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基于组LASSO的重组近亲杂交合作小鼠基因位点定位研究
1
作者
熊思灿
胡桂开
阮周生
《应用数学》
CSCD
北大核心
2021年第2期489-497,共9页
重组近亲杂交合作小鼠品系(CC-RIX)具有很多优点,特别是在复杂疾病的数量性状位点定位方面,具有较高功效.本文在现有研究基础上,考虑了仅含主基因效应的混合线性定位模型,并通过组LASSO惩罚函数法对问题进行转换,然后采用迭代加权最小...
重组近亲杂交合作小鼠品系(CC-RIX)具有很多优点,特别是在复杂疾病的数量性状位点定位方面,具有较高功效.本文在现有研究基础上,考虑了仅含主基因效应的混合线性定位模型,并通过组LASSO惩罚函数法对问题进行转换,然后采用迭代加权最小二乘法对转换后的问题进行求解.从而克服了设计矩阵容易奇异,计算速度慢等计算上的难题.模拟计算表明,本文所提模型和方法在CC-RIX品系的数量性状位点定位中能快速、准确地识别出数量性状位点,并具有较高的真阳性率,以及较低的假阳性率.
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关键词
重组近亲杂交合作小鼠
数量性状位点定位
组LASSO
迭代加权最小二乘法
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题名
基于组LASSO的重组近亲杂交合作小鼠基因位点定位研究
1
作者
熊思灿
胡桂开
阮周生
机构
东华理工大学理学院
出处
《应用数学》
CSCD
北大核心
2021年第2期489-497,共9页
基金
东华理工大学博士启动基金(DHBK2018052)
国家自然科学基金(11661003,12061008,12061009)
江西省自然科学基金(20192BAB201006)。
文摘
重组近亲杂交合作小鼠品系(CC-RIX)具有很多优点,特别是在复杂疾病的数量性状位点定位方面,具有较高功效.本文在现有研究基础上,考虑了仅含主基因效应的混合线性定位模型,并通过组LASSO惩罚函数法对问题进行转换,然后采用迭代加权最小二乘法对转换后的问题进行求解.从而克服了设计矩阵容易奇异,计算速度慢等计算上的难题.模拟计算表明,本文所提模型和方法在CC-RIX品系的数量性状位点定位中能快速、准确地识别出数量性状位点,并具有较高的真阳性率,以及较低的假阳性率.
关键词
重组近亲杂交合作小鼠
数量性状位点定位
组LASSO
迭代加权最小二乘法
Keywords
CC-RIX
Quantitative trait loci
Group LASSO
Iteratively re-weighted least-squares algorithm
分类号
O212.1 [理学—概率论与数理统计]
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作者
出处
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1
基于组LASSO的重组近亲杂交合作小鼠基因位点定位研究
熊思灿
胡桂开
阮周生
《应用数学》
CSCD
北大核心
2021
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