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基于质谱的单细胞蛋白质组学分析: 1; 作者范智瑞方群杨奕《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第11期61-76,共16页; 单细胞蛋白质组学分析能揭示细胞个体之间蛋白质的精细差异,在诸多重要领域具有重要的应用价值,已成为目前的研究热点;其难点在于单细胞内的蛋白质极其微量,需要解决样品处理过程中的损失问题、色谱质谱检测的灵敏度问题和低信号强度质... 展开更多; 关键词质谱蛋白质组学单细胞微流控数据非依赖性采集; 在线阅读下载PDF 职称材料

标志物研究中常用蛋白组学质谱方法的定量准确性评估: 2; 作者张磊申华莉《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第11期191-199,共9页; 在疾病发生过程中,蛋白质的表达水平、修饰状态或相互作用模式的变化有可能反映病理状态或疾病进展,因此蛋白质常被用作疾病标志物.基于质谱的蛋白质组学发现了大量的潜在疾病标志物,这些标志物及其质谱检测方法能否进一步推广至临床检... 展开更多; 关键词临床质谱蛋白质组学平行反应监测多反应监测数据非依赖性采集; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于4D-FastDIA定量蛋白质组的富硒与非富硒鸡蛋差异表达蛋白鉴定及功能分析: 3; 作者袁琳赵文竹 +2 位作者吴春剑于一丁于志鹏《食品科学》 2025年第12期163-170,共8页; 本研究旨在利用四维快速数据非依赖性采集(4D-fast data-independent acquisition,4D-FastDIA)定量蛋白质组学技术,解析富硒鸡蛋与非富硒鸡蛋中差异表达的蛋白及其功能特性。通过液相色谱-串联质谱分析技术结合生物信息学方法,比较组间... 展开更多; 关键词鸡蛋天然富硒非富硒蛋白质组学四维快速数据非依赖性采集; 在线阅读下载PDF 职称材料

超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱法快速辨识芪玉三龙汤化学成分被引量：9: 4; 作者黄梦文吴欢 +5 位作者于伟王影汪逢灿张纯纯周龙生李泽庚《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期730-743,共14页; 利用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(UPLC-QTOF-MS)的数据非依赖性采集(DIA)技术,结合靶向筛查方法,快速辨识芪玉三龙汤(Qi-Yu-San-Long decoction,QYSLD)化学成分。以Waters ACQUITY UPLC BEH C18柱(100 mm×2.1 mm,1.7μm)... 展开更多; 关键词超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱数据非依赖性采集靶向筛查芪玉三龙汤; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于质谱的单细胞蛋白质组学分析: 1; 作者范智瑞方群杨奕; 机构浙江大学化学系浙江大学杭州国际科创中心; 出处《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第11期61-76,共16页; 基金国家自然科学基金(批准号:22304153,22234007,21827806)资助。; 文摘单细胞蛋白质组学分析能揭示细胞个体之间蛋白质的精细差异,在诸多重要领域具有重要的应用价值,已成为目前的研究热点;其难点在于单细胞内的蛋白质极其微量,需要解决样品处理过程中的损失问题、色谱质谱检测的灵敏度问题和低信号强度质谱数据的解析利用问题.本文从单细胞分选、样品处理、色谱质谱采集和数据分析等方面,综合评述了目前基于质谱的单细胞蛋白质组学分析方法的研究进展及其在生物医学领域的应用,并展望了其未来的发展前景.; 关键词质谱蛋白质组学单细胞微流控数据非依赖性采集; Keywords Mass spectrometry Proteomics Single-cell Microfluidics Data-independent acquisition; 分类号 O657 [理学—分析化学] Q516 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名标志物研究中常用蛋白组学质谱方法的定量准确性评估: 2; 作者张磊申华莉; 机构复旦大学生物医学研究院; 出处《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第11期191-199,共9页; 基金国家自然科学基金(批准号:82272174) 上海市科委科技创新行动计划项目(批准号:22S31901900)资助。; 文摘在疾病发生过程中,蛋白质的表达水平、修饰状态或相互作用模式的变化有可能反映病理状态或疾病进展,因此蛋白质常被用作疾病标志物.基于质谱的蛋白质组学发现了大量的潜在疾病标志物,这些标志物及其质谱检测方法能否进一步推广至临床检测,定量准确性和稳定性是关键.本文合成了32条标准肽段,对数据非依赖性采集(DIA)、多反应监测(MRM)及平行反应监测(PRM) 3种有潜力在临床质谱方面大规模应用的定量方法进行了比较和评估.将肽段稀释成4个不同的浓度来模拟不同丰度的实际样本,用以上3种质谱方法采集数据后,比较了肽段发现率、标准曲线线性、日间和日内精密度及保留时间(RT)漂移等情况,总结了3种定量方法各自的优缺点和潜在应用方向.结果表明,MRM定量方法最适合临床应用,在于其优异的日间日内稳定性、灵敏度和定量精度;PRM适合科研方向靶向定量,因其拥有最高灵敏度和较高稳定性定量精度;而DIA由于高通量而依赖于软件和算法解析,定量数目多的同时,对于特定肽段定量准确性比PRM/MRM差.; 关键词临床质谱蛋白质组学平行反应监测多反应监测数据非依赖性采集; Keywords Clinical mass spectrometry Proteomics Parallel reaction monitoring Multiple reaction monitoring Data independent acquisition; 分类号 O657 [理学—分析化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于4D-FastDIA定量蛋白质组的富硒与非富硒鸡蛋差异表达蛋白鉴定及功能分析: 3; 作者袁琳赵文竹吴春剑于一丁于志鹏; 机构海南大学食品科学与工程学院; 出处《食品科学》 2025年第12期163-170,共8页; 基金海南省国际科技合作研发项目(GHYF20240010) 海南富硒鸡蛋高端产品创制及产业化示范项目(HKKJ202424)。