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两种大眼蟹线粒体12S rRNA基因序列的比较研究
被引量:
4
1
作者
徐敬明
《水产科学》
CAS
北大核心
2009年第12期779-782,共4页
测定了宽身大眼蟹和日本大眼蟹线粒体12S rRNA基因部分片段的序列,前者为577 bp,后者为572 bp。二者的核苷酸序列A、T、G、C的含量相似,分别为39.0%、35.7%、16.5%、8.8%;39.3%、36.2%、15.8%、8.7%;不包括11处插入/缺失位点,两序列间...
测定了宽身大眼蟹和日本大眼蟹线粒体12S rRNA基因部分片段的序列,前者为577 bp,后者为572 bp。二者的核苷酸序列A、T、G、C的含量相似,分别为39.0%、35.7%、16.5%、8.8%;39.3%、36.2%、15.8%、8.7%;不包括11处插入/缺失位点,两序列间有75个变异位点,核苷酸差异率为13.18%,其中转换42个、颠换33个,转换与颠换比约为1.3。对国内外4种大眼蟹长度为331bp的12S rRNA基因同源序列进行分析,A+T的平均含量为76.6%,明显高于G+C的平均含量,且存有变异位点52个,简约信息位点25个。系统发生树的拓扑结构显示,所有的大眼蟹聚为一支,支持大眼蟹类为一单系。
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关键词
宽身
大眼
蟹
日本大眼蟹
12S
RRNA
序列
系统发生
在线阅读
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职称材料
两种大眼蟹线粒体16S rRNA基因序列分析
被引量:
3
2
作者
徐敬明
《海洋通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期57-61,共5页
测定了宽身大眼蟹和日本大眼蟹线粒体16SrRNA基因部分片段的序列,其长度均为517bp。二者的核苷酸序列A,T,G,C的含量相似:宽身大眼蟹分别为33.3%,35.6%,19.9%,11.2%;日本大眼蟹分别为35.2%,35.4%,18.4%,11.0%。不包括6处插入/缺失位点,...
测定了宽身大眼蟹和日本大眼蟹线粒体16SrRNA基因部分片段的序列,其长度均为517bp。二者的核苷酸序列A,T,G,C的含量相似:宽身大眼蟹分别为33.3%,35.6%,19.9%,11.2%;日本大眼蟹分别为35.2%,35.4%,18.4%,11.0%。不包括6处插入/缺失位点,两序列间有63个变异位点,核苷酸差异率为12.26%,其中转换32个、颠换31个,转换与颠换比约为1.0。对国内外大眼蟹的24条长度为415bp的16SrRNA基因同源序列进行分析,A+T的平均含量为71.7%,明显高于G+C的平均含量,且存有变异位点171个,简约信息位点137个。中国和日本的日本大眼蟹之间的核苷酸差异率为4.42%,表明二者已有明显的遗传分化;中国的日本大眼蟹与日本的万岁大眼蟹之间的核苷酸差异率仅为0.21%,表明二者有可能为同一物种。上述结果得到了系统发生树拓扑结构的支持。
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关键词
宽身
大眼
蟹
日本大眼蟹
16S
RRNA
序列
系统发生
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职称材料
2种大眼蟹线粒体COI基因序列的比较研究
被引量:
2
3
作者
徐敬明
《水生态学杂志》
北大核心
2010年第2期42-47,共6页
测定了宽身大眼蟹(Macrophthalmus dilatatum)和日本大眼蟹(M.japonicus)线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI)基因片段的序列,其长度均为658bp,A、T、G、C的含量宽身大眼蟹为27.4%、30.9%、17.3%、24.4%,日本大眼蟹为25.8%、32.0%、17.4%、2...
