检测AmMETTL14在卵、幼虫、预蛹、蛹及工蜂成虫中以及刚出房工蜂成虫的触角、毒腺、脑、中肠、咽下腺、脂肪体和表皮7种组织中的相对表达量。【结果】成功克隆到西方蜜蜂AmMETTL14的CDS;AmMETTL14的分子式为C 1957 H 3113 N 567 O 589 S 15,分子量约为44.49 kD,脂溶系数为79.97,理论等电点为8.58,平均亲水系数为-0.59,不含典型的跨膜结构域和信号肽,可同时定位于细胞核、线粒体和细胞质;西方蜜蜂、中华蜜蜂A.cerana cerana、黑大蜜蜂A.laboriosa、东方蜜蜂A.cerana、大蜜蜂A.dorsata、小蜜蜂A.florea、欧洲熊蜂Bombus terrestris、金环胡蜂Vespa mandarinia、美洲东部熊蜂B.impatiens和黑腹果蝇Drosophila melanogaster的METTL14均含有MT-A70结构域和3个相同的保守基序;AmMETTL14与黑大蜜蜂的METTL14的氨基酸序列一致性最高(65.60%)且亲缘关系最近。制备的AmMETTL14多克隆抗体效价较高(大于512 K)且特异性较强。AmMETTL14在7和8日龄预蛹与卵中的表达量相近且均显著高于在3日龄幼虫中的表达量,在12日龄蛹中的表达量显著高于卵、幼虫和预蛹中的表达量,在6,12和15日龄工蜂成虫体内的表达量显著高于1日龄工蜂成虫体内的表达量;AmMETTL14在刚出房工蜂成虫脑和咽下腺中的表达量与触角中的表达量相近且均显著高于在毒腺、中肠、脂肪体和表皮中的表达量。【结论】研究结果表明,AmMETTL14可能为亲水性、非跨膜和胞内蛋白,AmMETTL14在幼虫生长发育中发挥潜在的调控作用,制备得到的AmMETTL14的多克隆抗体效价高、灵敏度高和特异性强,为进一步探究AmMETTL14的功能及其参与的表观调控机制打下了基础。 展开更多
关键词 西方蜜蜂 N 6-甲基腺苷 甲基化转移酶14 时空表达模式 MT-A70 抗体
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谷子SiNADP-ME1基因的光响应模式
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作者 李颜方 杜晓芬 +5 位作者 赵淑培 连世超 王智兰 赵晋锋 杜艳伟 王军 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1897-1905,共9页
为探究谷子光合基因SiNADP-ME1(Seita.3G109300)对光照强度和光质的响应模式,本研究以豫谷1号为材料,采用反转录PCR(RT-PCR)克隆SiNADP-ME1的编码序列(CDS序列),利用MEGA软件构建多物种进化树,构建PCAMBIA1300-SiNADP-ME1-GFP载体,转化... 为探究谷子光合基因SiNADP-ME1(Seita.3G109300)对光照强度和光质的响应模式,本研究以豫谷1号为材料,采用反转录PCR(RT-PCR)克隆SiNADP-ME1的编码序列(CDS序列),利用MEGA软件构建多物种进化树,构建PCAMBIA1300-SiNADP-ME1-GFP载体,转化农杆菌,注射烟草进行亚细胞定位,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)研究其在不同光照强度、光质处理下的表达模式。结果表明,SiNADP-ME1全长CDS序列为1731 bp,共编码576个氨基酸,定位于内质网,与狗尾草中SvNADP-ME1(XP_034584220.1)亲缘关系最近。该基因在不同组织器官及不同生育期表达量存在显著差异,在灌浆期穗中表达量最高,同时响应不同光强和光质,在不同光照强度处理下,SiNADP-ME1的表达呈显著变化,在1200μmol·m^(-2)·s^(-1)光照3 h表达量最高,是对照(正常光照,250μmol·m^(-2)·s^(-1))的4.25倍;在不同光质处理下,受红光影响最大,红光下表达量是黑暗处理表达量的47.27倍,是白光处理表达量的2.69倍。本研究结果为深入探讨SiNADP-ME1基因的生物学功能提供了一定的参考依据。 展开更多
