期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
蜂窝状数字PCR微阵列荧光图像的信息提取
被引量：
9
1
作者
李树力
李金泽
+3 位作者
郭振
朱文艳
周连群
张芷齐
《光学精密工程》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期2745-2755,共11页
蜂窝状堆叠数字PCR微阵列图像因其单元尺寸小、排列密集,荧光信号弱、易受光照分布影响,其样点定位困难。本文提出基于形态学的三通道蜂窝状荧光图像样点寻址算法及数字PCR图像信息提取方法,可快速、有效识别微阵列芯片生物分子微弱荧...
蜂窝状堆叠数字PCR微阵列图像因其单元尺寸小、排列密集,荧光信号弱、易受光照分布影响,其样点定位困难。本文提出基于形态学的三通道蜂窝状荧光图像样点寻址算法及数字PCR图像信息提取方法,可快速、有效识别微阵列芯片生物分子微弱荧光信息。针对不同通道的图像进行配准融合,使样点排布整齐;通过增强图像的对比度,选取有效样点区域,基于改进伽马算法去除光照分布不均效应;基于形态学算法识别紧密排列的样点,对微阵列芯片图像进行单元分割定位,提取每个样点的生物分子荧光信息。该方法处理一块约20000个微单元的数字PCR芯片图像的耗时小于20 s,与现有定位方法相比,处理相同数量样点的图片的耗时可减少3个数量级;通过与标准仪器结果相比,样点识别精度达到98.79%,生物信息计算结果(拷贝数)准确度达到96.2%。本文提出基于形态学的三通道蜂窝状荧光图像样点寻址算法及数字PCR图像信息提取方法克服了蜂窝状堆叠式微阵列荧光图像样点难以定位的问题,与现有方法相比,能够快速、准确地获取生物信息,为数字PCR技术的精准定量奠定了基础。
展开更多
关键词
生物荧光图像
蜂窝状
数字pcr微阵列
寻址定位
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
蜂窝状数字PCR微阵列荧光图像的信息提取
被引量：
9
1
作者
李树力
李金泽
郭振
朱文艳
周连群
张芷齐
机构
上海大学通信与信息工程学院
中国科学院苏州生物医学工程技术研究所中国科学院生物医学检验技术重点实验室
中国科学技术大学
出处
《光学精密工程》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期2745-2755,共11页
基金
国家重点研发计划资助项目(No.2018YFC0115705)
国家自然科学基金资助项目(No.51675517,No.61874133,No.61901469)
+7 种基金
江苏省重点研究开发项目(No.BE2019684,No.BE2018080)
季华实验室资助项目(No.X190181TD190)
中科院青年创新促进会资助项目(No.2019322,No.2018360,No.Y201856)
中国科学院STS项目(No.KFJ-STS-SCYD-217,No.KFJ-STS-ZDTP-061)
中国科学院仪器装备项目(No.YJKYYQ20190057)
苏州市科技支撑计划资助项目(No.SYG201907)
济南市“高校20条”资助项目(No.2018GXRC030)
天津科学与技术工程资助项目(No.19YFYSQY00040)。
文摘
蜂窝状堆叠数字PCR微阵列图像因其单元尺寸小、排列密集,荧光信号弱、易受光照分布影响,其样点定位困难。本文提出基于形态学的三通道蜂窝状荧光图像样点寻址算法及数字PCR图像信息提取方法,可快速、有效识别微阵列芯片生物分子微弱荧光信息。针对不同通道的图像进行配准融合,使样点排布整齐;通过增强图像的对比度,选取有效样点区域,基于改进伽马算法去除光照分布不均效应;基于形态学算法识别紧密排列的样点,对微阵列芯片图像进行单元分割定位,提取每个样点的生物分子荧光信息。该方法处理一块约20000个微单元的数字PCR芯片图像的耗时小于20 s,与现有定位方法相比,处理相同数量样点的图片的耗时可减少3个数量级;通过与标准仪器结果相比,样点识别精度达到98.79%,生物信息计算结果(拷贝数)准确度达到96.2%。本文提出基于形态学的三通道蜂窝状荧光图像样点寻址算法及数字PCR图像信息提取方法克服了蜂窝状堆叠式微阵列荧光图像样点难以定位的问题,与现有方法相比,能够快速、准确地获取生物信息,为数字PCR技术的精准定量奠定了基础。
关键词
生物荧光图像
蜂窝状
数字pcr微阵列
寻址定位
Keywords
bioluminescent image
honeycomb
digital polymerase chain reaction microarray
spot addressing
分类号
TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
Q503 [生物学—生物化学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蜂窝状数字PCR微阵列荧光图像的信息提取
李树力
李金泽
郭振
朱文艳
周连群
张芷齐
《光学精密工程》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
