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致病疫霉菌无毒基因AVR3a的克隆与序列分析
被引量:
3
1
作者
兰成忠
陈庆河
+5 位作者
汪进仕
胡方平
李本金
赵健
邱荣洲
翁启勇
《福建农业学报》
CAS
2008年第3期235-238,共4页
根据GenBank中致病疫霉菌无毒基因AVR3a序列(AJ893357)及参考文献中的特异引物(Pex147F,Pex147R),以致病疫霉菌基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到了特异性扩增片段,并对特异片段进行纯化和测序。结果表明,该片段的长度为451 bp,经序列分...
根据GenBank中致病疫霉菌无毒基因AVR3a序列(AJ893357)及参考文献中的特异引物(Pex147F,Pex147R),以致病疫霉菌基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到了特异性扩增片段,并对特异片段进行纯化和测序。结果表明,该片段的长度为451 bp,经序列分析表明,其氨基酸编码序列为441 bp,共编码147个氨基酸。BLAST分析结果显示,该片段核苷酸序列与无毒基因AVR3a核苷酸序列的同源性为99.34%,氨基酸序列比对结果表明,氨基酸序列在第19、80和103位存在着差异,这些核苷酸序列差异以及某些关键氨基酸的改变有可能是导致不同菌株中AVR3a毒性变异的原因。
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关键词
马铃薯
致病疫霉菌
无毒基因avr3a
毒性
基因
克隆
序列分析
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职称材料
题名
致病疫霉菌无毒基因AVR3a的克隆与序列分析
被引量:
3
1
作者
兰成忠
陈庆河
汪进仕
胡方平
李本金
赵健
邱荣洲
翁启勇
机构
福建农林大学植物保护学院
福建省农业科学院植物保护研究所
出处
《福建农业学报》
CAS
2008年第3期235-238,共4页
基金
国家自然科学基金项目(30600401)
农业部公益性行业(农业)科研专项(nyhyzx07-053)
+1 种基金
福建省农业科学院青年科技人才创新项目(闽农科院发[2006]157号)
福建省财政专项-福建省农业科学院科技创新团队建设基金(STIF-Y07)
文摘
根据GenBank中致病疫霉菌无毒基因AVR3a序列(AJ893357)及参考文献中的特异引物(Pex147F,Pex147R),以致病疫霉菌基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到了特异性扩增片段,并对特异片段进行纯化和测序。结果表明,该片段的长度为451 bp,经序列分析表明,其氨基酸编码序列为441 bp,共编码147个氨基酸。BLAST分析结果显示,该片段核苷酸序列与无毒基因AVR3a核苷酸序列的同源性为99.34%,氨基酸序列比对结果表明,氨基酸序列在第19、80和103位存在着差异,这些核苷酸序列差异以及某些关键氨基酸的改变有可能是导致不同菌株中AVR3a毒性变异的原因。
关键词
马铃薯
致病疫霉菌
无毒基因avr3a
毒性
基因
克隆
序列分析
Keywords
Potato
Phytophthora infestans
avr
3a
virulenace
gene cloning
sequence analysis
分类号
S435.32 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
致病疫霉菌无毒基因AVR3a的克隆与序列分析
兰成忠
陈庆河
汪进仕
胡方平
李本金
赵健
邱荣洲
翁启勇
《福建农业学报》
CAS
2008
3
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