关键词 谷子 SiNADP-ME1基因 时空表达模式 光照强度 光质
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合浦珠母贝BMP7b基因的克隆与表达分析 被引量:5
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作者 范嗣刚 周代志 +3 位作者 刘宝锁 邓正华 郭奕惠 喻达辉 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期121-126,共6页
为了解骨形态发生蛋白(BMP)在贝类生物矿化方面的作用,该研究发现并克隆了合浦珠母贝(Pinctada fucata)BMP7的同源基因BMP7b,并对其进行了组织表达分析。结果显示,该基因c DNA长2 464 bp,其中ORF长1 194 bp,编码397个氨基酸。BMP7b蛋白... 为了解骨形态发生蛋白(BMP)在贝类生物矿化方面的作用,该研究发现并克隆了合浦珠母贝(Pinctada fucata)BMP7的同源基因BMP7b,并对其进行了组织表达分析。结果显示,该基因c DNA长2 464 bp,其中ORF长1 194 bp,编码397个氨基酸。BMP7b蛋白无跨膜结构,含有1个信号肽(1~26 aa),1个TGF-β前肽结构域(25~240 aa)和1个TGF-β结构域(299~396 aa)。BMP7b在各组织和各胚胎发育时期中均有表达,在鳃和外套膜的表达量高,在肠和肝胰腺的表达量低;在担轮幼虫期的表达量远远高于其他时期。贝壳缺刻实验显示24 h后,BMP7b表达量显著上升。以上结果表明BMP7b可能在合浦珠母贝贝壳形成和修护过程中起重要作用。 展开更多
关键词 合浦珠母贝 BMP7b 时空表达模式 贝壳形成与修复
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鸡Lats1基因在卵泡不同发育期的半定量表达研究
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作者 吕智超 李旭 +2 位作者 武斌 徐日福 张云影 《吉林畜牧兽医》 2021年第11期6-7,共2页
本实验以150日龄的海兰褐蛋鸡为试验材料,采用半定量RT-PCR方法检测海兰褐蛋鸡不同等级卵泡发育时期Lats1基因的mRNA表达水平,实验结果得出Lats1基因存在于海兰褐蛋鸡卵泡发育各个时期,并呈现一定表达规律,说明Lats1基因参与家禽开产时... 本实验以150日龄的海兰褐蛋鸡为试验材料,采用半定量RT-PCR方法检测海兰褐蛋鸡不同等级卵泡发育时期Lats1基因的mRNA表达水平,实验结果得出Lats1基因存在于海兰褐蛋鸡卵泡发育各个时期,并呈现一定表达规律,说明Lats1基因参与家禽开产时卵泡发育的调控,有促进细胞生长的作用。本实验为进一步研究Hippo信号通路在鸡卵泡不同发育时期控制细胞增殖时空表达模式打下基础。 展开更多
关键词 海兰褐蛋鸡 MRNA表达水平 卵泡发育 定量表达 不同发育期 时空表达模式 不同等级 细胞增殖
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镉污染土壤中甘薯镉元素的时空积累规律 被引量:4
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作者 张道微 董芳 +2 位作者 张亚 黄艳岚 张超凡 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2020年第S01期289-298,共10页
