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发现·辨识·优化——中药新药设计的核心与关键被引量：23: 1; 作者杨洪军雷燕 +5 位作者唐仕欢陈建新许海玉李韶菁陈畅黄璐琦《世界科学技术-中医药现代化》 2011年第1期154-158,共5页; 中药新药设计在中药新药研发中占有重要地位,对提升新药创制水平具有重大意义。本文围绕"组效关系",提出了中药新药设计的概念、研究框架及技术方法,将处方发现、成分辨识和组方优化作为中药新药设计的核心与关键,以期为中药... 展开更多; 关键词中药新药设计组效关系处方发现成分辨识组方优化系统建模; 在线阅读下载PDF 职称材料

R基团搜索技术用于HIV-1逆转录酶抑制剂的分子设计被引量：5: 2; 作者仝建波白敏 +1 位作者赵翔常佳《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期48-52,共5页; 本文采用基于R基团搜索技术的Topomer CoMFA方法对41个人类免疫缺陷病毒(HIV-1)逆转录酶抑制剂进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)分析。所得优化模型的拟合、交互验证及外部验证的复相关系数分别为0.995、0.859和0.945。采用Topomer Sea... 展开更多; 关键词逆转录酶抑制剂 TopomerCoMFA 定量构效关系 Topomer Search 新药设计; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于Topomer CoMFA的苯磺酰基亚胺噻唑衍生物的三维定量构效关系研究和分子设计被引量：4: 3; 作者仝建波秦尚尚 +1 位作者雷珊王洋《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2018年第6期925-932,共8页; 采用Topomer CoMFA方法对21个苯磺酰基亚胺噻唑衍生物进行三维定量构效关系研究,得到了HIV-1非核苷类逆转录酶抑制剂的3D-QSAR模型,其拟合复相关系数r2=0.964,交互验证复相关系数q2=0.801,外部验证复相关系数Qext2=0.959;采用基于片段... 展开更多; 关键词 Topomer COMFA 苯磺酰基亚胺噻唑衍生物定量构效关系 Topomer Search 新药设计; 在线阅读下载PDF 职称材料

R基团搜索技术用于2-氨基-6-磺酰苯甲腈衍生物的分子设计: 4; 作者仝建波白敏 +1 位作者赵翔常佳《陕西科技大学学报（自然科学版）》 2015年第6期67-71,81,共6页; 艾滋病对人类的健康构成了很大的威胁,因此,抗艾滋病药物的研究设计成为了当今社会的重要任务之一.本文采用基于R基团搜索技术的Topomer CoMFA方法,对60个2-氨基-6-磺酰苯甲腈衍生物分子进行了三维定量构效关系分析.所得优化模型的拟合... 展开更多; 关键词 2-氨基-6-磺酰苯甲腈衍生物定量构效关系新药设计; 在线阅读下载PDF 职称材料

应用药物累积法研究复方中药Ⅱ的药代动力学研究被引量：3: 5; 作者李艳华佟恒敏 +1 位作者闫清波于康震《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2007年第7期86-87,共2页; 关键词药代动力学复方中药药物剂型累积法应用有效成分新药设计给药方案; 在线阅读下载PDF 职称材料

HIV-1逆转录酶的分子对接及运动功能相关性分析被引量：1: 6; 作者杜文义胡建平 +3 位作者左柯梁立刘嵬苟小军《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期963-972,共10页; 目的研究逆转录酶的运动性和生理功能的关系,以及N-乙酰基-β-芳基-1,2-二脱氢乙胺类衍生化合物与其的分子识别,方法采用高斯网络模型和各向异性网络模型研究了p66和p66-DNA的运动模式差异,并用分子对接方法研究化合物与逆转录酶的识别... 展开更多; 关键词 HIV-1逆转录酶高斯网络模型各向异性网络模型分子对接新药设计; 在线阅读下载PDF 职称材料

TEM β-内酰胺酶变构位点与相应先导药物的研究: 7; 作者白雯静史彦斌 +1 位作者刘焕香邱国玉《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2020年第11期1116-1120,共5页; 目的对前期研究发现的TEM β-内酰胺酶变构位点的功能性进行进一步的验证,并针对该位点开展潜在的先导药物分子的研究。方法采用长时间全原子分子动力学模拟,分别对β-内酰胺酶的野生型结构与耐药性突变型进行模拟,通过分析活性位点和... 展开更多; 关键词 TEMβ-内酰胺酶耐药机制新药设计; 在线阅读下载PDF 职称材料

