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整合生物信息学和实验验证研究续苓健骨方抗骨质疏松作用机制
被引量：
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作者
陈玄
黄景文
+8 位作者
谢丽华
陈娟
李生强
叶云金
黄小彬
何艳艳
薛立鹏
陈赛楠
葛继荣
《中国骨质疏松杂志》
北大核心
2025年第3期321-329,共9页
目的系统性预测续苓健骨方治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的作用机制并实验验证。方法利用整合生物信息学方法分析药物的化合物信息及抗OP靶点、前20(TOP20)关键靶点及相关作用机制和信号通路。基于去卵巢(ovariectomy,OVX)大鼠模型,...
目的系统性预测续苓健骨方治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的作用机制并实验验证。方法利用整合生物信息学方法分析药物的化合物信息及抗OP靶点、前20(TOP20)关键靶点及相关作用机制和信号通路。基于去卵巢(ovariectomy,OVX)大鼠模型,骨密度(bone mineral density,BMD)、生物力学、Micro CT、HE染色等指标验证疗效;转录组学及GO和KEGG分析初步验证机制和相关靶点;qRT-PCR和Western blot方法进一步验证关键靶点。结果药物的144个有效成分作用于242个靶点,主要参与血管发生;刺激应答;细胞增殖、分化、凋亡、迁移和黏附;骨重建和破骨分化;物质代谢等。其中TOP20关键靶点对应10种中药的55种化学成分,骨碎补和续断的活性成分居多。药物治疗可明显改善OVX大鼠骨组织的BMD、生物力学、Micro CT下骨质量参数及骨组织形态;转录组学检测获差异表达基因679个,GO和KEGG分析其机制与整合生物信息学结果基本相符,在代谢相关信号通路方面有明显富集,TOP20靶点的表达水平均发生相应改变;qRT-PCR和Western blot结果进一步证实了Gapdh、Tnf、Spp1、Mmp2、Mmp1、Mapk3、Hif1a、Esr1等基因表达水平在造模及药物治疗前后发生了相反变化。结论续苓健骨方药效与骨碎补和续断具有密切关系,Gapdh、Hif1a等代谢相关基因调控的代谢信号通路可能在其中发挥重要作用。
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关键词
骨质疏松
整合生物信息学
续苓健骨方
代谢
mRNA表达谱芯片
转录组学
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职称材料
题名
整合生物信息学和实验验证研究续苓健骨方抗骨质疏松作用机制
被引量：
1
1
作者
陈玄
黄景文
谢丽华
陈娟
李生强
叶云金
黄小彬
何艳艳
薛立鹏
陈赛楠
葛继荣
机构
福建省中医药科学院
出处
《中国骨质疏松杂志》
北大核心
2025年第3期321-329,共9页
基金
福建省科技厅省属公益类科研院所基本科研专项(2020R1003007)
福建省科技厅省自然科学基金项目(2021J01917),福建省科技厅省属公益类科研院所基本科研专项(2022R1003002)
+1 种基金
国家中医药管理局高水平中医药重点学科建设项目(中医骨伤科学,zyyzdxk2023106)
福建中医药大学中医骨伤科学学科开放课题(XGS2023001)。
文摘
目的系统性预测续苓健骨方治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的作用机制并实验验证。方法利用整合生物信息学方法分析药物的化合物信息及抗OP靶点、前20(TOP20)关键靶点及相关作用机制和信号通路。基于去卵巢(ovariectomy,OVX)大鼠模型,骨密度(bone mineral density,BMD)、生物力学、Micro CT、HE染色等指标验证疗效;转录组学及GO和KEGG分析初步验证机制和相关靶点;qRT-PCR和Western blot方法进一步验证关键靶点。结果药物的144个有效成分作用于242个靶点,主要参与血管发生;刺激应答;细胞增殖、分化、凋亡、迁移和黏附;骨重建和破骨分化;物质代谢等。其中TOP20关键靶点对应10种中药的55种化学成分,骨碎补和续断的活性成分居多。药物治疗可明显改善OVX大鼠骨组织的BMD、生物力学、Micro CT下骨质量参数及骨组织形态;转录组学检测获差异表达基因679个,GO和KEGG分析其机制与整合生物信息学结果基本相符,在代谢相关信号通路方面有明显富集,TOP20靶点的表达水平均发生相应改变;qRT-PCR和Western blot结果进一步证实了Gapdh、Tnf、Spp1、Mmp2、Mmp1、Mapk3、Hif1a、Esr1等基因表达水平在造模及药物治疗前后发生了相反变化。结论续苓健骨方药效与骨碎补和续断具有密切关系,Gapdh、Hif1a等代谢相关基因调控的代谢信号通路可能在其中发挥重要作用。
关键词
骨质疏松
整合生物信息学
续苓健骨方
代谢
mRNA表达谱芯片
转录组学
Keywords
osteoporosis
integrating bioinformatics
Xuling Jiangu decoction
metabolism
mRNA microarray
transcriptomics
分类号
R274.9 [医药卫生—中西医结合]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
整合生物信息学和实验验证研究续苓健骨方抗骨质疏松作用机制
陈玄
黄景文
谢丽华
陈娟
李生强
叶云金
黄小彬
何艳艳
薛立鹏
陈赛楠
葛继荣
《中国骨质疏松杂志》
北大核心
2025
1
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