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羊口疮病毒新疆野毒株SHZ1 B2L和F1L基因的克隆及遗传进化分析
被引量：
4
1
作者
杨海波
贺志昊
+5 位作者
刘昱成
彭叶龙
王国超
孟庆玲
乔军
陈创夫
《石河子大学学报（自然科学版）》
CAS
2013年第3期323-327,共5页
为了研究羊口疮病毒(ORFv)新疆野毒株的遗传进化情况,参照GenBank公布的ORFv B2L和F1L基因序列,设计特异性引物,对ORFv SHZ1新疆野毒株B2L和F1L基因进行PCR扩增,克隆、测序后进行遗传进化分析。结果表明:新疆野毒株SHZ1与GenBank公布的...
为了研究羊口疮病毒(ORFv)新疆野毒株的遗传进化情况,参照GenBank公布的ORFv B2L和F1L基因序列,设计特异性引物,对ORFv SHZ1新疆野毒株B2L和F1L基因进行PCR扩增,克隆、测序后进行遗传进化分析。结果表明:新疆野毒株SHZ1与GenBank公布的不同地域的17个流行株相比,B2L基因核苷酸同源性为97.28%～98.86%,推导氨基酸同源性为88.65%～90.50%;F1L基因核苷酸同源性为94.56%～97.07%,推导氨基酸同源性为93.82%～95.88%。基于B2L基因的遗传进化树分析发现,SHZ1株B2L基因与我国现用疫苗株B2L基因亲缘关系较近;而基于F1L基因的遗传进化树显示,SHZ1株与意大利分离株的亲缘关系最近。本研究提示ORFv SHZ1株可能是国外流行株与疫苗株重组后产生的一个变异株。
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关键词
羊口疮病
毒
新疆野毒株shz1
B2L基因
F
1
L基因
遗传进化分析
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职称材料
题名
羊口疮病毒新疆野毒株SHZ1 B2L和F1L基因的克隆及遗传进化分析
被引量：
4
1
作者
杨海波
贺志昊
刘昱成
彭叶龙
王国超
孟庆玲
乔军
陈创夫
机构
石河子大学动物科技学院预防兽医学重点实验室
出处
《石河子大学学报（自然科学版）》
CAS
2013年第3期323-327,共5页
基金
新疆兵团国际科技合作计划项目(2012BC006)
农业公益行业专项(201303037-5)
文摘
为了研究羊口疮病毒(ORFv)新疆野毒株的遗传进化情况,参照GenBank公布的ORFv B2L和F1L基因序列,设计特异性引物,对ORFv SHZ1新疆野毒株B2L和F1L基因进行PCR扩增,克隆、测序后进行遗传进化分析。结果表明:新疆野毒株SHZ1与GenBank公布的不同地域的17个流行株相比,B2L基因核苷酸同源性为97.28%～98.86%,推导氨基酸同源性为88.65%～90.50%;F1L基因核苷酸同源性为94.56%～97.07%,推导氨基酸同源性为93.82%～95.88%。基于B2L基因的遗传进化树分析发现,SHZ1株B2L基因与我国现用疫苗株B2L基因亲缘关系较近;而基于F1L基因的遗传进化树显示,SHZ1株与意大利分离株的亲缘关系最近。本研究提示ORFv SHZ1株可能是国外流行株与疫苗株重组后产生的一个变异株。
关键词
羊口疮病
毒
新疆野毒株shz1
B2L基因
F
1
L基因
遗传进化分析
Keywords
Orf virus
Otfv Xinjiang wild strain
shz
I
B2L gene
FIL gene
phylogenetic analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
S858.26 [农业科学—临床兽医学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
羊口疮病毒新疆野毒株SHZ1 B2L和F1L基因的克隆及遗传进化分析
杨海波
贺志昊
刘昱成
彭叶龙
王国超
孟庆玲
乔军
陈创夫
《石河子大学学报（自然科学版）》
CAS
2013
4
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