我国生化与分子药理学学科发展历程: 8; 作者李学军《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期725-726,共2页; 生化和分子药理学是药理学的一个重要分支。在四十年代还只在整体、器官和组织的水平上研究药物与机体相互作用。半个多世纪来,随着生物化学和分子生物学等新理论、新技术的融入,生化和分子药理学得到了迅速发展,神经递质、受体、多肽... 展开更多; 关键词分子药理学药物作用机制生化药理学生物学理论新药设计药物受体四十年代基因组学肠道微生态生命科学; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名发现·辨识·优化——中药新药设计的核心与关键被引量：23: 1; 作者杨洪军雷燕唐仕欢陈建新许海玉李韶菁陈畅黄璐琦; 机构中国中医科学院中药研究所中国中医科学院北京中医药大学; 出处《世界科学技术-中医药现代化》 2011年第1期154-158,共5页; 基金国家科技支撑计划项目(2008BAI51B03):基于有效成分群的中药组方设计技术研究子课题负责人:杨洪军 +4 种基金负责人:曹洪欣负责人:杨洪军; 文摘中药新药设计在中药新药研发中占有重要地位,对提升新药创制水平具有重大意义。本文围绕"组效关系",提出了中药新药设计的概念、研究框架及技术方法,将处方发现、成分辨识和组方优化作为中药新药设计的核心与关键,以期为中药新药创制提供理论和技术支撑。; 关键词中药新药设计组效关系处方发现成分辨识组方优化系统建模; Keywords Design of New Drug of Chinese Medicine, Combination-Activity Relationship, Prescription discovery,Component identification, Prescription optimization, System modeling; 分类号 R97 [医药卫生—药品]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名R基团搜索技术用于HIV-1逆转录酶抑制剂的分子设计被引量：5: 2; 作者仝建波白敏赵翔常佳; 机构陕西科技大学化学与化工学院; 出处《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期48-52,共5页; 基金陕西省自然科学基础研究计划(No.2015JM2057) 陕西科技大学研究生创新基金; 文摘本文采用基于R基团搜索技术的Topomer CoMFA方法对41个人类免疫缺陷病毒(HIV-1)逆转录酶抑制剂进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)分析。所得优化模型的拟合、交互验证及外部验证的复相关系数分别为0.995、0.859和0.945。采用Topomer Search技术对ZINC数据库进行R基团的虚拟筛选,得到R贡献高的基团,以活性最高的13号分子为模板进行过滤得到1个Ra基团和20个Rb基团。并以此设计得到20个新化合物分子,其中有19个化合物的预测活性值高于13号分子。研究结果表明,所建立的Topomer CoMFA模型具有良好的稳定性和预测能力,基于R基团的Topomer Search技术可以有效筛选并设计出新的HIV-1逆转录酶抑制剂,为抗艾滋病新药设计提供了理论依据。; 关键词逆转录酶抑制剂 TopomerCoMFA 定量构效关系 Topomer Search 新药设计; Keywords Reverse transcriptase inhibitors Topomer CoMFA Quantitative structure-activity relationship（QSAR） Topomer Search New drug design; 分类号 O641 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于Topomer CoMFA的苯磺酰基亚胺噻唑衍生物的三维定量构效关系研究和分子设计被引量：4: 3; 作者仝建波秦尚尚雷珊王洋; 机构陕西科技大学化学与化工学院教育部轻化工助剂化学与技术重点实验室; 出处《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2018年第6期925-932,共8页; 基金国家自然科学基金(21475081) 陕西省自然科学基础研究计划(2015JM2057) 陕西科技大学研究生创新基金; 文摘采用Topomer CoMFA方法对21个苯磺酰基亚胺噻唑衍生物进行三维定量构效关系研究,得到了HIV-1非核苷类逆转录酶抑制剂的3D-QSAR模型,其拟合复相关系数r2=0.964,交互验证复相关系数q2=0.801,外部验证复相关系数Qext2=0.959;采用基于片段的药物设计方法 Topomer Search从ZINC数据库中虚拟筛选出3个Ra基团和7个Rb基团,且设计得到21个新化合物.