测定了宽身大眼蟹(Macrophthalmus dilatatum)和日本大眼蟹(M.japonicus)线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI)基因片段的序列,其长度均为658bp,A、T、G、C的含量宽身大眼蟹为27.4%、30.9%、17.3%、24.4%,日本大眼蟹为25.8%、32.0%、17.4%、24.7%。宽身大眼蟹只有1种单倍型,日本大眼蟹出现2种单倍型,2种间有123(124)个变异位点,核苷酸差异率为18.69%(18.85%),其中转换68(69)处,颠换55(55)处,转换与颠换比约为1.2(1.3);种间差异远大于种内个体间差异(0.61%)。2种大眼蟹的AT(57.9%)含量明显高于GC含量,与其他蟹类COI基因研究结果相似。系统发生树的拓扑结构支持大眼蟹科与弓蟹科亲缘关系相对较近,二者为姊妹群关系。
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关键词
宽身
大眼
蟹
日本大眼蟹
COI
序列
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职称材料
题名
两种大眼蟹线粒体12S rRNA基因序列的比较研究
被引量:
4
1
作者
徐敬明
机构
重庆文理学院生命科学与技术学院
出处
《水产科学》
CAS
北大核心
2009年第12期779-782,共4页
基金
重庆文理学院引进人才专项
文摘
测定了宽身大眼蟹和日本大眼蟹线粒体12S rRNA基因部分片段的序列,前者为577 bp,后者为572 bp。二者的核苷酸序列A、T、G、C的含量相似,分别为39.0%、35.7%、16.5%、8.8%;39.3%、36.2%、15.8%、8.7%;不包括11处插入/缺失位点,两序列间有75个变异位点,核苷酸差异率为13.18%,其中转换42个、颠换33个,转换与颠换比约为1.3。对国内外4种大眼蟹长度为331bp的12S rRNA基因同源序列进行分析,A+T的平均含量为76.6%,明显高于G+C的平均含量,且存有变异位点52个,简约信息位点25个。系统发生树的拓扑结构显示,所有的大眼蟹聚为一支,支持大眼蟹类为一单系。
关键词
宽身
大眼
蟹
日本大眼蟹
12S
RRNA
序列
系统发生
Keywords
Macrophthalmus dilatatum
M. japonicus
12S rRNA
sequence
phylogeny
分类号
Q953 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
两种大眼蟹线粒体16S rRNA基因序列分析
被引量:
3
2
作者
徐敬明
机构
重庆文理学院生命科学与技术学院
出处
《海洋通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期57-61,共5页
基金
重庆文理学院引进人才专项
文摘
测定了宽身大眼蟹和日本大眼蟹线粒体16SrRNA基因部分片段的序列,其长度均为517bp。二者的核苷酸序列A,T,G,C的含量相似:宽身大眼蟹分别为33.3%,35.6%,19.9%,11.2%;日本大眼蟹分别为35.2%,35.4%,18.4%,11.0%。不包括6处插入/缺失位点,两序列间有63个变异位点,核苷酸差异率为12.26%,其中转换32个、颠换31个,转换与颠换比约为1.0。对国内外大眼蟹的24条长度为415bp的16SrRNA基因同源序列进行分析,A+T的平均含量为71.7%,明显高于G+C的平均含量,且存有变异位点171个,简约信息位点137个。中国和日本的日本大眼蟹之间的核苷酸差异率为4.42%,表明二者已有明显的遗传分化;中国的日本大眼蟹与日本的万岁大眼蟹之间的核苷酸差异率仅为0.21%,表明二者有可能为同一物种。上述结果得到了系统发生树拓扑结构的支持。
关键词
宽身
大眼
蟹
日本大眼蟹
16S
RRNA
序列
系统发生
Keywords
Macrophthalmus dilatatum
M. japonica
16 S rRNA
sequence
phylogeny
分类号
P735 [天文地球—海洋生物学]
Q953.1 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
2种大眼蟹线粒体COI基因序列的比较研究
被引量:
2
3
作者
徐敬明
机构
重庆文理学院生命科学与技术学院
出处
《水生态学杂志》
北大核心
2010年第2期42-47,共6页
基金
重庆文理学院引进人才专项
文摘
测定了宽身大眼蟹(Macrophthalmus dilatatum)和日本大眼蟹(M.japonicus)线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI)基因片段的序列,其长度均为658bp,A、T、G、C的含量宽身大眼蟹为27.4%、30.9%、17.3%、24.4%,日本大眼蟹为25.8%、32.0%、17.4%、24.7%。宽身大眼蟹只有1种单倍型,日本大眼蟹出现2种单倍型,2种间有123(124)个变异位点,核苷酸差异率为18.69%(18.85%),其中转换68(69)处,颠换55(55)处,转换与颠换比约为1.2(1.3);种间差异远大于种内个体间差异(0.61%)。2种大眼蟹的AT(57.9%)含量明显高于GC含量,与其他蟹类COI基因研究结果相似。系统发生树的拓扑结构支持大眼蟹科与弓蟹科亲缘关系相对较近,二者为姊妹群关系。
关键词
宽身
大眼
蟹
日本大眼蟹
COI
序列
Keywords
Macrophthalmus dilatatum
M.japonicus
COI
Sequence
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
两种大眼蟹线粒体12S rRNA基因序列的比较研究
徐敬明
《水产科学》
CAS
北大核心
2009
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
两种大眼蟹线粒体16S rRNA基因序列分析
徐敬明
《海洋通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
2种大眼蟹线粒体COI基因序列的比较研究
徐敬明
《水生态学杂志》
北大核心
2010
2
在线阅读
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职称材料
已选择
0
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