为进一步明确甘薯镉元素的时空积累规律,探索甘薯薯肉低镉积累特性形成的原因,利用原子吸收光谱仪检测了在镉中度污染土壤和镉重度污染土壤生长条件下湘薯20号各组织器官镉分配与积累的时空差异,并用荧光定量PCR检测分析了与之对应的甘... 为进一步明确甘薯镉元素的时空积累规律,探索甘薯薯肉低镉积累特性形成的原因,利用原子吸收光谱仪检测了在镉中度污染土壤和镉重度污染土壤生长条件下湘薯20号各组织器官镉分配与积累的时空差异,并用荧光定量PCR检测分析了与之对应的甘薯镉积累相关同源基因的表达差异。研究发现,镉污染土壤中甘薯的镉积累符合根>茎>叶的特性,当土壤镉浓度增加至0.6 mg/kg或2.0 mg/kg时,相对于阴性对照,各部位镉含量增加的倍数分别为3.05~8.75和6.25~26.89;各组织器官随生长时间延长植株镉积累量逐渐增加,地上部茎叶镉积累速率高于薯肉镉积累速率,且叶片中积累的镉不易发生二次转移,因而新叶中镉含量低于老叶。植物镉积累和转运相关的基因在甘薯基因组存在同源基因,且多数存在多个同源拷贝,虽然这些基因在一定程度上随着镉积累量的增加而被诱导表达,但是各拷贝之间的时空表达模式存在差异。相对于镉积累调控相关基因的表达,胁迫响应相关基因受镉胁迫诱导表达的趋势更为明显。镉污染土壤中甘薯的镉积累随着土壤镉浓度增加而增加,随着生长时间延长而增加。甘薯薯肉的镉积累规律较为特殊,薯肉镉积累量低于薯皮、茎、叶等部位,且随着生长时间的增加,薯肉镉积累速率也远低于地上部茎叶。植物镉积累和转运相关的基因在甘薯基因组存在同源基因,且多数存在多个同源拷贝,各拷贝之间的时空表达模式存在差异,推测这种表达差异与甘薯的镉积累特性有关。 展开更多
关键词 甘薯 镉的积累 同源基因 时空表达模式
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大豆GmABI4基因克隆及表达分析 被引量:2
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作者 江如 周文冠 +3 位作者 赵思华 尹晗 杨文钰 舒凯 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1010-1016,共7页
该研究基于大豆基因组数据库,根据拟南芥ABI4蛋白的氨基酸序列,经比对分析,获得了大豆中的2个GmABI4基因,分别命名为GmABI4-1(GenBank登录号为XM_014766551.1)和GmABI4-2(GenBank登录号为NM_001249003)。TMHMM软件和系统进化转录分析表... 该研究基于大豆基因组数据库,根据拟南芥ABI4蛋白的氨基酸序列,经比对分析,获得了大豆中的2个GmABI4基因,分别命名为GmABI4-1(GenBank登录号为XM_014766551.1)和GmABI4-2(GenBank登录号为NM_001249003)。TMHMM软件和系统进化转录分析表明,这2个基因编码的蛋白均不具有信号肽,二级结构主要以无规则卷曲和延伸链为主;进化树分析表明,大豆GmABI4和野生大豆亲缘关系较近。荧光定量PCR分析表明,GmABI4-1与GmABI4-2基因在大豆种子与豆荚中的表达量均高于根、茎、叶、花等其他组织,推测可能与调控大豆种子生命活动相关。 展开更多
关键词 大豆 GmABI4 生物信息学分析 时空表达模式
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大豆阴蔽响应基因GmIF-3的克隆与表达分析
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作者 黎艳 蒋亨珂 +5 位作者 孙歆 尚静 余靓 刘春燕 杨文钰 杜俊波 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2020年第1期1-7,14,共8页