结果表明:该模型不仅稳定性良好,而且具有较强的预测能力;采用Topomer Search技术能够有效的筛选进而设计出新的化合物,为抗艾滋病新药的设计提供理论依据.; 关键词 Topomer COMFA 苯磺酰基亚胺噻唑衍生物定量构效关系 Topomer Search 新药设计; Keywords Topomer CoMFA Thiazolidenebenzenesulfonamide derivatives 3D-QSAR Topomer Search New drug design; 分类号 O656 [理学—分析化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名R基团搜索技术用于2-氨基-6-磺酰苯甲腈衍生物的分子设计: 4; 作者仝建波白敏赵翔常佳; 机构陕西科技大学化学与化工学院陕西科技大学教育部轻化工助剂化学与技术重点实验室; 出处《陕西科技大学学报（自然科学版）》 2015年第6期67-71,81,共6页; 基金陕西省科技厅科技计划项目(2011K07-13) 陕西省教育厅专项科研计划项目(12JK0629 +2 种基金 11JK0602) 榆林市科技计划项目陕西科技大学研究生创新基金项目; 文摘艾滋病对人类的健康构成了很大的威胁,因此,抗艾滋病药物的研究设计成为了当今社会的重要任务之一.本文采用基于R基团搜索技术的Topomer CoMFA方法,对60个2-氨基-6-磺酰苯甲腈衍生物分子进行了三维定量构效关系分析.所得优化模型的拟合、交互验证及外部验证的复相关系数分别为0.851、0.601和0.671;并采用Topomer Search技术对ZINC数据库进行R基团的虚拟筛选,最终得到5个Ra基团和2个Rb基团,并设计出了10个新化合物.研究结果表明:所建立的Topomer CoMFA模型具有良好的稳定性和预测能力;基于R基团的Topomer Search技术可以有效地筛选并设计出新的化合物,这为抗艾滋病新药设计提供了依据.; 关键词 2-氨基-6-磺酰苯甲腈衍生物定量构效关系新药设计; Keywords Topomer CoMFA Topomer Search Topomer CoMFA 2-amino-6-arylsulfonylbenzonitrile derivatives Topomer Search new drug design; 分类号 O641 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名应用药物累积法研究复方中药Ⅱ的药代动力学研究被引量：3: 5; 作者李艳华佟恒敏闫清波于康震; 机构东北农业大学动物医学院中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感开放实验室; 出处《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2007年第7期86-87,共2页; 关键词药代动力学复方中药药物剂型累积法应用有效成分新药设计给药方案; 分类号 S859.796 [农业科学—临床兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名HIV-1逆转录酶的分子对接及运动功能相关性分析被引量：1: 6; 作者杜文义胡建平左柯梁立刘嵬苟小军; 机构成都大学药食同源植物资源开发重点实验室乐山师范学院化学学院; 出处《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期963-972,共10页; 基金国家自然科学基金(11247018 11147175) +1 种基金乐山市科技计划项目(14SZD018); 文摘目的研究逆转录酶的运动性和生理功能的关系,以及N-乙酰基-β-芳基-1,2-二脱氢乙胺类衍生化合物与其的分子识别,方法采用高斯网络模型和各向异性网络模型研究了p66和p66-DNA的运动模式差异,并用分子对接方法研究化合物与逆转录酶的识别.结果 DNA的结合对p66各区域的运动方向影响不大,但其运动的幅度大大降低.分子对接结果发现Y115和M184的疏水结构在识别的过程中起到重要作用.结论基于各个区域的运动方向分析,推测手指区和RNase H区的开合运动可能是逆转录酶发挥逆转录功能的重要原因.并且,N-乙酰基-β-芳基-1。