; 文摘本研究旨在利用四维快速数据非依赖性采集(4D-fast data-independent acquisition,4D-FastDIA)定量蛋白质组学技术,解析富硒鸡蛋与非富硒鸡蛋中差异表达的蛋白及其功能特性。通过液相色谱-串联质谱分析技术结合生物信息学方法,比较组间相对定量的蛋白质,探讨蛋白质的差异表达规律,并利用基因本体论注释分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析法对蛋白质功能和代谢通路进行分析。蛋白质组学分析共鉴定到257种蛋白质,其中251种蛋白质被定量分析。蛋清中共鉴定到48种差异蛋白,其中28种蛋白表达下调,20种蛋白表达上调。蛋黄中共鉴定到82种差异蛋白,其中58种蛋白表达下调,24种蛋白表达上调。通过比较天然富硒鸡蛋与非富硒鸡蛋中蛋白质的表达水平,发现丝氨酸肽酶抑制剂、免疫球蛋白样结构域蛋白、卵转铁蛋白和黏蛋白-6在富硒鸡蛋中的表达水平显著高于非富硒鸡蛋。通过基因本体注释分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析发现,天然富硒鸡蛋中与免疫调节、抗菌、抗氧化相关的蛋白质在表达水平上显著高于非富硒鸡蛋。研究结果可为揭示富硒鸡蛋与非富硒鸡蛋在营养成分价值上的差异及其分子机制提供科学依据。; 关键词鸡蛋天然富硒非富硒蛋白质组学四维快速数据非依赖性采集; Keywords egg natural selenium-enriched non-selenium-enriched proteomics 4D-fast data-independent acquisition; 分类号 TS253.1 [轻工技术与工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱法快速辨识芪玉三龙汤化学成分被引量：9: 4; 作者黄梦文吴欢于伟王影汪逢灿张纯纯周龙生李泽庚; 机构安徽中医药大学科研实验中心中药研究与开发安徽省重点实验室中药复方安徽省重点实验室安徽省教育厅中医药防治肺系重大疾病重点实验室; 出处《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期730-743,共14页; 基金国家自然科学基金(81903765) 国家级大学生创新训练项目(医学自然)(202006180216) +1 种基金安徽省教育厅中医药防治肺系重大疾病重点实验室开放基金项目(JYTKF2020-5).; 文摘利用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(UPLC-QTOF-MS)的数据非依赖性采集(DIA)技术,结合靶向筛查方法,快速辨识芪玉三龙汤(Qi-Yu-San-Long decoction,QYSLD)化学成分。以Waters ACQUITY UPLC BEH C18柱(100 mm×2.1 mm,1.7μm)为色谱柱,流速为0.2 mL/min,柱温为35℃,进样量为2μL,以0.1%(v/v)甲酸水溶液-乙腈为流动相进行梯度洗脱。采用电喷雾电离(ESI)源,以全信息串联质谱(MSE)技术在正、负离子模式下分别采集QYSLD复杂组分的质谱数据。通过检索文献和在线数据库,建立QYSLD中各单味药材化学成分库。将采集到的样品原始质谱数据与QYSLD化学成分库导入天然产物后处理筛查(UNIFI)平台;在UNIFI平台中设置参数(保留时间偏差为±0.1 min,精确质量数偏差阈值为±5×10^(-6),正离子模式下,选择[M+H]^(+)和[M+Na]^(+)为准分子离子或加合离子,负离子模式下,选择[M-H]^(-)和[M+HCOO]^(-))。经UNIFI平台对MSE模式下采集的质谱数据与自建数据库中成分作靶向筛查,结合化合物准分子离子、质谱裂解途径及部分对照品进行结构确认。从QYSLD中共识别出166种化学成分,其中皂苷类22种,生物碱类13种,黄酮类27种,萜类32种,氨基酸类20种,苯丙素类16种,有机酸类9种,甾醇类6种,蒽醌类6种,其他类15种。其中16种成分使用对照品作验证。研究建立的方法能够快速、可靠的表征QYSLD中的化学成分,为该复方的药效物质及质量控制研究奠定了基础。; 关键词超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱数据非依赖性采集靶向筛查芪玉三龙汤; Keywords ultra high performance liquid chromatography-quadrupole time-of-flight mass spectrometry(UPLC-QTOF-MS) data independent acquisition(DIA) targeted screening strategy Qi-Yu-San-Long decoction(QYSLD); 分类号 O658 [理学—分析化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于质谱的单细胞蛋白质组学分析	范智瑞方群杨奕	《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	标志物研究中常用蛋白组学质谱方法的定量准确性评估	张磊申华莉	《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于4D-FastDIA定量蛋白质组的富硒与非富硒鸡蛋差异表达蛋白鉴定及功能分析	袁琳赵文竹吴春剑于一丁于志鹏	《食品科学》	2025		在线阅读下载PDF 职称材料
4	超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱法快速辨识芪玉三龙汤化学成分	黄梦文吴欢于伟王影汪逢灿张纯纯周龙生李泽庚	《色谱》 CAS CSCD 北大核心	2021	9	在线阅读下载PDF 职称材料