【目的】对大豆阴蔽响应基因GmIF-3进行克隆与表达分析。【方法】前期采用蛋白磷酸化组学分析了大豆全蛋白组在白光及阴蔽胁迫下的磷酸化水平,筛选到1个受阴蔽诱导磷酸化水平显著升高的IF-3(translation initiation factor)蛋白,将其基... 【目的】对大豆阴蔽响应基因GmIF-3进行克隆与表达分析。【方法】前期采用蛋白磷酸化组学分析了大豆全蛋白组在白光及阴蔽胁迫下的磷酸化水平,筛选到1个受阴蔽诱导磷酸化水平显著升高的IF-3(translation initiation factor)蛋白,将其基因命名为GmIF-3(Glyma.17G072300)。利用生物信息学分析其启动子序列、蛋白结构、蛋白疏水性等生化特性;采用Gateway®克隆方法克隆该基因的cDNA序列;采用实时荧光定量PCR检测该基因的组织表达模式及阴蔽处理下的表达情况。【结果】生物信息学分析表明:GmIF-3位于大豆第17号染色体上,可编码274个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白等电点为9.11,分子量为30.83 ku,启动子含有多个与光信号响应和激素响应的顺式作用元件。实时荧光定量PCR显示:GmIF-3基因在真叶中的相对表达量最高,在三出复叶、茎尖分生组织、根、茎、叶柄、子叶、花和荚等多种器官中也均有表达。对大豆幼苗阴蔽处理0、1、2、4和6 h后,GmIF-3的表达量显著升高,阴蔽6 h的相对表达量最高,约为对照(阴蔽0 h)的8.3倍。【结论】GmIF-3基因可能参与大豆对阴蔽胁迫的应答过程。 展开更多
关键词 大豆 阴蔽胁迫 生物信息学分析 基因克隆 时空表达模式
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鲫Kaiso基因cDNA的克隆和表达分析
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作者 陈海炎 黄万旭 罗琛 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期1-7,共7页
在爪蟾和斑马鱼中,Kaiso是一种在整个基因组范围内与甲基化CpG序列特异性结合的转录抑制因子,在调控被甲基化基因表达的时间模式中起重要的作用。为深入研究DNA甲基化对我国重要养殖鱼类生殖和发育的影响,我们克隆了鲫Kaiso基因的cDNA序... 在爪蟾和斑马鱼中,Kaiso是一种在整个基因组范围内与甲基化CpG序列特异性结合的转录抑制因子,在调控被甲基化基因表达的时间模式中起重要的作用。为深入研究DNA甲基化对我国重要养殖鱼类生殖和发育的影响,我们克隆了鲫Kaiso基因的cDNA序列,并对其时空表达模式进行了分析。该cDNA全长3145bp,5′-非翻译区132 bp,3′-非翻译区1117 bp,开放阅读框1896 bp,编码631个氨基酸。鲫Kaiso蛋白与其他物种Kaiso蛋白的同源性分析表明,与其他物种一样,其N端和C端分别有高保守性的BTB/POZ结构域和锌指结构域。整胚原位杂交结果显示,Kaiso mRNA在早期胚胎发育的各个时期均广泛表达,信号均一,但从尾芽期开始出现组织特异性表达差异。对不同发育阶段胚胎的实时定量PCR检测结果表明:卵子中有高丰度的母源Kaiso mRNA存在;在卵裂期至囊胚中期胚胎中Kaiso mRNA的丰度逐渐降低;从囊胚中期至原肠早期都维持在最低水平状态;原肠后期其表达水平又逐渐升高,至尾芽期达到与未受精卵中相当的高水平后在器官发生期的整体水平又稍有下降。Kaiso mRNA丰度在胚胎发育早期的这种变化过程提示在卵裂期检测到的mRNA可能都是母源mRNA,合子核Kaiso基因可能是在囊胚晚期后才开始转录。对成体不同组织的实时定量PCR检测结果表明Kaiso的表达存在明显的组织特异性差异,在鲫肌肉、视网膜、心脏和脑中表达水平较高,而在肾、胰、肝等器官中表达水平很低。Kaiso表达的时间和组织特异性提示其作为甲基化基因的转录抑制因子参与了胚胎和成体基因表达时空模式的调控。这些结果为进一步研究Kaiso和DNA甲基化修饰在鲫发育调控和遗传育种中的作用提供了基础资料。 展开更多
关键词 Kaiso 基因克隆 表达时空模式
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