; 关键词 HIV-1逆转录酶高斯网络模型各向异性网络模型分子对接新药设计; Keywords HIV-1 reverse transcriptase Gaussian network model Anisotropic network model Molecular docking New drug design; 分类号 O64 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名TEM β-内酰胺酶变构位点与相应先导药物的研究: 7; 作者白雯静史彦斌刘焕香邱国玉; 机构兰州市食品药品检验所兰州大学药学院; 出处《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2020年第11期1116-1120,共5页; 基金国家自然科学基金(No.21675070)。; 文摘目的对前期研究发现的TEM β-内酰胺酶变构位点的功能性进行进一步的验证,并针对该位点开展潜在的先导药物分子的研究。方法采用长时间全原子分子动力学模拟,分别对β-内酰胺酶的野生型结构与耐药性突变型进行模拟,通过分析活性位点和变构位点在野生型与突变型中功能性变化的情况,以研究变构活性位点是否可以克服抗生素的耐药性;并针对变构位点采用虚拟筛选的方法,通过筛选大型化合物数据库,筛选潜在的先导候选药物分子。结果与结论长时间分子动力学模拟表明,不同于活性位点,β-内酰胺酶变构活性位点不会受到突变体的影响;虚拟筛选发现一些苯基呋喃类和吲哚类化合物可结合于变构位点,具有潜在的变构抑制调节功能。本文再次验证了前期发现的TEM β-内酰胺酶变构位点潜在的成药性,并针对该位点发现了两大类候选变构抑制剂。; 关键词 TEMβ-内酰胺酶耐药机制新药设计; Keywords TEMβ-lactamase Drug resistance mechanism Drug design; 分类号 R914.2 [医药卫生—药物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名我国生化与分子药理学学科发展历程: 8; 作者李学军; 机构中国药理学会副理事长兼司库生化与分子药理学专业委员会主任委员; 出处《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期725-726,共2页; 文摘生化和分子药理学是药理学的一个重要分支。在四十年代还只在整体、器官和组织的水平上研究药物与机体相互作用。半个多世纪来,随着生物化学和分子生物学等新理论、新技术的融入,生化和分子药理学得到了迅速发展,神经递质、受体、多肽、酶和代谢等的研究取得了可喜的成果,药物作用机制的研究也深入到分子水平,亦为新药设计提供了重要的依据。; 关键词分子药理学药物作用机制生化药理学生物学理论新药设计药物受体四十年代基因组学肠道微生态生命科学; 分类号 R96 [医药卫生—药理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	发现·辨识·优化——中药新药设计的核心与关键	杨洪军雷燕唐仕欢陈建新许海玉李韶菁陈畅黄璐琦	《世界科学技术-中医药现代化》	2011	23	在线阅读下载PDF 职称材料
2	R基团搜索技术用于HIV-1逆转录酶抑制剂的分子设计	仝建波白敏赵翔常佳	《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心	2016	5	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于Topomer CoMFA的苯磺酰基亚胺噻唑衍生物的三维定量构效关系研究和分子设计	仝建波秦尚尚雷珊王洋	《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心	2018	4	在线阅读下载PDF 职称材料
4	R基团搜索技术用于2-氨基-6-磺酰苯甲腈衍生物的分子设计	仝建波白敏赵翔常佳	《陕西科技大学学报（自然科学版）》	2015	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	应用药物累积法研究复方中药Ⅱ的药代动力学研究	李艳华佟恒敏闫清波于康震	《中国兽医杂志》 CAS 北大核心	2007	3	在线阅读下载PDF 职称材料
6	HIV-1逆转录酶的分子对接及运动功能相关性分析	杜文义胡建平左柯梁立刘嵬苟小军	《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心	2016	1	在线阅读下载PDF 职称材料
7	TEM β-内酰胺酶变构位点与相应先导药物的研究	白雯静史彦斌刘焕香邱国玉	《中国抗生素杂志》 CAS CSCD	2020	0	在线阅读下载PDF 职称材料
8	我国生化与分子药理学学科发展历程	李学军	《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2015	0	在线阅读下载PDF 职称材料