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基于6个内部基因序列的A型流感病毒的系统发育多样性及分布概况
1
作者
Ji-Ming Chen
邱文英
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2009年第10期121-121,共1页
A型流感病毒是人、禽、猪、马及一些海生哺乳动物重要的病原。A型流感病毒能变异成多种复杂的亚型、系及亚系。最近,通过病毒内部HA和NA基因序列,A型流感病毒的系统发育多样性已从整体上进行了描述,但其6个内部基因(PB2,PB1,PA,NP,MP和...
A型流感病毒是人、禽、猪、马及一些海生哺乳动物重要的病原。A型流感病毒能变异成多种复杂的亚型、系及亚系。最近,通过病毒内部HA和NA基因序列,A型流感病毒的系统发育多样性已从整体上进行了描述,但其6个内部基因(PB2,PB1,PA,NP,MP和NS)的进化关系仍不清楚。作者通过NCBI中的流感病毒数据库,从GenBank中选取具有代表性的6个病毒内部基因的2798条序列。然后,使用MEGA4.1和RAxML 7.0.4软件对这些代表性序列之间的进化关系进行计算。根据进化树以及病毒在宿主、区域和时间上的分布的拓扑结构进行系和亚系的分类。结果构建了A型流感病毒6个内部基因的发育树概况图。通过一种假定的通用的数字命名系统对基于6个内部基因的型间各系和亚系进行分类和命名。通过概况图对流感病毒在不同地区、时期和宿主流通的多样性进行了分析。本研究首次呈现了基于6个内部基因的A型流感病毒的系统发育多样性和分布的概况图,同时还提出了针对病毒系和亚系的一种假定通用的命名系统,这些可以作为概括病毒历史和推测以后发展的候选形式,能促进以后在病毒系统发育多样性和进化上的科学交流。另外,本研究还提出了一种用以识别病毒新型的发育图,包括大规模流行的A型(H1N1)流感病毒的起源。
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关键词
A型流感病毒
系统
发育多样性
内部基因
数字命名系统
分布概况
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题名
基于6个内部基因序列的A型流感病毒的系统发育多样性及分布概况
1
作者
Ji-Ming Chen
邱文英
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2009年第10期121-121,共1页
文摘
A型流感病毒是人、禽、猪、马及一些海生哺乳动物重要的病原。A型流感病毒能变异成多种复杂的亚型、系及亚系。最近,通过病毒内部HA和NA基因序列,A型流感病毒的系统发育多样性已从整体上进行了描述,但其6个内部基因(PB2,PB1,PA,NP,MP和NS)的进化关系仍不清楚。作者通过NCBI中的流感病毒数据库,从GenBank中选取具有代表性的6个病毒内部基因的2798条序列。然后,使用MEGA4.1和RAxML 7.0.4软件对这些代表性序列之间的进化关系进行计算。根据进化树以及病毒在宿主、区域和时间上的分布的拓扑结构进行系和亚系的分类。结果构建了A型流感病毒6个内部基因的发育树概况图。通过一种假定的通用的数字命名系统对基于6个内部基因的型间各系和亚系进行分类和命名。通过概况图对流感病毒在不同地区、时期和宿主流通的多样性进行了分析。本研究首次呈现了基于6个内部基因的A型流感病毒的系统发育多样性和分布的概况图,同时还提出了针对病毒系和亚系的一种假定通用的命名系统,这些可以作为概括病毒历史和推测以后发展的候选形式,能促进以后在病毒系统发育多样性和进化上的科学交流。另外,本研究还提出了一种用以识别病毒新型的发育图,包括大规模流行的A型(H1N1)流感病毒的起源。
关键词
A型流感病毒
系统
发育多样性
内部基因
数字命名系统
分布概况
分类号
R51 [医药卫生—内科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于6个内部基因序列的A型流感病毒的系统发育多样性及分布概况
Ji-Ming Chen
邱文英
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2009
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